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m5C甲基化修饰及其在肿瘤免疫治疗中的研究进展
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作者 陆云洋 杜维东 余东升 《口腔疾病防治》 2024年第2期143-148,共6页
表观遗传修饰在真核细胞生物学过程中有重要的调节作用。肿瘤免疫疗法是治疗癌症的重要手段和临床策略。5⁃甲基胞嘧啶(5⁃methylcytosine,m5C)是继N6甲基腺苷(N6⁃methyladenosine,m6A)之后发现的表观遗传调控网络的重要组成部分。RNA的m5... 表观遗传修饰在真核细胞生物学过程中有重要的调节作用。肿瘤免疫疗法是治疗癌症的重要手段和临床策略。5⁃甲基胞嘧啶(5⁃methylcytosine,m5C)是继N6甲基腺苷(N6⁃methyladenosine,m6A)之后发现的表观遗传调控网络的重要组成部分。RNA的m5C甲基化修饰能影响被修饰RNA分子的命运,并在包括RNA稳定性、蛋白质合成和转录调控在内的各种生物学过程中发挥重要作用。最近研究表明,m5C甲基转移酶、去甲基化酶、甲基化识别蛋白与多种细胞生物学过程和系统性疾病有关,包括肿瘤的发生、转移和肿瘤免疫微环境等。m5C甲基化修饰可在多个水平上广泛影响基因表达和肿瘤发生发展的生物学过程,但其具体机制及与其他表观遗传修饰的相互作用尚未阐明,其在恶性肿瘤中的调控机制、风险评估和靶向治疗的研究有待深入。本文将从m5C的动态调节网络、m5C修饰在实体瘤中的生物学作用及在肿瘤免疫治疗中的潜在靶点等进行综述。 展开更多
关键词 肿瘤 表观遗传修饰 甲基化修饰 5⁃甲基胞嘧啶 n6甲基腺苷 RnA甲基 免疫治疗 肿瘤微环境 m5C调节蛋白
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YTHDF基因DNA甲基化与乙肝疫苗低/无免疫应答水平关系研究 被引量:4
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作者 苏永健 陈梦丽 +7 位作者 李嘉铃 张家玮 赵文文 陈钦艳 胡莉萍 王超 李海 董柏青 《陕西医学杂志》 CAS 2022年第9期1076-1080,1085,共6页
目的:从表观遗传角度探究N6-甲基腺苷(m 6 A)修饰相关的YTHDF基因DNA甲基化与乙肝疫苗接种者免疫低/无免疫应答水平的关系。方法:收集263例汉族儿童为研究对象。对儿童的外周血进行乙肝血清标志物检测,将乙型肝炎表面抗体(anti-HBs)浓度... 目的:从表观遗传角度探究N6-甲基腺苷(m 6 A)修饰相关的YTHDF基因DNA甲基化与乙肝疫苗接种者免疫低/无免疫应答水平的关系。方法:收集263例汉族儿童为研究对象。对儿童的外周血进行乙肝血清标志物检测,将乙型肝炎表面抗体(anti-HBs)浓度<100 mIU/ml者纳入病例组,将anti-HBs≥100 mIU/ml者纳入对照组。使用Methyl Target技术检测YTHDF基因位点的DNA甲基化水平,分析YTHDF基因81个位点CpG DNA甲基化水平与乙肝疫苗免疫应答水平的关系。结果:病例组纳入104例,对照组纳入159例,两组年龄和性别分布比较差异无统计学意义(均P>0.05)。病例组YTHDF1_1基因23位点、YTHDF1_2基因69位点与YTHDF1_2基因140位点甲基化水平均高于对照组(均P<0.05)。多因素非条件Logistic回归分析表明,YTHDF1_1基因23位点和YTHDF1_2基因140位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的危险因素,而YTHDF1_2基因69位点和YTHDF2_1基因28位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的保护因素(均P<0.05)。结论:YTHDF1_1基因23位点和YTHDF1_2基因140位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的危险因素,YTHDF1_2基因69位点和YTHDF2_1基因28位点甲基化水平可能是乙肝疫苗低/无免疫应答的保护因素。 展开更多
关键词 YTHDF基因 DnA甲基 乙肝疫苗 免疫应答水平 n6甲基腺苷 表观遗传学
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RNA甲基化转移酶METTL3在白血病中的研究进展
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作者 杜佳慧 王晓晓(综述) 刘松柏(审校) 《重庆医学》 CAS 2023年第11期1732-1737,共6页
近年来,RNA修饰成为表观遗传调控的研究新领域,其中,N6-甲基腺苷(m6A)修饰是发生在腺嘌呤第六位N原子上的甲基化修饰,是真核细胞mRNA最常见、最丰富的化学修饰,由甲基转移酶复合体、去甲基化转移酶及相应的阅读器协同调控,对维持mRNA的... 近年来,RNA修饰成为表观遗传调控的研究新领域,其中,N6-甲基腺苷(m6A)修饰是发生在腺嘌呤第六位N原子上的甲基化修饰,是真核细胞mRNA最常见、最丰富的化学修饰,由甲基转移酶复合体、去甲基化转移酶及相应的阅读器协同调控,对维持mRNA的稳定性、调节剪接和翻译等过程具有重要意义,并参与肿瘤、生殖、生物节律等多种病理、生理过程。甲基转移酶样蛋白3(METTL3)作为核心成分,在正常造血和恶性血液肿瘤中起着至关重要的作用。该文重点关注METTL3的结构,及其在正常造血和血液恶性肿瘤中的作用,以及METTL3治疗血液肿瘤的潜力,归纳METTL3在白血病中的研究进展及相关作用机制,为白血病的治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 n6甲基腺苷 甲基转移酶样蛋白3 白血病 小分子抑制剂 研究进展
