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The N^6-adenine methylation in yeast genome profiled by single-molecule technology 被引量:3
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作者 Zhe Liang Guoliang Yu +5 位作者 Jingrong Liu Yuke Geng Jinghui Mao Depeng Wang Jiapeng Zhou Xiaofeng Gu 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2018年第4期223-225,共3页
The most common and abundant DNA modification is 5-methylcytosine(5mC),which has been well-established as an epigenetic mark regulating gene expression in eukaryotes(Jones,2012).Another DNA modification N^6-methyl... The most common and abundant DNA modification is 5-methylcytosine(5mC),which has been well-established as an epigenetic mark regulating gene expression in eukaryotes(Jones,2012).Another DNA modification N^6-methyldeoxyadenosine(6mA),previously reported as a widespread DNA methylation in prokaryotes. 展开更多
关键词 DnA TSS The n~6-adenine methylation in yeast genome profiled by single-molecule technology
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森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析 被引量:5
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作者 徐昇 张鑫 +1 位作者 刘德才 顾婷婷 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2194-2206,共13页
通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个... 通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据及实时定量荧光PCR分析显示,各个基因均具有时空表达特异性和非生物胁迫响应。其中1个DAMT基因表达量在果实中较高且随果实成熟上调,推测可能参与调控果实成熟。此外,这5个基因在冷胁迫下表达水平有不同程度下调:而在热胁迫下各基因表达量变化显著不同。由此推测6m A甲基转移酶基因可能参与了森林草莓的生长发育和对冷、热胁迫的响应。 展开更多
关键词 森林草莓 n^6-腺嘌呤甲基化(6mA) n^6-腺嘌呤甲基转移酶 系统进化 逆境胁迫
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As3MT、N6AMT1基因-环境交互作用对砷暴露所致皮肤损伤影响 被引量:3
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作者 魏亚萍 侯祥庆 +4 位作者 蓝园 左菁菁 李举双 王涛 毛广运 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期188-192,共5页
目的探讨砷甲基转移酶(As3MT)和N-6-腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1(N6AMT1)基因多态性及基因-环境交互作用与砷暴露所致皮肤损伤(AISL)的关联性。方法于2010年9月到2011年12月在内蒙古五原县入选饮水型砷暴露人群335人,65例被确诊患有AIS... 目的探讨砷甲基转移酶(As3MT)和N-6-腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1(N6AMT1)基因多态性及基因-环境交互作用与砷暴露所致皮肤损伤(AISL)的关联性。方法于2010年9月到2011年12月在内蒙古五原县入选饮水型砷暴露人群335人,65例被确诊患有AISL。应用MassARRAY^(?)分子量阵列平台检测基因型,高效液相色谱-电感耦合等离子体质谱联用法测定尿砷代谢物,砷暴露时间由其高砷水饮用时间确定,多因子降维法与岭回归模型分析基因型、环境因素的单独效应及基因-环境的交互作用。结果 As3MT基因rs3740400位点CA/AA基因型、N6AMT1基因rs 1006903位点GC/CC基因型和尿二甲基胂酸(DMA)升高为AISL的独立危险因素(P<0.05)。rs3740400位点基因型-尿无机砷(iAs)-单甲基胂酸(MMA)的交互作用与AISL发生风险间存在显著的统计学关联(OR=0.62, 95%CI=0.41~0.94,P=0.024),模型的验证样本准确率为0.577 6,交叉验证一致性为9/10。结论 As3MT、N6AMT1基因多态性及尿砷化合物水平均与AISL独立相关,rs3740400位点基因型、尿iAs和MMA的交互作用在慢性砷中毒的发生发展中具有重要作用。 展开更多
关键词 砷甲基转移酶(As3MT) n-6-腺嘌呤特异性DnA甲基转移酶1(n6AMT1) 基因-环境交互作用 多因子降维
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Amplification and function analysis of N6-adenine-specific DNA methyltransferase gene in Nilaparvata lugens 被引量:1
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作者 ZHANG Jiao XING Yan-ru +5 位作者 HOU Bo-feng YUAN Zhu-ting LI Yao JIE Wen-cai SUN Yang LI Fei 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第3期591-599,共9页
