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一株新型旱獭源性宽谱大肠杆菌噬菌体的分离鉴定及基因组分析 被引量:3
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作者 黄倩妮 陶媛美慧 +5 位作者 黄虞远 濮吉 罗雪莲 金东 杨晶 徐建国 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期3503-3517,共15页
【目的】分离喜马拉雅旱獭肠内容物样本中的噬菌体,并研究其生物学特性和基因组特征。【方法】以大肠杆菌为宿主菌,利用双层琼脂平板法从喜马拉雅旱獭肠内容物样本中分离噬菌体;用透射电镜观察形态特征;测定其最佳感染复数、一步生长曲... 【目的】分离喜马拉雅旱獭肠内容物样本中的噬菌体,并研究其生物学特性和基因组特征。【方法】以大肠杆菌为宿主菌,利用双层琼脂平板法从喜马拉雅旱獭肠内容物样本中分离噬菌体;用透射电镜观察形态特征;测定其最佳感染复数、一步生长曲线、酸碱耐受度及宿主裂解谱等生物学特性,并进行全基因组测序。【结果】从喜马拉雅旱獭肠内容物样本中分离得到一株裂解性大肠杆菌噬菌体,命名为vB_EcoM_TH18,其噬菌斑呈无晕环的透亮圆形,透射电镜观察发现该噬菌体头部直径为(90±5)nm,尾部长度为(115±5)nm;最佳感染复数为1;一步生长曲线显示其潜伏期为10 min,110 min后进入平台期,平均裂解量为15 PFU/mL;在pH 4.5–9.5的范围内具有稳定活性;可裂解多种致病型和血清型大肠杆菌和宋内志贺氏菌,无法裂解沙门氏菌、屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌及鲍曼不动杆菌;基因组测序结果表明,其基因组长度为133882 bp,GC含量为39.95%。基因组共注释到210个编码序列(CDS)和13个tRNAs,不含毒力基因及耐药基因。BLASTn比对结果表明该基因组与Avunavirus属噬菌体Av-05同源性为95.17%。基于噬菌体全基因组、主要衣壳蛋白和终止酶大亚基分别构建系统进化树,结果表明vB_EcoM_TH18是一株肌尾噬菌体科(Myoviridae)Avunavirus属的新型噬菌体。【结论】从喜马拉雅旱獭肠内容物中成功分离并鉴定了一株新型宽谱大肠杆菌噬菌体vB_EcoM_TH18,可裂解多种致病型和血清型的大肠杆菌及宋内志贺菌。 展开更多
关键词 噬菌体 大肠杆菌 肌尾噬菌体科 生物学特性
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云南松鼠鼠疫噬菌体的分离鉴定及其流行病学意义 被引量:3
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作者 钟佑宏 吴鹤松 +9 位作者 邵宗体 申小娜 郭英 张海鹏 董珊珊 杨丽华 黄英 梁云 李伟 王鹏 《中华地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期406-410,共5页
目的了解云南松鼠是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2015-2018年,在云南鼠疫疫源地和非疫源地的5个调查点进行鼠疫宿主动物调查。对调查中捕获的松鼠,取其脾、肝、肠道标本,低温保存备用。取肠道标本磷酸盐缓冲液(PBS)增菌... 目的了解云南松鼠是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2015-2018年,在云南鼠疫疫源地和非疫源地的5个调查点进行鼠疫宿主动物调查。对调查中捕获的松鼠,取其脾、肝、肠道标本,低温保存备用。取肠道标本磷酸盐缓冲液(PBS)增菌液,经0.22μm滤膜滤过后加入到含有100μl鼠疫疫苗株(EV76)菌悬液的LB液体培养基中,28℃、220 r/min恒温气浴振荡培养18~24 h,采用双层平板法观察噬菌斑的生长情况,电镜下观察鼠疫噬菌体的形态结构;同时取脾、肝、肠道标本进行鼠疫菌特异标志基因caf1检测。结果共捕获到10只松鼠,其中赤腹松鼠8只,珀氏长吻松鼠2只。共分离出4株鼠疫噬菌体,其中在赤腹松鼠分离出2株,在珀氏长吻松鼠分离出2株;家鼠鼠疫疫源地弥勒县和新平县各分离出1株,野鼠鼠疫疫源地剑川县和洱源县未分离出,非鼠疫疫源地永善县分离出2株。肉眼下观察,家鼠鼠疫疫源地分离出的2株噬菌体产生的噬斑为透明状,生长状态良好;非鼠疫疫源地分离出的2株噬菌体产生的噬斑为半透明状,生长状态欠佳。电镜下观察,噬菌体为较典型的肌尾噬菌体,噬菌体头部直径约40 nm,肌尾约120 nm,肌尾末梢可见尾丝簇。10份松鼠脾、肝、肠道标本caf1检测均为阴性。结论云南松鼠中携带鼠疫噬菌体的比例较高,虽然鼠疫菌特异标志基因caf1检测均为阴性,但由于鼠疫噬菌体的存在,松鼠有可能成为鼠疫菌传播的一种载体。 展开更多
关键词 赤腹松鼠 珀氏长吻松鼠 鼠疫噬菌体 肌尾噬菌体 流行病学
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2株肺炎克雷伯菌肌尾噬菌体的鉴定 被引量:1
