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兔出血症病毒RT-PCR检测方法的建立及其临床应用 被引量:15
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作者 胡波 魏后军 +5 位作者 王芳 范志宇 徐鹏 徐为中 薛家宾 何孔旺 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1442-1446,共5页
本研究旨在建立检测兔群鼻拭子中兔出血症病毒(RHDV)的RT-PCR方法,研究健康免疫兔群是否存在携带RHDV现象。根据GenBank上公布的RHDVvp60基因保守序列,设计了1对特异性引物,经cDNA的合成和PCR扩增,目的片段大小为591bp。结果表明该方法... 本研究旨在建立检测兔群鼻拭子中兔出血症病毒(RHDV)的RT-PCR方法,研究健康免疫兔群是否存在携带RHDV现象。根据GenBank上公布的RHDVvp60基因保守序列,设计了1对特异性引物,经cDNA的合成和PCR扩增,目的片段大小为591bp。结果表明该方法能检出最小RNA浓度为2.40ng·μL-1,敏感性为血凝试验(HA)的8×103倍。通过对自5个省采集的168份健康免疫兔鼻拭子样品进行检测,结果显示,阳性样品为22份,阳性率为13.09%。试验表明:RT-PCR方法能快速、敏感地从健康免疫兔鼻拭子样品中检出RHDV,提示健康免疫兔群存在携带RHDV的现象,该方法适合临床进行大规模病原学检测和兔群携带病毒的调查,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 兔出血症病毒 RT-PCR 鼻拭子 病毒携带
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不同种类呼吸道样品活体检测猪肺炎支原体抗原和抗体的比较分析 被引量:1
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作者 甘源 苏丽娟 +8 位作者 韦艳娜 武昱孜 林昌华 覃秀珍 黄海权 白昀 邵国青 熊祺琰 冯志新 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2023年第9期100-105,共6页
猪支原体肺炎是由猪肺炎支原体(Mhp)引起的猪的一种慢性呼吸道疾病,Mhp基础感染率的监测对于及时实施控制措施和评估防控与净化效果至关重要。为了解在活体检测过程中的不同采集时间、样品类型和检测方法对猪肺炎支原体感染诊断结果的影... 猪支原体肺炎是由猪肺炎支原体(Mhp)引起的猪的一种慢性呼吸道疾病,Mhp基础感染率的监测对于及时实施控制措施和评估防控与净化效果至关重要。为了解在活体检测过程中的不同采集时间、样品类型和检测方法对猪肺炎支原体感染诊断结果的影响,本研究通过ELISA和实时定量PCR方法检测了来源于某大型养殖场的断奶仔猪、保育猪、屠宰猪、后备猪和种猪群活体采集的鼻拭子、喉拭子和咽拭子样品中的Mhp黏膜sIgA抗体和Mhp抗原。结果:鼻拭子、喉拭子和咽拭子样品总体的黏膜抗体阳性率分别为63.23%、62.55%和47.27%,抗原阳性率分别为74.75%、65.91%和63.64%。从不同的生产阶段看,保育猪和屠宰猪群中Mhp黏膜sIgA抗体阳性率较高,而断奶仔猪群中Mhp黏膜sIgA抗体阳性率最低。Mhp抗原的检出率随着猪群生产日龄的增加而增加,屠宰猪群和后备猪群鼻拭子和喉拭子中Mhp抗原阳性率达到峰值,种猪群中的抗原检测率出现了下降。对于鼻拭子样品中抗原与抗体的检测,从断奶仔猪至屠宰猪阶段,Mhp黏膜sIgA抗体的检出率更高,而后备猪群的抗原检出率更高。研究表明,在临床生产实际中,对于Mhp感染的活体检测,相较于喉拭子和咽拭子样本,鼻拭子样品对不同生产阶段猪群均具有更好的采集便利性与检测适用性。为了提高检测敏感性与准确度,黏膜sIgA抗体检测更适用于保育及生长育肥猪群,而定量PCR检测抗原则更适用于育肥后期以及后备猪群。 展开更多
关键词 猪肺炎支原体 感染监测 活体检测 鼻拭子 喉拭子 咽拭子
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基于PCR循环阈值的SARS-CoV-2奥密克戎变异株的实验室分析
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作者 刘海波 于海柱 +5 位作者 高舒 王云霞 刘颖 史文凤 赵耀 潘阳 《医学动物防制》 2024年第8期784-786,792,共4页