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IGF2BP2/m6A/ITGA5信号轴调控肾透明细胞增殖和迁移 被引量:1
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作者 张振伟 李佳 陈克明 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2022年第9期74-84,共11页
目的探讨N6-甲基腺嘌呤(m6A)“识别蛋白”胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的潜在作用。方法通过分析癌症基因数据库(TCGA)、采用qRT-PCR法和Western blotting法检测IGF2BP2在肾癌中的表达水平,甲基化... 目的探讨N6-甲基腺嘌呤(m6A)“识别蛋白”胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的潜在作用。方法通过分析癌症基因数据库(TCGA)、采用qRT-PCR法和Western blotting法检测IGF2BP2在肾癌中的表达水平,甲基化RNA免疫沉淀qPCR结合生物信息学鉴定整合素α5(ITGA5)mRNA的m6A修饰。采用基因敲低/过表达技术,采用qRT-PCR和Western blotting法检测IGF2BP2对ITGA5表达调控的作用。通过功能性获得和缺失实验确定IGF2BP2和ITGA5对肾癌细胞增殖和迁移的调控。结果TCGA肾癌数据库显示,IGF2BP2在肾癌组织中高表达。同时高表达的IGF2BP2不利于患者的整体生存期(HR=1.6,P=0.005)和无病生存期(HR=1.9,P=0.014)。qRT-PCR法以及Western blotting法检测结果显示,IGF2BP2在肾癌组织中高表达。Western blotting检测结果显示,正常肾上皮细胞中IGF2BP2的表达低于其他几种肾癌细胞系。基因集合富集分析(GSEA)发现ITGA5可能是IGF2BP2下游靶分子。进一步通过敲除或者过表达发现,IGF2BP2在转录后水平调控ITGA5。甲基化RNA免疫沉淀qPCR发现ITGA5在3′UTR区存在m6A修饰化位点,低m6A修饰可能有助于维持其mRNA的稳定性。结论IGF2BP2在肾透明细胞癌中高表达;IGF2BP2不利于肾癌患者的生存预后;IGF2BP2/m6A/ITGA5信号轴调控肾癌细胞的增殖、迁移和血管新生。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 胰岛素样生长因子2 mRnA结合蛋白2 n6甲基腺苷 增殖 迁移 血管新生
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m6aRNA甲基化在肝细胞癌中的研究进展
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作者 李兵 温迪光(综述) +1 位作者 龚建平 刘作金(审校) 《重庆医学》 CAS 2020年第18期3132-3135,共4页
肝细胞癌(HCC)是全球病死率排名第四的恶性肿瘤,目前对于HCC发生发展机制尚不完全了解,患者预后较差,手术介入等治疗方式往往给患者带来较大损伤且未必能有效延长患者生存时间,寻找HCC新的干预靶点,可以更好地理解HCC发生机制和造福患者... 肝细胞癌(HCC)是全球病死率排名第四的恶性肿瘤,目前对于HCC发生发展机制尚不完全了解,患者预后较差,手术介入等治疗方式往往给患者带来较大损伤且未必能有效延长患者生存时间,寻找HCC新的干预靶点,可以更好地理解HCC发生机制和造福患者。m6aRNA甲基化是一种新兴的在真核细胞中最常见的RNA修饰。目前已经发现m6aRNA甲基化在多种人体生命活动中起重要作用,且参与包括HCC在内的多种肿瘤的发生发展,是一种新的HCC干预靶点,但在某些方面仍存在争议,该文综述了m6aRNA甲基化在HCC治疗中的相关最新研究进展并提出一些笔者的看法。 展开更多
关键词 RnA甲基 肝细胞 n6甲基腺苷
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FTO介导m6A修饰的PRKD2调节SIRT1/HIF-1α通路抑制糖尿病肾病足细胞损伤的机制研究 被引量:1
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作者 李亚宁 李成乾 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第1期5-9,22,共6页
目的探究脂肪含量和肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)和丝氨酸-苏氨酸激酶蛋白激酶D2(serine-threonine kinase protein kinase D2,PRKD2)在糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)进展中的调控作用和调节... 目的探究脂肪含量和肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)和丝氨酸-苏氨酸激酶蛋白激酶D2(serine-threonine kinase protein kinase D2,PRKD2)在糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)进展中的调控作用和调节机制。方法采用35 mmol/L葡萄糖对足细胞(MPC5细胞)进行高糖刺激24h构建DKD体外模型。采用FTO过表达载体(pcDNA-FTO)和PRKD2过表达载体(pcDNA-PRKD2),或空载体(vector)转染高糖诱导的MPC5细胞。