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谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族的鉴定及表达分析
被引量:
6
1
作者
张瑞娟
屈聪玲
+2 位作者
贺榆婷
杨致荣
王兴春
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第4期37-43,76,共8页
[目的]为了揭示谷子硝酸盐高效吸收和利用的分子机制,本文鉴定并分析了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1基因家族。[方法]以拟南芥中已知的11个参与硝酸盐吸收和转运的NRT1蛋白为基础,利用Blast的方法在全基因组范围内鉴定谷子参与硝酸盐吸收和...
[目的]为了揭示谷子硝酸盐高效吸收和利用的分子机制,本文鉴定并分析了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1基因家族。[方法]以拟南芥中已知的11个参与硝酸盐吸收和转运的NRT1蛋白为基础,利用Blast的方法在全基因组范围内鉴定谷子参与硝酸盐吸收和转运的NRT1基因,利用MEGA7.0和MEME构建系统进化树和鉴定保守的基序,并进一步利用PlantCARE预测顺式作用元件,最后通过RT-PCR的方法研究了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族基因的组织表达情况。[结果]从谷子中鉴定了8个硝酸盐转运蛋白NRT1基因,系统进化分析表明所得8个NRT1基因分别属于NPF1、NPF2、NPF4、NPF6和NPF7亚家族。谷子NRT1蛋白中都含有一个保守的QX4GX8GX3FX5P基序,可能与硝酸盐的吸收和转运相关。谷子NRT1基因的启动子中富含光响应元件,尤其是SP1元件。RT-PCR分析表明谷子8个NRT1基因表达具有组织特异性,暗示了其可能在不同组织和器官的硝酸盐吸收转运中起作用。[结论]本研究鉴定了8个谷子硝酸盐吸收和转运相关的NRT1基因,为后续谷子NRT1基因功能研究及谷子耐低氮分子机制的揭示奠定了基础。
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关键词
谷子
氮素
硝酸盐转运蛋白
nrt
1
基因
家族
NPF
基因
家族
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职称材料
题名
谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族的鉴定及表达分析
被引量:
6
1
作者
张瑞娟
屈聪玲
贺榆婷
杨致荣
王兴春
机构
山西农业大学生命科学院
山西农业大学文理学院
杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室
出处
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第4期37-43,76,共8页
基金
国家自然科学基金(31471502
31600289)
+2 种基金
山西省自然科学基金项目(201601D011071)
山西省回国留学人员科研资助项目(2015-067)
山西省留学回国人员科技活动择优资助项目(2014-11)资助项目
文摘
[目的]为了揭示谷子硝酸盐高效吸收和利用的分子机制,本文鉴定并分析了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1基因家族。[方法]以拟南芥中已知的11个参与硝酸盐吸收和转运的NRT1蛋白为基础,利用Blast的方法在全基因组范围内鉴定谷子参与硝酸盐吸收和转运的NRT1基因,利用MEGA7.0和MEME构建系统进化树和鉴定保守的基序,并进一步利用PlantCARE预测顺式作用元件,最后通过RT-PCR的方法研究了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族基因的组织表达情况。[结果]从谷子中鉴定了8个硝酸盐转运蛋白NRT1基因,系统进化分析表明所得8个NRT1基因分别属于NPF1、NPF2、NPF4、NPF6和NPF7亚家族。谷子NRT1蛋白中都含有一个保守的QX4GX8GX3FX5P基序,可能与硝酸盐的吸收和转运相关。谷子NRT1基因的启动子中富含光响应元件,尤其是SP1元件。RT-PCR分析表明谷子8个NRT1基因表达具有组织特异性,暗示了其可能在不同组织和器官的硝酸盐吸收转运中起作用。[结论]本研究鉴定了8个谷子硝酸盐吸收和转运相关的NRT1基因,为后续谷子NRT1基因功能研究及谷子耐低氮分子机制的揭示奠定了基础。
关键词
谷子
氮素
硝酸盐转运蛋白
nrt
1
基因
家族
NPF
基因
家族
Keywords
Foxtail millet
Nitrogen
Nitrate transporter
nrt
1
gene family
NPF gene family
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族的鉴定及表达分析
张瑞娟
屈聪玲
贺榆婷
杨致荣
王兴春
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018
6
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职称材料
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