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中国国内首次发现Nam Dinh病毒
被引量：
9
1
作者
刘渠
林琳
+5 位作者
周健明
陈应坚
张起文
王德全
李静媚
金玉娟
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期1-6,共6页
2009～2011年,课题组在深圳市龙岗区的致倦库蚊标本中检测到我国首株Nam Dinh病毒(Nam DinhVirus,NDiV)。本研究通过细胞培养、SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR和RT-PCR方法对深圳NDiV的细胞易感性和分子进化特征进行分析。结果发现4批...
2009～2011年,课题组在深圳市龙岗区的致倦库蚊标本中检测到我国首株Nam Dinh病毒(Nam DinhVirus,NDiV)。本研究通过细胞培养、SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR和RT-PCR方法对深圳NDiV的细胞易感性和分子进化特征进行分析。结果发现4批致倦库蚊标本可以引起C6/36细胞病变。4株深圳分离株的SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR检测结果均出现"S"型扩增曲线与特异性的熔解曲线。对分离株的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)基因与部分ZmHel1(Zn module+Superfamily 1 Helicase)基因进行扩增均可以在2%琼脂糖电泳显示到目的条带。4株深圳分离毒株的RdRp基因核苷酸和氨基酸序列与越南代表株NDiV(02VN178)的同源性均达99%以上。系统进化树分析表明,4株深圳NDiV株与越南NDiV代表株的亲缘性最近,属于同一个进化分支上。据文献检索表明,本文发现的NDiV为国内首次报道。
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关键词
nam
dinh
病毒
rna
依赖的
rna
聚合酶(
rdrp
)
系统进化树
原文传递
四川省Nam Dinh病毒的首次分离鉴定
被引量：
1
2
作者
李伟
张佳珂
+2 位作者
林世华
周兴余
冯玉亮
《中国病毒病杂志》
CAS
2022年第2期108-113,共6页
目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(re...
目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)鉴定,同时扩增分离株的开放阅读框、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)、解旋酶超家族1(superfamily 1 helicase,HEL1)、刺突蛋白(spike protein,S蛋白)基因序列并测序,然后利用Mega Align软件对核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比对分析,利用Mega 7软件绘制系统进化树。结果SC1502、SC1510病毒株能够引起C6/36细胞发生病变,但不能引起BHK-21细胞的病变。同源性分析结果显示,2株四川新分离株与NDiV的RdRp、HEL1、S蛋白的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别超过99.4%和97.5%。系统进化分析结果表明,2株四川新分离株与NDiV亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论SC1502与SC1510为NDiV,该研究结果丰富了四川省的虫媒病毒病原谱数据库,对相关地区的不明原因疫情分析和调查提供了参考依据。
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关键词
nam
dinh
病毒
rna
依赖的
rna
聚合酶(
rdrp
)
HEL1基因
S基因
系统进化树
原文传递
题名
中国国内首次发现Nam Dinh病毒
被引量：
9
1
作者
刘渠
林琳
周健明
陈应坚
张起文
王德全
李静媚
金玉娟
机构
广东省深圳市龙岗区疾病预防控制中心
广东药学院
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期1-6,共6页
文摘
2009～2011年,课题组在深圳市龙岗区的致倦库蚊标本中检测到我国首株Nam Dinh病毒(Nam DinhVirus,NDiV)。本研究通过细胞培养、SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR和RT-PCR方法对深圳NDiV的细胞易感性和分子进化特征进行分析。结果发现4批致倦库蚊标本可以引起C6/36细胞病变。4株深圳分离株的SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR检测结果均出现"S"型扩增曲线与特异性的熔解曲线。对分离株的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)基因与部分ZmHel1(Zn module+Superfamily 1 Helicase)基因进行扩增均可以在2%琼脂糖电泳显示到目的条带。4株深圳分离毒株的RdRp基因核苷酸和氨基酸序列与越南代表株NDiV(02VN178)的同源性均达99%以上。系统进化树分析表明,4株深圳NDiV株与越南NDiV代表株的亲缘性最近,属于同一个进化分支上。据文献检索表明,本文发现的NDiV为国内首次报道。
关键词
nam
dinh
病毒
rna
依赖的
rna
聚合酶(
rdrp
)
系统进化树
Keywords
nam
dinh
virus
rna-dependent rna polymerase
（
rdrp
）
phylogenetic tree
分类号
R183.5 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
四川省Nam Dinh病毒的首次分离鉴定
被引量：
1
2
作者
李伟
张佳珂
林世华
周兴余
冯玉亮
机构
四川省疾病预防控制中心微生物检验所虫媒病毒室
出处
《中国病毒病杂志》
CAS
2022年第2期108-113,共6页
基金
国家“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项(2017ZX10103010)。
文摘
目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)鉴定,同时扩增分离株的开放阅读框、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)、解旋酶超家族1(superfamily 1 helicase,HEL1)、刺突蛋白(spike protein,S蛋白)基因序列并测序,然后利用Mega Align软件对核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比对分析,利用Mega 7软件绘制系统进化树。结果SC1502、SC1510病毒株能够引起C6/36细胞发生病变,但不能引起BHK-21细胞的病变。同源性分析结果显示,2株四川新分离株与NDiV的RdRp、HEL1、S蛋白的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别超过99.4%和97.5%。系统进化分析结果表明,2株四川新分离株与NDiV亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论SC1502与SC1510为NDiV,该研究结果丰富了四川省的虫媒病毒病原谱数据库,对相关地区的不明原因疫情分析和调查提供了参考依据。
关键词
nam
dinh
病毒
rna
依赖的
rna
聚合酶(
rdrp
)
HEL1基因
S基因
系统进化树
Keywords
nam
dinh
virus
rna-dependent rna polymerase
(
rdrp
)
HEL1
gene
S
gene
phylogenetic tree
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国国内首次发现Nam Dinh病毒
刘渠
林琳
周健明
陈应坚
张起文
王德全
李静媚
金玉娟
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
9
原文传递
2
四川省Nam Dinh病毒的首次分离鉴定
李伟
张佳珂
林世华
周兴余
冯玉亮
《中国病毒病杂志》
CAS
2022
1
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