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UHPLC-QTOF-MS联合网络药理学-分子对接及动物实验探讨芎麻汤有效部位治疗偏头痛的作用机制 被引量：1
1
作者 刘顶鼎 王静茹 +5 位作者 常露露 朱蔷 刘耀 刘冬 吴雪梅 曾贵荣 《中国医院药学杂志》 CAS 北大核心 2023年第18期2023-2031,共9页
目的:运用UHPLC-QTOF-MS、网络药理学-分子对接技术及动物实验探讨芎麻汤有效部位治疗偏头痛的物质基础和作用机制。方法:采用UHPLC-QTOF-MS技术测定芎麻汤有效部位化学成分,并运用PubChem、Swiss Target Prediction数据库预测其靶点;从... 目的:运用UHPLC-QTOF-MS、网络药理学-分子对接技术及动物实验探讨芎麻汤有效部位治疗偏头痛的物质基础和作用机制。方法:采用UHPLC-QTOF-MS技术测定芎麻汤有效部位化学成分,并运用PubChem、Swiss Target Prediction数据库预测其靶点;从GeneCards数据库获取偏头痛相关靶点;通过Venny平台筛选交集靶点,Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络;运用String数据库构建蛋白互作网络后,结合Cytoscape筛选核心靶点;使用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。利用AutoDock vina软件进行分子对接验证。观察偏头痛大鼠血清CGRP、NO含量及三叉神经髓鞘结构。结果:从芎麻汤有效部位中共鉴定107个化学成分,主要包含有机酸类、糖苷类、黄酮类等。得到TNF、AKT1、IL-1β等304个交集靶点,对应阿魏酸、天麻素、洋川芎内酯A等80个活性成分;315个GO注释条目、78条KEGG信号通路(P<0.01)。分子对接发现活性成分与核心靶点及CGRP、TRPV1均自发结合。动物实验表明芎麻汤有效部位可明显降低偏头痛大鼠血清CGRP、NO含量;三叉神经可见神经纤维,致密的髓鞘板层,胞质中线粒体呈大小不一的形态。结论:芎麻汤有效部位含有的阿魏酸、天麻素、洋川芎内酯A等药效物质,可通过影响神经信号传递通路、钙信号通路、cAMP信号通路等调节外周血CGRP、NO水平,治疗偏头痛。 展开更多
关键词 芎麻汤有效部位 偏头痛 UHPLC-QTOF-MS 网络药理学-分子对接 炎症汤
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基于网络药理学、分子对接和代谢组学研究鸡血藤抗AS药效与机制 被引量：4
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作者 方晓燕 李保生 +5 位作者 黎飚 周柳芳 卢国康 彭静静 王金花 杨彩艳 《右江民族医学院学报》 2022年第6期783-793,共11页
目的研究鸡血藤预防动脉粥样硬化(AS)及其并发症中肌少症的药效、剂量和作用机制。方法使用AS模型,通过分析血脂组成、血液流变学、血浆中SOD含量及主动脉弓、比目鱼肌病理形态差别评价其抗AS及并发症中肌少症药效,通过网络药理学、GEO... 目的研究鸡血藤预防动脉粥样硬化(AS)及其并发症中肌少症的药效、剂量和作用机制。方法使用AS模型,通过分析血脂组成、血液流变学、血浆中SOD含量及主动脉弓、比目鱼肌病理形态差别评价其抗AS及并发症中肌少症药效,通过网络药理学、GEO数据库、分子对接和代谢组学研究其机制。结果鸡血藤提取物能降低血脂含量、改善血液流变学、阻止脂质在血管内壁聚集等预防AS药效[最佳的剂量是0.42 g/(d·kg)]及增加比目鱼肌横截面积(预防肌少症)药效;鸡血藤提取物预防AS药效不及血脂康但预防肌少症药效更强;代谢组学发现二氢(神经)鞘氨醇、鞘磷脂、鞘氨醇等在内的22个药效代谢差异物,代谢通路主要与糖鞘脂及组氨酸代谢相关;网络药理学发现114个鸡血藤抗AS靶点,MAPK1、MAPK14、AKT1和TP53等23个靶点作用于脂质-AS信号通路;二氢(神经)鞘氨醇、鞘磷脂、鞘氨醇作用于鞘脂信号通路,MAPK1、MAPK14、AKT1和TP53等11个鸡血藤抗AS药效靶点作用于shingolipid信号通路;分子对接技术对网络药理学研究验证结果表明luteolin、aloe-emodin、Formononetin、vestitol、naringenin是鸡血藤作用于AS结合较好的药效物质,MAPK14、TP53、CASP3、JUN、MMP9和IL6是鸡血藤作用于AS较好的药效靶点,脂质-AS和鞘脂是其重要的信号通路。