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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制与分子流行病学特征 被引量:32
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作者 张志军 鹿麟 +3 位作者 牛法霞 赵珂 姜梅杰 赵书平 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2018年第9期759-763,共5页
目的了解耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的碳青霉烯酶基因携带情况及分子流行病学特点,为医院感染控制和临床治疗提供实验室依据。方法收集山东省泰安市中心医院2014年1—11月临床分离的CRKP 13株,采用Walk Away 96 PLUS型全自动细菌... 目的了解耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的碳青霉烯酶基因携带情况及分子流行病学特点,为医院感染控制和临床治疗提供实验室依据。方法收集山东省泰安市中心医院2014年1—11月临床分离的CRKP 13株,采用Walk Away 96 PLUS型全自动细菌分析仪进行细菌鉴定和药敏试验;改良Hodge试验及EDTA协同试验进行碳青霉烯酶表型的确认;采用多聚酶链反应(PCR)方法扩增相关碳青霉烯类耐药基因(bla KPC、bla IMP、bla VIM、bla GIM及bla NDM-1)并测序;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)调查菌株的克隆相关性并进行流行病学比较。结果 13株CRKP主要来源于痰(7株,53.85%)及尿(4株,30.77%),对复方磺胺甲口恶唑、四环素的耐药率较低(均<40%),对其他抗菌药物(除阿米卡星)的耐药率均>70%,对碳青霉烯类药物的耐药率均为100%;13株细菌改良Hodge试验均为阳性,5株细菌EDTA协同试验阳性;经PCR测序确认,碳青霉烯酶基因中,bla KPC基因最常见(13/13),其次为bla NDM-1基因(5/13),未发现其基因bla IMP、bla VIM和bla GIM;PFGE聚类结果显示,13株肺炎克雷伯菌被分为5型,主要为C型(9/13),且均属于ST11,其他分别为ST37、ST626、ST628和ST668型。结论碳青霉烯酶基因bla KPC与bla NDM-1是引起该院肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素耐药的主要原因,ST11是主要的克隆类型,医院需尽快强化医院感染预防控制措施。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 分子流行病学 耐药机制 碳青霉烯酶 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 同源性
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2015-2017年聊城市腹泻病例中沙门氏菌分子分型及耐药性研究 被引量:25
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作者 杜银菊 梁胜楠 +8 位作者 段瑶 李晓迪 徐可心 郭海燕 程利红 王飞 刘雨 苗雪峰 李心朋 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期915-921,共7页
目的对2015-2017年聊城地区主动监测哨点医院腹泻患者中分离到的沙门氏菌进行病原学分析,了解沙门氏菌的感染现状及血清型分布、分子分型特征和耐药情况。方法对2015-2017年分离自腹泻患者的41株沙门氏菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和药... 目的对2015-2017年聊城地区主动监测哨点医院腹泻患者中分离到的沙门氏菌进行病原学分析,了解沙门氏菌的感染现状及血清型分布、分子分型特征和耐药情况。方法对2015-2017年分离自腹泻患者的41株沙门氏菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和药物敏感性测试,并用BioNumerics软件分析菌株之间的相似度,用微量肉汤稀释法进行菌株耐药性检测。结果腹泻患者中沙门氏菌总分离率为7.16%,且不同年龄段分离率存在差异。分离的沙门氏菌共有8个血清型,其中鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌分别为18株和7株,为优势血清型;PFGE分析发现41株菌共产生了34种不同的PFGE带型,相同血清型的沙门氏菌的PFGE带型比较相近,不同血清型的PFGE带型具有多态性,未发现菌株成簇存在现象。测试菌株对四环素耐药率最高为73.17%,多重耐药率达68.29%,发现6株携带不同耐药基因类型的产广谱β-内酰胺酶的鼠伤寒沙门氏菌。结论聊城地区沙门氏菌具有一定的血清型及遗传的多样性,高耐药和多重耐药现象严重,应加强病例及环境联合耐药监测。 展开更多
关键词 沙门氏菌 血清型 分子分型 耐药性
