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基于N端信号的蛋白质亚细胞定位识别 被引量:2
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作者 贾芸 赵巨东 吕军 《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》 2008年第2期81-87,共7页
对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标.一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植... 对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标.一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植物定位类型和3个非植物定位类型,5-fold交叉检验的总精度分别为87%和91%,所得结果与已有模型相比,预测结果较好. 展开更多
关键词 亚细胞定位 多样性增量 二次判别分析 氨基酸组分 n端信号
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细胞色素P450的研究进展 被引量:17
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作者 赵博 王中伟 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第1期142-144,共3页
真核细胞中 ,细胞色素P4 5 0主要分布在内质网和线粒体内膜上 ,通过N端的疏水序列将其锚定在膜。分拣机制依赖于N端信号序列 ,而降解则主要通过细胞质中ATP依赖的泛素降解途径 ,最终被 2 6S蛋白酶体所降解。作为一种末端加氧酶 ,参与了... 真核细胞中 ,细胞色素P4 5 0主要分布在内质网和线粒体内膜上 ,通过N端的疏水序列将其锚定在膜。分拣机制依赖于N端信号序列 ,而降解则主要通过细胞质中ATP依赖的泛素降解途径 ,最终被 2 6S蛋白酶体所降解。作为一种末端加氧酶 ,参与了生物体内的甾醇类激素合成等过程 ,肝脏中的细胞色素P4 5 展开更多
关键词 细胞色素P450 n端信号序列 26S蛋白酶 激素合成 药物代谢 结构 分拣机制 降解机制
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Cry1Ia蛋白N端信号肽对其蛋白表达量的影响 被引量:1
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作者 郭俊佩 刘璇 +2 位作者 韩阜志 高建华 史宗勇 《山西农业科学》 2021年第6期694-698,共5页
Cry1Ia是苏云金芽孢杆菌表达的分泌型Cry杀虫蛋白。为了研究Cry1Ia蛋白N端信号肽(Iasp)区域对其蛋白表达量的影响,梯度删除了N端氨基酸序列,将这些缺失突变体基因接入p ET28a Del表达载体,并转化大肠杆菌BL21 Star(DE3)感受态细胞,得到... Cry1Ia是苏云金芽孢杆菌表达的分泌型Cry杀虫蛋白。为了研究Cry1Ia蛋白N端信号肽(Iasp)区域对其蛋白表达量的影响,梯度删除了N端氨基酸序列,将这些缺失突变体基因接入p ET28a Del表达载体,并转化大肠杆菌BL21 Star(DE3)感受态细胞,得到一系列缺失突变体,即Cry1Ia D5、Cry1Ia D10、Cry1Ia D13、Cry1Ia D16、Cry1Ia D24、Cry1Ia D32、Cry1Ia D44和Cry1Ia D73,分析其蛋白表达和m RNA热稳定性。结果显示,8种Cry1Ia蛋白突变体均成功表达,其中,Cry1Ia D32和Cry1Ia D44的表达量高于Cry1Ia,分别为Cry1Ia的1.43、1.12倍,Cry1Ia D13和Cry1Ia D16表达量与Cry1Ia基本持平,其余4种蛋白的表达量低于Cry1Ia;对m RNA起始密码子附近的核苷酸序列的二级结构进行预测发现,不同突变体该区域能够形成不同的茎环结构,且其热稳定性能具有一定的差异;进一步对蛋白相对表达量和m RNA结构热稳定性进行相关性分析表明,2个变量间无显著相关关系。研究结果可为揭示Iasp的功能奠定一定理论基础。 展开更多
关键词 苏云金芽孢杆菌 大肠杆菌 Cry1Ia蛋白 n端信号 原核表达
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一种基于最优局部信息融合的蛋白质亚细胞定位预测方法 被引量:3
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作者 张树波 赖剑煌 何建国 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期16-21,共6页
基于蛋白质的合成及分选机制,提出了一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法。先采用遍历搜索技术,找出各种亚细胞蛋白质序列分选信号和成熟蛋白质之间的最佳分割位点,把蛋白质序列分为两条子序列,计算这两条子序列中的氨基酸组份并将它们融... 基于蛋白质的合成及分选机制,提出了一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法。先采用遍历搜索技术,找出各种亚细胞蛋白质序列分选信号和成熟蛋白质之间的最佳分割位点,把蛋白质序列分为两条子序列,计算这两条子序列中的氨基酸组份并将它们融合起来作为整条蛋白质序列的特征,然后构造用于识别每类蛋白质的最佳子分类器,再根据最大化原则组建集成分类器。在NNPSL数据集上,采用5重交叉验证方法对本文方法进行测试,原核和真核两个蛋白质序列子集分别取得94.1%和87.5%的总体预测精度。同时,此方法在一些蛋白质序列中找到的分割位点与真实生物现象相吻合,能为预测蛋白质序列的剪切位点提供参考信息。 展开更多
关键词 亚细胞定位n端分选信号 成熟蛋白质 支持向量机 分割位点
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通过去除V3 N306聚糖改变N端糖基化信号效应提高HIV-1 env DNA疫苗的免疫原性
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作者 闭兰 《国外医学(预防.诊断.治疗用生物制品分册)》 2003年第1期36-36,共1页
关键词 艾滋病 n端糖基化信号效应 HIV-1 DNA疫苗 免疫原性
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