目的分析新型冠状病毒感染人群的鼻拭子和咽拭子标本的循环阈(Ct)值,为流行病学调查和临床预测等提供一定的理论依据。方法对2022年4月1日至7月31日本实验室接收的SARS-CoV-2核酸阳性人群的鼻拭子和咽拭子标本,运用磁珠法进行核酸提取,... 目的分析新型冠状病毒感染人群的鼻拭子和咽拭子标本的循环阈(Ct)值,为流行病学调查和临床预测等提供一定的理论依据。方法对2022年4月1日至7月31日本实验室接收的SARS-CoV-2核酸阳性人群的鼻拭子和咽拭子标本,运用磁珠法进行核酸提取,用实时荧光定量PCR检测SARS-CoV-2核酸的ORF1ab基因和N基因两个靶标,分析两类标本中两个靶标的Ct值。Ct值差异用独立样本t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果SARS-CoV-2核酸阳性标本401例,男性243例、女性158例(男女比例1.54∶1);SARS-CoV-2核酸阳性人员年龄分布为7个月~91岁,中位数为39岁;临床分型为普通型31例,轻型281例,无症状感染者89例。同时采鼻拭子和咽拭子的106例,两类标本ORF1ab基因(t=7.728,P<0.001)和N基因(t=7.504,P<0.001)Ct值差异均有统计学意义。在同一人不同时间送检鼻拭子或咽拭子的73例标本中,采样时间间隔≤48h的标本26例,两次Ct值差值的绝对值>2的标本占61.54%(16/26),末次Ct值≤30的标本占61.5%(16/26);采样时间间隔>48h的标本56件,两次Ct值差值的绝对值>2的标本占82.1%(46/56),末次Ct值>30的标本占98.2%(55/56)。结论SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染者的临床分型以轻型为主;鼻拭子标本的病毒载量高于咽拭子;采样时间间隔≤48h的标本,若Ct值快速下降且末次Ct值≤30,大多为新发感染人员;若末次Ct值>30则大多为复阳人员。Ct值仅有一定的提示作用,对于COVID-19人群的临床情况预测、感染者当下状态及何时参与社会活动,要根据其临床情况连同实验室结果进行评估。 展开更多
关键词 CT值 鼻拭子 咽拭子 新型冠状病毒 PCR 分析
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应用巢氏PCR方法快速检测猪鼻拭子样品中产毒素多杀性巴氏杆菌 被引量:5
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作者 汤细彪 吴斌 +4 位作者 刘国平 杨明柳 罗勇 卢顺 陈焕春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1083-1087,共5页
根据产毒素多杀性巴氏杆菌的toxA基因序列,设计了2对特异性引物,扩增的片段大小分别为864和447 bp,从而建立了一种能直接从猪鼻拭子中快速检测产毒素多杀性巴氏杆菌的巢氏PCR方法。该方法能检出26CFU菌量以上的模板DNA,且不能从猪的其它... 根据产毒素多杀性巴氏杆菌的toxA基因序列,设计了2对特异性引物,扩增的片段大小分别为864和447 bp,从而建立了一种能直接从猪鼻拭子中快速检测产毒素多杀性巴氏杆菌的巢氏PCR方法。该方法能检出26CFU菌量以上的模板DNA,且不能从猪的其它7种常见病原菌扩增到特异性条带。通过对5个不同地区阳性猪群中采集的146份临床鼻拭子样品进行巢氏PCR检测和细菌分离鉴定,结果2种方法同时为阳性的样品有44份,同时为阴性的样品有97份,另有5份样品只有巢氏PCR检测为阳性,巢氏PCR检测与细菌分离鉴定的符合率为96.58%。试验表明:巢氏PCR方法能快速、灵敏地从猪鼻拭子样品中检出产毒素多杀性巴氏杆菌,适合临床进行大规模病原学检测,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 产毒素多杀性巴氏杆菌 toxA 鼻拭子 巢氏PCR
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咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析 被引量:3
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作者 牛卫东 段江洋 +4 位作者 蒋诗苑 孙丽梅 胡乃月 周鹏 赵瑞臻 《传染病信息》 2020年第4期307-311,共5页
目的通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-Co... 目的通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemarχ~2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果本研究共有61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本(71.5%),其次是鼻拭子标本(34.3%),咽拭子标本检出率最低(29.1%)。