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结核分枝杆菌蛋白Rv1872c的表达、纯化及其生物信息学分析 被引量:3
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作者 唐王刚 司雨 +1 位作者 张娜 连超群 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2020年第10期1117-1121,1127,共6页
目的异源表达并纯化结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)H37Rv的Rv1872c蛋白,探讨抗Mtb药物新型靶点。方法PCR扩增Rv1872c编码基因,构建融合表达载体pET-Rv1872c,并转化至大肠埃希菌(E.coli)BL21(DE3)中,加入异丙基硫代-β-D... 目的异源表达并纯化结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)H37Rv的Rv1872c蛋白,探讨抗Mtb药物新型靶点。方法PCR扩增Rv1872c编码基因,构建融合表达载体pET-Rv1872c,并转化至大肠埃希菌(E.coli)BL21(DE3)中,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)进行诱导表达。用Co2+亲和层析纯化Rv1872c融合蛋白,并对其进行生物信息学分析。结果经SDS-PAGE和Western blot分析,证明Rv1872c融合蛋白在E.coli中完全以包涵体形式表达,其亚基相对分子质量约46200,且在变性条件下,经亲和层析获得高纯度的Rv1872c融合蛋白。生物信息学分析表明,Rv1872c为不稳定的碱性蛋白,主要二级结构元件为α-螺旋和无规则卷曲,无跨膜区,推测为外周膜蛋白,且为潜在的醌依赖型L-乳酸脱氢酶。结论通过原核表达和亲和层析,成功获得了高纯度的Rv1872c融合蛋白,为进一步功能鉴定和开发抗Mtb药物新型靶点提供了参考。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌h37rv rv1872c蛋白 原核表达 亲和层析 生物信息学
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结核分支杆菌H_(37)Rv莽草酸脱氢酶基因的克隆、表达及酶学性质的研究 被引量:2
2
作者 于海东 张雪莲 +5 位作者 王宝林 雷建强 曹健 淳于利娟 许云敏 王洪海 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期195-199,205,共6页
以结核分支杆菌H3 7Rv基因组为模板 ,扩增了该菌株的莽草酸脱氢酶基因aroE ,通过在大肠杆菌BL2 1(DE3) pLYS中表达 ,纯化出可溶性的重组结核分支杆菌莽草酸脱氢酶 (SD) .对其酶学性质测定分析表明 :在辅酶NADPH作用下该酶可催化还原 3 ... 以结核分支杆菌H3 7Rv基因组为模板 ,扩增了该菌株的莽草酸脱氢酶基因aroE ,通过在大肠杆菌BL2 1(DE3) pLYS中表达 ,纯化出可溶性的重组结核分支杆菌莽草酸脱氢酶 (SD) .对其酶学性质测定分析表明 :在辅酶NADPH作用下该酶可催化还原 3 脱氢莽草酸生成莽草酸 ,最适pH值为 11,最适温度为 6 3℃ ,比活性 8.2 6× 10 4U/mg .Mg2 + ,Ni2 + ,Zn2 + 等金属离子及NP4 0、TritonX 10 0等变性剂对其酶活有一定的促进作用 ,而SDS则强烈抑制该酶活性 .应用圆二色仪初步测定了重组蛋白的二级结构 ,重组SD的二级结构中大约有 2 9.2 %的α螺旋 ,9.3% β折叠 ,32 .7% β转角 ,2 8.8%无规卷曲 .结核分支杆菌H3 7Rv莽草酸脱氢酶基因的克隆 ,为该酶的晶体结构分析、免疫学研究及抗结核药物靶点的筛选奠定基础 . 展开更多
关键词 结核分支杆菌h37rv 莽草酸途径 莽草酸脱氢酶SD
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兔脊柱结核模型建立的实验研究 被引量:2
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作者 陶亢 张峥 +10 位作者 呼西旦.阿巴拜克力 姜涛 古努尔.吐尔逊 李海建 吴林波 龙志成 白晶晶 丁俐文 陈江涛 王翀 宋兴华 《新疆医科大学学报》 CAS 2015年第8期937-940,共4页