结论鸡血藤具有较好的预防AS及少肌症药效;药效机制代谢层面主要与糖鞘脂和组氨酸代谢相关,在蛋白和基因层面与脂质-AS及鞘脂信号通路有关;药效物质主要为黄酮类化合物。 展开更多
关键词 鸡血藤 代谢组学 网络药理学与分子对接 动脉粥样硬化 少肌症
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UHPLC-QTOF-MS联合网络药理学及分子对接探讨青阳参总苷治疗社会挫败的物质基础及作用机制
3
作者 王静茹 刘顶鼎 +4 位作者 常露露 朱蔷 杨菁 吴雪梅 曾贵荣 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2023年第2期564-579,共16页
目的运用UHPLC-QTOF-MS和网络药理学-分子对接技术,探讨青阳参总苷治疗社会挫败的物质基础和潜在的作用机制。方法首先,采用UHPLC-QTOF-MS鉴定青阳参总苷化学成分。其次,运用Pubchem下载青阳参总苷化学成分2D结构后,利用Swiss Target Pr... 目的运用UHPLC-QTOF-MS和网络药理学-分子对接技术,探讨青阳参总苷治疗社会挫败的物质基础和潜在的作用机制。方法首先,采用UHPLC-QTOF-MS鉴定青阳参总苷化学成分。其次,运用Pubchem下载青阳参总苷化学成分2D结构后,利用Swiss Target Prediction数据库预测其靶点;从TTD、GeneCards、CTD数据库获取社会挫败相关治疗靶点;通过Venny平台获取两者的交集靶点;采用Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络;运用String数据库构建蛋白互作(PPI)网络后,结合Cytoscape分析得交集靶点排名;使用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用AutoDock vina软件进行分子对接验证。最后,构建社会挫败小鼠模型,采用ELISA法检测小鼠血清5-羟色胺(5-HT)、多巴胺(DA)含量,HE染色观察小鼠海马组织神经细胞病理变化。结果从青阳参总苷共鉴定152个化学成分。预测及筛选得到丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、单胺氧化酶A(MAOA)、多巴胺受体D3(DRD3)等26个青阳参总苷治疗社会挫败潜在作用靶点,对应85个青阳参总苷活性成分;富集分析得到45个GO注释条目(P<0.01)、11条KEGG信号通路。分子对接发现青阳参苷元、白桦脂酸、绿原酸等20个活性成分与AKT1、DRD4、DRD2、DRD3等10个核心靶蛋白均可自发结合。动物实验表明,与正常对照组相比,模型对照组小鼠血清中5-HT、DA含量均明显降低(P<0.05);小鼠海马组织神经细胞排列疏松,有明显的细胞丢失。与模型对照组相比,青阳参总苷各剂量组小鼠血清中5-HT、DA含量均显著升高(P<0.05,P<0.01);青阳参总苷中、高剂量组小鼠海马组织神经细胞间隙减小,且排列较为整齐。结论青阳参总苷对社会挫败具有治疗作用。主要药效物质为青阳参苷元、白桦脂酸、绿原酸等,可通过多靶点、多通路发挥抗社会挫败作用。 展开更多
关键词 青阳参总苷 社会挫败 UHPLC-QTOF-MS 网络药理学-分子对接 物质基础及作用机制
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基于网络药理学与分子对接探讨丹参-川芎药对改善肝癌癌前病变的作用机制 被引量：1