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%,N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义(P均<0.05),ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差(k<0.4),N基因检出结果中2者间不存在一致性(k<0),痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异(P均<0.05),ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差(k<0.4),N基因检出结果中2者间不存在一致性(k<0),痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义(P均>0.05),一致性检验结果则表明2者一致性差(k均<0.4),因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义,但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异,即检测结果可相互 展开更多
关键词 核酸检测 痰液标本 咽拭子标本 鼻拭子标本
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西安市134例百日咳疑似病例不同标本百日咳鲍特菌检测阳性率比较 被引量:1
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作者 王锐泽 胡伟军 +6 位作者 张超 刘晓宇 周天天 孙欣荣 王雪 田恬 张少白 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2021年第1期74-78,共5页
目的比较百日咳疑似病例鼻、咽和鼻咽拭子标本百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)检测阳性率。方法选择西安市两家医院2018年1-7月134例百日咳疑似病例,同时采集鼻、咽和鼻咽拭子标本,进行Bp分离培养和实时荧光定量聚合酶链反应核... 目的比较百日咳疑似病例鼻、咽和鼻咽拭子标本百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)检测阳性率。方法选择西安市两家医院2018年1-7月134例百日咳疑似病例,同时采集鼻、咽和鼻咽拭子标本,进行Bp分离培养和实时荧光定量聚合酶链反应核酸检测。结果百日咳疑似病例的Bp检测总阳性率为44.78%(60/134),其中鼻、咽、鼻咽拭子阳性率分别为36.57%、32.09%、39.55%(χ^(2)=1.64,P=0.440);发病后0-7d、8-14d、15-21d、22-28d、29d采样的阳性率分别为23.33%、64.52%、63.89%、42.86%、23.33%(χ^(2)=22.13,P=0.000)。鼻、咽、鼻咽拭子Bp核酸检测阳性率分别为36.57%、32.09%、39.55%(χ^(2)=1.64,P=0.440);分离培养阳性率分别为0.00%、0.00%、4.59%(Fisher精确概率法,P=0.036)。在Bp核酸阳性病例中鼻和/或咽、鼻和/或鼻咽、咽和/或鼻咽拭子阳性分别占93.33%、91.67%、100%(Fisher精确概率法,P=0.080)。结论百日咳疑似病例鼻、咽和鼻咽拭子Bp检测总阳性率相当;核酸检测阳性率以鼻咽拭子最高,组合采样可提高Bp核酸检测阳性率;分离培养仍建议选择鼻咽拭子。 展开更多
关键词 百日咳 鼻咽拭子 鼻拭子 咽拭子 实时荧光聚合酶链反应 分离培养
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猪鼻拭子与支气管肺泡灌洗液用于呼吸道分泌性抗体检测 被引量:3
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作者 冯志新 张亚 +7 位作者 华利忠 甘源 刘茂军 王海燕 韦艳娜 白昀 王占伟 邵国青 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第1期219-221,共3页
黏膜免疫是机体抵抗细菌或病毒感染的第一道防线[1]。因此,检测黏膜免疫反应对评估黏膜接种方案和病原与宿主之间的相互关系具有重要的意义[2]。目前,支气管。肺泡灌洗液样本(BALF)在下呼吸道样本的采集中占有重要的地位,也是目前... 黏膜免疫是机体抵抗细菌或病毒感染的第一道防线[1]。因此,检测黏膜免疫反应对评估黏膜接种方案和病原与宿主之间的相互关系具有重要的意义[2]。目前,支气管。肺泡灌洗液样本(BALF)在下呼吸道样本的采集中占有重要的地位,也是目前评价呼吸道黏膜免疫的常用样本。 展开更多
关键词 鼻拭子 支气管肺泡灌洗液 抗体检测
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咽拭子和鼻拭子标本新型冠状病毒核酸检测效果分析 被引量:1
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作者 周兰兰 魏泉德 +1 位作者 焦亮 黄辉涛 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2021年第6期710-713,共4页