通过RT-qPCR检测FTO和PRKD2过表达效率;MeRIP检测PRKD2 mRNA的N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰水平;ELISA检测Caspase-3活性、IL-6,TNF-α和单核细胞趋化蛋白-1(monocyte chemotactic protein-1,MCP-1)分泌量;流式细胞术分析细胞凋亡率;Western blot评估FTO和PRKD2蛋白水平,以及SIRT1/HIF-1α通路关键蛋白表达水平;Pearson分析FTO和PRKD2水平的相关性。结果与无高糖诱导对照组比较,高糖诱导的足细胞中FTO蛋白(0.51±0.04 vs 1.00±0.03)和PRKD2蛋白(0.45±0.03 vs 1.01±0.04)水平显著下调,差异具有统计学意义(t=13.17,16.76,均P<0.001)。高糖诱导的足细胞中FTO蛋白水平和PRKD2蛋白水平呈正相关(r2=0.7051,P<0.001)。与vector组相比,pcDNA-FTO组PRKD2 mRNA的m6A水平(0.56±0.09 vs1.01±0.13)降低,PRKD2 mRNA水平(3.16±0.14 vs 1.03±0.02)显著升高,差异具有统计学意义(t=51.37,11.82,均P<0.001)。与control组(IL-6:512.76±61.85 pg/ml,TNF-α:28.17±2.83 pg/ml,MCP-1:157.31±17.69 pg/ml)和vector组(IL-6:498.41±87.51 pg/ml,TNF-α:26.35±5.47 pg/ml,MCP-1:165.52±16.87 pg/ml)比较,pcDNA-PRKD2组IL-6(301.86±21.85 pg/ml),TNF-α(11.06±4.12 pg/ml),MCP-1分泌量(81.45±9.03pg/ml)显著减少,差异具有统计学意义(F=7.51,10.47,61.97,均P<0.01)。与control组(Caspase-3:689.65±79.5U/L,细胞凋亡率:22.31%±2.69%)和vector组(Caspase-3:715.91±113.58 U/L,细胞凋亡率:21.07%±3.28%)比较,pcDNA-PRKD2组Caspase-3活性(437.64±104.76 U/L)和细胞凋亡率(8.41%±3.15%)下降,差异具有统计学意义(F=2.35,79 展开更多
关键词 糖尿病肾病 足细胞 n6甲基腺苷修饰 脂肪和肥胖相关蛋白 丝氨酸-苏氨酸激酶蛋白激酶D2
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补肾中药调控骨髓间充质干细胞成骨分化的RNA m6A修饰作用研究
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作者 李沂霖 王花欣 +3 位作者 田硕 王洁 董仁超 刘艳秋 《世界中医药》 CAS 北大核心 2024年第2期261-266,共6页
骨髓间充质干细胞(BMSCs)是一种成体干细胞,具有成骨细胞分化能力。BMSCs成骨分化能力减弱易导致骨质疏松等多种骨相关疾病。中医学认为“肾主骨生髓”,补肾中药是治疗骨质疏松的常用药物,具有调控BMSCs成骨分化作用。腺苷N6位甲基化修... 骨髓间充质干细胞(BMSCs)是一种成体干细胞,具有成骨细胞分化能力。BMSCs成骨分化能力减弱易导致骨质疏松等多种骨相关疾病。中医学认为“肾主骨生髓”,补肾中药是治疗骨质疏松的常用药物,具有调控BMSCs成骨分化作用。腺苷N6位甲基化修饰(m6A)是真核生物RNA的转录后修饰,是BMSCs成骨分化的关键因素。探讨m6A动态修饰与BMSCs成骨分化的关系,分析补肾中药调控m6A修饰的可能作用及靶点,能够为补肾中药治疗骨质疏松提供新靶点,为中医肾藏象理论的科学阐释提供思路。 展开更多
关键词 骨间充质干细胞 n6甲基腺苷修饰 补肾中药 成骨分化 骨质疏松 靶点 作用机制 肾藏象
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N6甲基腺苷修饰在非编码RNA中的研究进展 被引量:2
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作者 肖鹏 郎庆赋 裴铁民 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2171-2177,共7页
N6甲基腺苷(m6A)作为真核生物RNA修饰的关键位点,近年来已成为表观遗传学研究的热点。对m6A甲基化修饰的广泛研究表明,m6A影响RNA剪接、转运、翻译和稳定性等多种生物功能,这一过程也直接或间接地受到非编码RNA调控。大量的非编码RNA,例... N6甲基腺苷(m6A)作为真核生物RNA修饰的关键位点,近年来已成为表观遗传学研究的热点。对m6A甲基化修饰的广泛研究表明,m6A影响RNA剪接、转运、翻译和稳定性等多种生物功能,这一过程也直接或间接地受到非编码RNA调控。大量的非编码RNA,例如microRNAs、long non coding RNAs、circular RNAs、small nuclear RNAs和核糖体RNAs,也被m6A高度修饰,进而实现它们的生命活动和生物功能。在这里,我们将对m6A修饰与非编码RNA之间的相互作用进行综述。 展开更多
关键词 n6甲基腺苷修饰 非编码RnA 癌症
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m6A相关长链非编码RNA在黑色素瘤患者预后中的作用研究
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作者 张玉艳 黄亚鹏 +3 位作者 陈倩梅 龙惠 黄久遂 朱慧兰 《今日药学》 CAS 2022年第6期453-461,共9页
