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皮肤鳞状细胞癌生物治疗研究进展 被引量:2
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作者 孙忠辉 张国龙 王秀丽 《皮肤病与性病》 2022年第4期308-311,共4页
皮肤鳞状细胞癌(Cutaneous squamous cell carcinoma,cSCC)属最常见的皮肤恶性肿瘤之一,是仅次于黑色素瘤,导致死亡的第二大常见皮肤癌,近年来发病数量正在逐年增加。cSCC的传统治疗主要是手术和放疗。生物治疗近年来发展迅速,尽管价格... 皮肤鳞状细胞癌(Cutaneous squamous cell carcinoma,cSCC)属最常见的皮肤恶性肿瘤之一,是仅次于黑色素瘤,导致死亡的第二大常见皮肤癌,近年来发病数量正在逐年增加。cSCC的传统治疗主要是手术和放疗。生物治疗近年来发展迅速,尽管价格昂贵,但疗效确切、副作用小,适合不能手术的转移和晚期患者,以及部分老年或免疫功能低下患者。目前随着c SCC发病机制研究的进展,cSCC发展过程中涉及的信号通路已开发了靶向药物,而且免疫治疗也有在临床应用于cSCC。本文综述cSCC的分子发病机制以及cSCC生物治疗的目前进展。 展开更多
关键词 皮肤鳞状细胞癌 生物治疗 突变负担 研究进展
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晚期非小细胞肺癌患者肿瘤突变负荷与靶向治疗疗效相关性 被引量:14
2
作者 童琳 丁宁 +9 位作者 李佳旻 徐晓波 张勇 叶茂松 李春 张新 洪群英 周建 白春学 胡洁 《中国临床医学》 2019年第4期538-542,共5页
目的:探讨晚期非小细胞肺癌肿瘤突变负荷(TMB)与肿瘤靶向治疗疗效的相关性。方法:纳入2016年1月至2018年1月在复旦大学附属中山医院行靶向治疗的51例晚期非小细胞肺癌患者,采用靶向二代测序技术检测其肿瘤组织标本的TMB水平,并分析TMB... 目的:探讨晚期非小细胞肺癌肿瘤突变负荷(TMB)与肿瘤靶向治疗疗效的相关性。方法:纳入2016年1月至2018年1月在复旦大学附属中山医院行靶向治疗的51例晚期非小细胞肺癌患者,采用靶向二代测序技术检测其肿瘤组织标本的TMB水平,并分析TMB与靶向治疗疗效的相关性。结果:51例非小细胞肺癌患者的中位TMB水平为6.2个突变/Mb,其中吸烟患者的TMB水平较不吸烟患者升高(P=0.046)。将所有入组患者分为高TMB组和中低TMB组,生存分析显示:与高TMB组相比,中低TMB组患者的无进展生存期(PFS)更长(410 d vs 217 d,HR=0.331,95%CI 0.165~0.665,P=0.001 2)。亚组分析显示:在男女性、有无吸烟史、合并TP53基因突变与否患者中,中低TMB组者的中位PFS均长于高TMB组患者(P<0.05);在腺癌、表皮生长因子受体(EGFR)突变、EGFR 19外显子缺失、EGFR L858R患者中,中低TMB组患者的中位PFS也长于高TMB组患者(P<0.05)。结论:对于具有驱动突变的晚期非小细胞肺癌患者,肿瘤组织TMB水平对靶向治疗疗效具有预测作用,高TMB水平提示靶向治疗患者的PFS更短。 展开更多
关键词 肿瘤突变负荷 晚期非小细胞肺癌 靶向治疗 无进展生存期
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Targeted therapy or immunotherapy? Optimal treatment in hepatocellular carcinoma 被引量:12
3
作者 Merly Contratto Jennifer Wu 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE CAS 2018年第5期108-114,共7页
Hepatocellular carcinoma(HCC) is the fifth leading cause of cancer mortality in the United States and the second leading cause of cancer mortality worldwide. Sorafenib is the only food and drug administration(FDA) app... Hepatocellular carcinoma(HCC) is the fifth leading cause of cancer mortality in the United States and the second leading cause of cancer mortality worldwide. Sorafenib is the only food and drug administration(FDA) approved as first line systemic treatment in HCC. Regorafenib and nivolumab are the only