Methylation of the N6 position of adenine, termed N6-methyladenine, protects DNA from restriction endonucleases via the host-specific restriction-modification system. N6-methyladenine was discovered and has been well ... Methylation of the N6 position of adenine, termed N6-methyladenine, protects DNA from restriction endonucleases via the host-specific restriction-modification system. N6-methyladenine was discovered and has been well studied in bacteria. N6-adenine-specific DNA methyltransferase(N6AMT) is the main enzyme catalyzing the methylation of the adenine base and knowledge of this enzyme was mainly derived from work in prokaryotic models. However, large-scale gene discovery at the genome level in many model organisms indicated that the N6AMT gene also exists in eukaryotes, such as humans, mice, fruit flies and plants. Here, we cloned a N6AMT gene from Nilaparvata lugens(Nlu-N6AMT) and amplified its fulllength transcript. Then, we carried out a systematic investigation of N6AMT in 33 publically available insect genomes, indicating that all studied insects had N6AMT. Genomic structure analysis showed that insect N6AMT has short introns compared with the mammalian homologs. Domain and phylogenetic analysis indicated that insect N6AMT had a conserved N6-adenine Mlase domain that is specific to catalyze the adenine methylation. Nlu-N6AMT was highly expressed in the adult female. We knocked down Nlu-N6AMT by feeding ds RNA from the second instar nymph to adult female, inducing retard development of adult female. In all, we provide the first genome-wide analysis of N6AMT in insects and presented the experimental evidence that N6AMT might have important functions in reproductive development and ovary maturation. 展开更多
关键词 n6-adenine-specific DnA methyltransferase(n6AMT) nilaparvata lugens expression RnA interference gene structure
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甲基转移酶3在肝细胞癌中的研究进展 被引量:1
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作者 王朔 柯炜炜 卢再鸣 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第1期86-89,93,共5页
肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,居癌症发病率第四位,是全球第二大癌症死亡原因。N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化是信使RNA(mRNA)最普遍的修饰,而甲基转移酶3(METTL3)是m6A RNA甲基化的核心酶。作为致癌基因,METTL3在HCC中多处于过表... 肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,居癌症发病率第四位,是全球第二大癌症死亡原因。N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化是信使RNA(mRNA)最普遍的修饰,而甲基转移酶3(METTL3)是m6A RNA甲基化的核心酶。作为致癌基因,METTL3在HCC中多处于过表达状态。METTL3的过表达可增强HCC的增殖、侵袭及转移能力,降低患者的预后水平。此外,METTL3介导不同基因表达也为HCC的治疗提供诸多靶点。本文对近十年来METTL3在HCC中的研究进展进行综述,系统分析METTL3在HCC发生、治疗及预后中的作用,以期为HCC的治疗提供新的思路及方案。 展开更多
关键词 甲基转移酶3 n6-甲基腺苷 肝细胞癌 基因表达调控 信号通路
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东方蜜蜂微孢子虫N6-腺苷特异性甲基化转移酶基因的克隆、分子特性及表达模式 被引量:1
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作者 孙明会 张佳欣 +9 位作者 张艺琼 赵浩东 荆欣 高旭泽 郭思佳 冯佩林 刘小玉 陈大福 付中民 郭睿 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期3279-3291,共13页
