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狂犬病病毒CTN株糖蛋白基因的克隆与序列分析 被引量:4
1
作者 高佃平 张曼夫 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期378-384,共7页
克隆分离自我国狂犬病病毒固定毒CTN株糖蛋白基因,分析它的主要功能位点表明它具有319位的糖基化位点和完整的抗原位点,说明其具有用作疫苗株的潜力。并与国内外疫苗株、我国的3株街毒株、CVS株和Mokola毒株进行了同源性分析,表明我国... 克隆分离自我国狂犬病病毒固定毒CTN株糖蛋白基因,分析它的主要功能位点表明它具有319位的糖基化位点和完整的抗原位点,说明其具有用作疫苗株的潜力。并与国内外疫苗株、我国的3株街毒株、CVS株和Mokola毒株进行了同源性分析,表明我国疫苗株和CVS株与我国的街毒株相距最远,而CTN株与我国的3株街毒株相距最近,同属一个分支。 展开更多
关键词 狂犬病 病毒 CTN株 糖蛋白基因 克隆 序列分析 核苷酸序列
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2株甲型肝炎病毒蛋白酶2A核苷酸序列的测定与比较 被引量:1
2
作者 胡凝珠 胡云章 +5 位作者 邵聪文 杨净思 钟光禄 柯华昕 王晓辉 何继红 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第2期137-140,143,共5页
从甲型肝炎病毒 (HAV) 2个不同株 (H2 株和L8株 )感染的KMB17细胞中提取总RNA ,经RT -PCR特异性扩增出此 2毒株病毒蛋白酶 2A基因 ,将 2个 2A基因克隆到pGEM -T载体上 ,经DNA序列测定 ,得到2个 2A基因的核苷酸序列 ,序列比较发现它们间... 从甲型肝炎病毒 (HAV) 2个不同株 (H2 株和L8株 )感染的KMB17细胞中提取总RNA ,经RT -PCR特异性扩增出此 2毒株病毒蛋白酶 2A基因 ,将 2个 2A基因克隆到pGEM -T载体上 ,经DNA序列测定 ,得到2个 2A基因的核苷酸序列 ,序列比较发现它们间及与HAV野毒株 (HM175)相对应序列有突变存在 ,H2 株与HM175相比有一个点突变 ,同源性为 99.72 % ;与HM175比较 ,H2 株和L8株第 3197位核苷酸均由A突变为G ,相应的氨基酸由丝氨酸 (Ser)变为天冬氨酸 (Asp) ;L8株与HM175株相比有 3个点突变 ,同源性为 99.37% ,相应氨基酸均有变化 ;L8株与H2 株相比同源性为 99.6 5 % ,2A区域的变异可能与病毒的生长特性相关 . 展开更多
关键词 甲型肝炎病毒 病毒蛋白酶2A基因 核苷酸序列
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四川省两株脊髓灰质炎Ⅰ型野病毒的核酸序列分析
3
作者 何吉兰 童文彬 +1 位作者 孙莉 秦明辉 《现代预防医学》 CAS 2000年第3期340-341,共2页
目的 :探索脊髓灰质炎 (脊灰 )流行与野毒株性状的关系。方法 :选择了 1991年安岳县和 1992年会东县各一例临床诊断为脊灰的患者 ,从其粪便标本中各分离出一株病毒 ,用微量中和试验进行血清学鉴定 ,PCR— RFL P法进行型内鉴定 ,对 VP1区... 目的 :探索脊髓灰质炎 (脊灰 )流行与野毒株性状的关系。方法 :选择了 1991年安岳县和 1992年会东县各一例临床诊断为脊灰的患者 ,从其粪便标本中各分离出一株病毒 ,用微量中和试验进行血清学鉴定 ,PCR— RFL P法进行型内鉴定 ,对 VP1区 30 0个核苷酸进行测序。结果 :血清学定型均为脊灰 型病毒 ,经 PCR— RFL P法检测 ,判为野病毒。核酸序列分析证实两株病毒与 Sabin 有明显差异为野病毒。两毒株间核酸序列不完全一致 ,有 2 0个核苷酸的差异。结论 :不同年份、不同地方流行株间的序列有差异。四川省脊灰流行与毒株间核酸序列的差异有关。但我国现行疫苗 OPV能有效预防我省脊灰 。 展开更多
关键词 脊灰Ⅰ型野病毒 序列分析 流行株 PCR-RFLP
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我国分离的两株病毒为重组甲病毒 被引量:21
4