FDA approved second line treatment after progression on sorafenib. We will discuss all potential first and second line options in HCC. In addition, we also will explore sequencing treatment options in HCC, and examine biomarkers that can potentially predict benefits from treatments such as immune checkpoint inhibitor. This minireview summarizes potential treatments in HCC based on clinical trials that have been published in manuscript or abstract format from 1994-2018. 展开更多
关键词 Sequencing TREATMENT Sorafenib Hepatocellular carcinoma treatments Nivolumab REGORAFENIB Lenvatinib Cabozantinib IMMUNOTHERAPY Biomarker Pembrolizumab Ramucirumab ALPHA-FETOPROTEIN NEOANTIGEN Tumor mutational burden INTERFERON-GAMMA
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肿瘤突变负荷应用于肺癌免疫治疗的专家共识 被引量:12
4
作者 中国临床肿瘤学会血管靶向治疗专家委员会 中国临床肿瘤学会非小细胞肺癌专家委员会 +3 位作者 王洁 周彩存 韩宝惠 聂蔚 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期743-752,共10页
肺癌是全球范围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs),包括程序性死亡受体1(programmed cell death 1,PD-1)抗体、程序性死亡受体1配体(programmed cell death ligand 1,PD-L1)抗... 肺癌是全球范围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs),包括程序性死亡受体1(programmed cell death 1,PD-1)抗体、程序性死亡受体1配体(programmed cell death ligand 1,PD-L1)抗体和细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(cytotoxic T lymphocyte antigen 4,CTLA-4)抗体,给部分晚期肺癌患者带来了显著的生存获益,改变了晚期肺癌的治疗格局。既往研究表明,PD-1/PD-L1抗体在晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的客观缓解率只有20%左右。所以临床亟需可靠的生物标志物协助筛选ICIs潜在获益人群,提高治疗响应率。肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)是除PD-L1表达以外新兴的免疫治疗标志物。肺癌中PD-L1表达与TMB的相关性不大,评估TMB可扩大免疫治疗的获益人群。然而在临床实践中,TMB的检测、阈值的确定和临床指导策略仍然没有形成规范。本共识将对TMB检测和应用场景给出指导性建议,以促进TMB在肺癌免疫治疗中应用的规范化。 展开更多
关键词 肺肿瘤 免疫治疗 免疫检查点抑制剂 肿瘤突变负荷 专家共识
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肿瘤突变负荷评估非小细胞肺癌患者术后复发转移的价值研究 被引量:7
5
作者 石长林 张冉 +1 位作者 何鸿晏 苟小军 《临床和实验医学杂志》 2021年第16期1700-1703,共4页
目的探讨肿瘤突变负荷(TMB)对非小细胞肺癌(NSCLC)患者术后复发转移的应用价值。方法回顾性选取2010年6月至2015年11月巴中市中心医院收治的NSCLC患者312例为研究对象。根据TMB突变个数分为中低TMB组(TMB <8,217例)和高TMB组(TMB≥8... 目的探讨肿瘤突变负荷(TMB)对非小细胞肺癌(NSCLC)患者术后复发转移的应用价值。方法回顾性选取2010年6月至2015年11月巴中市中心医院收治的NSCLC患者312例为研究对象。根据TMB突变个数分为中低TMB组(TMB <8,217例)和高TMB组(TMB≥8,95例)。记录2组患者的基因突变信息;收集患者一般资料(包括:年龄、性别、病理类型、临床分期、吸烟史、分化程度);Kaplan-Meier生存曲线分析TMB对NSCLC患者术后复发转移的影响;COX分析影响NSCLC患者术后复发转移的因素。