目的探讨N6甲基腺苷(m6A)甲基化修饰相关的长链非编码RNA(lncRNA)在黑色素瘤预后中的作用以及可能的机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载黑色素瘤患者的测序和临床数据并进行整合,利用皮尔逊相关系数分析获得与m6A甲基化修饰... 目的探讨N6甲基腺苷(m6A)甲基化修饰相关的长链非编码RNA(lncRNA)在黑色素瘤预后中的作用以及可能的机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载黑色素瘤患者的测序和临床数据并进行整合,利用皮尔逊相关系数分析获得与m6A甲基化修饰酶相关的lncRNA,并基于这些lncRNA在肿瘤患者中的表达通过一致性聚类分析确定黑色素瘤患者的不同分子亚型,进一步分析患者亚型之间肿瘤微环境的差异分布,筛选存在预后价值的lncRNA并进行基因评分(gene score=∑PC1i+∑PC2i),进而分析高/低评分患者之间的差异表达基因与分子通路。结果通过获取的468例黑色素瘤患者的基因测序结果和临床数据,筛选出453个与m6A甲基化修饰酶相关的lncRNA,并基于这些lncRNA在肿瘤患者中确定出两种分子亚型—cluster1与clueter2,其中cluster1的预后明显差于cluster2(P<0.001),而且亚型之间的肿瘤微环境存在明显差异,其中M2型巨噬细胞和滤泡辅助性T细胞在cluster1中表达明显高于cluster2(P<0.05),而静息性NK杀伤细胞、激活的记忆CD4T细胞及M1型巨噬细胞在cluster1中表达明显低于cluster2(P<0.05)。同时获得85个存在预测预后价值的m6A-lncRNA(P<0.05),基因评分高的情况下黑色素瘤患者预后更佳,且高评分患者中的浸润性免疫细胞更为活跃,对于应用PD1与CTLA4免疫抑制剂治疗的应答率更高,此外,高/低评分患者间存在大量差异表达基因,并富集在T细胞激活等免疫细胞调控通路。结论本研究显示m6A甲基转移酶相关lncRNAs与黑色素瘤的预后密切相关,m6A-lncRNAs可能在黑色素瘤肿瘤微环境分布中发挥着一定的调控功能,并可有效预测其对PD1与CTLA4免疫抑制剂治疗反应。 展开更多
关键词 黑色素瘤 n6甲基腺苷(m6A)甲基化修饰 长链非编码RnA 免疫调节 基因评分
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N6-甲基腺苷相关调节因子与骨关节炎:生物信息学和实验验证分析 被引量:2
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作者 袁长深 廖书宁 +5 位作者 李哲 官岩兵 吴思萍 胡琪 梅其杰 段戡 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第11期1724-1729,共6页
背景:越来越多证据表明N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调节因子与骨关节炎密切相关,被认为是防治骨关节炎新方向,但具体作用机制不明。目的:通过对骨关节炎基因芯片数据集进行生物信息学分析,探讨m6A对骨关节炎的作用,解析骨关节... 背景:越来越多证据表明N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调节因子与骨关节炎密切相关,被认为是防治骨关节炎新方向,但具体作用机制不明。目的:通过对骨关节炎基因芯片数据集进行生物信息学分析,探讨m6A对骨关节炎的作用,解析骨关节炎发病机制。方法:首先利用R软件提取GEO数据库中GSE1919数据集中骨关节炎相关m6A调节因子及其表达量,进而对提取结果行基因差异分析及GO、KEGG富集分析;接着对PPI网络拓扑学分析结果和机器学习结果取交集得到m6A关键调节因子,并通过体外细胞实验验证。结果与结论:①提取得到16个骨关节炎相关m6A调节因子表达量,通过差异分析获得ZC3H13、YTHDC1、YTHDF3、HNRNPC等11个m6A差异调节因子;②GO富集分析显示,骨关节炎相关m6A差异调节因子在生物过程中主要于mRNA转运、RNA分解代谢、胰岛素样生长因子受体信号通路调控等发挥作用;③KEGG富集分析显示,差异调节因子主要参与p53、白细胞介素17和AMPK信号通路;④综合PPI网络拓扑学分析和机器学习结果获得m6A关键调节因子——YTHDC1;⑤体外细胞实验结果表明,m6A关键调节因子——YTHDC1在对照组与骨关节炎组中表达存在显著差异(P<0.05);⑥结果显示,YTHDC1与骨关节炎发生发展密切相关,有望成为m6A治疗骨关节炎的分子靶点。 展开更多
关键词 骨关节炎 n6-甲基腺苷 生物信息学 机器学习 调节因子 软骨细胞 实验验证
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信使RNA甲基化在肾脏病中研究进展
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作者 张诗文 栾军军 周华 《临床肾脏病杂志》 2024年第2期143-150,共8页
信使RNA(messenger RNA,mRNA)甲基化修饰近年来研究普遍,包括N6-甲基腺苷(m^(6)A)、N5-甲基胞苷(m^(5)C)和N1-甲基腺苷(m^(1)A)等多种修饰在内。mRNA甲基化修饰的动态可逆生物学过程包括“编码器(Writer)”“消码器(Eraser)”和“读码器... 信使RNA(messenger RNA,mRNA)甲基化修饰近年来研究普遍,包括N6-甲基腺苷(m^(6)A)、N5-甲基胞苷(m^(5)C)和N1-甲基腺苷(m^(1)A)等多种修饰在内。mRNA甲基化修饰的动态可逆生物学过程包括“编码器(Writer)”“消码器(Eraser)”和“读码器(Reader)”的参与,甲基化修饰中出现异常,可导致多种疾病的发生、发展,其中包括急性肾损伤和慢性肾脏病等肾脏相关疾病。mRNA甲基化修饰逐渐成为诊断和监测人类肾脏疾病发生、发展的生物标志物。本文将对mRNA甲基化在各种人类肾脏疾病中的研究展开简要论述。 展开更多