【目的】东方蜜蜂微孢子虫(Nosme ceranae)专性侵染成年蜜蜂导致微孢子虫病,给养蜂生产造成很大损失。目前,东方蜜蜂微孢子虫的N6-腺苷特异性甲基化转移酶(N6-adenine-specific methyltransferase,N6AMT)基因NcN6AMT的研究仍然缺失。本... 【目的】东方蜜蜂微孢子虫(Nosme ceranae)专性侵染成年蜜蜂导致微孢子虫病,给养蜂生产造成很大损失。目前,东方蜜蜂微孢子虫的N6-腺苷特异性甲基化转移酶(N6-adenine-specific methyltransferase,N6AMT)基因NcN6AMT的研究仍然缺失。本研究对NcN6AMT的编码序列(coding sequence,CDS)区进行克隆,并解析NcN6AMT蛋白的理化性质和分子特性,进而测定东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica)和中华蜜蜂(Apis cerana cerana)工蜂过程中NcN6AMT的相对表达量,以期丰富NcN6AMT的信息,并为探究东方蜜蜂微孢子虫侵染过程NcN6AMT的功能及表观调控机制提供基础。【方法】采用Protparam和ProtScale软件对NcN6AMT进行等电点和亲水性分析。通过SignalP 5.0、NetPhos 3.1、TMHMM-2.0、SOPMA和SWISS-MODEL等软件分别预测NcN6AMT的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域、二级结构和三级结构。使用WoLF PSORT II软件预测NcN6AMT的亚细胞定位。根据N6AMT氨基酸序列,通过TBtools软件对智人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)、褐飞虱(Nilaparvata lugens)、兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)、肠脑炎微孢子虫(Encephalitozoon intestinalis ATCC 50506)、蚱蜢脑炎微孢子虫(Encephalitozoon romaleae SJ-2008)、美洲思普雷格孢虫(Spraguea lophii 42_110)、家蚕微孢子虫(Nosema bombycis CQ1)、隐生菱形藻(Nitzschia inconspicua)和东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)的N6AMT进行结构域预测和分析。利用MEME软件和MEGA 11.0软件进行东方蜜蜂微孢子虫和其他物种N6AMT的保守基序预测及进化树构建。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测NcN6AMT在东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂和中华蜜蜂工蜂过程的相对表达量。【结果】通过PCR扩增出大小约500 bp的目的片段,克隆测序结果显示其与GenBank数据库收录的预测序列一致;NcN6AMT蛋白的分子� 展开更多
关键词 微孢子虫 东方蜜蜂微孢子虫 DnA甲基化 n6-腺苷特异性甲基化转移酶 克隆 分子特性 表达模式
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i^6Ade和Hi^6Ade对芸扁豆和棉豆愈伤组织细胞分裂素氧化酶的影响 被引量:1
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作者 黄学林 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1989年第2期59-63,共5页
异戊烯基腺嘌呤(i^6Ade)和异戊烷基腺嘌呤(Hi^6Ade)均可诱导棉豆和芸扁豆愈伤组织中细胞分裂素氧化酶(CKO)的活性,但有差异。对芸扁豆愈伤组织带饱和侧链的Hi^6Ade对CKO的诱导效应比带非饱和侧链的i^6Ade强2—3倍,而对棉豆愈伤组织这两... 异戊烯基腺嘌呤(i^6Ade)和异戊烷基腺嘌呤(Hi^6Ade)均可诱导棉豆和芸扁豆愈伤组织中细胞分裂素氧化酶(CKO)的活性,但有差异。对芸扁豆愈伤组织带饱和侧链的Hi^6Ade对CKO的诱导效应比带非饱和侧链的i^6Ade强2—3倍,而对棉豆愈伤组织这两个化合物的诱导效应却很相似。表明这两个化合物在促进愈伤组织生长中所显示的结构—活性差异性与其诱导CKO活性差异有着一定的联系。 展开更多
关键词 芸扁豆 棉豆 愈伤组织 CKO
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N^6-异戊烯基腺嘌呤与牛血清白蛋白的相互作用研究
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作者 叶桦珍 陈国南 《福州大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2019年第4期550-553,559,共5页
采用紫外可见吸收光谱法和荧光光谱法研究N^6-异戊烯基腺嘌呤与牛血清白蛋白间的相互作用.通过Stern-Volmer方程法和紫外可见吸收光谱法,确定N^6-异戊烯基腺嘌呤对牛血清白蛋白的荧光猝灭作用主要为静态猝灭;推断两者之间的结合常数在... 采用紫外可见吸收光谱法和荧光光谱法研究N^6-异戊烯基腺嘌呤与牛血清白蛋白间的相互作用.通过Stern-Volmer方程法和紫外可见吸收光谱法,确定N^6-异戊烯基腺嘌呤对牛血清白蛋白的荧光猝灭作用主要为静态猝灭;推断两者之间的结合常数在温度为290、295、302、310 K时分别为162 143、13 400、4 326和74 353,结合位点数分别为1.181 4、0.907 4、0.810 2和1.112 1,结合力主要为氢键或范德华力;通过Δλ为60、15 nm时荧光同步扫描光谱的位移情况,推断出N^6-异戊烯基腺嘌呤与牛血清白蛋白的结合使牛血清白蛋白的构象发生了一定变化. 展开更多
关键词 n^6-异戊烯基腺嘌呤 牛血清白蛋白 荧光光谱法
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茉莉酸和其它激素对巴西橡胶树乳管分化的协同作用 被引量:22
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作者 刘惠芳 吴继林 郝秉中 《热带作物学报》 CSCD 2001年第3期6-16,I002,共12页
研究了外源茉莉酸分别和6-苄基腺嘌呤、吲哚乙酸、水杨酸、乙烯丰和脱落酸共同施用对巴西橡胶树(Hevea brasiliensis Mull.Arg)乳管分化的作用.将含这些激素的羊毛脂涂在巴西橡胶树无性系的萌条上,用光学显微镜技术检查茎中乳管数目的变... 研究了外源茉莉酸分别和6-苄基腺嘌呤、吲哚乙酸、水杨酸、乙烯丰和脱落酸共同施用对巴西橡胶树(Hevea brasiliensis Mull.Arg)乳管分化的作用.将含这些激素的羊毛脂涂在巴西橡胶树无性系的萌条上,用光学显微镜技术检查茎中乳管数目的变化,以及次生韧皮部轴向系统的细胞层数.施用茉莉酸对正在伸长的茎中初生乳管分化有明显促进作用,但不能诱导形成次生乳管.施用茉莉酸对已经停止伸长的茎中初生乳管的分化没有显著作用,但促进次生乳管的形成.对经过一个生长季节的萌条,施用茉莉酸能够促进各个伸长单位茎中次生乳管的分化.单独施用不同浓度的6-苄基腺嘌呤、吲哚乙酸、水杨酸、乙烯丰和脱落酸对乳管分化都没有显著影响.荣莉酸分别与不同浓度吲哚乙酸、水杨酸、乙烯丰共施后,与单独施用茉莉酸比较,对乳管分化没有显著影响.0.08%茉莉酸和0.45%6-苄基腺嘌呤同时施用比单独施用0.08%茉莉酸能诱导形成更多的次生乳管.0.08%茉莉酸和0.53%~0.005 3%的脱落酸共施与单独施0.08%茉莉酸比较,诱导形成的次生乳管有减少趋势.采用酶联免疫技术对巴西橡胶树茎中的异戊烯基腺嘌呤水平进行了初步测定,结果表明,橡胶树顶端伸长单位茎中异戊烯基腺嘌呤含量高于基部伸长单位.施茉莉酸后,无论是基部伸长单位还是顶部伸长单位,异戊烯基腺嘌呤的水平均低于对照,5 d后明显上升,明显高于对照,然后趋于稳定. 展开更多
关键词 巴西橡胶树 乳管分化 茉莉酸 6-苄基腺呋嘌呤 脱落酸 橡胶树
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