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森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析
被引量：
5
1
作者
徐昇
张鑫
+1 位作者
刘德才
顾婷婷
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期2194-2206,共13页
通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个...
通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据及实时定量荧光PCR分析显示,各个基因均具有时空表达特异性和非生物胁迫响应。其中1个DAMT基因表达量在果实中较高且随果实成熟上调,推测可能参与调控果实成熟。此外,这5个基因在冷胁迫下表达水平有不同程度下调:而在热胁迫下各基因表达量变化显著不同。由此推测6m A甲基转移酶基因可能参与了森林草莓的生长发育和对冷、热胁迫的响应。
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关键词
森林草莓
^
n
^
6
-腺嘌呤甲基化(
6
mA)
^
n
^
6
-腺嘌呤甲基转移酶
系统进化
逆境胁迫
原文传递
题名
森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析
被引量：
5
1
作者
徐昇
张鑫
刘德才
顾婷婷
机构
南京农业大学园艺学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期2194-2206,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31672123)
江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015B156)。
文摘
通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据及实时定量荧光PCR分析显示,各个基因均具有时空表达特异性和非生物胁迫响应。其中1个DAMT基因表达量在果实中较高且随果实成熟上调,推测可能参与调控果实成熟。此外,这5个基因在冷胁迫下表达水平有不同程度下调:而在热胁迫下各基因表达量变化显著不同。由此推测6m A甲基转移酶基因可能参与了森林草莓的生长发育和对冷、热胁迫的响应。
关键词
森林草莓
^
n
^
6
-腺嘌呤甲基化(
6
mA)
^
n
^
6
-腺嘌呤甲基转移酶
系统进化
逆境胁迫
Keywords
Fragaria
vesca
^
n
^
6
-
adenine
methylatio
n
^
n
^
6
-
adenine
dna methyltransferase
genes
phyloge
n
etic
evolutio
n
abiotic
stress
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析
徐昇
张鑫
刘德才
顾婷婷
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
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