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荧光定量PCR法检测重组汉逊酵母中HBsAg基因的拷贝数
被引量:
2
1
作者
邵强
冯真真
+2 位作者
张勇朝
潘若文
徐玉国
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期178-180,193,共4页
重组汉逊酵母基因中外源基因拷贝数是影响目的基因表达水平和检测传代稳定性的重要因素,因此外源基因拷贝数的检测成为研究和分析重组基因的重要内容。利用快速、灵敏的荧光定量PCR法检测外源基因HBsAg拷贝数,以Mox基因为内源参照基因,...
重组汉逊酵母基因中外源基因拷贝数是影响目的基因表达水平和检测传代稳定性的重要因素,因此外源基因拷贝数的检测成为研究和分析重组基因的重要内容。利用快速、灵敏的荧光定量PCR法检测外源基因HBsAg拷贝数,以Mox基因为内源参照基因,通过梯度稀释法,建立了Mox基因和HBsAg基因的循环数(Ct值)与起始模板数的相关标准曲线,其相关系数分别达到0.9996和0.9982。通过比较目的基因HBsAg和内源参照基因Mox在同一荧光强度下出峰的循环数,获得了目的基因HBsAg在重组汉逊酵母中的拷贝数为39。发酵前后HBsAg基因在重组汉逊酵母中稳定存在,发酵前后拷贝数相差均小于6.2%。本方法快速、简便、准确,可以满足基因拷贝数检测的需要。
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关键词
荧光定量PCR
HBsAg
基因
mox
基因
重组汉逊酵母
拷贝数
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职称材料
7p部分三体综合征的表型和基因型关系研究
2
作者
张月萍
徐建忠
+2 位作者
殷民
吴佳龙
孙晓溪
《现代妇产科进展》
CSCD
2014年第3期161-164,共4页
目的:探讨7p部分三体综合征的起源,分析患者表型和基因型的关联性,同时研究单核苷酸多态-微阵列比较基因组杂交技术(SNP aCGH)在检测亚细胞遗传学改变中的应用价值。方法:对外院核型报告正常的1例特殊面容、低智合并先心患儿复查染色体,...
目的:探讨7p部分三体综合征的起源,分析患者表型和基因型的关联性,同时研究单核苷酸多态-微阵列比较基因组杂交技术(SNP aCGH)在检测亚细胞遗传学改变中的应用价值。方法:对外院核型报告正常的1例特殊面容、低智合并先心患儿复查染色体,G带发现其4q35.2区域疑似有额外片断附着,进一步用SNP aCGH进行全基因组扫描,并用4号染色体长臂末端和7号染色体短臂末端探针与患儿淋巴细胞杂交(FISH)以验证SNP aCGH结果,同时对患儿进行家系调查及部分成员染色体检查。结果:患儿核型46,XX,add(4)(q35.2)?全基因组扫描显示,患儿7p21.1-pter区域有20.78Mb的重复,而4q35.2-qter区域有3.24Mb的缺失。FISH发现,患儿外周血淋巴细胞含3个拷贝的7号染色体短臂末端和1个拷贝的4号染色体长臂末端。家系调查发现,患儿父亲及祖父均为46,XY,t(4;7)(q35.2;p21.1)。综合以上结果,确定患儿核型为46,XX,der(4)t(4;7)(q35.2;p21.1)pat,异常核型由父亲传递,系精子在减数分裂中通过邻近分离-I所形成的不平衡产物。患儿不平衡片断包含与颅骨发育异常相关的TWIST基因、与先心相关的MOX2基因以及与颅面部异常特征相关的ACTB基因。结论:亲代平衡易位导致的子代小片断不平衡是7p部分三体综合征等出生缺陷的重要原因;SNP aCGH是鉴别小片断不平衡的有效手段;7p部分三体综合征患者异常表型可能与TWIST、MOX2、ACTB等基因有关。
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关键词
7p部分三体综合征
单核苷酸多态-微阵列比较
基因
组杂交技术
平衡易位
TWIST
基因
mox
2
基因
ACTB
基因
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职称材料
题名
荧光定量PCR法检测重组汉逊酵母中HBsAg基因的拷贝数
被引量:
2
1
作者
邵强
冯真真
张勇朝
潘若文
徐玉国
机构
河南师范大学生命科学学院
华兰生物工程股份有限公司
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期178-180,193,共4页
基金
