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ODC1基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达影响的初步观察与分析
1
作者
宋尖卓
马健
陈鹏
《新疆医科大学学报》
CAS
2024年第4期526-532,共7页
目的探讨鸟氨酸脱羧酶1(ODC1)基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达的影响,为进一步研究其作用及调控机制提供一些实验基础和线索。方法以前列腺癌细胞PC-3作为研究对象,敲低ODC1基因,经q-PCR检测及WB检测验证后采用Illumina Novaseq 6000...
目的探讨鸟氨酸脱羧酶1(ODC1)基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达的影响,为进一步研究其作用及调控机制提供一些实验基础和线索。方法以前列腺癌细胞PC-3作为研究对象,敲低ODC1基因,经q-PCR检测及WB检测验证后采用Illumina Novaseq 6000,PE150模式进行高通量测序,测序结果应用编码潜能分析方法(CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、LGC分析)进行预测筛选,对筛选出的lncRNAs行差异分析、顺式作用元件分析以及GO和KEGG富集分析。再选择文献报道中与前列腺癌关系密切的几个功能lncRNAs,采用q-PCR进行验证。结果(1)在ODC1敲低PC-3细胞中筛选到341个lncRNA,差异表达的lncRNA中上调154个,下调128个。符合条件的差异lncRNA与差异表达基因共表达的顺式调控靶标有38个。(2)差异表达lncRNAs行GO和KEGG富集分析显示,lncRNA靶标基因参与体内多种生物学通路,如磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt信号通路)、Ras信号通路等,还与肿瘤血管生成、细胞群增殖、正调控细胞分裂等密切相关。(3)q-PCR法验证结果:LINC00973、TERC表达显著下调、LINC00638表达显著上调,与GO和KEGG富集分析得到的lncRNA差异表达情况一致。结论敲低ODC1基因可导致PC-3细胞lncRNAs差异表达,ODC1基因有可能通过lncRNAs影响细胞信号通路,促进肿瘤的发生发展。本实验为进一步研究ODC1基因在前列腺癌中的作用提供了一些新的实验基础。
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关键词
前列腺癌
odc
1
基因
lncRNA
差异表达
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职称材料
三穗鸭ODC1基因多态性与屠体性状关联性分析
被引量：
1
2
作者
李潇蒙
戴焰
+4 位作者
周琳
林威
柳诚刚
陆曼
杨胜林
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期76-80,共5页
[目的]寻找与三穗鸭屠体性状相关的遗传标记。[方法]以139只贵州三穗鸭为研究对象,采用PCR-SSCP技术和DNA测序方法,对鸟氨酸脱羧酶1(Ornithine decarboxylase,ODC1)基因进行遗传多态性研究。[结果]在ODC1基因中检测到1个碱基变异,位于第...
