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2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性分析
被引量:
3
1
作者
王鹏飞
高欢欢
+5 位作者
苏玲
蒋锡龙
吴新颖
杨立英
任凤山
王咏梅
《安徽农业科学》
CAS
2018年第1期96-101,共6页
[目的]分析2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性。[方法]利用Codon W1.4计算密码子偏好性参数的相关参数。[结果]2种果蝇线粒体中蛋白编码基因的AT含量比GC含量...
[目的]分析2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性。[方法]利用Codon W1.4计算密码子偏好性参数的相关参数。[结果]2种果蝇线粒体中蛋白编码基因的AT含量比GC含量更高。D.sechellia的线粒体基因组的密码子偏好性比黑腹果蝇D.melanogastera的线粒体基因组的密码子偏好性略强。2种果蝇线粒体基因组中各蛋白编码基因CDs中,RSCU值大于1的密码子都是以A或U结尾,而并不以C或G结尾。2种果蝇线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因簇基因的密码子偏好性都可能受到突变压力影响。D.melanogaster线粒体基因组中不存在密码子CGC。NADH dehydrogenase subunit 3基因的密码子偏好性可能比其他NADH dehydrogenase subunit基因更高。此外,尽管大部分NADH dehydrogenase subunit基因偏爱使用A或U结尾的密码子,但是在NADH dehydrogenase subunit 6基因中,有2个AU结尾的密码子(AGA、GCA)的RSCU也为0。[结论]该研究结果为2种果蝇线粒体的进化研究提供了新观点。
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关键词
果绳
葡萄
线粒体
密码子偏好性
nadhdehydrogenasesubunit
RSCU
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职称材料
题名
2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性分析
被引量:
3
1
作者
王鹏飞
高欢欢
苏玲
蒋锡龙
吴新颖
杨立英
任凤山
王咏梅
机构
山东省葡萄研究院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2018年第1期96-101,共6页
基金
山东省农业重大应用技术创新项目"特色酒用葡萄产期精准调控与产品创新研究应用"
山东省农业重大应用技术创新项目"山东葡萄酒地标性酒种开发与关键技术集成应用"
山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2016D01)
文摘
[目的]分析2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性。[方法]利用Codon W1.4计算密码子偏好性参数的相关参数。[结果]2种果蝇线粒体中蛋白编码基因的AT含量比GC含量更高。D.sechellia的线粒体基因组的密码子偏好性比黑腹果蝇D.melanogastera的线粒体基因组的密码子偏好性略强。2种果蝇线粒体基因组中各蛋白编码基因CDs中,RSCU值大于1的密码子都是以A或U结尾,而并不以C或G结尾。2种果蝇线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因簇基因的密码子偏好性都可能受到突变压力影响。D.melanogaster线粒体基因组中不存在密码子CGC。NADH dehydrogenase subunit 3基因的密码子偏好性可能比其他NADH dehydrogenase subunit基因更高。此外,尽管大部分NADH dehydrogenase subunit基因偏爱使用A或U结尾的密码子,但是在NADH dehydrogenase subunit 6基因中,有2个AU结尾的密码子(AGA、GCA)的RSCU也为0。[结论]该研究结果为2种果蝇线粒体的进化研究提供了新观点。
关键词
果绳
葡萄
线粒体
密码子偏好性
nadhdehydrogenasesubunit
RSCU
Keywords
Fruit fly
Grape
Mitochondrion
Codon usage bias
NADH dehydrogenase subunit
RSCU
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性分析
王鹏飞
高欢欢
苏玲
蒋锡龙
吴新颖
杨立英
任凤山
王咏梅
《安徽农业科学》
CAS
2018
3
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