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2005年我国多中心苯唑西林耐药的金黄色葡萄球菌分子流行病学研究 被引量:20
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作者 王辉 刘昱东 +3 位作者 杜娜 孙宏莉 徐英春 陈民钧 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1354-1359,共6页
目的多中心研究我国2005年苯唑西林耐药的金黄色葡萄球菌(MRSA)分子流行病学特征。方法收集2005年1—12月14个城市17家教学医院连续分离的非重复 MRSA 395株,通过多重 PCR 对 MRSA 进行葡萄球菌染色体 mec(SCCmec)分型,脉冲场凝胶电泳(P... 目的多中心研究我国2005年苯唑西林耐药的金黄色葡萄球菌(MRSA)分子流行病学特征。方法收集2005年1—12月14个城市17家教学医院连续分离的非重复 MRSA 395株,通过多重 PCR 对 MRSA 进行葡萄球菌染色体 mec(SCCmec)分型,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行同源性分析。根据药敏结果、PFGE、SCCmec 型别和分布地区选出53株进行多位点序列分型(MLST)。采用PCR 检测毒素基因。结果 395株 MRSA 中,SCCmecⅢ型243株、占61.5%,不能分型菌株96株、占24.3%,Ⅱ型56株、占14.2%;沈阳 SCCmecⅡ型占60.7%(17/28),远高于其他地区(0~42.9%)。PFGE 共有24种分型,42种亚型,其中 A 型占50.1%,为12个城市13家医院所共有,R 型占23.5%,存在于8个城市9家医院。MLST 共有6种分型,其中序列分型(ST)239占75.5%,ST5占17.0%。395株 MRSA 中,pvl 基因检出率为2.5%。结论我国 MRSA 主要获得Ⅱ型、Ⅲ型 SCCmec 基因,SCCmec 的分布有地区差异。一些地区发生 MRSA 的暴发,并且地区问发生流行克隆的传播。有些流行克隆可能来源于某些世界流行克隆株的传播。 展开更多
关键词 葡萄球菌 金黄色 流行病学 分子 序列分型 DNA 苯唑西林 抗药性 细菌
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纹带棒状杆菌临床分离株分子分型和耐药性分析 被引量:20
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作者 王雪冰 陈东科 +4 位作者 董爱英 林晓晖 邱小彤 周海健 李振军 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第4期471-477,共7页
目的 揭示我国临床分离的纹带棒状杆菌分子分型及耐药性,为制定纹带棒状杆菌感染防治措施提供依据.方法 采用多中心横断面研究方法,收集广东、唐山、北京地区各一家三级甲等医院在2017年10月-2018年1月间从临床标本中分离的197株纹带棒... 目的 揭示我国临床分离的纹带棒状杆菌分子分型及耐药性,为制定纹带棒状杆菌感染防治措施提供依据.方法 采用多中心横断面研究方法,收集广东、唐山、北京地区各一家三级甲等医院在2017年10月-2018年1月间从临床标本中分离的197株纹带棒状杆菌.用微量肉汤法检测最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC);聚合酶链式反应检测菌株的氨基糖苷修饰酶基因[aph(3″)-Ⅰb、aph(6)-Ⅰd、aac(6′)-Ⅰb、aadA、aph(3′)-Ⅲa以及AC(6′)-Ⅰe-APH(2″)-Ⅰa、核糖体甲基化酶基因(ermX)、核糖体保护蛋白基因(tetW)、外输泵蛋白基因(tetL)以及碳青霉烯酶基因(blaIMP、blaVIM、blaOXA-48、blaNDM和blaKPC),目的产物经测序和BLAST比对并确定其基因型;采用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)对菌株进行分子分型,用Bio Numerics 软件对所有实验菌株的PFGE图谱进行聚类分析.结果 99.5%的被测菌株至少对一种抗生素表现耐药;庆大霉素耐药菌株中耐药基因aph(3″)-Ⅰb、aph(6)-Ⅰd、aac(6′)-Ⅰb和aadA检出率分别为89.3%(67/75)、84%(63/75)、57.3%(43/75)和4%(3/75);红霉素以及克林霉素耐药菌株中耐药基因ermX的检出率均为88.3%(153/173);四环素和多西环素耐药菌株中耐药基因tetW和tetL的检出率分别95.5%(105/110)、97.2%(70/72)和100%(110/110)、100%(72/72).197株临床分离纹带棒状杆菌共分为82个型别,每个型别分别包含1~27株菌,其中11个型别包含的菌株数大于5株,广东的菌株优势型别为CSS01.CN0058;唐山的菌株优势型别为CSS01.CN0035、CSS01.CN0051、CSS01.CN0052和CSS01.CN0048;北京的菌株优势型别为CSS01.CN0058、CSS01.CN0070、CSS01.CN0108和CSS01.CN0015.结论 我国纹带棒状杆菌临床分离株耐药情况严峻,而且存在多重耐药菌株的院内传播,需要开展更大范围的系统监测为制定控制措施提供实验依据. 展开更多