结果高TMB组表皮生长因子受体(EGFR)突变占比为93.68%,明显高于中低TMB组(77.42%),差异有统计学意义(P<0.05)。与中低TMB组相比,高TMB组年龄、临床分期、吸烟史均升高,分化程度降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,与中低TMB组相比,高TMB组无进展生存率降低(P<0.05)。单因素COX分析结果显示,TMB、年龄、临床分期、吸烟史、分化程度与NSCLC患者术后复发转移有关(P<0.05);多因素COX分析结果显示,高TMB、高临床分期是影响NSCLC患者术后复发转移的独立危险因素(P<0.05),高分化程度是影响NSCLC患者术后复发转移的保护因素(P<0.05)。结论NSCLC术后复发转移患者中TMB升高,且与临床分期、分化程度有关,其可能共同影响术后NSCLC复发转移,具有一定临床价值。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 肿瘤突变负荷 复发 转移
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双硫死亡相关lncRNA建立胰腺癌新的预后特征并预测免疫治疗反应 被引量:2
6
作者 唐明政 李晓凤 +4 位作者 荣耀 吴志航 马国榕 刘松华 蔡辉 《中国医科大学学报》 北大核心 2024年第1期20-26,共7页
目的筛选与双硫死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA),研究其在胰腺癌中的免疫景观,为临床实践提供更有效的指导。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取胰腺癌组织和癌旁正常组织样本,基于Cox回归和LASSO回归分析鉴定双硫死亡相关lncRNA... 目的筛选与双硫死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA),研究其在胰腺癌中的免疫景观,为临床实践提供更有效的指导。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取胰腺癌组织和癌旁正常组织样本,基于Cox回归和LASSO回归分析鉴定双硫死亡相关lncRNA。构建风险评分模型,通过综合方法验证其预测性能。构建精确的列线图,预测胰腺癌患者的预后。通过基因本体(GO)、基因集富集分析(GSEA)和免疫分析研究生物学差异。通过肿瘤突变负荷(TMB)估计免疫治疗反应。结果成功鉴定出251个双硫死亡相关lncRNA,筛选出3组lncRNA作为风险评分模型的参考。通路分析结果表明,免疫相关通路与双硫死亡相关lncRNA风险评分模型相关。风险评分与免疫细胞浸润以及ESTIMATE评分显著相关。风险评分较高的患者TMB升高,表明高风险患者表现出更好的免疫检查点阻断反应。结论本研究的发现有助于深入理解双硫死亡相关lncRNA在胰腺癌中的作用,为胰腺癌提供潜在的治疗策略。 展开更多
关键词 胰腺癌 长链非编码RNA 双硫死亡 肿瘤突变负荷
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肺癌免疫治疗中肿瘤突变负荷(TMB)临床指导意义的研究进展 被引量:6
7
作者 王军委 许昱 魏素菊 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期1784-1790,共7页
免疫治疗在肺癌治疗中扮演着日趋重要的角色,因其作用机理复杂,目前尚缺乏明确的疗效预测指标。既往研究提示肿瘤突变负荷(TMB)具有一定疗效预测价值,近期围绕该问题的一系列临床研究证实了TMB值与疗效之间的正相关性,同时证实TMB值与... 免疫治疗在肺癌治疗中扮演着日趋重要的角色,因其作用机理复杂,目前尚缺乏明确的疗效预测指标。既往研究提示肿瘤突变负荷(TMB)具有一定疗效预测价值,近期围绕该问题的一系列临床研究证实了TMB值与疗效之间的正相关性,同时证实TMB值与免疫治疗疗效独立相关而不受PD-L1水平影响,而兼具高TMB和高PD-L1水平的患者免疫治疗效果更理想。免疫治疗与靶向治疗关系方面,目前研究暂不支持两者联合用于靶点基因阳性的肺癌患者,但依据TMB水平,免疫抑制剂可能成为靶向治疗进展后潜在的可选药物。目前研究未发现TMB与微卫星不稳定存在明确的相关性。本文就TMB在肺癌免疫治疗中相关研究结果做一综述。 展开更多
关键词 免疫检查点抑制剂 肿瘤突变负荷 程序性死亡受体-1/程序性死亡配体-1 生物标志物 肺癌
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肿瘤突变负荷与肿瘤浸润性免疫细胞在结直肠癌预后及进展中的作用 被引量:5
8
作者 时姗姗 李霄 +2 位作者 丁颖 宋国新 张智弘 《临床与病理杂志》 CAS 2022年第7期1543-1551,共9页