目的建立H37Rv结核分支杆菌诱导的兔脊柱结核模型。方法选择未致敏处理的新西兰大白兔48只,在第5腰椎近椎间盘处钻孔,并填充明胶海绵,注射0.5 mg/0.1 m L结核菌悬液,术后观察新西兰大白兔一般情况,并用影像学、组织病理学、细菌学等检... 目的建立H37Rv结核分支杆菌诱导的兔脊柱结核模型。方法选择未致敏处理的新西兰大白兔48只,在第5腰椎近椎间盘处钻孔,并填充明胶海绵,注射0.5 mg/0.1 m L结核菌悬液,术后观察新西兰大白兔一般情况,并用影像学、组织病理学、细菌学等检查对兔脊柱结核模型进行评估。结果受H37Rv结核菌株感染后的新西兰大白兔,局部反应较明显,全身反应较轻。48只兔中38只兔完成实验,10只因死亡、术后截瘫被淘汰,15只兔分别于术后第5、6周出现进食欠佳、消瘦,但生命体征平稳,其中4只术区局部肿胀,6只出现下肢运动障碍;其余23只兔术后进食较好,体质量未见明显变化。术后3个月行外科手术,暴露致病兔椎体,38只兔中29只兔椎体可见虫噬样改变,9只兔椎体未见明显变化。术中取脓肿形成的兔脓液培养示结核分枝杆菌生长;取周围软组织、脓壁行苏木精-伊红色(HE)染色,示坏死灶形成、较多炎细胞聚集、淋巴细胞、较少上皮样细胞,骨结构紊乱或消失。建立模型成功率为76.3%(29/38)。结论使用0.5 mg/0.1 m L的H37Rv标准菌株感染的新西兰白兔结核模型建立成功。 展开更多
关键词 脊柱结核 动物模型 h37rv结核分支杆菌
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利用插入序列IS6110建立结核分枝杆菌检测方法的研究 被引量:2
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作者 金福姝 薛强 +3 位作者 邹明强 傅迎 房芳 滕文峰 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第21期3053-3055,共3页
目的利用DNA聚合酶链式反应(PCR)扩增技术,建立一种敏感、特异的结核分枝杆菌检测方法,并探讨该方法在早期检测结核分枝杆菌中的应用价值。方法以结核分枝杆菌特异性较好的插入序列IS6110基因片段为目的序列,设计一对特异性引物,对结核... 目的利用DNA聚合酶链式反应(PCR)扩增技术,建立一种敏感、特异的结核分枝杆菌检测方法,并探讨该方法在早期检测结核分枝杆菌中的应用价值。方法以结核分枝杆菌特异性较好的插入序列IS6110基因片段为目的序列,设计一对特异性引物,对结核分枝杆菌H37Rv、大肠杆菌、肠炎沙门菌、志贺菌、金黄色葡萄球菌、单增李斯特菌进行聚合酶链式反应扩增检测。结果只有结核分枝杆菌H37Rv菌株经聚合酶链反应扩增后可见247 bp的特异性条带,其余5种非结核分枝杆菌菌株扩增产物经电泳后均未出现特异性条带。敏感性实验可检测出10 fg结核分枝杆菌DNA。结论插入序列IS6110 DNA聚合酶链反应(PCR)是一种敏感、特异的结核分枝杆菌H37Rv的检测方法,为结核分枝杆菌的早期实验室检测提供了新的参考。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌h37rv 结核病 聚合酶链反应 敏感性 特异性
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Quantitative Structure-Activity Relationship Study of a Benzimidazole-Derived Series Inhibiting Mycobacterium tuberculosis H37Rv
5
作者 Georges Stéphane Dembélé Mamadou Guy-Richard Koné +2 位作者 Fandia Konate Doh Soro Nahossé Ziao 《Computational Chemistry》 2022年第2期71-96,共26页
This work was carried out on a series of twenty-two (22) benzimidazole derivatives with inhibitory activities against Mycobacterium tuberculosis H37Rv by applying the Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR... This work was carried out on a series of twenty-two (22) benzimidazole derivatives with inhibitory activities against Mycobacterium tuberculosis H37Rv by applying the Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) method. The molecules were optimized at the level DFT/B3LYP/6-31 + G (d, p), to obtain the molecular descriptors. We used three statistical learning tools