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作者 高云航 张红伟 +2 位作者 马红霞 么乃全 徐凤宇 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2021年第5期29-32,37,F0004,共6页
为了减少肺炎克雷伯菌对动物及人的危害,本试验以多重耐药肺炎克雷伯菌为宿主,采用双层平板法从健康猪、牛粪便中各分离到1株毒性噬菌体,命名为KP1、KP2。透射电镜观察发现,KP1、KP2均属肌尾噬菌体科,对乙醚、氯仿不敏感,在40~60℃或pH ... 为了减少肺炎克雷伯菌对动物及人的危害,本试验以多重耐药肺炎克雷伯菌为宿主,采用双层平板法从健康猪、牛粪便中各分离到1株毒性噬菌体,命名为KP1、KP2。透射电镜观察发现,KP1、KP2均属肌尾噬菌体科,对乙醚、氯仿不敏感,在40~60℃或pH 4~11条件下有良好的感染性;二者的最佳感染复数分别为0.1、0.01,潜伏期分别为20 min、30 min,裂解期分别为60 min、80 min,裂解量分别约15 PFU/cell、11 PFU/cell。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 肌尾噬菌体 鉴定
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一株希瓦氏菌低温噬菌体的分离及特征研究
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作者 李明源 王继莲 +1 位作者 朱平 库尔班江·艾买提 《海洋湖沼通报》 CSCD 北大核心 2017年第6期137-145,共9页
采用双层平板法从新疆东帕米尔高原喀拉库勒湖中分离纯化低温噬菌体,并对其特征进行研究。结果分离得到1株烈性低温噬菌体,命名为KLP17,其宿主菌KLB17经16SrRNA基因序列分析鉴定为Shewanella菌株。KLP17裂解性好,可在双层平板上感染宿主... 采用双层平板法从新疆东帕米尔高原喀拉库勒湖中分离纯化低温噬菌体,并对其特征进行研究。结果分离得到1株烈性低温噬菌体,命名为KLP17,其宿主菌KLB17经16SrRNA基因序列分析鉴定为Shewanella菌株。KLP17裂解性好,可在双层平板上感染宿主菌KLB17形成直径2-4mm的圆形、透明噬菌斑。电镜下其颗粒形态呈头尾型,头部为正多面体对称,直径约88nm,收缩性尾长约160nm,属肌尾噬菌体科(Myoviridae)。噬菌体KLP17对高温敏感,耐碱不耐酸,对氯仿和异丙醇均不敏感,但对SDS和蛋白酶K十分敏感,推测其衣壳组分为蛋白质而无脂质包被。KLP17最佳感染复数为0.01,感染宿主菌KLB17的潜伏期、裂解期分别为55min和30min,裂解量为27。酶切结果显示其基因组为dsDNA,大小约67~69kb,研究结果不仅为进一步探究微生物适冷机制积累重要素材,而且为深入解析低温噬菌体与宿主菌及环境的互作关系提供数据参考。 展开更多
关键词 喀拉库勒湖 希瓦氏菌 低温噬菌体 肌尾噬菌体科
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一株金黄色葡萄球菌噬菌体的裂解谱特异性和分子分类研究 被引量:8
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作者 张志宏 杨娇 +2 位作者 张海鹏 钟佑宏 王鹏 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2043-2052,共10页
【目的】从医院污水中分离金黄色葡萄球菌噬菌体,观察其形态,确证裂解谱特征并研究生物学和基因学特性,为噬菌体的临床应用奠定实验基础。【方法】将金黄色葡萄球菌ATCC25923作为宿主菌,采用双层琼脂平板法从医院污水中分离纯化噬菌体,... 【目的】从医院污水中分离金黄色葡萄球菌噬菌体,观察其形态,确证裂解谱特征并研究生物学和基因学特性,为噬菌体的临床应用奠定实验基础。【方法】将金黄色葡萄球菌ATCC25923作为宿主菌,采用双层琼脂平板法从医院污水中分离纯化噬菌体,电镜下观察形态并测定其最佳感染复数、一步生长曲线及裂解谱;全基因组测序并进行基因结构分析和功能注释。【结果】从4份医院污水中共分离到1株金黄色葡萄球菌噬菌体(命名为vB_SauH_SAP1),仅裂解10株临床分离的葡萄球菌属受试菌(共计37株),其余74株其他种属菌株不能被裂解;透射电镜观察具有正20面体头部和收缩性尾部,属于肌尾噬菌体;其最佳感染复数为0.1,潜伏期10 min,裂解期为20 min。vB_SauH_SAP1基因组全长143375 bp,G+C含量为30.2%,编码226个开放阅读框(ORF),未发现已知的毒力相关基因和抗生素抗性基因,基因组与Kayvirus属葡萄球菌噬菌体有较高的同源性。【结论】分离到1株新的Kayvirus属金黄色葡萄球菌噬菌体,根据生物学特性和基因组研究,具有一定的潜在应用价值。 展开更多
关键词 肌尾噬菌体 金黄色葡萄球菌 生物学特性 全基因组测序 基因组研究
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