关键词 纹带棒状杆菌 分子分型 抗菌药物敏感性 耐药基因 脉冲场凝胶电泳分型
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微滴数字PCR与Super-ARMS PCR检测非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂治疗耐药后血浆游离DNA EGFR基因T790M突变的对比分析 被引量:18
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作者 曹紫阳 吴伟 +4 位作者 侯立坤 张伟 高彩霞 武春燕 张莉萍 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期910-914,共5页
目的 比较微滴数字PCR(ddPCR)与Super-扩增阻滞突变系统( ARMS)法检测表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗后耐药非小细胞肺癌患者血浆中EGFR基因耐药位点T790M突变的差异,并探讨ddPCR的临床应用价值.方法 收集同济大学附... 目的 比较微滴数字PCR(ddPCR)与Super-扩增阻滞突变系统( ARMS)法检测表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗后耐药非小细胞肺癌患者血浆中EGFR基因耐药位点T790M突变的差异,并探讨ddPCR的临床应用价值.方法 收集同济大学附属上海市肺科医院2017年5至11月间37例经EGFR-TKI治疗后耐药的非小细胞肺癌患者血浆标本;分别采用ddPCR和Super-ARMS法检测血浆标本中EGFR 基因T790M突变情况.结果 EGFR-TKI治疗耐药后非小细胞肺癌患者,男性17例,女性20 例,年龄范围40~83岁,中位年龄 64岁.治疗前,37例患者肿瘤组织均检测出EGFR基因敏感突变,无 T790M 突变.靶向治疗耐药后,ddPCR检测患者血浆游离DNA EGFR 基因T790M突变,阳性率为45. 9%(17/37),Super-ARMS检测阳性率为35. 1%(13/37),统计学分析发现,两种方法检测 EGFR T790M 突变阳性率差异具有统计学意义(P<0. 05). 13例Super-ARMS法T790M突变病例(ΔCt值<8),经ddPCR法检测均为阳性; Super-ARMS法10例翘尾病例(ΔCt值≥8,T790M突变阴性),ddPCR法检测显示有3例T790M突变;Super-ARMS法14例完全阴性病例(无ΔCt值,T790M突变阴性),ddPCR法检测显示有1例T790M突变弱阳性. ddPCR法检测T790M突变结果与 Super-ARMS法检测判读的 ΔCt 值之间有显著相关性.在 ddPCR 检测出的17例T790M阳性的患者中,其中9例患者接受了奥西替尼治疗,7 例患者都有良好的获益.结论ddPCR检测EGFR-TKI治疗耐药后非小细胞肺癌患者血浆EGFR基因T790M突变,比Super-ARMS法具有更高的灵敏度,这可能会在指导临床靶向药物治疗上具有广泛的应用价值. 展开更多
关键词 非小细胞肺 聚合酶链反应 受体 表皮生长因子 分子靶向治疗 抗药性 肿瘤:液体活检
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2010-2018年安徽省马鞍山市腹泻患者中非伤寒沙门菌的分子分型与耐药性研究 被引量:15
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作者 洪颖 王利 +5 位作者 陈谨 王蓉 罗颖 杨晨 陈道利 柳燕 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期646-653,共8页
目的了解马鞍山地区腹泻监测人群非伤寒沙门菌的感染状况、血清学分布、分子分型与耐药性等特征。方法对2010-2018年腹泻患者中分离的非伤寒沙门菌进行血清学分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和药物敏感性试验。结果从2998例腹泻患者中检出... 目的了解马鞍山地区腹泻监测人群非伤寒沙门菌的感染状况、血清学分布、分子分型与耐药性等特征。方法对2010-2018年腹泻患者中分离的非伤寒沙门菌进行血清学分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和药物敏感性试验。结果从2998例腹泻患者中检出非伤寒沙门菌腹泻263例(8.8%),其中2例为2种非伤寒沙门菌混合感染;6-7月份非伤寒沙门菌感染率较高,05岁年龄组感染率最高(15.9%)(χ^2=72.98,P<0.001);265株非伤寒沙门菌分为36个血清型,优势血清型为阿贡纳沙门菌、肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌;阿贡纳沙门菌的PFGE带型分布较集中,有菌株成簇存在的现象;测试菌株总耐药率为95.6%(66/69),多重耐药率为82.6%(57/69);测试菌株对AMP(79.7%)、STR(75.3%)和Sul(66.6%)耐药率较高,对AMI和AZI完全敏感;发现2株ESBLs的菌株,均为多重耐药菌株;鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌对不同药物的敏感性有所不同,前者对喹诺酮类药物较敏感,而后者对四环素类药物较敏感。结论马鞍山地区优势血清型为阿贡纳沙门菌,与其他地区不同。阿贡纳沙门菌有成簇存在的情况,提示有既往暴发的可能。总耐药及多重耐药现象严重,应谨慎用药并加强对病例的耐药监测。 展开更多
