目的:通过生物信息学分析Nod样受体pyrin结构域蛋白6(Nod-like receptor pyrin domain-containing protein 6,NLRP6)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达模式、生物学功能和免疫细胞浸润关系。方法:利用癌症和肿瘤基因图...目的:通过生物信息学分析Nod样受体pyrin结构域蛋白6(Nod-like receptor pyrin domain-containing protein 6,NLRP6)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达模式、生物学功能和免疫细胞浸润关系。方法:利用癌症和肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)、国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium,ICGC)、基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库及TIMER 2.0数据库、HCCDB数据库、人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas,HPA)数据库、基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析NLRP6在HCC中的表达模式、临床预后价值。通过Enrichr数据库分析NLRP6的生物学功能。分析NLRP6表达与HCC免疫细胞浸润关系。此外,基于NLRP6表达构建Nomogram模型预测HCC患者预后。结果:NLRP6表达在多种类型肿瘤(包括HCC)中下调(P<0.05),其低表达与HCC不良预后相关(P<0.05)。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,EGGK)信号通路和基因本体论(gene ontology,GO)分析结果揭示,NLRP6参与炎症-免疫调节反应,包括原发性免疫缺陷、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、Th1和Th2细胞分化等信号通路。NLRP6表达与B细胞(r=-0.202)、CD4^(+)T细胞(r=-0.207)、CD8^(+)T细胞(r=0.153)、中性粒细胞(r=0.201)、巨噬细胞(r=-0.133)和髓树突状细胞(r=-0.245)浸润丰度显著相关;高中性粒细胞浸润丰度与HCC患者更差生存预后相关(P<0.05)。基于NLRP6表达、年龄和TNM分期的Nomogram模型能有效预测HCC患者1年、3年及5年总生存率,提供显著临床净收益。结论:NLRP6可能参与HCC发病机制,与炎症-免疫调节及免疫细胞浸润相关。基于NLRP6表达的Nomogram模型能有效预测HCC患者预后,为临床医师治疗HCC提供新的思路。展开更多
NOD样受体家族含pyrin结构域蛋白3(NOD-like receptor family pyrin domain-containing protein 3,NLRP3)炎症小体是一种蛋白质复合体,可促进Caspase的活化和IL-1β的成熟,在多种炎症的发生、发展过程中起促进作用。牙周炎(periodontiti...NOD样受体家族含pyrin结构域蛋白3(NOD-like receptor family pyrin domain-containing protein 3,NLRP3)炎症小体是一种蛋白质复合体,可促进Caspase的活化和IL-1β的成熟,在多种炎症的发生、发展过程中起促进作用。牙周炎(periodontitis,PD)的发生与牙周组织的菌群失调有关,NLRP3炎症小体参与中性粒细胞、巨噬细胞、破骨细胞(osteoclast,OC)和人牙周膜成纤维细胞(human periodontal liqament fibroblast,HPLF)的活化过程。该文归纳了相关免疫细胞及基质细胞的NLRP3炎症小体对PD的影响,并简述了与NLRP3炎症小体相关的PD治疗新思路。展开更多
为探究成人癫痫患者血清NOD样受体家族含pyrin结构域蛋白3(NOD-like receptor family pyrin domain-containing protein 3, NLRP3)水平对短期内(≤7 d)癫痫再发风险的预测价值,收集2018年9月—2019年8月于滨州医学院附属医院收治的61例...为探究成人癫痫患者血清NOD样受体家族含pyrin结构域蛋白3(NOD-like receptor family pyrin domain-containing protein 3, NLRP3)水平对短期内(≤7 d)癫痫再发风险的预测价值,收集2018年9月—2019年8月于滨州医学院附属医院收治的61例癫痫患者,其中丛集性发作者30例,非丛集性发作者31例。采集患者的一般资料,ELISA检测血清NLRP3炎症小体水平。根据住院后7 d内癫痫是否再发,分为癫痫再发组和未再发组,对一般资料进行统计学分析。随访过程中,有13例患者癫痫再次发作,比较2组发现,NLRP3水平、年龄、丛集性癫痫发生率有显著差异(均P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,NLRP3水平及年龄是癫痫患者短期内(≤7 d)再发的独立危险因素(均P<0.05)。NLRP3水平预测癫痫患者短期内再发的AUC为0.769(95%CI:0.608~0.931),截止值91.47μg/L,敏感度84.6%,特异度64.6%。以上结果表明,NLRP3水平对成人癫痫短期内再发有一定预测价值,阻断NLRP3生成可能有助于癫痫的治疗。展开更多
文摘目的:通过生物信息学分析Nod样受体pyrin结构域蛋白6(Nod-like receptor pyrin domain-containing protein 6,NLRP6)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达模式、生物学功能和免疫细胞浸润关系。方法:利用癌症和肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)、国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium,ICGC)、基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库及TIMER 2.0数据库、HCCDB数据库、人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas,HPA)数据库、基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析NLRP6在HCC中的表达模式、临床预后价值。通过Enrichr数据库分析NLRP6的生物学功能。分析NLRP6表达与HCC免疫细胞浸润关系。此外,基于NLRP6表达构建Nomogram模型预测HCC患者预后。结果:NLRP6表达在多种类型肿瘤(包括HCC)中下调(P<0.05),其低表达与HCC不良预后相关(P<0.05)。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,EGGK)信号通路和基因本体论(gene ontology,GO)分析结果揭示,NLRP6参与炎症-免疫调节反应,包括原发性免疫缺陷、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、Th1和Th2细胞分化等信号通路。NLRP6表达与B细胞(r=-0.202)、CD4^(+)T细胞(r=-0.207)、CD8^(+)T细胞(r=0.153)、中性粒细胞(r=0.201)、巨噬细胞(r=-0.133)和髓树突状细胞(r=-0.245)浸润丰度显著相关;高中性粒细胞浸润丰度与HCC患者更差生存预后相关(P<0.05)。基于NLRP6表达、年龄和TNM分期的Nomogram模型能有效预测HCC患者1年、3年及5年总生存率,提供显著临床净收益。结论:NLRP6可能参与HCC发病机制,与炎症-免疫调节及免疫细胞浸润相关。基于NLRP6表达的Nomogram模型能有效预测HCC患者预后,为临床医师治疗HCC提供新的思路。
文摘NOD样受体家族含pyrin结构域蛋白3(NOD-like receptor family pyrin domain-containing protein 3,NLRP3)炎症小体是一种蛋白质复合体,可促进Caspase的活化和IL-1β的成熟,在多种炎症的发生、发展过程中起促进作用。牙周炎(periodontitis,PD)的发生与牙周组织的菌群失调有关,NLRP3炎症小体参与中性粒细胞、巨噬细胞、破骨细胞(osteoclast,OC)和人牙周膜成纤维细胞(human periodontal liqament fibroblast,HPLF)的活化过程。该文归纳了相关免疫细胞及基质细胞的NLRP3炎症小体对PD的影响,并简述了与NLRP3炎症小体相关的PD治疗新思路。
