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线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用
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作者 吕凤军 王冰洁 +11 位作者 丁伟强 赵莉 班万里 段兰利 穆尼拉·特列吾汗 吴小霞 徐晶 陈云英 郭涛 王方 乌云花 张壮志 《草食家畜》 2020年第4期43-51,共9页
(目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫... (目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫线粒体NADH1基因和微卫星标记进行检测。(结果)PCR扩增分别得到大小约为510 bp的NADH1核苷酸片段和200~300 bp不等的微卫星标记片段,产物的长度与引物设计的预期产物长度一致;序列比对发现不同地区、不同宿主来源的样品序列存在碱基的颠/转换和碱基缺失现象;测序发现8份牛、羊肝/肺包囊样本均为细粒棘球蚴G1基因型感染,4份野生鼠肝包囊均为多房棘球蚴感染,2份狐狸肠道寄生棘球绦虫样本为多房棘球绦虫感染。(结论)线粒体NADH1基因和微卫星标记均适用于棘球绦虫种间和种内的鉴别、分类及系统进化分析研究。 展开更多
关键词 棘球绦虫 nadh脱氢酶亚基1基因 微卫星
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日本血吸虫线粒体DNA两个分子的遗传变异 被引量:10
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作者 郭凯文 牛安欧 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期300-302,共3页
目的 从线粒体DNA的 2个分子 ,探讨我国日本血吸虫的遗传变异。 方法 试剂盒抽提基因组总DNA后 ,以特异性引物对线粒体还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NADH)脱氢酶 1(ND1)和细胞色素c氧化酶I(COI)进行PCR扩增 ,将PCR产物分别测序 ,并... 目的 从线粒体DNA的 2个分子 ,探讨我国日本血吸虫的遗传变异。 方法 试剂盒抽提基因组总DNA后 ,以特异性引物对线粒体还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NADH)脱氢酶 1(ND1)和细胞色素c氧化酶I(COI)进行PCR扩增 ,将PCR产物分别测序 ,并以生物信息学方法加以比较 ,构建系统进化树。 结果 序列系统进化树显示日本血吸虫中国大陆株与中国台湾株之间差异较大 ,在树状图中可归为 2类 ;中国大陆山区型地域株 ,即云南洱源和四川天全在树状图中归为 1类 ;中国大陆湖沼洲滩型地域株 ,即湖南岳阳、江西新建和安徽贵池 3个地域株在树状图中处于并列位置 ;湖北省境内不同地域株在树状图中归为 1类。 结论 我国各地日本血吸虫存在不同程度的遗传变异 ,各地域株间亲缘关系密切 。 展开更多
关键词 地域株 日本血吸虫中国大陆株 线粒体DNA ND1 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 nadh 细胞色素C氧化酶 遗传变异 树状图 总DNA
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重症肺炎患儿NADH脱氢酶1、NADH脱氢酶3和味觉受体2家族成员43基因表达的意义 被引量:1
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作者 刘阳 杨莉 +1 位作者 王凌啸 高利真 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2020年第13期1019-1021,共3页