作者 何海怀 吕新军 +7 位作者 杨益良 付士红 周国林 张桂筠 陈向伟 梁国栋 金奇 侯云德 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期120-124,共5页
目的 明确我国分离的XJ 90 2 6 0和XJ 910 0 6病毒的分类地位、种系发生和遗传型。方法 特异引物逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)扩增两株病毒的NSP4、E1基因区和 3′端非编码区 ,测序 ,进行核苷酸序列同源性比较和 3′端非编码区核苷... 目的 明确我国分离的XJ 90 2 6 0和XJ 910 0 6病毒的分类地位、种系发生和遗传型。方法 特异引物逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)扩增两株病毒的NSP4、E1基因区和 3′端非编码区 ,测序 ,进行核苷酸序列同源性比较和 3′端非编码区核苷酸序列分析 ,并结合同属其他病毒这些基因区的核苷酸序列进行种系进化分析。结果 两株病毒的核苷酸序列同源性为 10 0 % ,与西方马脑炎病毒的核种酸序列同源性最高 ,具有西方马脑炎病毒 3′端非编码区结构特征 ,其NSP4基因区与东方马脑炎病毒同源 ,E1基因区与辛德毕斯病毒同源 ,两株病毒均位于西方马脑炎病毒B组 ,与西方马脑炎病毒俄罗斯分离株进化关系最近。结论 我国分离的XJ 90 2 6 0和 910 0 6病毒属于西方马脑炎病毒同一遗传型 ,均为重组甲病毒。 展开更多
关键词 披膜病毒科 甲病毒属 核苷酸类/分析 种系发生/分析 西方马脑炎病毒
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三种分子生物学数据库的格式和使用
5
作者 张闻 刘世熙 曹槐 《自然杂志》 1998年第1期41-44,共4页
本文介绍三大分子生物学数据库——蛋白质及生物分子三维结构数据库PDB、瑞士蛋白质序列及注解数据库SWISS-PROT和国际核酸序列数据库EMBL/GenBank/DDBJ的发展情况,以及从Internet检索和调用其数据记录方法,列表给出了三大数据库的记录... 本文介绍三大分子生物学数据库——蛋白质及生物分子三维结构数据库PDB、瑞士蛋白质序列及注解数据库SWISS-PROT和国际核酸序列数据库EMBL/GenBank/DDBJ的发展情况,以及从Internet检索和调用其数据记录方法,列表给出了三大数据库的记录格式和标题调整含义,并简介了Internet上其他生物学数据库的发展情况和调用方法. 展开更多
关键词 PDB 国际核酸序列 数据库 INTERNET
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人转化生长因子-β基因的分离及鉴定 被引量:1
6
作者 于英杰 赵顺敏 《基础医学与临床》 CSCD 1992年第2期29-31,共3页
利用人工合成的寡聚核苷酸作为探针,从人胎盘cDNA文库中筛选得到人TGF-β的cDNA,并进行核苷酸序列的测定和分析。
关键词 转化生长因子 Β基因 核苷酸序列
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人谷胱甘肽S-转移酶基因π(cDNA)的筛选和鉴定
7
作者 方福德 张敏磊 左瑾 《基础医学与临床》 CSCD 1994年第3期33-36,共4页
采用免疫筛选法和寡核苷酸探针筛选法从人肺cDNA文库中筛选得到人GST一pi(GST-x)cDNA,对其序列进行了测定和分析。
关键词 人类 谷胱甘肽S 转移酶 CDNA 肿瘤
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利用Pearson相关系数定量分析生物亲缘关系 被引量:103
8
作者 张宇镭 党琰 贺平安 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2005年第33期79-82,99,共5页
