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题名烟草TIR-NBS基因家族的生物信息学分析
被引量：2
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作者
董亚萍
杨仕梅
赵德刚
宋莉
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机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院
贵州省农业科学院
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出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期891-900,共10页
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基金
国家转基因生物新品种培育科技重大专项项目(2016ZX08010003)
贵州省科技计划项目(黔科合基础[2017]1044号,黔科合平台人才[2017]5788号)。
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文摘
TIR-NBS基因是一类与植物抗病调节和生长发育密切相关的基因,其特征解析有助于对植物免疫和发育调节的认识。该研究通过生物信息学分析方法,从基因鉴定、染色体分布、基因结构、蛋白性质和结构、信号肽、亚细胞定位和顺式作用元件等方面,对烟草TIR-NBS基因家族进行了鉴定和分子特性分析。结果表明:烟草TIR-NBS基因家族含有30条成员,分布在21条染色体上,含有3~8个保守基序;编码蛋白均为不稳定蛋白,无信号肽,主要分布于细胞核、细胞质和叶绿体中,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要构成元件;进化时主要受纯化选择作用,与番茄的TIR-NBS基因亲缘关系最近;顺式作用元件分析表明其可能受光照、温度以及生长素、茉莉酸甲酯、脱落酸、水杨酸、赤霉素等激素调控。该研究结果为进一步探究TIR-NBS基因的生物学功能及提高植物产量和品质提供了依据。
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关键词
烟草
抗病调节
生长发育
植物免疫
TIR-NBS基因家族
生物信息学分析
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Keywords
nicotiana attenuata(tobacco)
disease resistance regulation
growth and development
plant immunity
TIR-NBS gene family
bioinformatics analysis
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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