目的分析COVID-19病例咽拭子与鼻拭子标本新型冠状病毒(novel coronavirus 2019,2019-nCoV)核酸检测效果。方法对541例珠海市疑似病例和密切接触者,同时采集咽拭子和鼻拭子标本,用实时荧光PCR技术检测2019-nCoV核酸,分析两类标本核酸检... 目的分析COVID-19病例咽拭子与鼻拭子标本新型冠状病毒(novel coronavirus 2019,2019-nCoV)核酸检测效果。方法对541例珠海市疑似病例和密切接触者,同时采集咽拭子和鼻拭子标本,用实时荧光PCR技术检测2019-nCoV核酸,分析两类标本核酸检出阳性率和靶标ORF1ab和N基因Ct值。结果共43例核酸确诊阳性,咽拭子共检测出35例阳性,阳性率6.47%,鼻拭子共检出33例阳性,阳性率6.10%,阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=0.06,P=0.80),诊断一致性较好(Kappa=0.72)。两类标本ORF1ab和N基因的Ct值无差异。结论COVID-19病例鼻拭子和咽拭子标本采用实时荧光PCR技术检测2019-nCoV病毒核酸效果无差别。 展开更多
关键词 COVID-19 新型冠状病毒 核酸检测 咽拭子 鼻拭子
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伪狂犬病病毒和猪圆环病毒2型混合人工感染仔猪排毒的检测 被引量:1
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作者 宋春莲 张应国 +8 位作者 李永能 尹革芬 李文贵 段博芳 耿孝杰 张雪 凌万旭 颜洪奎 舒相华 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期360-365,共6页
为了解伪狂犬病病毒(PRV)和猪圆环病毒2型(PCV2)感染仔猪后不同时间点的病毒载量及排毒规律,将34头健康仔猪分为4组,第1~3组分别为人工接种PRV、PCV2和PRV+PCV2组,第4组为空白对照组。分别在接种后第3、7、14、21、35天采集试验仔猪的... 为了解伪狂犬病病毒(PRV)和猪圆环病毒2型(PCV2)感染仔猪后不同时间点的病毒载量及排毒规律,将34头健康仔猪分为4组,第1~3组分别为人工接种PRV、PCV2和PRV+PCV2组,第4组为空白对照组。分别在接种后第3、7、14、21、35天采集试验仔猪的鼻拭子和肛门拭子,用Taq Man荧光定量PCR(q PCR)对其进行定量检测,并分析仔猪排毒的变化规律。结果,接种后第3天,3个试验组仔猪肛门拭子、鼻拭子中均分离到PRV或PCV2;其中PRV单独感染后的病毒载量在第14天达到峰值331.67 copies/L;PCV2单独感染后的病毒载量在第3天达到峰值10 742.01 copies/L;PRV+PCV2混合感染后鼻拭子和肛门拭子的PRV分别在第14天和第7天达峰值980.96 copies/L和2 230.056 copies/L;鼻拭子和肛门拭子PCV2在感染后第14天达到峰值69.413 copies/L和271.72 copies/L;混合感染仔猪于感染后第8~14天发生死亡。3个感染组之间无论是肛门拭子还是鼻拭子,PRV、PCV2病毒载量均差异显著(P<0.05)。上述结果表明,PRV单独感染、PCV2单独感染和二者混合感染均对仔猪造成严重危害,除引起仔猪发病死亡外,这2种病毒均能通过呼吸道和消化道向外排毒。 展开更多
关键词 仔猪 伪狂犬病病毒 猪圆环病毒2型 鼻拭子 肛门拭子 排毒规律
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社区和医院环境对鼻腔耐甲氧西林金黄色葡萄球菌定植影响研究 被引量:1
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作者 徐洲 杜陈 +5 位作者 金钊 李旺胜 张楚微 王书菲 肖娜 唐一通 《教育教学论坛》 2020年第1期110-111,共2页
目的:了解社区和医院两种不同环境对鼻腔耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)定植的影响。方法:用鼻拭子法采集108例未进入临床实习医学生和99例正进行临床实习医学生鼻腔样本,用金黄色葡萄球菌显色培养基培养筛查金黄色葡萄球菌,并通过PCR... 目的:了解社区和医院两种不同环境对鼻腔耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)定植的影响。方法:用鼻拭子法采集108例未进入临床实习医学生和99例正进行临床实习医学生鼻腔样本,用金黄色葡萄球菌显色培养基培养筛查金黄色葡萄球菌,并通过PCR方法检测SCCmecA基因,进行MRSA的鉴定。比较两个群体中MRSA携带率的差异,分析社区和医院环境对MRSA在人鼻腔定植的影响。结果:108例未进入临床实习医学生共检出金黄色葡萄球菌(SAU)菌株44例,MRSA菌株8例,MRSA检出率7%,99例进入临床实习医学生共检出SAU菌株59例,MRSA菌株21例,MRSA检出率21%。实习组MRSA携带率是未实习组的2.86倍,两种不同环境下造成的MRSA阳性率不同具有统计学意义(χ^2=8.171,P<0.05)。结论:社区和医院两种不同环境对鼻腔耐甲氧西林金黄色葡萄球菌定植有显著影响,长期处于医院环境可使鼻腔MRSA定值率显著提高。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 鼻拭子 社区 医院
