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分子模拟技术在释药技术中的应用 被引量:8
1
作者 张卫敏 任晓文 +2 位作者 徐为人 孟凡翠 汤立达 《药物评价研究》 CAS 2012年第2期86-89,共4页
环糊精包合技术和缓控释技术是发展较快的释药技术,分子模拟技术在这两种释药技术中的应用也越来越多。简述环糊精包合技术和缓控释释药技术的优点、影响因素和释药原理,介绍几种重要的分子模拟技术在环糊精包合技术和缓控释释药技术中... 环糊精包合技术和缓控释技术是发展较快的释药技术,分子模拟技术在这两种释药技术中的应用也越来越多。简述环糊精包合技术和缓控释释药技术的优点、影响因素和释药原理,介绍几种重要的分子模拟技术在环糊精包合技术和缓控释释药技术中的应用,并给出了分子模拟技术在具体应用中的力场及模拟的条件,分析分子模拟技术的在环糊精包合技术和缓控释技术中应用的优点和难点,展望分子模拟在其应用中的前景,指出分子模拟技术有望成为研究释药技术的一种常规项的工具。 展开更多
关键词 分子模拟技术 分子动力学模拟 分子力学模拟 环糊精包合技术 缓控释释药技术
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Molecular mechanics and dynamics simulation of hydrogen diffusion in aluminum melt 被引量:5
2
作者 Huo-sheng Wang Gao-sheng Fu +2 位作者 Chao-zeng Cheng Li-li Song Lian-deng Wang 《China Foundry》 SCIE 2017年第6期478-484,共7页
The main impurities in aluminum melt are hydrogen and Al_2O_3,which can deteriorate melt quality and materials performance.However,the diffusion process of H atoms in aluminum melt and the interactions among Al atoms,... The main impurities in aluminum melt are hydrogen and Al_2O_3,which can deteriorate melt quality and materials performance.However,the diffusion process of H atoms in aluminum melt and the interactions among Al atoms,Al_2O_3 and hydrogen have been studied rarely.Molecular mechanics and dynamics simulations are employed to study the diffusion behaviors of different types of hydrogen,such as free H atoms,H atoms in H_2 and H^+ions in H_2O using COMPASS force field.Correspondingly,force field types h,h1h and h1o are used to describe different types of hydrogen which are labeled as H_h,H_(h1h) and H_(h1o).The results show that the adsorption areas are maximum for H_(h1o),followed by H_(h1h) and H_h.The diffusion ability of H_(h1o) is the strongest whereas H_h is hard to diffuse in aluminum melt because of the differences in radius and potential well depth of various types of hydrogen.Al_2O_3 cluster makes the Al atoms array disordered,creating the energy conditions for hydrogen diffusion in aluminum melt.Al_2O_3 improves the diffusion of H_h and H_(h1o),and constrains H_(h1h) which accumulates around it and forms gas porosities in aluminum.H_(h1o) is the most dispersive in aluminum melt,moreover,the distance of Al-H_(h1o) is shorter than that of Al-H_(h1h),both of which are detrimental to the removal of H_(h1o).The simulation results indicate that the gas porosities can be eliminated by the removal of Al_2O_3 inclusions,and the dispersive hydrogen can be removed by adsorption function of gas bubbles or molten fluxes. 展开更多