论文主要利用计算语言学中使用的统计学方法定量分析生物物种的亲缘关系。以包含生物体遗传信息的核酸序列为研究对象,采用计算语言学的思想和方法,将每一个生物体的核酸序列看作一篇很长的自然语言文本,抽取核酸序列的双核苷酸频率分... 论文主要利用计算语言学中使用的统计学方法定量分析生物物种的亲缘关系。以包含生物体遗传信息的核酸序列为研究对象,采用计算语言学的思想和方法,将每一个生物体的核酸序列看作一篇很长的自然语言文本,抽取核酸序列的双核苷酸频率分布特征向量,用以表征其数字特征。而后采用PearsonCorrelationCoefficient(Pearson相关系数)定量分析其亲缘关系的远近程度。将119个细菌的全基因组核酸序列进行两两比对,对所得的7021个r值进行分析,得出的结论是:亲缘关系越相近的物种,其Pearson相关系数越大。取定0.985作为“属”的分界阈值时,得到召回率为75.824%,准确率为73.404%。论文对定量分析生物学核酸序列的相似性和对生物亲缘关系远近的建模有重要的实际意义。 展开更多
关键词 Pearson相关系数 核酸序列 自然语言文本
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浙江和河北发生的一种水稻、小麦、玉米矮缩病是水稻黑条矮缩病毒引起的(英文) 被引量:85
9
作者 张恒木 雷娟利 +4 位作者 陈剑平 吕永平 陈声祥 薛庆中 M.J.Adams 《中国病毒学》 CSCD 2001年第3期246-251,共6页
以浙江省的水稻黑条矮缩病和河北省的玉米粗缩病的病毒分离物为材料 ,对我国南北方两种病毒分离物进行了比较研究。两种病毒分离物的粒子大小形态相似 ,且在血清学上密切相关 ;二者的介体、寄主相同 ,并引起相同的症状。提纯两种病毒分... 以浙江省的水稻黑条矮缩病和河北省的玉米粗缩病的病毒分离物为材料 ,对我国南北方两种病毒分离物进行了比较研究。两种病毒分离物的粒子大小形态相似 ,且在血清学上密切相关 ;二者的介体、寄主相同 ,并引起相同的症状。提纯两种病毒分离物的基因组片段凝胶电泳显示它们相应的基因组片段之间大小极其相似。根据水稻黑条矮缩病毒 (Riceblackstreakeddwarfvirus) ,RBSDV的S7和S8设计引物 ,利用RT PCR技术 ,在两种病毒分离物中均可特异扩增到预期大小的片段。序列测定比较分析表明 :它们的同源性达 97.0 %~ 98.9% ,与日本RBSDV的同源性 (92 .2 %~ 95 .5 % )高于与意大利MRDV的同源性 (76 .6 %~ 88.4% )。从而认为我国南方的水稻黑条矮缩病和北方和玉米粗缩病都是同一种病毒———RBSDV引起的 ,也就是说我国北方的玉米粗缩病病原实际上是水稻黑条矮缩病毒 ,而不是玉米粗缩病毒。 展开更多
关键词 水稻黑条矮缩病毒 玉米粗缩病毒 核苷酸序列
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中国人丙型肝炎病毒基因组的一级结构及其变异 被引量:73
10
作者 毕胜利 白宪鹤 +4 位作者 丛勉尔 田厚文 孙得贵 H.S.Margolis 刘崇柏 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第2期114-127,共14页
自河北省固安县和上海市的两份急性丙型肝炎病人血清分离丙型肝炎病毒RNA,纯化后经反转录和聚合酶链反应(PCR)获得覆盖病毒基因组全长的cDNA片段。通过对河北株丙型肝炎病毒基因全部cDNA序列的分析,以及对上海株丙型肝炎病毒部分重要区... 自河北省固安县和上海市的两份急性丙型肝炎病人血清分离丙型肝炎病毒RNA,纯化后经反转录和聚合酶链反应(PCR)获得覆盖病毒基因组全长的cDNA片段。通过对河北株丙型肝炎病毒基因全部cDNA序列的分析,以及对上海株丙型肝炎病毒部分重要区域cDNA序列的分析,确定了中国人丙型肝炎病毒基因cDNA的一级结构和变异趋势。实验结果表明,中国人丙型肝炎病毒的基因结构同日本与美国研究人员最初分离的丙型肝炎病毒基因结构相似。以中国河北株与日本HCV-J株比较,病毒基因有771个核苷酸不同,两者同源性为91.8%;氨基酸残基有174个不同,其同源性为94.3%。与美国HCV-1株相比,中国河北株有2011个棱苷酸发生变化,同源性为78.6%;氨基酸残基有458个发生变化,同源性为84.9%。河北与上海两株比较的结果发现,各区域变异程度大小不同,以E2基因区最高,NS3—NS4,NS5高度保守。总体水平上分析,我国的两株丙型肝炎病毒基因虽有变异,但总变异率很低,并且变异主要发生在结构基因区域。而与国外丙型肝炎病毒相比,变异则贯穿于全基因。表明中国丙型肝炎病毒基因组在核苷酸水平上有一定的共同特征。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 聚合酶链反应 结构