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2010—2011年猪场中猪源新型甲型流感病毒流行情况调查 被引量:1
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作者 张红娜 柴同杰 +3 位作者 李欣 王浩 孙玲玉 李欣贤 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第3期189-192,共4页
为深入了解猪源新型甲型流感病毒的流行情况,本研究对山东省9个地市40个猪场进行了猪源新型甲型流感病毒的感染情况调查。在养猪场采集有流感症状猪的血液样品(263份)和鼻咽拭子(235份),分别用HI试验来检测血清抗体滴度和荧光定量PCR技... 为深入了解猪源新型甲型流感病毒的流行情况,本研究对山东省9个地市40个猪场进行了猪源新型甲型流感病毒的感染情况调查。在养猪场采集有流感症状猪的血液样品(263份)和鼻咽拭子(235份),分别用HI试验来检测血清抗体滴度和荧光定量PCR技术检测鼻咽拭子中的流感病毒的含量。结果表明,血清阳性率为23.07%~63.33%,总阳性率为41.6%;荧光定量PCR检测鼻咽拭子阳性率为10.0%~64.28%,总阳性率为30.63%。这为了解山东省猪源新型甲型流感病毒的发生和分布,并采取相应的公共卫生措施提供了依据。 展开更多
关键词 猪源新型甲型流感病毒 血清 鼻咽拭子 荧光定量PCR HI试验
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副猪嗜血杆菌在感染猪体内的分布及其在血液、鼻拭子中载量的变化 被引量:1
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作者 庞琳琳 赵秋华 +9 位作者 王欣 张俊杰 郭爽 李蓓蓓 刘珂 邵东华 邱亚峰 马志永 袁万哲 魏建超 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2021年第6期62-67,共6页
为了解副猪嗜血杆菌感染猪后的组织分布和排毒情况,应用建立的SYBR Green Ⅱ荧光定量PCR检测方法,分析了副猪嗜血杆菌在猪各组织的分布及其在血液、鼻拭子中载量的变化情况。结果显示:高剂量感染组出现明显的临床症状,且平均体温高于其... 为了解副猪嗜血杆菌感染猪后的组织分布和排毒情况,应用建立的SYBR Green Ⅱ荧光定量PCR检测方法,分析了副猪嗜血杆菌在猪各组织的分布及其在血液、鼻拭子中载量的变化情况。结果显示:高剂量感染组出现明显的临床症状,且平均体温高于其他各组1~2℃;对试验组各组猪内脏组织进行检测发现,副猪嗜血杆菌主要集中在气管、扁桃体、颌下淋巴结、肺等组织中,不同组织器官中的细菌载量也存在着一定的差异;血液中并未检测到副猪嗜血杆菌,但在感染的8~20 d高剂量组鼻拭子中副猪嗜血杆菌的载量显著高于其他组。本文研究了副猪嗜血杆菌感染仔猪后的临床症状和体外排毒情况,为以后副猪嗜血杆菌的防治及致病机理研究奠定一定理论基础。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 SYBR GreenⅡ荧光定量PCR 鼻拭子
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不同样本类型对qPCR检测儿童急性呼吸道感染病原的影响
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作者 靳秀红 杨俊梅 +3 位作者 李晓燕 李会娟 常会娟 张小宁 《中国卫生检验杂志》 CAS 2020年第1期75-77,共3页
目的比较呼吸道感染鼻腔拭子和口咽拭子2种样本类型对qPCR检测结果的影响。方法采集同一患者的鼻腔拭子和口咽拭子,采用qPCR方法检测8项病原体,卡方检验分析2种样本类型检出率的差异。结果收集了急性呼吸道感染的400例住院患儿与260例... 目的比较呼吸道感染鼻腔拭子和口咽拭子2种样本类型对qPCR检测结果的影响。方法采集同一患者的鼻腔拭子和口咽拭子,采用qPCR方法检测8项病原体,卡方检验分析2种样本类型检出率的差异。结果收集了急性呼吸道感染的400例住院患儿与260例门诊患儿的口咽拭子和鼻腔拭子样本,住院患者口咽拭子与鼻腔拭子样本中病原体阳性率分别为47.3%、55.5%,门诊患者口咽拭子与鼻腔拭子病原体阳性率分别为38.1%、60.0%;住院患者流感病毒A型2种样本类型差异有统计学意义(P<0.05),门诊患者流感病毒A型、B型差异有统计学意义(P<0.05)。结论当使用qPCR检测呼吸道感染时,鼻腔拭子样本类型在检测流感病毒A型、B型时灵敏度高于口咽拭子,在检测其他6种病原时,2种样本类型灵敏度无差异。 展开更多
关键词 急性呼吸道 qPCR 鼻腔拭子 检测