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作者 雷雅婷 唐浪 吴广阳 《大众科技》 2022年第7期96-101,共6页
目的:应用网络药理学、分子对接技术预测丹参-川芎药对改善气滞血瘀型肝癌癌前病变的机制。方法:利用TCMSP提取丹参、川芎的化合物组成与靶点关系。利用OMIM和GeneCards网站获得肝癌的疾病靶点,依据交集靶点,通过STRING网站获得蛋白互... 目的:应用网络药理学、分子对接技术预测丹参-川芎药对改善气滞血瘀型肝癌癌前病变的机制。方法:利用TCMSP提取丹参、川芎的化合物组成与靶点关系。利用OMIM和GeneCards网站获得肝癌的疾病靶点,依据交集靶点,通过STRING网站获得蛋白互作网络,R语言V4.0.3进行GO、KEGG富集分析。结果:关键靶蛋白为ESR1、HSP90AA1、CCND1等,排名靠前的化合物是木犀草素、3β-羟基丹参酮IIA等;KEGG富集通路发现丹参-川芎药对影响肝癌癌前病变主要通过乙型肝炎、PI3K-AKT等信号通路;分子对接结果显示木犀草素等有效化合物都能与ESR1、HSP90AA1、CCND1等核心靶蛋白良好的结合。结论:丹参-川芎药对改善肝癌癌前病变具有多靶点,多通路的特点。其治疗机制可能与调控ESR1、HSP90AA1、CCND1等关键蛋白的活性有关。 展开更多
关键词 丹参-川芎药对 肝癌癌前病变 网络药理学与分子对接
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基于网络药理学和分子对接探讨“黄芪-黄连”药对治疗儿童肥胖症的作用机制 被引量：4
5
作者 刘维 张桂菊 +1 位作者 闫文月 吴正雪 《食品与药品》 CAS 2022年第1期6-14,共9页
目的基于网络药理学和分子对接探讨“黄芪-黄连”药对治疗儿童肥胖病的作用机制。方法首先利用(中药系统药理学数据库与分析平台)TCMSP数据库,对黄芪、黄连的活性成分进行挖掘。利用UniProt数据库对靶点进行校正。再以儿童肥胖病(childh... 目的基于网络药理学和分子对接探讨“黄芪-黄连”药对治疗儿童肥胖病的作用机制。方法首先利用(中药系统药理学数据库与分析平台)TCMSP数据库,对黄芪、黄连的活性成分进行挖掘。利用UniProt数据库对靶点进行校正。再以儿童肥胖病(childhood obesity)为查找条件,通过Gene Cards、OMIO数据库筛选儿童肥胖病的相关靶点,并与“黄芪-黄连”药对的作用靶点进行选取交集处理,得到该药对治疗儿童肥胖病的有效靶点。利用String数据库对上述靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络预测,之后利用Bioconductor数据库进行GO和KEGG富集分析,最后利用AutoDock软件对度值较高的药物成分和核心靶点进行分子对接验证。结果共筛选出“黄芪-黄连”药对67个药物活性成分及95个治疗儿童肥胖病的靶点。通过PPI网络分析,“黄芪-黄连”药对治疗儿童肥胖病可能与MAPK8、EGFR、IL6、ESR1、VEGFA、CCND1、AR、MYC、CASP3、PPARG等蛋白靶点有关。GO功能富集分析显示“黄芪-黄连”药对的主要功能为蛋白质异源二聚化、近端启动子序列特异性DNA结合、RNA聚合酶Ⅱ近端启动子序列特异性DNA结合、染色质结合、泛素样蛋白连接酶结合等;KEGG通路分析涉及的主要通路为PI3K/Akt、MAPK信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒、人巨细胞病毒感染等。分子对接表明“黄芪-黄连”药对的主要活性成分与疾病的核心靶点有较稳定的结合活性。结论“黄芪-黄连”药对可直接或间接作用于PI3K/Akt通路,主要通过调节细胞分裂、抑制炎症等治疗儿童肥胖症。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 黄芪-黄连药对 儿童肥胖症
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