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烟草NCED3基因的克隆及其干旱胁迫表达分析 被引量:18
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作者 牛志强 刘国顺 +5 位作者 师婷婷 张松涛 贾宏昉 张洪映 崔红 杨永霞 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期100-106,共7页
为揭示9-顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase,NCED)在烟草生长发育过程中的功能,通过同源克隆方法获得烟草品种K326类胡萝卜素降解关键基因NCED3两个c DNA全长序列。序列分析表明:K326 NCED3-1和NCED3-2基... 为揭示9-顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase,NCED)在烟草生长发育过程中的功能,通过同源克隆方法获得烟草品种K326类胡萝卜素降解关键基因NCED3两个c DNA全长序列。序列分析表明:K326 NCED3-1和NCED3-2基因分别包含一个1842bp和1830bp的开放读码框(ORF),各编码613个和609个氨基酸。预测蛋白质分子量分别为68177.8 Da和67754.2Da,理论等电点(p I)各为7.66和7.28。跨膜区预测、亲水性和信号肽分析表明很可能是定位于线粒体膜上的亲水性跨膜蛋白。二级结构预测模型显示此蛋白结构以β折叠和无规则卷曲为主。蛋白三级结构预测分析表明NCED3-1与NCED3-2空间结构极为相似。PEG6000胁迫分析表明,干旱胁迫可以诱导NCED3基因表达以及内源ABA的积累。且在处理12h之前,NCED3表达与ABA累积速度均呈现升高趋势,之后逐渐降低。研究结果为解析NCED3在烟草抗旱方面的功能提供一定的研究基础。 展开更多
关键词 烟草 nced3基因 克隆 序列分析 表达 ABA
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利用TAIL-PCR方法克隆拟南芥干旱主效基因NCED3 被引量:3
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作者 刘浩 苏凡 王棚涛 《河南大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2009年第6期621-625,共5页
利用远红外成像技术筛选得到一株T-DNA插入的干旱敏感突变体,并成功利用TAIL-PCR技术克隆到该突变基因为NCED3,该基因编码植物体内ABA合成的关键限速酶,突变体在干旱胁迫下不能合成ABA而表现出不耐干旱的特性.最后通过PCR及RT-PCR方法... 利用远红外成像技术筛选得到一株T-DNA插入的干旱敏感突变体,并成功利用TAIL-PCR技术克隆到该突变基因为NCED3,该基因编码植物体内ABA合成的关键限速酶,突变体在干旱胁迫下不能合成ABA而表现出不耐干旱的特性.最后通过PCR及RT-PCR方法验证了TAIL-PCR结果的可靠性. 展开更多
关键词 拟南芥 干旱突变体 TAIL-PCR技术 nced3基因
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白菜型冬油菜NCED3基因、启动子的克隆及其表达分析 被引量:3
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作者 武军艳 马骊 +7 位作者 方彦 张亚宏 马学才 刘丽君 牛早霞 李学才 李爱国 孙万仓 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2020年第5期64-70,共7页
从2个不同抗寒性的冬油菜品种中克隆了NCED3基因及其启动子序列,并分析其在叶片和根中的表达,研究NCED3基因在冬油菜中的作用机理。结果表明,陇油6号的NCED3基因开放阅读框(ORF)长度为1794 bp,编码597个氨基酸,分子量65.74 kD,理论等电... 从2个不同抗寒性的冬油菜品种中克隆了NCED3基因及其启动子序列,并分析其在叶片和根中的表达,研究NCED3基因在冬油菜中的作用机理。结果表明,陇油6号的NCED3基因开放阅读框(ORF)长度为1794 bp,编码597个氨基酸,分子量65.74 kD,理论等电点为5.81;天油2号的ORF与其长度相同,分子量为65.78 kD,理论等电点为5.94。2个蛋白都是亲水蛋白,具有疏水峰。根据预测,启动子具有生物过程中常见的顺式作用元件如CAAT-box等、分生组织表达CAT-box相关的顺式作用元件、-30 TATA box附近的核心启动子元件等,还有ABRE、TGA-element、CGTCA-motif、TGACG-element等激素响应元件,此外,还鉴定出低温响应元件(LTR)。2个品种启动子序列的相似度为99.38%,只有1个不同的顺式作用元件,即circadian,推测其与昼夜节律相关。低温、PEG及ABA处理后NCED3在叶片和根中的表达均高于对照,增加范围为0.07~6.48,且均于8 h达到峰值。与根系的表达特性相比,胁迫处理后叶片的基因表达均在2 h显著升高,天油2号的升高幅度(1.54~6.00)均大于陇油6号(0.04~1.95)。 展开更多
关键词 nced3基因 白菜型冬油菜 抗寒性 启动子克隆 序列分析 胁迫 基因相对表达量
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