关键词 hydrogen in aluminum melt molecular mechanics simulation molecular dynamics simulation COMPASS hydrogen diffusion
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应用分子力学研究表面吸附能的可行性 被引量:3
3
作者 黄晓华 张相育 +1 位作者 吉青 杨小震 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期375-379,共5页
为了节省计算时间和资源,研究真实体系的表面吸附问题,少数科研工作者采用分子力学研究分子的表面吸附问题。但是我们知道分子力学方法采用了“Born-Oppenheimer”近似,忽略了电子的运动,只计算与原子核位置相关的体系能量,因此不能求... 为了节省计算时间和资源,研究真实体系的表面吸附问题,少数科研工作者采用分子力学研究分子的表面吸附问题。但是我们知道分子力学方法采用了“Born-Oppenheimer”近似,忽略了电子的运动,只计算与原子核位置相关的体系能量,因此不能求解与电子运动和分布相关的问题。然而表面吸附可以划分为物理吸附和化学吸附两种情况。在物理吸附过程中,分子的电子运动和分布并没有发生变化。而在化学吸附过程中,分子的电子运动和分布发生了变化。那么用分子力学来研究表面吸附中的物理吸附过程忽略化学吸附,到底会对最终的吸附分析造成多大的误差呢?用分子力学来研究表面吸附究竟是否可行呢?为了消除这些困惑,我们通过分子力学优化计算得到了TiO_2(110)表面对无机分子(H_2O,CO_2),有机小分子(CH_3OH,CHOOH,CH_2O),共轭分子(Bi-isonicotinic acid)的分子吸附能,并将这些吸附能与实验,其他量化计算(DFT,PM3)的结果进行对比。我们的数据表明,用分子力学计算得到的吸附能与实验值,量化计算值都相当接近。因此用分子力学来研究表面吸附是可行的。 展开更多
关键词 TIO2 分子力学(MM) 吸附能 物理吸附 化学吸附 模拟
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n-十八醇在石墨表面吸附组装结构的理论研究 被引量:1
4
作者 殷淑霞 王琛 +2 位作者 雷圣宾 许博 白春礼 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期565-568,共4页
STM实验观察到正十八醇在石墨表面吸附 ,通过自组装形成二维有序的单分子层 ,有 1 2 0°夹角的“Λ”型和 1 80°夹角的斜线型两种排列。本文利用分子力学方法对十八醇 -石墨吸附体系进行了理论模拟 ,结果表明 ,十八醇分子通过... STM实验观察到正十八醇在石墨表面吸附 ,通过自组装形成二维有序的单分子层 ,有 1 2 0°夹角的“Λ”型和 1 80°夹角的斜线型两种排列。本文利用分子力学方法对十八醇 -石墨吸附体系进行了理论模拟 ,结果表明 ,十八醇分子通过长链烷基的强的二维组装性质和羟基间的氢键形成密排结构 ,这两种分子间作用影响着体系的吸附结构。羟基氢的顺式和反式都能形成稳定的“Λ”型组装结构 ,一列反式和一列顺式交错的排列方式能形成 1 80°夹角的斜线型组装结构 。 展开更多
关键词 STM n-十八醇 分子力学模拟 吸附结构 石墨
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1,1’-二萘基骨架的探针分子对氨基酸/氨基酸衍生物识别的研究 被引量:2
5
作者 范文杰 雷凯 +1 位作者 向明礼 杨明理 《成都电子机械高等专科学校学报》 2012年第1期5-9,共5页
对1,1’-二萘基骨架的3个探针分子,采用Hyperchem和Gaussian 03先后进行分子力学优化、分子动力学模拟、半经验和HF/STO-3G水平几何构型优化。用AutoDock Vina将优化后的探针分子、配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物进行对接实验,获得... 对1,1’-二萘基骨架的3个探针分子,采用Hyperchem和Gaussian 03先后进行分子力学优化、分子动力学模拟、半经验和HF/STO-3G水平几何构型优化。用AutoDock Vina将优化后的探针分子、配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物进行对接实验,获得相应的复合物的最佳作用模式并计算它们之间的亲和能。结果表明,理论计算所获得的探针分子与配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物之间的结合模式,与根据实验数据所推断的作用模式几乎完全相同;所计算的复合物之间的亲和能,也与实验测定的结合常数间有相同的变化趋势。 展开更多