目的研究重症肺炎患儿NADH脱氢酶1(ND1)、NADH脱氢酶3(ND3)和味觉受体2家族成员43(TAS2R43)基因表达情况及与儿童重症肺炎的关系。方法选取2016年5月至2018年5月驻马店市中心医院儿童重症监护病房住院的儿童重症肺炎患儿30例为重症肺炎... 目的研究重症肺炎患儿NADH脱氢酶1(ND1)、NADH脱氢酶3(ND3)和味觉受体2家族成员43(TAS2R43)基因表达情况及与儿童重症肺炎的关系。方法选取2016年5月至2018年5月驻马店市中心医院儿童重症监护病房住院的儿童重症肺炎患儿30例为重症肺炎组,选取同期在本院体检健康的儿童25例为健康对照组。重症肺炎组男17例,女13例,年龄(5.30±1.69)岁;健康对照组男13例,女12例,年龄(4.96±1.31)岁。使用real-time PCR方法检测ND1、ND3和TAS2R43基因表达量,2-ΔΔCt法计算ND1、ND3和TAS2R43基因相对表达量。结果重症肺炎组ND1、ND3及TAS2R43 mRNA的循环阈(Ct)值分别为20.49±0.45、21.32±0.61和32.20±0.46,健康对照组分别为26.69±0.62、27.50±0.35和26.69±0.49,2组比较差异均有统计学意义(t=-14.02、-15.25、-14.19,均P<0.05)。2-ΔΔCt法计算重症肺炎组ND1、ND3和TAS2R43基因相对表达量是健康对照组的51.27、50.56和0.02倍。结论ND1、ND3和TAS2R43基因在重症肺炎患儿体内有异常表达,这3个基因可能与儿童重症肺炎关系密切。 展开更多
关键词 重症肺炎 nadh脱氢酶1 nadh脱氢酶3 味觉受体2家族成员43 基因表达
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阿拉山口口岸地区多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1基因序列分析 被引量:2
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作者 尹小平 王安东 +3 位作者 田延河 梁臻 巴特 张江国 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2016年第5期481-483,共3页
目的分析阿拉山口口岸多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1(ND1)基因序列。方法使用ND1基因Cest引物对2014年捕获鼠类进行多房棘球蚴初筛,对阳性样品扩增ND1基因全长序列,利用Blast分析序列同源性、Mega 6.0软件构建分子遗传进化树,使用DNA... 目的分析阿拉山口口岸多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1(ND1)基因序列。方法使用ND1基因Cest引物对2014年捕获鼠类进行多房棘球蚴初筛,对阳性样品扩增ND1基因全长序列,利用Blast分析序列同源性、Mega 6.0软件构建分子遗传进化树,使用DNAStar软件分析其跨膜结构、信号肽、B细胞抗原表位等。结果阿拉山口口岸1.57%的野鼠感染多房棘球蚴,其线粒体ND1基因全长894 bp,编码297个氨基酸,与日本的多房棘球蚴AB018440和AB720065同源性最高,为100%。结论阿拉山口口岸地区野鼠存在多房棘球蚴感染,其序列信息为该地区多房棘球蚴的科学监控提供依据。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 线粒体 nadh脱氢酶亚基1 基因 阿拉山口口岸
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安徽省不同地区日本血吸虫群体线粒体基因遗传变异研究 被引量:1
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作者 马晓荷 汪敏 +7 位作者 朱磊 郭见多 李清越 刘婷 翟杜娟 孙成松 张世清 汪天平 《热带病与寄生虫学》 CAS 2021年第5期254-258,共5页
目的探讨安徽省不同地区日本血吸虫种群的遗传进化关系。方法分别从安徽省山丘型流行区(池州市石台县)和湖沼型流行区(安庆市大观区、铜陵市枞阳县)采集钉螺,逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(50±3)条尾蚴。35 d后解剖小鼠,门静脉... 目的探讨安徽省不同地区日本血吸虫种群的遗传进化关系。方法分别从安徽省山丘型流行区(池州市石台县)和湖沼型流行区(安庆市大观区、铜陵市枞阳县)采集钉螺,逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(50±3)条尾蚴。35 d后解剖小鼠,门静脉灌注法收集成虫,提取成虫DNA,PCR扩增、克隆和测序成虫的线粒体NADH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)脱氢酶1(ND1)和细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因,利用生物信息学软件Dnasp 6.0和Mega X分析所得序列基本特征并构建系统进化树作遗传进化分析。