关键词 mRnA甲基 急性肾损伤 慢性肾脏病 n6-甲基腺苷 n1-甲基腺苷 n5-甲基胞苷
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大鼠亚慢性铝暴露N6-甲基腺苷甲基化和N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1分析
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作者 丁晓慧 卢炀 +3 位作者 郝嘉瑞 王甜甜 徐萌彤 宋静 《预防医学》 2024年第9期825-828,共4页
目的观察亚慢性铝暴露对大鼠海马组织N6-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化水平及N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTHDF1)表达的影响。方法24只SPF级雄性SD大鼠,随机分为对照组(生理盐水)和低(10μmoL/kg)、中(20μmoL/kg)、高(40μmoL/kg)剂量Al(mal)3... 目的观察亚慢性铝暴露对大鼠海马组织N6-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化水平及N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTHDF1)表达的影响。方法24只SPF级雄性SD大鼠,随机分为对照组(生理盐水)和低(10μmoL/kg)、中(20μmoL/kg)、高(40μmoL/kg)剂量Al(mal)3组,每组6只,腹腔注射隔天染毒,持续90 d。染毒结束后,采用Morris水迷宫实验测试大鼠逃避潜伏期、目标象限停留时间和穿越平台次数,评估学习记忆能力;处死后,取脑组织称重计算脑体比,取海马组织采用酶联免疫吸附法测定m^(6)A甲基化水平,免疫印迹法测定YTHDF1蛋白相对表达量。结果染毒期间无大鼠死亡。染毒结束后,对照组和低、中、高剂量组大鼠脑体比分别为(0.46±0.06)%、(0.44±0.04)%、(0.49±0.06)%和(0.51±0.07)%,差异无统计学意义(P>0.05)。大鼠逃避潜伏期的时间与组间不存在交互作用(P>0.05),大鼠逃避潜伏期随训练时间增加而缩短(P<0.05);与对照组、低剂量组比较,高剂量组第3~5天大鼠逃避潜伏期延长(均P<0.05)。与对照组比较,低、中、高剂量组大鼠目标象限停留时间缩短,高剂量组大鼠穿越平台次数减少(均P<0.05)。与对照组比较,中、高剂量组大鼠海马组织m^(6)A甲基化水平升高,YTHDF1蛋白相对表达量降低(均P<0.05)。结论亚慢性铝暴露可能通过升高m^(6)A甲基化水平、抑制YTHDF1蛋白表达导致学习记忆能力损害。 展开更多
关键词 n6-甲基腺苷 n6-甲基腺苷RnA结合蛋白1 学习记忆能力
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基于N6-甲基腺苷相关长链非编码核糖核酸表达的喉鳞状细胞癌预后分析 被引量:3
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作者 李念燊 韩杏倩 +5 位作者 何金阳 黎国胜 练淼兰 罗宗华 尹时华 侯涛 《中国耳鼻咽喉颅底外科杂志》 CAS CSCD 2023年第1期81-91,共11页
目的 探索N6-甲基腺苷(m6A)相关长链非编码核糖核酸(lncRNA)与喉鳞状细胞癌(LSCC)的预后关系及其临床意义。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库LSCC的转录组数据和临床数据,共表达分析筛选m6A基因相关的lncRNA,单变量Cox分析m6A相关ln... 目的 探索N6-甲基腺苷(m6A)相关长链非编码核糖核酸(lncRNA)与喉鳞状细胞癌(LSCC)的预后关系及其临床意义。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库LSCC的转录组数据和临床数据,共表达分析筛选m6A基因相关的lncRNA,单变量Cox分析m6A相关lncRNA与LSCC预后关系、套索回归及交叉验证法迭代分析构建LSCC预后模型。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证构建预后模型的lncRNA在LSCC中的转录水平。通过预后模型计算风险评分,将LSCC区分为高、低风险患者,高、低风险患者之间进行基因集富集分析(GSEA)。风险评分与浸润LSCC的免疫细胞进行免疫相关性分析。结果 m6A相关基因与lncRNA的共表达分析筛选出169个与m6A基因相关的lncRNA(相关系数>0.4,P<0.001),通过单变量Cox分析确定了LSCC预后相关lncRNA:ALOX12-AS1(P<0.05)、LINC00528(P<0.05)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.05)、MNX1-AS1(P<0.01)和LINC02043(P<0.05)。套索回归、交叉验证迭代分析结果:变量为4时模型的均方根误差最小,即5个预后相关lncRNA仅有ALOX12-AS1、LINC00528、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB与MNX1-AS1可作为模型变量。