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猪流行性腹泻病毒中国地方流行株LJB/03M基因的克隆与序列分析 被引量:38
11
作者 范京惠 郎景华 +2 位作者 吴凌 张海峰 李一经 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2005年第7期7-9,共3页
从黑龙江某猪场疑似猪流行性腹泻猪的粪便中提取总RNA,采用RT-RCR方法扩增,首次获得中国地方流行株PEDVM全基因序列,将其克隆到pMD18-T载体中进行测序,克隆的M基因核苷酸序列由681个核苷酸组成,含有一个完整的开放阅读框架,编码226个氨... 从黑龙江某猪场疑似猪流行性腹泻猪的粪便中提取总RNA,采用RT-RCR方法扩增,首次获得中国地方流行株PEDVM全基因序列,将其克隆到pMD18-T载体中进行测序,克隆的M基因核苷酸序列由681个核苷酸组成,含有一个完整的开放阅读框架,编码226个氨基酸。与国外已发表的其他毒株进行基因进化分析,GenBank中的6株PEDV形成的基因进化树具有3个分支。其中分离株LJB/03形成一个独立的分支,说明LJB/03的M基因序列与其他毒株相比,发生了一定的变异。 展开更多
关键词 流行性腹泻病毒 M基因 克隆 序列测定
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魁蚶核糖体DNA基因转录间隔区的序列特征 被引量:28
12
作者 陈琳琳 孔晓瑜 +2 位作者 周立石 陈丽梅 喻子牛 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期104-108,共5页
以相应引物PCR扩增魁蚶(Scapharcabroughtonii)的核糖体转录间隔子ITS 1和ITS 2片段,测序后得到长度分别为461bp和533bp的核苷酸序列(含引物)。其中A、T、G、C4种碱基的含量分别为21 91%、24 73%、28 20%和25 16%(ITS 1),27 02%、25 52%... 以相应引物PCR扩增魁蚶(Scapharcabroughtonii)的核糖体转录间隔子ITS 1和ITS 2片段,测序后得到长度分别为461bp和533bp的核苷酸序列(含引物)。其中A、T、G、C4种碱基的含量分别为21 91%、24 73%、28 20%和25 16%(ITS 1),27 02%、25 52%、25 52%和21 95%(ITS 2)。将这2个片段与其他双壳贝类的相应片段进行比较,发现ITS 1和ITS 2引物在贝类中具有良好的通用性。比较几种贝类的ITS 1片段发现有1~100bp长度不等、弥散状态的插入/缺失;对5种蚶科贝类的ITS 2相应片段进行比较,发现中间有75bp的保守区域,与本研究在魁蚶ITS 2群体序列研究中观察到的情况相同。 展开更多
关键词 魁蚶 核苷酸序列 ITS-1 ITS-2
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栉孔扇贝核糖体DNA转录间隔子序列研究及其潜在应用(英文) 被引量:18
13
作者 喻子牛 孔晓瑜 +2 位作者 庄志猛 刘亚军 宋林生 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期6-9,共4页
以相应引物PCR扩增栉孔扇贝 (Chlamysfarreri)核基因组的核糖体DNA两个转录间隔子 (ITS - 1和ITS - 2 ) ,PCR产物经T载体连接后进行克隆、测序 ,分别得到了 340bp和 510bp的碱基序列 ,序列大小非常适合遗传变异及分子系统学研究。其A、T... 以相应引物PCR扩增栉孔扇贝 (Chlamysfarreri)核基因组的核糖体DNA两个转录间隔子 (ITS - 1和ITS - 2 ) ,PCR产物经T载体连接后进行克隆、测序 ,分别得到了 340bp和 510bp的碱基序列 ,序列大小非常适合遗传变异及分子系统学研究。其A、T、G、C含量在ITS - 1分别为 32 .0 6 % ,2 0 .59% ,2 2 .35%和2 5.0 0 % ,在ITS - 2分别为 30 .0 0 % ,2 1.37% 2 4 .12 %和 2 4 .51%。这两个变异性较大的序列在扇贝种群中应用潜力很大 ,可广泛用于种内群体间遗传变异研究、种质鉴别及系统学研究。 展开更多
关键词 栉孔扇贝 ITS-1 ITS-2 基因序列 核糖体DNA 转录间隔子