目的:本文旨在通过分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)、肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TICs)及临床病理特征三者之间的相互关系,探讨TMB及TICs在CRC进展中的相互... 目的:本文旨在通过分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)、肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TICs)及临床病理特征三者之间的相互关系,探讨TMB及TICs在CRC进展中的相互作用及临床意义。方法:下载癌症基因组(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中CRC患者的相关数据,包括肿瘤突变、基因表达及相关临床信息等。利用R语言分别计算每个肿瘤样本的TMB值及TICs百分比,并分析TMB值及TICs百分比与临床病理参数和5年总生存率的相关性。根据TMB中位值将肿瘤样本分成高TMB组(n=224)和低TMB组(n=246),比较2组5年总生存率。筛选出差异表达基因和差异表达TICs,通过基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)及基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)寻找其潜在相关的免疫机制和功能。结果:根据TCGA数据,>65岁CRC患者的TMB值更高,发生血管及淋巴结转移的肿瘤TMB值较低(P<0.001)。与低TMB组相比,高TMB组CRC患者的5年总生存率更低(P<0.05)。116个差异表达基因主要涉及药物代谢及白细胞跨内皮迁移信号通路;4种差异表达的TICs为CD4+T细胞、滤泡辅助性T细胞、M0及M1巨噬细胞。结论:TMB是一个重要的评价CRC预后和免疫治疗的指标,可以通过与TICs相互作用调节免疫微环境,从而影响CRC预后及免疫治疗的效果。 展开更多
关键词 肿瘤突变负荷 肿瘤浸润性免疫细胞 肿瘤微环境 结直肠癌
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肿瘤突变负荷作为非小细胞肺癌免疫疗效预测标志物的研究进展 被引量:5
9
作者 吴鹏 赵玉梅 杨玲麟 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第19期2414-2418,共5页
以程序性死亡受体-1/程序性死亡配体-1(PD-1/PD-L1)为代表的免疫检查点抑制剂(ICB)开拓了晚期非小细胞肺癌(NSCLC)治疗的新篇章,与此同时,机遇与挑战并存,而寻找理想的疗效预测标志物则是当前最迫切希望解决的问题。PD-L1的检测是目前... 以程序性死亡受体-1/程序性死亡配体-1(PD-1/PD-L1)为代表的免疫检查点抑制剂(ICB)开拓了晚期非小细胞肺癌(NSCLC)治疗的新篇章,与此同时,机遇与挑战并存,而寻找理想的疗效预测标志物则是当前最迫切希望解决的问题。PD-L1的检测是目前运用最多的NSCLC免疫疗效预测标志物,但仍然存在一些问题,因此,有必要探索新的标志物。肿瘤突变负荷(TMB)是最近几年颇受关注的一个新兴标志物,许多研究表明,TMB与ICB的疗效具有明显相关性,而TMB作为NSCLC免疫疗效的预测标志物更是其中的研究热点之一。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 免疫检查点抑制剂 标志物 肿瘤突变负荷
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基于生物信息数据研究肿瘤突变负荷在结肠癌中的临床意义 被引量:5
10
作者 赵栋燕 孙希珍 姚树坤 《疑难病杂志》 CAS 2021年第5期433-439,445,共8页
目的研究肿瘤突变负荷(TMB)在结肠癌患者中的临床意义。方法通过癌症基因组图谱获取结肠癌的体细胞突变数据、基因表达数据及相关临床数据,计算结肠癌患者的TMB值并分析TMB与总生存率的关系,对高、低TMB组基因表达数据进行基因富集分析... 目的研究肿瘤突变负荷(TMB)在结肠癌患者中的临床意义。方法通过癌症基因组图谱获取结肠癌的体细胞突变数据、基因表达数据及相关临床数据,计算结肠癌患者的TMB值并分析TMB与总生存率的关系,对高、低TMB组基因表达数据进行基因富集分析,应用Wilcoxon秩和检验分析高TMB组与低TMB组浸润性免疫细胞占比及免疫检查点分子表达差异。结果高TMB组患者总生存率明显低于低TMB组(χ^(2)=5.351,P=0.021)。基因富集分析提示,高TMB组在许多免疫相关通路明显富集。高TMB组CD8^(+)T细胞、CD4^(+)记忆性T细胞、自然杀伤细胞及M1巨噬细胞水平高于低TMB组(Z/P=-2.151/0.032、-1.988/0.047、-3.090/0.002、-2.783/0.005),调节性T细胞、MO巨噬细胞浸润程度低于低TMB组(Z/P=2.494/0.012、2.114/0.035)。高TMB组免疫检查点分子表达显著高于低TMB组(P<0.01)。结论高TMB的结肠癌患者预后较差,并且TMB明显影响浸润性免疫细胞及免疫检查点分子的表达。 展开更多