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规范标本采集及送检流程对提高甲型流感病毒快速筛查阳性率的探讨与分析 被引量:9
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作者 郭阳 苑晓冬 +4 位作者 佟丽娟 孙玉玲 王海英 乌日乐 栾颖 《中国急救复苏与灾害医学杂志》 2018年第6期547-548,共2页
目的探讨医务人员通过正确规范执行咽拭子标本采集及合理送检流程能否提高咽拭子快速检测甲型流感病毒抗原的阳性率。方法对比2016年1月1日-2017年3月1日首都医科大学附属北京世纪坛医院由发热门诊和其他科室分别采集的咽拭子样本,发... 目的探讨医务人员通过正确规范执行咽拭子标本采集及合理送检流程能否提高咽拭子快速检测甲型流感病毒抗原的阳性率。方法对比2016年1月1日-2017年3月1日首都医科大学附属北京世纪坛医院由发热门诊和其他科室分别采集的咽拭子样本,发热门诊样本直接送检,其他科室样本由外勤人员负责运送,所有标本均送至发热门诊检验室并运用“甲型流感病毒抗原检测试剂盒(DOT—ELISA法)”即刻检测。结果发热门诊共采集口咽拭子标本1539例,分离流感病毒阳性者为152例,阳性率9.88%,其他科室共采集口咽拭子标本928份,分离流感病毒阳性者68例,阳性率7.33%。发热门诊甲型流感病毒抗原检测阳性率高于其他科室,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论正确规范的咽拭子标本采集并及时严格送检样品,可提高甲型流感检测的阳性率。 展开更多
关键词 鼻咽拭子 甲型流感病毒 标本采集
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上海2株严重急性呼吸综合征冠状病毒2的分离与鉴定 被引量:6
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作者 彭浩然 李成忠 +13 位作者 唐海琳 薛建亚 陈志辉 梁雪松 朱咏梅 夏炳辉 朱勇喆 吴俊杰 赵兰娟 任浩 江亮亮 何燕华 戚中田 赵平 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期365-370,共6页
目的从新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者鼻/咽拭子样本中分离、培养严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)。方法将来自上海市COVID-19患者的3份鼻/咽拭子样本以TPCK胰酶处理,然后接种Vero E6细胞;待大部分细胞出现明显病变时,取细胞... 目的从新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者鼻/咽拭子样本中分离、培养严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)。方法将来自上海市COVID-19患者的3份鼻/咽拭子样本以TPCK胰酶处理,然后接种Vero E6细胞;待大部分细胞出现明显病变时,取细胞培养上清用qRT-PCR法检测病毒核酸,并用反转录PCR扩增病毒受体结合区(RBD)基因片段;将病毒扩增培养后感染接种于96孔板中的Vero E6细胞,观察细胞病变效应,并用免疫荧光法检测病毒蛋白。结果2份COVID-19患者鼻/咽拭子样本接种的Vero E6细胞出现明显细胞病变效应,细胞培养上清中检测出新复制产生的SARS-CoV-2核酸,扩增出的RBD序列与早期分离出的SARS-CoV-2相应序列完全一致;病毒感染的Vero E6细胞病变迅速,并能与SARS-CoV-2核衣壳蛋白(N蛋白)单克隆抗体、刺突蛋白(S蛋白)单克隆抗体及COVID-19患者恢复期血清发生反应。结论从2份COVID-19患者鼻/咽拭子样本中成功分离出SARS-CoV-2,为后续开展SARS-CoV-2感染与致病机制研究、防治药物与疫苗的研发奠定了基础。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 新型冠状病毒肺炎 鼻拭子 咽拭子 病毒分离
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不同方法检测急性呼吸道感染患儿咽拭子与鼻拭子标本诊断呼吸道合胞病毒感染的评价 被引量:6
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作者 秦笙 刘文宽 +3 位作者 原铁 李际强 陈茶 陈德晖 《中国当代医药》 2016年第21期118-120,133,共4页