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美国白蛾核型多角体病毒几丁质酶基因核苷酸序列研究 被引量:14
14
作者 贡成良 小林淳 +2 位作者 宫岛成寿 金伟 吴祥甫 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期260-269,共10页
美国白蛾核型多角体病毒( Hc N P V) 编码的几丁质酶 A( Chitinase A, Chi A) 基因定位在 Hind Ⅲ- 35kb 片段上。 D N A 测序表明,半胱氨酸蛋白酶( C P) 基因的5'上游反向存在 C... 美国白蛾核型多角体病毒( Hc N P V) 编码的几丁质酶 A( Chitinase A, Chi A) 基因定位在 Hind Ⅲ- 35kb 片段上。 D N A 测序表明,半胱氨酸蛋白酶( C P) 基因的5'上游反向存在 Chi A基因, Chi A 基因的 O R F 为1 662 个核苷酸,编码553 个氨基酸,5'、3'非编码区分别具有 T A A G 基序和 A A T A A Apoly( A+ ) 信号序列。同源性分析表明, Hc N P V 的 Chi A 与苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒、家蚕核型多角体病毒的 Chi A ,在 D N A 水平上的同源性分别为753 % 、757 % ,在氨基酸水平上的同源性分别为750 % 、787 % ,与来自灵菌的 Chi A 比较,一致性氨基酸达51 % ,推测杆状病毒几丁质酶基因与细菌几丁质酶基因可能具有共同的祖先。 展开更多
关键词 美国白蛾核型多角体病毒 几丁质酶 核苷酸序列
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河套蜜瓜ACC合成酶cDNA片段的克隆和序列分析 被引量:9
15
作者 尹俊 哈斯阿古拉 方天祺 《生物技术》 CAS CSCD 1997年第3期10-13,共4页
1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合成酶是高等植物中乙烯生物合成的关键酶。以成熟河套蜜瓜(CucumismeloL.cvHetau)果实的RNA为模板,经反转录和PCR扩增得到预期大小的DNA片段,插入到pUC19的SmaⅠ位点后转化E.coliJM109,筛选出重组子pH... 1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合成酶是高等植物中乙烯生物合成的关键酶。以成熟河套蜜瓜(CucumismeloL.cvHetau)果实的RNA为模板,经反转录和PCR扩增得到预期大小的DNA片段,插入到pUC19的SmaⅠ位点后转化E.coliJM109,筛选出重组子pHMAS1。序列分析表明获得了长627bp的ACC合成酶cDNA片段。与已报道的ACC合成酶基因相应序列比较有很高的同源性. 展开更多
关键词 河套蜜瓜 ACC合成酶 CDNA 克隆 序列分析
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中国棉铃虫单粒包埋核型多角体病毒多角体蛋白基因的序列分析 被引量:15
16
作者 陈新文 胡志红 +4 位作者 JustM.Vlak(DepartmentofVirology WageningenAgriculturalVniversity Binnenhaven11 7609PDWageningen TheNetherlands) 《中国病毒学》 CSCD 1997年第4期346-353,共8页
以AcMNPV的多角体蛋白基因为探针,定位了中国棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HaSNPV)的多用体蛋白基因。序列测定表明,HaSNPV的多角体蛋白基因编码区为738个核苷酸,编码246个氨基酸,预计蛋白质分子量为29kDa。同源性分析表明,HaS... 以AcMNPV的多角体蛋白基因为探针,定位了中国棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HaSNPV)的多用体蛋白基因。序列测定表明,HaSNPV的多角体蛋白基因编码区为738个核苷酸,编码246个氨基酸,预计蛋白质分子量为29kDa。同源性分析表明,HaSNPV与美洲棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HzSNPV)具有最高的同源性,在整个阅读框架中只有4个碱基的差异,其中第179位碱基的变化导致唯一的氨基酸变化,这种变化并未导致其二级结构的改变。此外,两种病毒该基因的启动子结构也完全一样。HaSNPV与其它的SNPV和MNPV的同源性明显要低。结果预示HaSNPV与HzSNPV可能为同种病毒的不同变种。 展开更多