关键词 结肠癌 肿瘤突变负荷 免疫浸润 免疫检查点分子 预后
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非小细胞肺癌患者肿瘤突变负荷影响因素探究 被引量:5
11
作者 赵璐 李靖 +3 位作者 赵晓光 陈会会 蒋梦瑶 张国俊 《中国实用内科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期541-544,共4页
目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者的肿瘤突变负荷(TMB)与临床病理特征的关系。方法回顾性分析2017年1月至2019年4月于郑州大学第一附属医院检测TMB且具有完整的临床病理特征、肿瘤标志物及二代测序(NGS)检测结果的93例NSCLC患者的数据,... 目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者的肿瘤突变负荷(TMB)与临床病理特征的关系。方法回顾性分析2017年1月至2019年4月于郑州大学第一附属医院检测TMB且具有完整的临床病理特征、肿瘤标志物及二代测序(NGS)检测结果的93例NSCLC患者的数据,研究TMB与NSCLC患者临床病理特征之间的关系,分析驱动基因与TMB的相关性,并采用多元线性回归建立临床病理特征与TMB之间的关系。结果TMB低表达组和TMB高表达组在吸烟史及病理类型上存在统计学差异(P<0.05)。驱动基因与TMB无相关性(P>0.05)。多元线性回归提示TMB与年龄、吸烟史、病理类型密切相关,LnTMB=(0.015×年龄+0.295×吸烟史+0.299×病理类型)(腺癌为1,鳞癌为2)。结论TMB与年龄、吸烟史、病理类型密切相关,三个指标联合可预测TMB值,从而指导NSCLC的诊治。 展开更多
关键词 肿瘤突变负荷 非小细胞肺癌 临床病理特征 驱动基因
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非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预测生物标志物研究进展
12
作者 孙天生 陈彰 +1 位作者 韦坤辰 唐昊 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期459-465,共7页
肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占大多数。免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)的出现极大地改变了NSCLC的治疗策略,并改善了患者预后,然而现实中只有少部分... 肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占大多数。免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)的出现极大地改变了NSCLC的治疗策略,并改善了患者预后,然而现实中只有少部分患者能够获得长期受益。因此,确定可靠的预测生物标志物对选择治疗方式至关重要。随着近年来分子生物学、基因组测序技术的发展以及对肿瘤及其宿主免疫微环境的认识不断深入,生物标志物的研究层出不穷。本文围绕NSCLC免疫治疗疗效的预测生物标志物进行综述,以期为精准免疫治疗提供指导。 展开更多
关键词 肺肿瘤 免疫治疗 肿瘤突变负荷 生物标志物 预测
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SMAD4突变型结直肠癌患者基因突变及肿瘤免疫微环境特征分析
13
作者 姬清华 徐伟 +6 位作者 张虎山 马俊蕊 黄飞 伍龙 郭伟 张汝一 梁正子 《现代免疫学》 CAS 2024年第6期506-512,共7页
为探讨贵州地区结直肠癌患者人母亲DDP同源物4(mothers against decapentaplegic homolog 4,SMAD4)突变及肿瘤免疫微环境特征,采用二代测序(next generation sequencing,NGS)、多重免疫荧光及免疫组化等技术,回顾性分析了150例贵州地区... 为探讨贵州地区结直肠癌患者人母亲DDP同源物4(mothers against decapentaplegic homolog 4,SMAD4)突变及肿瘤免疫微环境特征,采用二代测序(next generation sequencing,NGS)、多重免疫荧光及免疫组化等技术,回顾性分析了150例贵州地区结直肠癌患者的SMAD4突变数据及其中8例患者的肿瘤免疫微环境数据。结果显示,在患者群中,有22.00%的患者出现SMAD4突变,最主要的突变形式为非同义突变(66.67%),与SMAD4共突变最主要的基因为Kirsten大鼠肉毒病毒原癌基因同源基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene homologue,KRAS,51.52%)。肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)和PD-L1表达水平在SMAD4突变与否的患者中差异无统计学意义(P>0.05)。微卫星高度不稳定性(microsatellite instability-high,MSI-H)的比例在SMAD4突变与否的患者中差异有统计学意义(P=0.014),但MSI-H仅占6.06%(4/66)。相比SMAD4野生型患者,SMAD4突变型患者肿瘤组织中具有更多的M2型巨噬细胞(P=0.038)。该研究提示,SMAD4突变患者M2型巨噬细胞在肿瘤中的浸润,可能导致了这类患者更差的预后以及对化疗药物的耐药。 展开更多