目的比较不同方法检测急性呼吸道感染患儿咽拭子与鼻拭子标本的检测结果。方法收集2011年3月-2012年2月本院临床诊断为急性呼吸道感染的315名患儿的咽拭子和鼻拭子标本,采用实时荧光定量qPCR法和传统病毒培养鉴定两种方法同时检测病毒... 目的比较不同方法检测急性呼吸道感染患儿咽拭子与鼻拭子标本的检测结果。方法收集2011年3月-2012年2月本院临床诊断为急性呼吸道感染的315名患儿的咽拭子和鼻拭子标本,采用实时荧光定量qPCR法和传统病毒培养鉴定两种方法同时检测病毒核酸或抗原,比较其结果。结果病毒培养鉴定方法中的鼻拭子和咽拭子阳性率分别为12.1%、6.7%,鼻拭子阳性率高于咽拭子(P〈0.01)。qPCR检测中的鼻拭子阳性率分别为17.1%和6.9%,鼻拭子阳性率高于咽拭子(P〈0.01)。鼻拭子和咽拭子标本分别用两种检测方法进行比较,qPCR的阳性率均高于病毒培养鉴定方法(P〈0.01)。以咽拭子培养与鉴定呼吸道合胞病毒(RSV)结果为标准,鼻拭子培养与鉴定、鼻拭子qPCR检测、咽拭子qPCR检测的敏感性分别为57%、91%、24%;特异性分别为91%、88%、94%。结论鼻拭子标本检测RSV的敏感度高于相应的口咽拭子,且qPCR方法检测RSV的敏感度高于传统病毒培养鉴定法。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 实时荧光定量PCR病毒培养与鉴定 鼻咽拭子
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鼻擦拭分析在放射性内污染常规监测中的应用探讨 被引量:1
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作者 王亚东 王路生 +1 位作者 马彦 戴雄新 《辐射防护》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期687-692,共6页
针对当前放射性内污染常规监测手段难以快速精准识别职业人员意外吸入过量放射性物质事件的问题,提出了加强鼻擦拭分析在放射性内污染常规监测中应用的构想。利用人体呼吸道气溶胶沉积模型和真实鼻擦拭分析数据论证了鼻擦拭分析监测放... 针对当前放射性内污染常规监测手段难以快速精准识别职业人员意外吸入过量放射性物质事件的问题,提出了加强鼻擦拭分析在放射性内污染常规监测中应用的构想。利用人体呼吸道气溶胶沉积模型和真实鼻擦拭分析数据论证了鼻擦拭分析监测放射性内污染的可靠性,梳理并分析了现有的鼻擦拭分析技术能力,阐述了鼻擦拭分析应用于职业人员放射性内污染日常监测的必要性和辐射防护价值,并给出进一步开展鼻擦拭分析应用研究的建议。 展开更多
关键词 鼻擦拭分析 放射性内污染 常规监测
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Validation of Microchip Based RT-PCR ABC Test (InfA/B &COVID-19) in Clinical Samples 被引量:1
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作者 Gabriel Martinez Ryan Nunley +6 位作者 Michelle Gaines Timea Majoros Rajwant K. Gill Irina Gelimson Natallia Varankovich Maxim Slyadnev Sikander S. Gill 《Journal of Biosciences and Medicines》 CAS 2022年第8期172-187,共16页
To contain the rapid and global spread of SARS-CoV-2, it is essential to develop an accurate and sensitive test system to address pandemic bottlenecks, simplified sample collection, and no sample prep. While meeting t... To contain the rapid and global spread of SARS-CoV-2, it is essential to develop an accurate and sensitive test system to address pandemic bottlenecks, simplified sample collection, and no sample prep. While meeting the demand of testing large populations, the miniaturized volume of assay reagents and offering rapid results is the need in such scenarios. Moreover, in view of the reports of co-infections and overlapping symptoms of Influenza caused by Influenza A or Influenza B, and COVID-19 caused by SARS-CoV-2, a test system with three targets can be supportive for accurate clinical diagnosis. In this