namely, the linear multiple regression (LMR) method, the nonlinear regression (NLMR) and the artificial neural network (ANN) method. These methods allowed us to obtain three (3) quantitative models from the quantum descriptors that are, chemical potential (μ), polarizability (α), bond length l (C = N), and lipophilicity. These models showed good statistical performance. Among these, the ANN has a significantly better predictive ability R<sup>2</sup> = 0.9995;RMSE = 0.0149;F = 31879.0548. The external validation tests verify all the criteria of Tropsha et al. and Roy et al. Also, the internal validation tests show that the model has a very satisfactory internal predictive character and can be considered as robust. Moreover, the applicability range of this model determined from the levers shows that a prediction of the pMIC of the new benzimidazole derivatives is acceptable when its lever value is lower than 1. 展开更多
关键词 mycobacterium tuberculosis h37rv Benzimidazole Derivatives QSAR ANN Applicability Domain
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结核杆菌H_(37)Rv异柠檬酸裂解酶基因的克隆及表达 被引量:1
6
作者 李大为 肖春玲 关艳 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期368-371,共4页
目的 构建在大肠杆菌中高效表达结核杆菌H37Rv异柠檬酸裂解酶(ICL)的重组质粒,实现ICL在原核表达系统的高效稳定表达。方法 采用PCR和克隆技术构建含有结核杆菌H37TRy ICL基因的表达质粒pET30(a)-Rv0467,转化至E.coli BL21(DE3)中诱导... 目的 构建在大肠杆菌中高效表达结核杆菌H37Rv异柠檬酸裂解酶(ICL)的重组质粒,实现ICL在原核表达系统的高效稳定表达。方法 采用PCR和克隆技术构建含有结核杆菌H37TRy ICL基因的表达质粒pET30(a)-Rv0467,转化至E.coli BL21(DE3)中诱导表达。目的蛋白经金属螯合层析纯化后,对其活性进行初步研究。结果 构建了高效表达结核杆菌H37Rv ICL的质粒;在E.coli BL21(DE3)中得到高效表达,目的蛋白占总蛋白含量的30%;表达产物以可溶性形式存在,通过金属螯合层析纯化,所得酶的纯度为90%;目的蛋白具有ICL的活性。结论 利用原核表达系统成功克隆表达了结核杆菌H37Rv的ICL,为以ICL为靶点建立新型抗结核药物奠定了基础。 展开更多
关键词 异柠檬酸裂解酶 结核杆菌h37rv 克隆 基因表达
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结核分枝杆菌Rv0357c蛋白的生物信息学分析与鉴定
7
作者 唐王刚 梅传忠 +2 位作者 高佳慧 司雨 连超群 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期52-56,共5页