关键词 人母亲DDP同源物4突变 结直肠癌 肿瘤突变负荷 免疫微环境 二代测序
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潜在生物标志物预测PD-1/PD-L1抑制剂治疗恶性肿瘤临床疗效的Meta分析
14
作者 林雨虹 林志冰 +3 位作者 王晓贤 刘洁 方跃华 周晓燕 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期931-938,共8页
目的:研究可预测PD-1/PD-L1抑制剂治疗恶性肿瘤临床疗效的潜在生物标志物。方法:检索PubMed、Web of Science、CNKI、万方和维普数据库,检索时限为各数据库建库至2022年9月20日。由2名评价员独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏... 目的:研究可预测PD-1/PD-L1抑制剂治疗恶性肿瘤临床疗效的潜在生物标志物。方法:检索PubMed、Web of Science、CNKI、万方和维普数据库,检索时限为各数据库建库至2022年9月20日。由2名评价员独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用RevMan5.4和STATA16.0软件进行Meta分析。结果:共纳入18项研究,共计4018例患者。在随访的1年和2年内,发现高水平肿瘤突变负担(TMB)的肿瘤患者使用PD-1/PD-L1抑制剂的总生存率(OS)(P=0.003,P=0.01)和无进展生存率(PFS)(P=0.0002,P=0.04)更高。在不同的随访时间内,以1%为临界值,PD-L1表达高低作为预测PD-1/PD-L1抑制剂OS和PFS的生物标志物差异无统计学意义(P>0.05)。结论:TMB可以作为预测PD-1/PD-L1抑制剂治疗恶性肿瘤患者后2年内临床疗效的生物学指标,但其效用能否持续更长时间有待进一步研究;PD-L1单项检测目前不能成为预测应用PD-1/PD-L1抑制剂受益与否的生物学标志物。 展开更多
关键词 恶性肿瘤 肿瘤突变负担 PD-L1 生物标志物
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基于乳酸代谢基因的软组织肉瘤预后模型的建立及评价
15
作者 张田田 孟莲 +1 位作者 孙皓 刘春霞 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第13期1958-1962,共5页
目的在软组织肉瘤中建立乳酸代谢相关基因的风险评分模型,并分析其与肿瘤突变负荷及肿瘤微环境中免疫细胞、免疫功能和免疫检查点的相关性。方法通过TCGA和GTEx数据库中获取软组织肉瘤的差异表达基因,再结合分子标签数据库(Msigdb)中乳... 目的在软组织肉瘤中建立乳酸代谢相关基因的风险评分模型,并分析其与肿瘤突变负荷及肿瘤微环境中免疫细胞、免疫功能和免疫检查点的相关性。方法通过TCGA和GTEx数据库中获取软组织肉瘤的差异表达基因,再结合分子标签数据库(Msigdb)中乳酸代谢相关基因集获取软组织肉瘤中乳酸代谢相关的差异表达基因,并进行基因本体、京都基因与基因组百科全书通路富集分析;通过单因素比例风险模型和最小绝对收缩和选择算子回归构建风险评分模型,将软组织肉瘤样本分为高风险组和低风险组;最后,分析2组之间的肿瘤突变负荷、肿瘤微环境免疫状态。结果共筛选出29个与乳酸代谢相关的差异表达基因。通路富集分析结果表明,这29个基因主要与代谢过程有关。构建预后风险评分模型,按风险评分中位值将软组织肉瘤样本分为高风险组和低风险组,肿瘤突变负荷分析结果显示,在所有软组织肉瘤样本中,首位突变基因均为肿瘤蛋白p53。最常见的体细胞突变类型是错义突变,且高风险组中的基因突变频率比低风险组高。肿瘤微环境分析结果表明,高风险组中M0、M2型巨噬细胞浸润多,而在低风险组中CD8~+T细胞和单核细胞浸润比例较高。低风险组中免疫相关功能反应、免疫检查点表达比高风险组高。结论乳酸代谢评分模型可以较好地评估软组织肉瘤患者的预后及反映肿瘤微环境的状态。 展开更多
关键词 软组织肉瘤 乳酸代谢 模型构建 肿瘤突变负荷 肿瘤微环境
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TMB在肾透明细胞癌中的临床意义
16
作者 管波 钱永 张挺 《国际泌尿系统杂志》 2024年第2期225-229,共5页