presentation, we evaluated the performance of a test comprising Microchip RT-PCR Influenza and COVID-19 Detection System for identifying these three viral pathogens in nasal swabs and saliva specimens. A rapid and simplified total nucleic acid extraction method was developed and validated for the reliable, high-throughput simultaneous detection of respiratory viruses causing Influenza (type A and type B viruses) and COVID-19 (SARS-CoV-2 virus) using the microchip-based AriaDNATM platform deriving the name ABC Test. The test system was evaluated using 81 nasal swab samples, 77 clinical saliva samples, 5 blind CAP reference samples, and RNA standards. The limit of detection (LoD) was assessed using SARS-CoV-2, Influenza A, and Influenza B RNA standards. The multiplex ABC Test microchip displayed LoD of 14 copies/μL for SARS-CoV-2 and approximately 26 copies/μL for Influenza A, and 140 copies/μL for Influenza B, respectively. The ABC Test offers rapid multiplex one-step RT-PCR in 32 minutes for 45 cycles as the miniaturized reaction of 1.2 μL offering a highly sensitive, robust, and accurate assay for the detection of Influenza A/B, and SARS-CoV-2. 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 INFLUENZA Multiplex Microchip PCR nasal swab and Saliva
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新型冠状病毒上海株(nCoV-SH01)的分离和鉴定 被引量:9
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作者 张荣 易志刚 +19 位作者 王玉燕 滕峥 徐巍 宋武慧 蔡霞 孙志平 谷陈建 周艳秋 陈洪友 叶荣 韩文东 朱云凯 冯飞 房方皓 李崇山 张曦 瞿涤 付晨 谢幼华 袁正宏 《微生物与感染》 2020年第1期16-21,共6页
新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情对人类生命健康构成极大威胁。病毒的分离是构建新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)细胞感染模型和动物感染模型的基础。本研究利用冠状病毒易感的Vero E6细胞,从... 新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情对人类生命健康构成极大威胁。病毒的分离是构建新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)细胞感染模型和动物感染模型的基础。本研究利用冠状病毒易感的Vero E6细胞,从1例上海感染者的咽拭子中分离到一株2019-nCoV,命名为nCoV-SH01。对该毒株全基因组采用一代Sanger和二代Illumina法测序,发现该毒株与GenBank MN908947的同源性>99.99%。免疫荧光检测显示,该毒株与COVID-19康复者的血清呈阳性反应。当nCoV-SH01感染Vero E6细胞后,导致典型的合胞体病变,细胞病变效应明显且进展迅速,提示nCoV-SH01可用于进一步建立2019-nCoV的细胞感染和动物感染模型,为开展致病性研究以及抗病毒药物和疫苗研发奠定了基础。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 合胞体 VERO E6细胞 鼻/咽拭子 细胞模型
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