为鉴定结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv0357c蛋白的生物学功能,进而寻找新的抗Mtb靶点,对Rv0357c进行生物信息学分析,构建了表达Rv0357c的原核表达载体pET-Rv0357c,并在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中表达Rv0357c融合蛋白,最... 为鉴定结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv0357c蛋白的生物学功能,进而寻找新的抗Mtb靶点,对Rv0357c进行生物信息学分析,构建了表达Rv0357c的原核表达载体pET-Rv0357c,并在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中表达Rv0357c融合蛋白,最后用Co 2+亲和层析纯化并对其进行鉴定与活性分析。生物信息学分析表明:Rv0357c是稳定的酸性亲水蛋白,且含有腺苷酸琥珀酸合成酶(AdSS)的2个保守基序和保守的活性位点,同时和人AdSS同工酶(AdSS1和AdSS2)的同源性均低于40%。SDS-PAGE分析证实Rv0357c融合蛋白以包涵体形式表达,亚基分子质量约为48 ku,经包涵体溶解、亲和纯化和重折叠,可以得到可溶性目的蛋白(复性率约为63%)。Western Blot检测进一步表明过表达的蛋白为目的蛋白。此外,酶活性测定证实重折叠的Rv0357c融合蛋白有AdSS活性,比活力为0.0161 U/mg。综上,Rv0357c是功能性的AdSS蛋白,这将为Rv0357c的进一步功能鉴定和开发新型抗Mtb靶点奠定基础。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌h37rv rv0357c蛋白 蛋白异源表达 亲和层析 生物信息学
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结核分枝杆菌H37Rv蛋白Rv2364c的表达纯化与生物信息学分析
8
作者 徐宛玲 付陈增 《河南科技大学学报(医学版)》 2017年第1期22-24,共3页
目的在大肠杆菌中表达结核分枝杆菌H37Rv的Rv2364c蛋白,为研发抗结核分枝杆菌的药物提供材料。方法 PCR扩增目的基因Rv2364c。将PCR产物克隆至原核表达载体p ET-28a中,构建重组原核表达质粒p ET-28a-Rv2364c。将重组质粒转化大肠杆菌BL2... 目的在大肠杆菌中表达结核分枝杆菌H37Rv的Rv2364c蛋白,为研发抗结核分枝杆菌的药物提供材料。方法 PCR扩增目的基因Rv2364c。将PCR产物克隆至原核表达载体p ET-28a中,构建重组原核表达质粒p ET-28a-Rv2364c。将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)中,用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达融合蛋白。表达产物经镍亲和层析柱纯化,并对该蛋白做生物信息分析。结果双酶切和基因测序结果表明,成功构建了含有Rv2364c基因的重组表达质粒。SDS-PAGE结果显示,目的蛋白在大肠杆菌中得到了大量表达,经镍亲和层析柱纯化后目的蛋白的纯度达到了90%以上。生物信息学分析表明Rv2364c为稳定酸性蛋白,α-螺旋和无规卷曲为其主要二级结构元件,主要结构域类型有Era结构域和KH结构域两种。结论成功表达和纯化了Rv2364c蛋白,并利用生物信息学方法初步预测其结构域等,为进一步研究Rv2364c在结核病发生发展中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌h37rv rv2364c 转染 生物信息分析
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结核分枝杆菌H37Rv ORF的高通量克隆和表达方法的建立
9
作者 刘立国 冷文川 +2 位作者 郑建华 李锐 胡仲明 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期539-543,共5页
以结核分枝杆菌H37Rv基因组为模板,采用Gateway重组表达系统,以基因长度200~2500 bp为标准,选择目的基因(n=384),以ORF的保守序列设计引物并加上正反向AttB,通过PCR扩增获得基因片段检测入门克隆,得到的克隆有效率为374/384。通过两... 以结核分枝杆菌H37Rv基因组为模板,采用Gateway重组表达系统,以基因长度200~2500 bp为标准,选择目的基因(n=384),以ORF的保守序列设计引物并加上正反向AttB,通过PCR扩增获得基因片段检测入门克隆,得到的克隆有效率为374/384。通过两次同源重组,这些基因片段被克隆到表达载体中,克隆效率为350/384。随后将这些重组表达质粒分别在2个表达菌株BL21和BL21-codonplus-RP中进行诱导表达,表达得率为270/384,并对其中64个进行了纯化,16个是可溶性表达。这种大规模高效率地克隆表达技术适合各种生物的开放阅读框的克隆表达,是一种高通量的克隆表达方法。 展开更多
关键词 GATEWAY技术 结核分枝杆菌h37rv 高通量 表达 纯化染色体
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H37Rv结核标准菌株构建豚鼠膝关节滑膜结核模型的研究
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作者 李万里 宋跃明 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期804-806,809,共4页