预后模型:风险评分=(0.176723096228585×MNX1-AS1表达量)+(-0.614916717648596×ALOX12-AS1表达量)+(-0.814201385798827×LINC00528表达量)+(-0.436537752110547×STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB表达量)。qPCR结果ALOX12-AS1(P<0.0001)、LINC00528(P<0.01)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.0001)、MNX1-AS1(P<0.0001)较于癌旁组织,在LSCC组织表达水平上调。GSEA分析结果:高风险患者在细胞-基质粘附(KEGG_FOCAL_ADHESION)(P<0.05)与细胞外基质受体相互作用(KEGG_ECM_RECEPTOR_INTERACTION)(P<0.05)的通路下调,低风险患者在碱基切除修复(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)、剪接体(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)通路上调。风险评分与免疫浸润细胞相关性分析,风险评分与效应B细胞(R=-0.24,P=0.017)、细胞毒性T细胞(R=-0.26,P=0.0091)和T滤泡辅助细胞(R=-0.22,P=0.028)呈负相关。结论 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 n6-甲基腺苷 长链非编码核糖核酸 基因富集分析 免疫相关性分析
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METTL3介导的LncRNA MIR99AHG通过抑制miR-136-5p表达诱导卵巢颗粒细胞凋亡的机制研究
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作者 常建芳 孙延庆 《中国计划生育和妇产科》 2024年第6期58-64,共7页
目的 研究LncRNA MIR99AHG(MIR99AHG)在化疗药物导致的卵巢颗粒细胞凋亡中的作用及其潜在的调节机制。方法 采集正常女性和卵巢早衰(premature ovarian failure, POF)患者的卵泡液,检测MIR99AHG表达。将卵巢颗粒细胞KGN分为对照组、顺... 目的 研究LncRNA MIR99AHG(MIR99AHG)在化疗药物导致的卵巢颗粒细胞凋亡中的作用及其潜在的调节机制。方法 采集正常女性和卵巢早衰(premature ovarian failure, POF)患者的卵泡液,检测MIR99AHG表达。将卵巢颗粒细胞KGN分为对照组、顺铂组、顺铂+NC shRNA组、顺铂+sh-MIR99AHG组、顺铂+vector组、顺铂+OE-METTL3组、顺铂+OE-METTL3+OE-MIR99AHG组、顺铂+OE-MIR99AHG组、顺铂+NC mimic组、顺铂+miR-136-5p mimic组及顺铂+sh-MIR99AHG+NC inhibitor组和顺铂+sh-MIR99AHG+miR-136-5p inhibitor组。KGN细胞经相应载体或质粒处理后,采用RIP分析MIR99AHG的m6A修饰水平;在线数据库预测MIR99AHG与miR-136-5p的结合位点,并通过荧光素酶报告基因分析进行验证;采用CCK-8和流式细胞术分析KGN细胞的活力和凋亡水平;ELISA检测Caspase-3酶活性;Western blot检测凋亡相关蛋白BCL-2和Bax表达水平。结果 与正常女性相比,POF患者卵泡液中MIR99AHG表达水平显著上调(P<0.001)。与对照组相比,顺铂处理组KGN细胞中MIR99AHG表达显著上调,METTL3表达及蛋白水平显著下调(P<0.05)。与对照组相比,顺铂处理组KGN细胞活力显著降低,细胞凋亡率显著升高(P<0.05);而与NC shRNA组相比,sh-MIR99AHG组KGN细胞活力显著升高,细胞凋亡率显著降低(P<0.05)。RIP分析发现,Anti-m6A抗体下拉复合物中MIR99AHG显著富集。与vector组相比,OE-METTL3组MIR99AHG的m6A水平显著升高,MIR99AHG mRNA表达水平显著降低(P<0.05);OE-METTL3组KGN细胞活力显著升高,细胞凋亡率显著降低(P<0.05);共转染OE-MIR99AHG可逆转OE-METTL3对KGN细胞活力、凋亡及相关蛋白表达的影响。miR-136-5p与MIR99AHGA存在结合位点,MIR99AHGA负调控miR-136-5p表达。与NC-mimic组相比,miR-136-5p mimic组细胞活力及BCL-2蛋白表达明显升高,细胞凋亡率、Caspase-3酶活性及Bax蛋白表达明显降低(P<0.05)。共转染miR-136-5p inhibitor逆转了sh-MIR99AHG对细胞KGN细胞活力、凋亡及相关蛋白表达的 展开更多
关键词 卵巢颗粒细胞 长链非编码mir-99a-let-7c簇宿主基因 n6-甲基腺苷修饰 n6腺苷甲基转移酶样3 微小核糖核酸-136-5p
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环状RNA m6A甲基化修饰在口腔疾病中的研究进展 被引量:3
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作者 杨靖雯 周海文 《口腔疾病防治》 2023年第2期137-141,共5页
