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多重实时定量PCR同时检测人全血中大肠杆菌与白念珠菌基因方法的建立
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作者 房嘉宾 康军仁 +2 位作者 马恩陵 郭广亮 崔希增 《中华临床营养杂志》 CAS CSCD 2015年第3期170-175,共6页
目的建立多重实时定量PCR(MRQ—PCR)同时快速检测血中大肠杆菌与白念珠菌DNA的方法,以评估肠屏障损伤可能导致的移位微生物的种类和程度并提供针对性用药的建议。方法选择大肠杆菌β-右旋半乳糖苷酶基因作为检测大肠杆菌的靶基因设... 目的建立多重实时定量PCR(MRQ—PCR)同时快速检测血中大肠杆菌与白念珠菌DNA的方法,以评估肠屏障损伤可能导致的移位微生物的种类和程度并提供针对性用药的建议。方法选择大肠杆菌β-右旋半乳糖苷酶基因作为检测大肠杆菌的靶基因设计引物和探针,选择白念珠菌ITS2基因设计引物和探针。采用QIAamp DNA Blood Mini Kit试剂盒提取大肠杆菌与白念珠菌基因组DNA;建立25μlTaqMan探针MRQ-PCR反应体系;对18份模拟血标本及10份外科发热患者临床标本进行MRQ—PCR检测。结果引物和探针特异性好,大肠杆菌与白念珠菌标准曲线相关系数分别在0.994—0.999和0.994~0.998,扩增效率分别为0.894~1.022和0.905~1.028。标准样品检测限分别为大肠杆菌13.9拷贝/μl和白念珠菌0.8cfu/μl,两种菌的检测灵敏度分别为100%和99.69%,特异度分别为100%和94.73%,标准品中大肠杆菌与白念珠菌特异基因平均回收率分别为(101.89±5.69)%和(103.74±4.64)%,两种菌基因检测的批内变异系数分别为(13.14±10.27)%和(19.18±8.54)%,批间变异系数分别为(14.35±9.34)%和(18.31±10.25)%。全血标本中大肠杆菌与白念珠菌特异基因的检出限分别为12455.2拷贝/ml和800.3cfu/ml,平均回收率分别为(111.60±11.06)%和(99.96±6.16)%,两种菌基因检测的批内变异系数分别为(11.02±5.65)%和(8.14±7.29)%,平均批间变异系数分别为(12.88±7.59)%和(18.62±9.14)%。结论多重实时定量PCR可以同时快速、灵敏、特异地定量检测人全血标本中大肠杆菌与白念珠菌基因,准确度高、重复性好、节省血标本用量及检测成本、总检测时间缩短,在临床全血标本的真菌与细菌快速鉴别检测、抗微生物药物的针对性应用及疗效评估、肠屏障� 展开更多
关键词 多重实时定量PCR 大肠杆菌 白念珠菌 全血
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阿龙山病毒及松岭病毒多重实时荧光定量RT-PCR快速检测方法的建立
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作者 李德 殷启凯 +10 位作者 侯泽英 王瑞晨 张维嘉 付士红 何英 聂凯 梁国栋 许松涛 李樊 李兴洲 王环宇 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2024年第1期74-78,共5页
目的 建立一种多重实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(多重实时qRT-PCR)法,用于阿龙山病毒(Alongshan virus,ALSV)及松岭病毒(Songling virus,SGLV)核酸的快速检测。方法 针对ALSV NS 3基因和SGLV S基因保守区设计特异性引物及TaqMan探... 目的 建立一种多重实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(多重实时qRT-PCR)法,用于阿龙山病毒(Alongshan virus,ALSV)及松岭病毒(Songling virus,SGLV)核酸的快速检测。方法 针对ALSV NS 3基因和SGLV S基因保守区设计特异性引物及TaqMan探针,建立针对2种病毒的多重实时qRT-PCR检测方法,评价方法的特异性、灵敏度和重复性,并应用蜱标本对该方法进行应用评价。结果 该检测方法与森林脑炎病毒等其他6种虫媒病毒无交叉反应,灵敏度达1×101拷贝/μl,重复性检测的循环阈值(Ct)变异系数均<2.00%;运用该方法,从2019年黑龙江省采集的30组蜱标本中检出2组ALSV阳性,1组SGLV阳性。经验证,该方法与普通PCR方法检测结果的一致性为100%。结论 建立了敏感性高、特异性好的ALSV和SGLV多重实时qRT-PCR快速检测方法。 展开更多
关键词 阿龙山病毒 松岭病毒 多重实时荧光定量反转录聚合酶链式反应 核酸检测
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