目的研究肿瘤突变负荷(TMB)在肾透明细胞癌患者中的临床意义。方法通过癌症基因组图谱获取肾透明细胞癌的体细胞突变数据、基因表达数据甲基化数据和相关临床数据以及临床蛋白质组肿瘤分析协作组数据库中肾透明细胞癌的蛋白组数据,计算... 目的研究肿瘤突变负荷(TMB)在肾透明细胞癌患者中的临床意义。方法通过癌症基因组图谱获取肾透明细胞癌的体细胞突变数据、基因表达数据甲基化数据和相关临床数据以及临床蛋白质组肿瘤分析协作组数据库中肾透明细胞癌的蛋白组数据,计算肾透明细胞癌患者的TMB值并分析TMB与总生存率的关系及其与临床预后的关系。TMB值按降序排列,以中位数将所有肿瘤样本分为高TMB组(171例)和低TMB组(166例),对两组的基因表达数据进行基因富集分析,对肾透明细胞癌突变率最高的前10位基因进行多组学分析。结果高TMB组患者的总生存率低于低TMB组(P=0.035);肿瘤级别越高的ccRCC患者的TMB值越高,差异有统计学意义(P=0.036)。突变率最高的前10位基因中,突变数据和预后相关的只有BAP1和HMCN1;SETD2、HMCN1、MTOR、PBRM1、MUC16的基因表达与ccRCC患者的临床预后相关;BAP1、DNAH9、HMCN1、KDM5C、MTOR的甲基化水平与ccRCC患者的临床预后相关。结论高TMB的肾透明细胞癌患者预后较差,不同肿瘤分级患者的TMB值不同,其突变率最高的前10位基因在突变水平、转录组水平以及甲基化水平与肾透明细胞癌患者预后相关。 展开更多
关键词 肾肿瘤 肿瘤突变负荷 基因 甲基化 突变
原文传递
肿瘤突变负荷在EGFR突变型晚期非小细胞肺癌中的临床研究进展 被引量:3
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作者 何夕 焦晓栋 臧远胜 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期69-75,共7页
表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的应用使EGFR突变型非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的生存显著改善,但仍有部分患者疗效及预后不佳,... 表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的应用使EGFR突变型非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的生存显著改善,但仍有部分患者疗效及预后不佳,寻求预测此类患者疗效及预后的标志物迫在眉睫。肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)前期主要应用于免疫治疗获益人群的筛选及疗效预测,近期在EGFR突变型NSCLC中也有相应的探索性研究。就TMB的检测与挑战及其在EGFR突变型晚期NSCLC中的最新应用研究进展进行综述。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 肿瘤突变负荷 表皮生长因子受体 二代测序 全面基因组测序 预后
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子宫癌肉瘤的临床病理与基因突变特征分析 被引量:2
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作者 涂健 许竞泽 +1 位作者 张永胜 邓立峰 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第24期1864-1867,共4页
探讨子宫癌肉瘤(UCS)的临床病理学特征、免疫表型、诊断及鉴别诊断,探索UCS的基因突变特征及肿瘤突变负荷(TMB)情况。回顾性分析苏州大学附属第二医院病理科2021年1月至2022年5月存档的4例UCS患者的临床影像学、病理形态学资料、免疫组... 探讨子宫癌肉瘤(UCS)的临床病理学特征、免疫表型、诊断及鉴别诊断,探索UCS的基因突变特征及肿瘤突变负荷(TMB)情况。回顾性分析苏州大学附属第二医院病理科2021年1月至2022年5月存档的4例UCS患者的临床影像学、病理形态学资料、免疫组织化学表达,并对4例UCS病例行全外显子组测序分析。4例患者中均为女性,年龄47~81岁,肿瘤最大径4.0~13.0 cm,界限不清楚,镜下以恶性上皮成分和肉瘤成分共同构成。免疫组织化学显示4例患者上皮成分表达广谱细胞角蛋白(AE1/E3),肉瘤成分表达波形蛋白(Vimentin),PAX8、雌激素受体、孕激素受体均有不同程度的表达,Ki-67阳性指数均较高(60%~90%),3例p53错义突变,1例无义突变,4例MLH1、PMS2、MSH2、MSH6均表达阳性且PD-L1表达阴性。4例UCS的全外显子组测序结果显示TP53、BCL9L、BRD4、CLTCLI、PSMD1I、PLEC基因表现出较高的突变比例,分别为3/4、2/4、2/4、2/4、2/4、2/4。TMB分析结果显示4例UCS的TMB均<5 mut/Mb。UCS是一种少见的、高度恶性的子宫内膜肿瘤。全外显子组测序结果提示TP53、BCL9L、BRD4等基因存在较高的突变率,提示UCS的发生发展可能与Wnt信号通路等密切相关。分子分型提示3例UCS为高拷贝数型/p53突变型,其中1例出现POLD1突变。微卫星稳定、PD-L1低表达及TMB结果提示UCS患者在免疫治疗中获益的优势不明显。 展开更多