N6⁃甲基腺苷(N6⁃methyladenosine,m6A)修饰是真核生物最丰富的一种RNA修饰,广泛参与RNA的核输出、剪接、翻译和降解等过程的调控。越来越多的证据表明环状RNA(circular RNA,circRNA)m6A甲基化修饰与代谢、免疫以及良恶性疾病有关。本文... N6⁃甲基腺苷(N6⁃methyladenosine,m6A)修饰是真核生物最丰富的一种RNA修饰,广泛参与RNA的核输出、剪接、翻译和降解等过程的调控。越来越多的证据表明环状RNA(circular RNA,circRNA)m6A甲基化修饰与代谢、免疫以及良恶性疾病有关。本文对circRNA m6A甲基化修饰在机体生理过程、恶性肿瘤中的作用及口腔疾病中的研究现状作一综述。现有研究显示,m6A甲基化修饰主要通过调节circRNA翻译、促进circRNA的核输出以及促进circRNA降解对circRNA产生影响;circRNA m6A甲基化修饰在免疫、生殖系统、肌细胞发生发育和恶性肿瘤中发挥调控作用;m6A甲基转移酶蛋白3(methyltransferase⁃like 3,METTL3)通过YTH m6A RNA结合蛋白1(YTH m6A RNA binding protein 1,YTHDF1)介导的m6A修饰促进口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的发生,METTL14的高表达可有效降低OSCC的增殖、迁移和侵袭;circRNA m6A甲基化修饰在口腔领域的研究较少,仅限于成釉细胞瘤和口腔种植骨吸收方向的初步研究,在口腔重大疾病(如口腔潜在恶性疾病及OSCC)方向有广阔的研究前景。 展开更多
关键词 环状RnA 非编码RnA 甲基化修饰 n6甲基腺苷 口腔鳞状细胞癌 口腔潜在恶性疾病 口腔 肿瘤 生物标志物
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N6-甲基腺苷修饰在呼吸系统疾病中的研究进展
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作者 韩永康 杜毓锋 +3 位作者 钱力 李丹 孙梓越 刘学军 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第1期136-139,144,共5页
慢性呼吸系统疾病已成为影响我国居民健康的重要因素,给患者、社会带来沉重的经济负担。表观遗传因素在呼吸系统疾病的发生发展中有重要作用,RNA甲基化是重要表观遗传修饰方式之一,其中6-甲基腺嘌呤(m6A)作为一种转录后修饰方式在真核... 慢性呼吸系统疾病已成为影响我国居民健康的重要因素,给患者、社会带来沉重的经济负担。表观遗传因素在呼吸系统疾病的发生发展中有重要作用,RNA甲基化是重要表观遗传修饰方式之一,其中6-甲基腺嘌呤(m6A)作为一种转录后修饰方式在真核生物中广泛存在。关注m6A修饰在肺部疾病中的功能,对深入理解m6A表观遗传学调控规律,阐明肺部疾病的发病机制,提供药物治疗靶点,指导临床诊治具有重要意义。将对RNA m6A修饰在呼吸系统疾病中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 肺部疾病 RnA甲基 n6-甲基腺苷修饰 甲基化转移酶 甲基化酶 甲基化阅读蛋白
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N6-甲基腺苷在疾病中的研究进展
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作者 潘旺 周爱华 《中国药师》 CAS 2024年第8期1436-1444,共9页
N6-甲基腺苷(m6A)修饰是由甲基化酶和去甲基化酶调节,导致一个动态和可逆的过程。m6A水平的变化涉及广泛的细胞过程,包括核RNA输出、mRNA代谢、蛋白质翻译和RNA剪接,与各种疾病有很强的相关性。本文旨在归纳和总结mRNA中m6A表达水平的... N6-甲基腺苷(m6A)修饰是由甲基化酶和去甲基化酶调节,导致一个动态和可逆的过程。m6A水平的变化涉及广泛的细胞过程,包括核RNA输出、mRNA代谢、蛋白质翻译和RNA剪接,与各种疾病有很强的相关性。本文旨在归纳和总结mRNA中m6A表达水平的变化在常见三类疾病中的作用和机制,以及基于m6A在mRNA中水平变化作为药物干预靶点的研究趋势。 展开更多
关键词 n6-甲基腺苷 甲基化酶 甲基化酶 细胞过程 肺癌 肺纤维化 肾癌 急性肾损伤 哮喘 阿尔兹海默症 研究进展
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m6A去甲基化酶ALKBH5在肝细胞癌发生发展中的功能作用
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作者 李倚南 吴俊艺 +4 位作者 吴嘉艺 曾振鑫 傅仰楷 王锦绣 严茂林 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2024年第4期218-226,共9页
目的探讨m6A去甲基化酶ALKBH5在肝细胞癌(HCC)发生发展中的功能作用。方法分析公共数据库(TCGA、CPTAC)中ALKBH5在肝癌和癌旁组织中的mRNA和蛋白表达情况。采用qRT-PCR检测ALKBH5在正常肝细胞LO2和肝癌细胞系HepG2、Hep3B和Huh7中的表达... 目的探讨m6A去甲基化酶ALKBH5在肝细胞癌(HCC)发生发展中的功能作用。方法分析公共数据库(TCGA、CPTAC)中ALKBH5在肝癌和癌旁组织中的mRNA和蛋白表达情况。采用qRT-PCR检测ALKBH5在正常肝细胞LO2和肝癌细胞系HepG2、Hep3B和Huh7中的表达;采用siRNA干扰技术和慢病毒技术构建稳定敲减的肝癌细胞株,并检测ALKBH5 mRNA及蛋白质水平的干扰效率;随后通过CCK-8、平板克隆、细胞划痕及Transwell等实验研究ALKBH5对HCC增殖活性及迁移、侵袭能力的影响。结果对TCGA、CPTAC数据库分析显示,相比于癌旁组织,ALKBH5在肝癌组织中的mRNA[(5.78±0.62)vs(5.41±0.25)]和蛋白表达[(0.09±0.35)vs(-0.01±0.16)]水平呈高表达。ALKBH5在正常肝细胞系LO2(1.0±0.1)中的表达显著低于肝癌细胞Hep3B(1430.7±103.9)、Huh7(1515.6±162.4)和HepG2(311.0±29.6)。通过慢病毒法成功构建ALKBH5稳定敲减的Hep3B、Huh7肝癌细胞株。抑制ALKBH5的表达后,Hep3B和Huh7细胞的增殖活性、迁移和侵袭能力均明显减弱(P<0.05)。结论ALKBH5在肝癌细胞中呈高表达,低表达ALKBH5后,对HCC的恶性生物学行为具有抑制作用,但是ALKBH5在HCC中其他的生物学功能及其关联的调控网络仍需进一步探讨。 展开更多