关键词 分子识别 分子力学 分子动力学 分子模拟 分子对接
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硫代双烯型螯合物溶剂效应的定量研究 被引量:2
6
作者 高昕 程铸生 蒋华良 《华东理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 1998年第1期65-70,共6页
用分子力学方法研究了硫代双烯型过渡金属螯合物溶剂效应的分子模型及定量性能关系。得到了该类结构染料最大吸收波长与其在溶液中构象能的半定量关系,为快速预测该类结构染料最大吸收波长提供了一个新的方法。
关键词 溶剂效应 硫代双烯型 激光染料 螯合物
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槲皮素与Cu^(2+)、Zn^(2+)的配位色谱分离特性计算机模拟研究
7
作者 潘见 张晨光 《安徽化工》 CAS 2006年第2期35-37,共3页
利用grid计算程序软件包,应用分子力场等计算模型模拟了Cu2+、Zn2+与处于能量最小构象的槲皮素分子间的配位相互作用,得到了Cu2+、Zn2+与斛皮素分子间的作用力场势能曲面,并与试验结果进行比较分析,从而对采用何种金属阳离子与槲皮素进... 利用grid计算程序软件包,应用分子力场等计算模型模拟了Cu2+、Zn2+与处于能量最小构象的槲皮素分子间的配位相互作用,得到了Cu2+、Zn2+与斛皮素分子间的作用力场势能曲面,并与试验结果进行比较分析,从而对采用何种金属阳离子与槲皮素进行配位分离以及配位体空间结构的确定提供了理论依据。 展开更多
关键词 配位 分离 分子力场 分子模拟 槲皮素
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金属银与聚苝酰亚胺表面相互作用的模拟研究
8
作者 侯艳君 白续铎 +1 位作者 高金胜 庞彤心 《黑龙江大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2005年第6期781-784,788,共5页
利用分子力学模拟研究了单层金属银在双层聚苝酰亚胺的不同表面模型上的静态行为。单层银在聚苝酰亚胺“V”形开口向上的表面上形成了聚集体。数据分析表明银原子之间的内聚能小于银与聚苝酰亚胺表面之间的着附能,在内聚能和着附能中范... 利用分子力学模拟研究了单层金属银在双层聚苝酰亚胺的不同表面模型上的静态行为。单层银在聚苝酰亚胺“V”形开口向上的表面上形成了聚集体。数据分析表明银原子之间的内聚能小于银与聚苝酰亚胺表面之间的着附能,在内聚能和着附能中范德华力均起重要作用。通过分子动力学模拟研究了温度对银与聚苝酰亚胺表面相互作用的影响。量化计算结果表明银与聚苝酰亚胺表面之间的相互作用主要是物理作用。 展开更多
关键词 分子力学 分子动力学 量化计算 金属/聚花酰亚胺界面
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高性能分子动力学模拟在生物大分子结构和功能研究中的应用
9
作者 吴超 马路遥 黄牛 《科研信息化技术与应用》 2010年第4期60-68,共9页
基于经典物理学理论的分子动力学模拟是研究生物大分子结构和功能的重要工具。然而,分子动力学模拟对计算资源的巨大需求,限制了其在生物领域的应用。近几年来,随着计算机科学的迅猛发展以及计算化学理论和方法的完善,进行生物大分子在... 基于经典物理学理论的分子动力学模拟是研究生物大分子结构和功能的重要工具。然而,分子动力学模拟对计算资源的巨大需求,限制了其在生物领域的应用。近几年来,随着计算机科学的迅猛发展以及计算化学理论和方法的完善,进行生物大分子在溶液状态下微秒时间尺度的模拟具备了可行性。本篇综述主要介绍近期高性能分子动力学模拟的发展,及在蛋白质三维结构、动态构象变化和生物学功能上的具体应用实例。 展开更多
关键词 分子力学 力场 分子动力学模拟 蛋白结构功能关系
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用MM2力场模拟手性金属配合物[Co(phen)_2dppz]^(3+)的新方法
10
作者 韩大雄 杨频 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期368-371,共4页
配位键并非典型价键 ,所以在模拟金属配合物时若模拟方法和参数选取不当 ,将会导致不能成键或构型发散。本文将探讨一种能在微机上用分子力学模拟手性金属配合物的新方法 ,该方法以CsChem3D中MM2为支持力场 ,通过搭建和优化配合物Δ ,Λ... 配位键并非典型价键 ,所以在模拟金属配合物时若模拟方法和参数选取不当 ,将会导致不能成键或构型发散。本文将探讨一种能在微机上用分子力学模拟手性金属配合物的新方法 ,该方法以CsChem3D中MM2为支持力场 ,通过搭建和优化配合物Δ ,Λ [Co(phen) 2 dppz]3+获得其几何构型 。 展开更多