关键词 棉铃虫病毒 核型多角体病毒 多角体蛋白 基因
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我国分离的甲病毒YN87448毒株全部结构区基因核苷酸的序列测定及分析 被引量:18
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作者 周国林 梁国栋 +6 位作者 李蕾 付士红 李福胜 金奇 张海林 黄文丽 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期205-211,共7页
Y N87448 毒株1986 年分离自云南傣族52 岁女发热病人的血液标本,曾用血清学方法鉴定为披膜病毒科甲病毒属。用我们创立的单引物差异 R T- P C R 方法及简并引物 R T- P C R 法均已证明:该病毒为甲病毒属... Y N87448 毒株1986 年分离自云南傣族52 岁女发热病人的血液标本,曾用血清学方法鉴定为披膜病毒科甲病毒属。用我们创立的单引物差异 R T- P C R 方法及简并引物 R T- P C R 法均已证明:该病毒为甲病毒属的辛德毕斯样病毒( Sindbis - like virus) 。本研究从甲病毒属的病毒基因序列的共同保守区,设计4 对引物。用 R T- P C R 方法扩增,再将扩增片段分别连结克隆到p G E M- T 载体。通过对4 个克隆的测序完成了对 Y N87448 毒株的全部结构区基因序列的测定,结果表明:(1) Y N87448 病毒的全部结构区基因序列长度为4 059 个核苷酸( 不包括多聚腺苷酸尾) ;(2) Y N87448 病毒的全部结构区基因与辛德毕斯病毒家族中毒力最强的、唯一能致成年小鼠100 % 死亡的、南非分离的辛德毕斯样病毒 S A A R86 株相应基因的核苷酸序列同源性为99 % ,但 Y N87448 毒株不致成年小鼠死亡;(3) 二者基因结构上有一点大的差异是, Y N87448 病毒位于基因组8 641bp 处的结构区基因 E2 和 E3 之间多出3 个核苷酸( A A A) ;(4) 与其它甲属病毒的进化树比较来看? 展开更多
关键词 辛德毕斯样病毒 克隆 RT-PCR 核苷酸 序列
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中国狂犬病毒疫苗株(3aG株)糖蛋白cDNA的核苷酸序列测定和分析 被引量:12
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作者 白宪鹤 古漓 +1 位作者 王树声 Georger M.Bear 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第2期128-135,共8页
本文报告了中国狂犬病毒疫苗株(3aG株)糖蛋白cDNA的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列。完整的糖蛋白基因从起始密码ATG到终止密码TGA共有1575个核苷酸残基,编码524个氨基酸残基的多肽链。4种核苷酸的组成分别为:A占27%,T占26%,C占22%,... 本文报告了中国狂犬病毒疫苗株(3aG株)糖蛋白cDNA的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列。完整的糖蛋白基因从起始密码ATG到终止密码TGA共有1575个核苷酸残基,编码524个氨基酸残基的多肽链。4种核苷酸的组成分别为:A占27%,T占26%,C占22%,G占25%。SaG株的糖蛋白全基因的核苷酸序列与巴斯德株(PV株)和国际标准攻击毒株(CVS株)的糖蛋白基因序列的同源性分别为91.17%和89.44%。其氨基酸推导序列与PV株和CVS株的相比,同源性分别为89.89%和86.83%。3aG株有3个N-糖基化位点,分别位于第37、247和319位的氨基酸残基上。糖蛋白膜外区部分特征抗原位点的比较显示,3aG株、PV株及CVS株有高度同源性。 展开更多
