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神经元钙传感蛋白研究前沿与热点分析 被引量:3
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作者 朱玉珍 张庆文 《中国组织工程研究》 CAS CSCD 2014年第42期6856-6862,共7页
背景:神经元钙传感蛋白的研究前沿和热点始终是这一领域的研究者共同关注的焦点。目的:从定量的层面探测神经元钙传感蛋白的前沿领域与研究热点。方法:以ISI的Web of Science数据库中1982至2014年363篇神经元钙传感蛋白相关文献为分析对... 背景:神经元钙传感蛋白的研究前沿和热点始终是这一领域的研究者共同关注的焦点。目的:从定量的层面探测神经元钙传感蛋白的前沿领域与研究热点。方法:以ISI的Web of Science数据库中1982至2014年363篇神经元钙传感蛋白相关文献为分析对象,采用文献共被引分析方法和词频分析方法,运用CiteSpaceⅢ可视化软件绘制神经元钙传感蛋白文献共被引网络图谱和关键词共现图谱,结合突现节点文献二次检索的方法,梳理并揭示神经元钙传感蛋白的研究前沿与热点。结果与结论:神经元钙传感蛋白的研究前沿与热点是蛋白质的生理功能,研究热点转变的时间点是1994至1996年,2000年,2008年和2012年。在不同时间阶段,其研究热点也表现出一定的差异性,1992至2000年研究热点是蛋白质的结构和性质,2004至2012年主要集中于研究蛋白质的功能和作用机制。而2008至2014年研究热点是在蛋白质生理功能的研究基础上,更侧重于这一蛋白质的高级功能(如记忆)和各种疾病(如精神分裂症、肿瘤、抑郁症、老年痴呆症、神经元损伤等)的研究。神经元钙传感蛋白前沿领域与研究热点的确定,为今后的研究提供一定的参考。 展开更多
关键词 组织构建 组织工程 神经元钙传感蛋白 研究前沿 研究热点 科学知识图谱 CITESPACE 可视化 精神病学
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神经元钙传感蛋白R102Q突变体的动力学构象特征 被引量:2
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作者 朱玉珍 张庆文 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2015年第2期225-230,共6页
背景:神经元钙传感蛋白参与多种生理功能,在大脑皮质不同脑区都有很高的分布。在自闭症患者基因测序中识别出神经元钙传感蛋白第102个氨基酸精氨酸ARG102突变成谷氨酰胺Glu102(R102Q)。实验研究显示,R102Q突变对神经元钙传感蛋白局部区... 背景:神经元钙传感蛋白参与多种生理功能,在大脑皮质不同脑区都有很高的分布。在自闭症患者基因测序中识别出神经元钙传感蛋白第102个氨基酸精氨酸ARG102突变成谷氨酰胺Glu102(R102Q)。实验研究显示,R102Q突变对神经元钙传感蛋白局部区域影响很大,发生本质性的构象改变。目的:确定神经元钙传感蛋白单一氨基酸R102Q突变引起结构构象动力学变化的具体原因。方法:采用计算机分子动力学模拟的方法,进行6个独立的、模拟时间是450 ns的全原子动力学模拟。结果与结论:1神经元钙传感蛋白R102Q突变对蛋白整体结构影响不大,在整个模拟过程中都没有进行大的构象重组,但导致螺旋改变,结构更加稳定。2R102Q突变导致盐桥网络发生改变,一方面降低了L2的柔性,使其更加稳定;另一方面改变L3在疏水口袋中的位置,使其在疏水口袋中更加舒展。结果表明,螺旋在蛋白结构稳定中起到一定的作用,盐桥改变也是蛋白动力学变化的重要原因。这项研究可能从分子的层面和结构的视角,为与R102Q突变有关的蛋白质功能缺失提供理论参考。 展开更多
关键词 组织构建 组织工程 神经元钙传感蛋白 R102Q突变 盐桥 自闭症 神经系统 分子动力学
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NaCl浓度改变对人类神经元钙传感蛋白结构的影响:来自分子动力学模拟证据
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作者 朱玉珍 李云翔 +1 位作者 蔡皓 张庆文 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2018年第16期2549-2557,共9页
背景:人类神经元钙传感蛋白是一个含有高电荷的蛋白,对溶液温度极其敏感,但溶液中离子浓度的变化是否能够改变蛋白结构,进而影响其正常功能的发挥,尚未发现相关研究。目的:探讨溶液中NaCl浓度的微小改变对人类神经元钙传感蛋白结构动力... 背景:人类神经元钙传感蛋白是一个含有高电荷的蛋白,对溶液温度极其敏感,但溶液中离子浓度的变化是否能够改变蛋白结构,进而影响其正常功能的发挥,尚未发现相关研究。目的:探讨溶液中NaCl浓度的微小改变对人类神经元钙传感蛋白结构动力学影响的分子机制。方法:采用全原子计算机动力学模拟的方法,将蛋白质数据库中ID为2LCP的人类神经元钙传感蛋白前两个能量最低的结构作为初始结构,能量最小化后,将蛋白置于NaCl浓度分别为0.1,0.3和1 mol/L的水溶液中,以高速摄像速度(ps,10-12s)记录蛋白在模拟体系中的运行和变化情况。结果与结论:溶液中NaCl浓度升高,(1)人类神经元钙传感蛋白柔性增加,整体结构和局部的疏水口袋体积增大;(2)蛋白C端尾部L3蜷缩,首尾氨基酸D176和V190之间的次联系路径数量明显减少,导致两者之间的联系减弱;(3)蛋白N段和C段氨基酸之间的联系削弱,但两段段内氨基酸联系明显增强;(4)蛋白正负电荷间形成的盐桥数量和百分比均降低,尤其在0.3 mol/L NaCl水溶液中的减少更为明显。(5)结果说明,人类神经元钙传感蛋白对溶液NaCl浓度的改变非常敏感,NaCl浓度的微小变化能够引起蛋白关键结构的改变,从原子-分子的视角,为人类神经元钙传感蛋白在不同溶液环境中的结构变化提供理论参考。 展开更多
关键词 神经细胞钙离子传感蛋白质类 氯化钠 蛋白质结构 四级 动力学 计算机模拟 组织工程 人类神经元钙传感蛋白 NaCl浓度 结构特性 动态网络分析 盐桥 计算机分子动力学模拟
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