关键词 肝细胞癌 n6-甲基腺苷 RnA去甲基化酶 ALKBH5 细胞增殖
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m^(6)A及m^(5)C甲基化修饰通过促进细胞增殖与转移影响癌症的发生和发展
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作者 邵爽 郭纪伟 孟玮 《国际医药卫生导报》 2024年第8期1316-1320,共5页
在RNA中已经发现了170多种化学修饰,RNA甲基化修饰是一个重要的转录后修饰过程,N6-甲基腺苷(m^(6)A)和5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)普遍存在于真核生物和原核生物中,使得RNA甲基化在调控基因表达进而影响细胞生物活性的研究越来越受到重视。与... 在RNA中已经发现了170多种化学修饰,RNA甲基化修饰是一个重要的转录后修饰过程,N6-甲基腺苷(m^(6)A)和5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)普遍存在于真核生物和原核生物中,使得RNA甲基化在调控基因表达进而影响细胞生物活性的研究越来越受到重视。与细胞增殖和转移有关的信号通路调控肿瘤免疫、代谢等细胞活动,并在调节器官大小、组织再生和干细胞自我更新中起着关键作用,影响癌症的发生和发展。在本综述中,我们讨论m^(6)A及m^(5)C甲基化修饰通过一些热门通路调控癌症的发生和发展,这为我们从RNA甲基化的角度理解疾病和寻找新的治疗方法提供了新的理论基础。 展开更多
关键词 RnA甲基化修饰 信号通路 n6-甲基腺苷 5-甲基胞嘧啶 癌症发生和发展 进展
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AlkB同源蛋白5去除前mRNA加工因子6的mRNA甲基化修饰调控肝细胞癌的细胞增殖
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作者 邹岩 李辉 +1 位作者 姜桂春 谢艳敏 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2024年第1期67-75,共9页
目的探讨AlkB同源蛋白5(AlkBhomolog5,ALKBH5)在肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)的细胞增殖中的作用。方法通过癌症基因组图谱数据库分析ALKBH5和前mRNA加工因子6(pre-mRNA processing factor 6,PRPF6)在HCC组织中的表达水平。... 目的探讨AlkB同源蛋白5(AlkBhomolog5,ALKBH5)在肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)的细胞增殖中的作用。方法通过癌症基因组图谱数据库分析ALKBH5和前mRNA加工因子6(pre-mRNA processing factor 6,PRPF6)在HCC组织中的表达水平。采用实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法检测ALKBH5和PRPF6在HCC细胞系(Huh7和Hep3B)中的mRNA和蛋白表达水平。荧光原位杂交确定ALKBH5和PRPF6在HCC细胞系(Huh7和Hep3B)中的亚细胞定位。在免疫沉淀复合物中检测PRPF6的N6-甲基腺苷甲基化水平。通过过表达和敲低基因表达的方法,将Huh7细胞和Hep3B细胞分别进行转染,分组为sh-NC组(阴性对照转染细胞)、sh-ALKBH5实验组(ALKBH5干扰序列转染细胞)、sh-ALKBH5+ex-PRPF6实验组(ALKBH5干扰序列转染+PRPF6 pcDNA 3.1过表达质粒转染细胞),并采用CCK-8和染色增殖试验检测各组细胞的增殖情况。裸鼠异种移植瘤实验验证ALKBH5和PRPF6在体内的生物学功能。蛋白质印迹法检测各组细胞中AKT/mTOR通路相关蛋白的表达水平。结果HCC细胞中ALKBH5的表达上调,可以去除PRPF6的甲基化修饰。体外和体内实验结果显示,ALKBH5可通过调节PRPF6的表达参与HCC细胞的恶性增殖。此外,敲低ALKBH5会抑制丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine-threonine kinase,AKT)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)的磷酸化,而PRPF6的过表达则有助于AKT和mTOR的磷酸化。结论ALKBH5能促进HCC细胞的增殖,相关机制是通过ALKBH5/PRPF6/AKT/mTOR轴实现的。 展开更多
关键词 Alk B同源蛋白5 前mRnA加工因子6 n6-甲基腺苷 肝细胞癌 增殖
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