关键词 分子力学 MM2力场 分子动力学模拟 手性金属配合物 钴配合物 结构
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固氮酶Fe-Mo辅因子空间构型模拟——分子力学在分子模型设计中的应用
11
作者 陈明旦 赖伍江 胡盛志 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1993年第5期599-603,共5页
在分子模型设计中交替使用分子图形学软件和分子力学优化计算,用计算机模拟固氮酶Fe-Mo辅因子空间构型,从而为进一步的理论研究提供了一个非实验方法的有效手段。
关键词 分子模型 固氮酶 铁-钼辅因子
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POSS纳米杂化材料压痕实验的分子力学模拟
12
作者 李君 孙毅 +1 位作者 赵兵 曾凡林 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第S1期12-15,共4页
本文通过分子力学模拟方法研究了聚苯乙烯和丙基POSS纳米杂化聚苯乙烯两种薄膜在压痕实验中的力学行为.计算得到了两种材料的载荷-位移曲线.曲线表明随着压头位移的增加,两种材料的载荷响应呈锯齿状增长.结合材料的载荷-位移曲线和模拟... 本文通过分子力学模拟方法研究了聚苯乙烯和丙基POSS纳米杂化聚苯乙烯两种薄膜在压痕实验中的力学行为.计算得到了两种材料的载荷-位移曲线.曲线表明随着压头位移的增加,两种材料的载荷响应呈锯齿状增长.结合材料的载荷-位移曲线和模拟过程中材料的形变计算了两种材料的硬度.进而,采用一个简单的表达式描述材料硬度与压痕深度之间的关系.我们通过对多种聚合物硬度-压痕深度的拟合验证了公式的合理性.根据此公式计算出了聚苯乙烯及其POSS杂化材料极限硬度的比值,结果表明POSS单体可以有效地提高聚苯乙烯的硬度. 展开更多
关键词 POSS 硬度 纳米压痕 分子力学模拟
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煤表面分子片段模型与瓦斯吸附分子力学模拟 被引量:10
13
作者 张世杰 李成武 +1 位作者 丁翠 张浩 《矿业研究与开发》 CAS 北大核心 2010年第1期88-91,共4页
采用分子力学模拟的方法研究了煤表面分子片段模型与瓦斯气的吸附作用,主要研究了煤表面分子的苯环和侧链对CH4、CO2、N2和O2的吸附作用,得到了吸附能,计算出了在不同位置吸附的概率。研究结果表明,煤表面对CH4、N2和O2的吸附计算结果相... 采用分子力学模拟的方法研究了煤表面分子片段模型与瓦斯气的吸附作用,主要研究了煤表面分子的苯环和侧链对CH4、CO2、N2和O2的吸附作用,得到了吸附能,计算出了在不同位置吸附的概率。研究结果表明,煤表面对CH4、N2和O2的吸附计算结果相似,主要是在苯环上吸附,还存在含N侧链位置的吸附作用;而煤表面对CO2的吸附计算明显的不同,主要在含N侧链位置和含N侧链在同一侧的苯环位置吸附,可能是由于NH与C=O形成了氢键,有待进一步研究。 展开更多
关键词 煤分子力学模拟 表面分子片段 吸附能 瓦斯
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Molecular dynamics simulations of LiCl association and NaCl association in water by means of ABEEM/MM 被引量:4
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作者 LI Xin GONG LiDong YANG ZhongZhi 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2008年第12期1221-1230,共10页
Constrained molecular dynamics simulations have been used to investigate the LiCl and NaCl ionic association in water in terms of atom-bond electronegativity equalization method fused into molecular mechanics (ABEEM/M... Constrained molecular dynamics simulations have been used to investigate the LiCl and NaCl ionic association in water in terms of atom-bond electronegativity equalization method fused into molecular mechanics (ABEEM/MM). The simulations make use of the seven-site fluctuating charge and flexible ABEEM-7P water model, based on which an ion-water interaction potential has