关键词 子宫肿瘤 子宫癌肉瘤 外显子测序 肿瘤突变负荷 免疫组织化学
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基于基因组突变数据分析肝癌预后分子标志物 被引量:3
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作者 茅新如 刘文斌 曹广文 《中国癌症防治杂志》 CAS 2019年第2期143-150,共8页
目的探讨肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的相关性。方法从TCGA数据库及cBioPortal数据库schulze2015队列分别获取376例和243例HCC患者全外显子... 目的探讨肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的相关性。方法从TCGA数据库及cBioPortal数据库schulze2015队列分别获取376例和243例HCC患者全外显子测序数据,从ICGC数据库获取JP队列 394例及FR 队列250例HCC患者全基因组测序数据。采用生存分析研究TMB、关键信号通路的基因变异与HCC患者预后的关系。结果 TCGA队列、JP队列、schulze2015队列和FR队列中,对数转换后的TMB与年龄均呈正相关(P<0.001);在schulze2015队列中,对数转换后的TMB与肿瘤大小呈正相关(r=0.204,P=0.002)。在TCGA队列中,与低TMB组比较,高TMB 组HCC患者的OS(P<0.001)及DFS(P=0.088)均明显降低,高TMB组HCC患者的死亡风险是低TMB组的2.156倍(P<0.001)。JP队列和FR队列均未发现TMB与OS及DFS有统计学意义。TCGA队列、JP队列和FR队列中,细胞周期调控通路基因变异的HCC患者中位DFS和中位OS均低于无变异的患者(P<0.05),而复发风险和死亡风险均高于无变异患者(P<0.05)。结论肿瘤突变负荷高和细胞周期调控通路的基因变异的HCC患者预后较差。 展开更多
关键词 肝细胞癌 肿瘤突变负荷 预后 细胞周期调控通路
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晚期肺癌患者胸腔积液上清液中肿瘤游离DNA检测肿瘤突变负荷的研究 被引量:3
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作者 童琳 丁宁 +9 位作者 李佳旻 徐晓波 张勇 叶茂松 李春 张新 洪群英 周建 白春学 胡洁 《中华结核和呼吸杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期596-601,共6页
目的探讨晚期肺癌患者胸腔积液上清液中肿瘤游离DNA检测肿瘤突变负荷(TMB)的可行性.方法纳入2016年12月至2018年8月复旦大学附属中山医院合并有胸腔积液的晚期肺癌患者34例,男19例,女15例,年龄34~85岁,中位年龄为65岁.在接受全身或局部... 目的探讨晚期肺癌患者胸腔积液上清液中肿瘤游离DNA检测肿瘤突变负荷(TMB)的可行性.方法纳入2016年12月至2018年8月复旦大学附属中山医院合并有胸腔积液的晚期肺癌患者34例,男19例,女15例,年龄34~85岁,中位年龄为65岁.在接受全身或局部抗肿瘤治疗之前,采集肿瘤组织、胸腔积液和血标本,用二代靶向测序技术检测肿瘤组织、胸腔积液上清液、胸腔积液沉淀物、血浆标本中肿瘤DNA突变情况,计算TMB水平,并将所有患者按是否有吸烟史、驱动基因突变情况进行亚组分析.采用SPSS 16.0软件对结果进行处理,组间比较采用单因素方差分析(ANOVA)及LSD-t检验.结果胸腔积液上清液中TMB的中位水平为6.23突变/Mb,与肿瘤组织的中位TMB水平(6.86突变/Mb)相似(t=1.174,P=0.245),显著高于胸腔积液沉淀物(2.49突变/Mb,t=3.044,P=0.003)和血浆(2.49突变/Mb)的中位TMB水平(t=2.464,P=0.016).胸腔积液上清液用于评估TMB与肿瘤组织的阳性一致性为52%(9/17),阴性一致性为65%(11/17).亚组分析结果显示,吸烟患者(11例)肿瘤组织中TMB水平(14.4突变/Mb)高于不吸烟患者(23例,5.4突变/Mb),差异有统计学意义(t=3.238,P=0.003).结论对于合并胸腔积液的晚期肺癌患者,检测胸腔积液上清液中TMB水平,有望替代肿瘤组织,作为预测免疫治疗疗效的一种生物标志物. 展开更多
关键词 肺肿瘤 胸腔积液 肿瘤突变负荷
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