结果安徽省三个地区日本血吸虫样本的ND1基因序列存在15个变异位点,COⅠ序列存在74个变异位点;ND1基因和COⅠ基因的核苷酸多样性(Pi)分别为0.0047、0.0173,样本间COⅠ基因序列差异高于ND1基因;来自湖沼型流行区的样本ND1基因和COⅠ基因的变异位点数、核苷酸多样性(Pi)均高于来自山丘型流行区样本。来自山丘型流行区的样本在ND1系统进化树中与来自湖沼型流行区的样本聚集在一起,而在COⅠ基因系统进化树中单独成簇。结论来自湖沼型流行区的日本血吸虫样本群体的基因多样性高于来自山丘型流行区的样本。安徽省三个地区日本血吸虫群体的COⅠ基因存在遗传分化,而ND1基因尚未产生较明显的遗传分化。 展开更多
关键词 日本血吸虫 遗传分化 nadh脱氢酶1基因 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因 安徽省
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湖南省不同种类蛇源裂头蚴线粒体pnad1基因序列多态性研究 被引量:2
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作者 谭磊 王爱兵 +5 位作者 孔小鲜 梁轩 贺峻琳 李洁 胡丹 刘伟 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期448-452,共5页
目的对湖南省不同种类蛇源裂头呦进行形态学与分子生物学鉴定,并分析其线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基基因部分序列(pnad1)多态性。方法对从湖南永州、郴州、岳阳等地区6种常见的野生蛇体内获得的11条裂头勉(来自大王蛇3条、... 目的对湖南省不同种类蛇源裂头呦进行形态学与分子生物学鉴定,并分析其线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基基因部分序列(pnad1)多态性。方法对从湖南永州、郴州、岳阳等地区6种常见的野生蛇体内获得的11条裂头勉(来自大王蛇3条、乌梢蛇2条、眼镜蛇1条、灰鼠蛇2条、滑鼠蛇2条和银环蛇1条)进行形态学鉴定,PCR扩增其线粒体pnad1,并测序,分析其核苷酸序列种内差异,并与已报道的迭宫属绦虫和其他属绦虫的相应序列进行同源性比较;以土耳其斯坦东毕吸虫为外群,用软件MEGA7.0采用邻接法构建系统进化树。结果从不同蛇类分离的11条虫体经形态学鉴定为裂头蚴。PCR扩增出11条裂头蚴分离株的nad1序列,片段大小为648bp,种内遗传差异分别为0~1.4%。与GenBank中收录的欧猬迭宫绦虫分离株序列相似性为97.8%-99.3%,与其它绦虫的序列相似性均低于74.3%。系统进化树结果显示,本研究分离的不同蛇源裂头蚴分离株与已知欧猬迭宫绦虫聚为一支,与微小膜壳绦虫和阔节裂头绦虫亲缘关系较近,与其它绦虫分支相隔较远。结论湖南省不同蛇源裂头蚴分离株均为欧猬迭宫绦虫,但存在一定的遗传变异,且线粒体pnad1基因适合作为分子标记对蛇源裂头蚴进行遗传变异研究。 展开更多
关键词 蛇源裂头蚴 线粒体 线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基基因部分序列基因 系统发育研究
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青岛文昌鱼NADH脱氢酶亚基I基因片段的克隆 被引量:1
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作者 梁恺龙 张晓辉 张红卫 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期88-90,94,共4页
NADH脱氢酶亚基I是细胞电子传递链的主要成员之一 .采用简并引物PCR方法获得青岛文昌鱼NADH脱氢酶亚基I基因片段 ,将其氨基酸序列与其他生物如佛罗里达文昌鱼 ,斑马鱼 ,爪蟾等无脊椎和脊椎动物NADH脱氢酶亚基I基因相应片段进行了同源性... NADH脱氢酶亚基I是细胞电子传递链的主要成员之一 .采用简并引物PCR方法获得青岛文昌鱼NADH脱氢酶亚基I基因片段 ,将其氨基酸序列与其他生物如佛罗里达文昌鱼 ,斑马鱼 ,爪蟾等无脊椎和脊椎动物NADH脱氢酶亚基I基因相应片段进行了同源性分析 ,均显示较高的同源性 .研究结果证实青岛文昌鱼作为脊索动物的代表之一 ,与脊椎动物有着较近的亲缘关系 。 展开更多
关键词 青岛文昌鱼 nadh脱氢酶亚基I 基因片段 基因克隆 脊索动物 同源性分析 线粒体
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