关键词 狂犬病毒 糖蛋白 基因 核苷酸序列
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人癌细胞线粒体DNA控制区序列特征分析 被引量:14
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作者 胡义德 钱桂生 +2 位作者 李淑平 陈维中 毛宝龄 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期1-5,共5页
为了探讨癌细胞 mt D N A 控制区序列的变化特征, 采用 P C R 产物限制性片段长度多态性( P C R- R F L P) 分析与直接测序相结合的方法, 对比分析6 株人癌细胞系、6 例癌患者及4 例健康成人白细胞mt D N ... 为了探讨癌细胞 mt D N A 控制区序列的变化特征, 采用 P C R 产物限制性片段长度多态性( P C R- R F L P) 分析与直接测序相结合的方法, 对比分析6 株人癌细胞系、6 例癌患者及4 例健康成人白细胞mt D N A 控制区序列。发现第16519 位 T→ C、16 534 位 A→ G、46 位 T→ G 和49 位 A→ C 突变,在癌细胞系和癌患者白细胞mt D N A 中分别占50 % (3/6) 和333 % (2/6) , 健康成人白细胞mt D N A 中未见此类型突变; 第16 278 位 C→ T 突变, 在癌细胞系 mt D N A 中占50 % (3/6) , 显著高于正常人群mt D N A 中此位点的多态性变异。表明癌细胞和癌患者白细胞 mt D N A 重链复制起点及其 相邻 D 环区的特征性突变可能与细胞癌变/ 或癌的易感性有关。 展开更多
关键词 人癌细胞系 线粒体DNA 控制区 核苷酸序列 突变
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棉铃虫核型多角体病毒几丁质酶基因及杆状病毒几丁质酶基因的分子进化 被引量:10
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作者 张传溪 林欣大 吴峻 《昆虫学报》 CSCD 北大核心 2000年第3期233-241,共9页
用PCR方法扩增了棉铃虫Helicoverpaarmigera单粒包埋型核型多角体病毒 (HaSNPV)几丁质酶基因 ,测定了基因编码区的核苷酸全序列。基因编码区全长 1713bp,可编码 570个氨基酸残基组成的多肽 ,预计分子量为 6 3 6kD。将所推导的HaSNPV几... 用PCR方法扩增了棉铃虫Helicoverpaarmigera单粒包埋型核型多角体病毒 (HaSNPV)几丁质酶基因 ,测定了基因编码区的核苷酸全序列。基因编码区全长 1713bp,可编码 570个氨基酸残基组成的多肽 ,预计分子量为 6 3 6kD。将所推导的HaSNPV几丁质酶氨基酸序列与其它已知杆状病毒几丁质酶氨基酸序列进行联配比较 ,结果表明HaSNPV与谷实夜蛾H .zea单粒包埋型核型多角体病毒 (HzSNPV)的氨基酸序列非常相似 ,同源性高达 90 7% ,与苜蓿丫纹夜蛾Autographacalifornica多粒包埋型核型多角体病毒 (AcMNPV)、家蚕Bombyxmori核型多角体病毒 (BmNPV)、美国白蛾Hyphantriacunea核型多角体病毒 (HcNPV)、舞毒蛾Lymantriadispar多粒包埋型核型多角体病毒 (LdMNPV)、黄杉毒蛾Orgyiapseudotsugata多粒包埋型核型多角体病毒 (OpMNPV)和云杉卷叶蛾Choristoneurafumiferana核型多角体病毒 (CfMNPV)氨基酸序列同源性分别为 6 4 4 %、 6 4 9%、 6 4 2 %、 6 2 9%、 6 6 2 %和 6 1 5%。根据氨基酸序列用PC\GENE程序绘制已知杆状病毒几丁质酶的分子系统树 ,并与杆状病毒中最为保守的多角体蛋白基因系统树作了比较 ,结果表明几丁质酶基因和多角体蛋白基因的进化速率是不尽相同的。 展开更多
关键词 HANPV 几丁质酶基因 核苷酸序列 杆状病毒
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