河南省重点科技攻关项目(082300450300)
华兰生物工程有限公司博士后科研基金
河南省动物学重点学科基金
文摘
重组汉逊酵母基因中外源基因拷贝数是影响目的基因表达水平和检测传代稳定性的重要因素,因此外源基因拷贝数的检测成为研究和分析重组基因的重要内容。利用快速、灵敏的荧光定量PCR法检测外源基因HBsAg拷贝数,以Mox基因为内源参照基因,通过梯度稀释法,建立了Mox基因和HBsAg基因的循环数(Ct值)与起始模板数的相关标准曲线,其相关系数分别达到0.9996和0.9982。通过比较目的基因HBsAg和内源参照基因Mox在同一荧光强度下出峰的循环数,获得了目的基因HBsAg在重组汉逊酵母中的拷贝数为39。发酵前后HBsAg基因在重组汉逊酵母中稳定存在,发酵前后拷贝数相差均小于6.2%。本方法快速、简便、准确,可以满足基因拷贝数检测的需要。
关键词
荧光定量PCR
HBsAg
基因
mox
基因
重组汉逊酵母
拷贝数
Keywords
Fluorescence quantitative PCR HBsAg gene
mox
gene Recombinant Hansenula polymorpha yeast Copy number
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
7p部分三体综合征的表型和基因型关系研究
2
作者
张月萍
徐建忠
殷民
吴佳龙
孙晓溪
机构
复旦大学附属妇产科医院集爱遗传与不育诊疗中心
出处
《现代妇产科进展》
CSCD
2014年第3期161-164,共4页
基金
上海市卫生和计划生育委员会科研课题资助项目(No:20134181)
文摘
目的:探讨7p部分三体综合征的起源,分析患者表型和基因型的关联性,同时研究单核苷酸多态-微阵列比较基因组杂交技术(SNP aCGH)在检测亚细胞遗传学改变中的应用价值。方法:对外院核型报告正常的1例特殊面容、低智合并先心患儿复查染色体,G带发现其4q35.2区域疑似有额外片断附着,进一步用SNP aCGH进行全基因组扫描,并用4号染色体长臂末端和7号染色体短臂末端探针与患儿淋巴细胞杂交(FISH)以验证SNP aCGH结果,同时对患儿进行家系调查及部分成员染色体检查。结果:患儿核型46,XX,add(4)(q35.2)?全基因组扫描显示,患儿7p21.1-pter区域有20.78Mb的重复,而4q35.2-qter区域有3.24Mb的缺失。FISH发现,患儿外周血淋巴细胞含3个拷贝的7号染色体短臂末端和1个拷贝的4号染色体长臂末端。家系调查发现,患儿父亲及祖父均为46,XY,t(4;7)(q35.2;p21.1)。综合以上结果,确定患儿核型为46,XX,der(4)t(4;7)(q35.2;p21.1)pat,异常核型由父亲传递,系精子在减数分裂中通过邻近分离-I所形成的不平衡产物。患儿不平衡片断包含与颅骨发育异常相关的TWIST基因、与先心相关的MOX2基因以及与颅面部异常特征相关的ACTB基因。结论:亲代平衡易位导致的子代小片断不平衡是7p部分三体综合征等出生缺陷的重要原因;SNP aCGH是鉴别小片断不平衡的有效手段;7p部分三体综合征患者异常表型可能与TWIST、MOX2、ACTB等基因有关。
关键词
7p部分三体综合征
单核苷酸多态-微阵列比较
基因
组杂交技术
平衡易位
TWIST
基因
mox
2
基因
ACTB
基因
Keywords
Partial trisomy 7p syndrome
Single nucleotide polymorphism array-based comparative genomic hybridization(SNP aCGH)
Balanced translocation
TWIST gene
mox
2 gene
ACTB gene
分类号
R725.9 [医药卫生—儿科]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
荧光定量PCR法检测重组汉逊酵母中HBsAg基因的拷贝数
邵强
冯真真
张勇朝
潘若文
徐玉国
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
下载PDF
职称材料
2
7p部分三体综合征的表型和基因型关系研究
张月萍
徐建忠
殷民
吴佳龙
孙晓溪
《现代妇产科进展》
CSCD
2014
0
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职称材料
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