been constructed. The mean force and the potential of mean force for LiCl and NaCl in water, the charge distributions, as well as the structural and dynamical properties of contact ion pair dissociation have been investigated. The results are reasonable and informative. For LiCl ion pair in water, the solvent-separated ion pair configurations are more stable than contact ion pair configurations. The calculated PMF for NaCl in water indicates that contact ion pair and solvent-separated ion pair configurations are of comparable stability. 展开更多
关键词 atom-bond ELECTRONEGATIVITY equalization method FUSED into molecular mechanics (ABEEM/MM) molecular dynamics simulation ionic ASSOCIATION
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ABEEM_(σπ)和OPLS-AA力场对蛋白质G_A88/G_B88的分子动力学模拟 被引量:3
15
作者 王晶晶 刘翠 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期142-148,共7页
将原子与键电负性均衡方法融入分子力学方法,即利用ABEEMσπ浮动电荷力场与ABEEM-7P水模型相结合的方法及OPLS-AA固定电荷力场方法,对GA88和GB88蛋白进行了水溶液(温度295 K)和真空中的分子动力学模拟.比较两种方法得到的两个蛋白质的... 将原子与键电负性均衡方法融入分子力学方法,即利用ABEEMσπ浮动电荷力场与ABEEM-7P水模型相结合的方法及OPLS-AA固定电荷力场方法,对GA88和GB88蛋白进行了水溶液(温度295 K)和真空中的分子动力学模拟.比较两种方法得到的两个蛋白质的结构与实验结构的均方根偏差,分析了两种方法得到的两个蛋白质的回旋半径、氢键分布、径向分布及电荷分布情况.结果表明,ABEEMσπ和OPLS-AA力场均能正确模拟蛋白质结构,得到的各项偏差值接近,但从各偏差的波动大小可见,ABEEMσπ力场的模拟更稳定;回旋半径模拟很好地体现了蛋白质的'电致紧缩'现象;氢键分布、径向分布及电荷分布表明,与OPLS-AA固定电荷力场相比,ABEEMσπ浮动电荷力场能更好地体现蛋白质和周围水分子的极化效应. 展开更多
关键词 原子与键电负性均衡方法 分子力场 OPLSAA固定电荷力场 GA88 GB88蛋白 分子动力学模拟 动力学性质
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蒙皂石层间结构与性质关系的分子模拟研究进展 被引量:2
16
作者 王进 曾凡桂 马炽丽 《硅酸盐通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期54-58,共5页
综述了计算机模拟中的分子力学、MonteCarlo和分子动力学模拟方法及其在蒙皂石层间结构中的应用进展,涉及粘土-水-离子体系的位能函数、粘土的水化和层间结构、热力学性质、物理机械性质和柱撑蒙脱石等各个方面。指出分子模拟对蒙皂石... 综述了计算机模拟中的分子力学、MonteCarlo和分子动力学模拟方法及其在蒙皂石层间结构中的应用进展,涉及粘土-水-离子体系的位能函数、粘土的水化和层间结构、热力学性质、物理机械性质和柱撑蒙脱石等各个方面。指出分子模拟对蒙皂石层间分子行为的基础研究将发挥重要作用。 展开更多
关键词 蒙皂石 吸附性 催化性 位能函数 热力学性质 物理机械性质 分子模拟 层间结构 阳离子表面活性剂
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烟酰胺酶催化水解脱氨反应的QM/MM分子动力学模拟
17
作者 段新丽 张欣 雷鸣 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2491-2496,共6页
采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻过程并... 采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻过程并降低整个催化反应的能垒.讨论了氨分子的离去过程和质子传递过程的相关细节.为烟酰胺酶的定点突变以及脱氨酶的设计提供了有益的参考. 展开更多
关键词 烟酰胺酶 脱氨 反应机理 QM/MM方法 分子动力学模拟