目的探索利用H37Rv结核标准菌株构建豚鼠膝关节滑膜结核病理模型的方法。方法对经过福氏佐剂免疫和致敏的豚鼠,行膝关节腔H37Rv菌株两种菌量(1×107/mL,50μL及100μL)的注射感染,观察豚鼠感染结核菌后膝关节滑膜组织及关节软骨与... 目的探索利用H37Rv结核标准菌株构建豚鼠膝关节滑膜结核病理模型的方法。方法对经过福氏佐剂免疫和致敏的豚鼠,行膝关节腔H37Rv菌株两种菌量(1×107/mL,50μL及100μL)的注射感染,观察豚鼠感染结核菌后膝关节滑膜组织及关节软骨与骨的病理变化,并行膝关节滑膜集菌培养。结果豚鼠膝关节在行两种菌量的H37Rv菌株感染后,局部肿胀均较明显,但动物的全身反应都较轻微。两组动物的膝关节滑膜病理切片均显示有典型的结核结节及其内的干酪样坏死灶形成;切片抗酸染色均检出有抗酸染色阳性的分枝杆菌;两组动物的关节滑膜匀浆培养均有结核分枝杆菌生长。结论通过在经预先免疫与致敏豚鼠的膝关节局部进行适当剂量的H37Rv结核菌株的注射感染,可以构建出与人类滑膜结核病理变化相似的豚鼠膝关节滑膜结核。 展开更多
关键词 豚鼠 滑膜结核 h37rv结核分枝杆菌
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结核分枝杆菌培养物不同组份蛋白质组研究 被引量:11
11
作者 庄玉辉 何秀云 +3 位作者 张小刚 李国利 阙海萍 刘绍军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期275-280,T001,共7页
将结核分枝杆菌H3 7RV株在苏通培养基内 ,3 7℃培养 2 1d ,然后将培养物分成上清液(A)、细胞浆 (B)和细胞膜 (C)蛋白质样品。以pH3 0~ 1 0 0的IPG预制胶条等电聚焦电泳为第一向 ,SDS PAGE为第二向进行双向电泳 (2 DE)、银染。经扫... 将结核分枝杆菌H3 7RV株在苏通培养基内 ,3 7℃培养 2 1d ,然后将培养物分成上清液(A)、细胞浆 (B)和细胞膜 (C)蛋白质样品。以pH3 0~ 1 0 0的IPG预制胶条等电聚焦电泳为第一向 ,SDS PAGE为第二向进行双向电泳 (2 DE)、银染。经扫描、计算机处理。A组份的部分蛋白质斑点采用质谱仪进行蛋白质鉴定。A、B和C 3个组份蛋白质斑点总数分别为 90 7、884和 6 81 ;3个组份蛋白质分子量分布基本相似 ,约 70 5 %~ 74 4%在 1 0~ 49kD之间 ;蛋白质等电点 (pH)A、B两组份分布基本相似 ,约 80 9%~ 83 5 %在pH3 0~ 6 4之间 ,而C组份pH7 6~ 1 0 0之间的蛋白质斑点数比A和B两组分略多 ;A、B和C 3个组份表达丰度较高的蛋白质斑点数占各组蛋白质斑点总数的比例分别为 7 8%、2 7 4%和 2 8% ,蛋白质等电点90 0 %均分布在pH3 0~ 6 4范围内。B组份蛋白质分子质量 73 1 %分布在 1 0~ 49kD之间 ,比A、B两组份略高。A组份 1 4个蛋白质斑点经肽质量指纹谱分析 ,其中 ,9个点有同源性的或推测的蛋白质功能 ,5个蛋白质功能不清楚。总之 ,初步获得了结核分枝杆菌H3 7RV株在上述体外培养条件下收获的培养物的上清液、细胞浆、细胞膜蛋白质组 2 DE图谱及其特点 。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 培养物 组份 蛋白质组
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ELISA法检测血清TB4抗体对结核病的诊断价值
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作者 冯雪鸣 《杭州师范学院学报(医学版)》 CAS 2006年第2期70-71,77,共3页
目的评价结核分支杆菌H37RV多肽(TB4)抗体对结核病的诊断价值。方法采用结核分支杆菌多肽(TB4)为包被抗原,应用ELISA法检测69例临床诊断为肺结核患者、45例支气管炎患者、70例健康体检者血清抗结核抗体水平,计算诊断试验的相关指标。结... 目的评价结核分支杆菌H37RV多肽(TB4)抗体对结核病的诊断价值。方法采用结核分支杆菌多肽(TB4)为包被抗原,应用ELISA法检测69例临床诊断为肺结核患者、45例支气管炎患者、70例健康体检者血清抗结核抗体水平,计算诊断试验的相关指标。结果TB4抗原以ELISA法检测结核病的敏感性为76.8%、特异性为95.7%、阳性预测值为91.4%、阴性预测值为87.3%、准确率为88.6%。结论以TB4为抗原,采用ELISA法检测血清抗结核抗体,可用于临床结核病的辅助诊断。 展开更多
关键词 结核分支杆菌h37rv多肽(TB4) ELISA 结核病
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