[目的]寻找与三穗鸭屠体性状相关的遗传标记。[方法]以139只贵州三穗鸭为研究对象,采用PCR-SSCP技术和DNA测序方法,对鸟氨酸脱羧酶1(Ornithine decarboxylase,ODC1)基因进行遗传多态性研究。[结果]在ODC1基因中检测到1个碱基变异,位于第4外显子109 bp处,为A→G突变,且在此位点的优势等位基因型为AA基因型,A为优势等位基因。ODC1基因Ex4处多态性对三穗鸭的腿肌重、半净膛重等屠体性状存在显著影响(P<0.05)。[结论]研究初步推测ODC1基因多态性与屠体性状具有显著的影响,A109G可作为穗鸭屠体性状的遗传标记,为建立三穗鸭的分子辅助标记选择方法提供初步依据,推进选育进程。
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关键词
三穗鸭
odc
1
屠体性状
SNPS
原文传递
题名
ODC1基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达影响的初步观察与分析
1
作者
宋尖卓
马健
陈鹏
机构
新疆医科大学附属肿瘤医院泌尿科
出处
《新疆医科大学学报》
CAS
2024年第4期526-532,共7页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2022D01C285)。
文摘
目的探讨鸟氨酸脱羧酶1(ODC1)基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达的影响,为进一步研究其作用及调控机制提供一些实验基础和线索。方法以前列腺癌细胞PC-3作为研究对象,敲低ODC1基因,经q-PCR检测及WB检测验证后采用Illumina Novaseq 6000,PE150模式进行高通量测序,测序结果应用编码潜能分析方法(CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、LGC分析)进行预测筛选,对筛选出的lncRNAs行差异分析、顺式作用元件分析以及GO和KEGG富集分析。再选择文献报道中与前列腺癌关系密切的几个功能lncRNAs,采用q-PCR进行验证。结果(1)在ODC1敲低PC-3细胞中筛选到341个lncRNA,差异表达的lncRNA中上调154个,下调128个。符合条件的差异lncRNA与差异表达基因共表达的顺式调控靶标有38个。(2)差异表达lncRNAs行GO和KEGG富集分析显示,lncRNA靶标基因参与体内多种生物学通路,如磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt信号通路)、Ras信号通路等,还与肿瘤血管生成、细胞群增殖、正调控细胞分裂等密切相关。(3)q-PCR法验证结果:LINC00973、TERC表达显著下调、LINC00638表达显著上调,与GO和KEGG富集分析得到的lncRNA差异表达情况一致。结论敲低ODC1基因可导致PC-3细胞lncRNAs差异表达,ODC1基因有可能通过lncRNAs影响细胞信号通路,促进肿瘤的发生发展。本实验为进一步研究ODC1基因在前列腺癌中的作用提供了一些新的实验基础。
关键词
前列腺癌
odc
1
基因
lncRNA
差异表达
Keywords
prostate
cancer
odc
1
gene
lncRNA
differential
expression
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
三穗鸭ODC1基因多态性与屠体性状关联性分析
被引量：
1
2
作者
李潇蒙
戴焰
周琳
林威
柳诚刚
陆曼
杨胜林
机构
贵州大学动物科学学院
高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期76-80,共5页
基金
贵州省科技厅农业重大专项项目("三穗鸭优质高效生产关键技术研究与产业化集成示范"
No.黔科合重大专项字2012-6004号)
+4 种基金
国家自然科学基金项目("三穗麻鸭旱养模式下的行为
生理反应及其啄羽行为的分子机理研究"
No.31360566)
贵州省教育厅产学研基地项目("三穗鸭产业示范园区产学研基地建设"
No.黔教合KY字2013-120号)资助
文摘
[目的]寻找与三穗鸭屠体性状相关的遗传标记。[方法]以139只贵州三穗鸭为研究对象,采用PCR-SSCP技术和DNA测序方法,对鸟氨酸脱羧酶1(Ornithine decarboxylase,ODC1)基因进行遗传多态性研究。[结果]在ODC1基因中检测到1个碱基变异,位于第4外显子109 bp处,为A→G突变,且在此位点的优势等位基因型为AA基因型,A为优势等位基因。ODC1基因Ex4处多态性对三穗鸭的腿肌重、半净膛重等屠体性状存在显著影响(P<0.05)。[结论]研究初步推测ODC1基因多态性与屠体性状具有显著的影响,A109G可作为穗鸭屠体性状的遗传标记,为建立三穗鸭的分子辅助标记选择方法提供初步依据,推进选育进程。
关键词
三穗鸭
odc
1
屠体性状
SNPS
Keywords
Sansui
duck,
odc
1
gene
,
carcass
traits,
SNPs
分类号
Q784 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ODC1基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达影响的初步观察与分析
宋尖卓
马健
陈鹏
《新疆医科大学学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
三穗鸭ODC1基因多态性与屠体性状关联性分析
李潇蒙
戴焰
周琳
林威
柳诚刚
陆曼
杨胜林
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
原文传递
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