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相互作用熵方法在计算生物分子体系结合自由能中的发展和应用
18
作者 段莉莉 黄开放 钟素素 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2020年第3期274-285,共12页
分子力学泊松-玻尔兹曼溶剂可及表面积(MM/PBSA)是一种非常主流的计算生物大分子体系结合自由能的方法,但是其中熵变的计算一直以来都是理论计算上的难点.2016年发展的相互作用熵方法因其理论严谨、计算成本低等优势得到了广泛的应用.... 分子力学泊松-玻尔兹曼溶剂可及表面积(MM/PBSA)是一种非常主流的计算生物大分子体系结合自由能的方法,但是其中熵变的计算一直以来都是理论计算上的难点.2016年发展的相互作用熵方法因其理论严谨、计算成本低等优势得到了广泛的应用.该方法已在周期蛋白依赖性激酶2、胰蛋白酶、HIV蛋白酶、间变性淋巴瘤激酶与配体以及P53与MDMX/MDM2等一些关键的体系上得到了应用,这为研究者理解生物大分子中相互作用的机理提供了可信且新颖的途径.本文介绍了相互作用熵方法的发展,并为其在生物大分子中的应用提供了可行的指引和建议. 展开更多
关键词 相互作用熵 分子力学泊松-玻尔兹曼溶剂可及表面积 结合自由能 分子动力学模拟
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血必净辐射防护作用机制的计算机模拟研究 被引量:1
19
作者 龙伟 吴红英 +6 位作者 张晓东 周则卫 沈秀 王浩 李德冠 孟爱民 刘培勋 《国际放射医学核医学杂志》 2013年第6期329-332,共4页
目的研究中药复方血必净辐射防护作用的可能机制。方法通过计算机模拟技术——分子对接的方法将血必净化学成分分子与凝血酶、纤溶酶原激活物抑制物1、血栓素A2受体、凝血因子IXa等4个重要凝血靶点进行对接,分析对接结果,评价作用效... 目的研究中药复方血必净辐射防护作用的可能机制。方法通过计算机模拟技术——分子对接的方法将血必净化学成分分子与凝血酶、纤溶酶原激活物抑制物1、血栓素A2受体、凝血因子IXa等4个重要凝血靶点进行对接,分析对接结果,评价作用效应。结果血必净对凝血酶、纤溶酶原激活物抑制物1、血栓素A2受体和凝血因子IXa等凝血靶点均具有一定的拮抗作用,其中对凝血酶的作用最为显著。结论血必净辐射防护作用的产生很可能与凝血靶点的拮抗相关。 展开更多
关键词 辐射防护 分子作用机制 计算机模拟 血必净 分子对接
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基于网络药理学研究黄龙合剂治疗小儿咳嗽变异性哮喘的机制及实验验证
20
作者 纪茜茜 王爱华 隆红艳 《国际中医中药杂志》 2024年第2期196-202,共7页
目的利用网络药理学方法、分子对接技术及体外细胞实验研究黄龙合剂基于IL-4/信号转导和转录激活因子6(STAT6)信号通路治疗小儿咳嗽变异性哮喘(CVA)的作用机制。方法通过TCMSP、HERB数据库及文献检索获得黄龙合剂组方中药的活性成分及... 目的利用网络药理学方法、分子对接技术及体外细胞实验研究黄龙合剂基于IL-4/信号转导和转录激活因子6(STAT6)信号通路治疗小儿咳嗽变异性哮喘(CVA)的作用机制。方法通过TCMSP、HERB数据库及文献检索获得黄龙合剂组方中药的活性成分及作用靶点,检索GeneCards数据库、OMIM数据库、DrugBank数据库、PharmGKB数据库中CVA相关靶点。对药物-疾病靶点取交集,使用STRING数据库构建交集靶点PPI网络,采用Cytoscape 3.9.1进行网络拓扑分析,筛选核心靶点,并构建“疾病-药物-成分-靶点”网络,筛选核心成分。使用Metascape数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用PDB蛋白数据库、PubChem、AutoDock及R语言对核心靶点及核心成分进行分子对接验证。培养大鼠原代气道平滑肌细胞,采用Western blot检测细胞质和细胞核中p-STAT6表达。结果得到黄龙合剂治疗CVA的活性成分122个,核心成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素等,核心靶点有JUN、ESR1、TP53、MYC、HIF1α等。GO功能富集分析涉及对外来刺激的反应、对氧气水平的反应、蛋白质磷酸化的正向调控、细胞应激反应的调节等生物过程。KEGG通路富集分析显示,黄龙合剂治疗CVA靶点主要富集于AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、JAK-STAT信号通路等。分子对接结果显示,核心靶点及药物核心成分有较好的结合活性。细胞实验表明,黄龙合剂可抑制IL-4介导的p-STAT6进入细胞核。结论预测了黄龙合剂治疗CVA的有效成分及靶点,其治疗小儿CVA的作用机制可能与抑制IL-4/STAT6信号通路有关。 展开更多
关键词 药理作用分子作用机制(中药) 咳嗽变异性哮喘 黄龙合剂 网络药理学 分子对接模拟 IL-4/STAT6信号通路
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