关键词 沙门菌 血清型 分子分型 耐药性
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烧伤患者产NDM-1型金属β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌的碳青霉烯类抗生素耐药机制研究 被引量:14
7
作者 杜芳玲 梅艳芳 +6 位作者 刘盼盼 万腊根 魏丹丹 曹先伟 文江雄 向天新 刘洋 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期29-34,共6页
目的探讨烧伤患者感染肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素高水平耐药的分子机制。方法采用回顾性分析方法,收集南昌大学第一附属医院2014年7月至2015年6月烧伤患者分离的非重复碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CR-KP)18株。测定菌株最低抑... 目的探讨烧伤患者感染肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素高水平耐药的分子机制。方法采用回顾性分析方法,收集南昌大学第一附属医院2014年7月至2015年6月烧伤患者分离的非重复碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CR-KP)18株。测定菌株最低抑菌浓度(MIC),对菌株进行特异性PCR扩增和序列分析、质粒接合试验、Southern杂交以及外膜蛋白分析。多位点序列分型(MLST)分型技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析菌株同源性。结果药敏试验显示所有碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CR-KP)具有多重耐药,对哌拉西林/他唑巴坦、头孢曲松、左氧氟沙星、环丙沙星、庆大霉素、妥布霉素、头孢替坦、头孢他啶、头孢吡肟、氨曲南、亚胺培南、美罗培南全部耐药,耐药率100%(18/18);对替加环素、复方新诺明、阿米卡星对耐药率分别为0%(0/18)、61.1%(11/18)、72.2%(13/18)。接合试验可使受体菌大肠埃希菌J53对碳青霉烯的MIC值从≤0.0625或0.125 μg/ml上升到16或32 μg/ml。特异性PCR扩增和序列分析发现18株产NDM-1菌株,5株KPC-2菌株。接合试验证实blaNDM-1可以通过质粒传播。Southern杂交显示blaNDM-1基因定位于46Kb大小的质粒上,质粒复制子分型显示为IncX3型。PFGE共7种细菌基因型,而MIST分型发现18株CR-KP分别属于ST11、ST395、ST17、ST37、ST263、ST14和ST76型。外膜蛋白的SDS-PAGE和ompK35/36基因序列分析发现ST11、ST395和ST37型CR-KP菌株OmpK36膜孔蛋白缺失,而其他ST分型菌株OmpK36膜孔蛋白表达量降低。结论本院烧伤患者分离的肺炎克雷伯菌对碳青酶烯类药物高水平耐药的主要机制是质粒介导的NDM-1型金属β-内酰胺酶的产生合并OmpK36膜孔蛋白表达降低或缺失,并且发现了同时携带NDM-1和KPC-2种碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌。 展开更多
关键词 克雷伯菌 肺炎 流行病学 分子 碳青霉烯类 抗药性 细菌
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浙江地区碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌分布、流行及耐药基因分析 被引量:13
8
作者 黄丹艳 史秋橙 +1 位作者 蓝鹏 俞云松 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2018年第1期7-11,共5页
目的回顾性分析2011年浙江省内碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem resistant Klebsiella pneumoniae, CRKP)的分布、分子流行病学特征及耐药基因的携带情况。方法选取浙江大学医学院附属邵逸夫医院保存的收集于2011年浙江省内9... 目的回顾性分析2011年浙江省内碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem resistant Klebsiella pneumoniae, CRKP)的分布、分子流行病学特征及耐药基因的携带情况。方法选取浙江大学医学院附属邵逸夫医院保存的收集于2011年浙江省内9家医院临床标本中分离的肺炎克雷伯菌772株,采用纸片法和微量肉汤稀释法进行药物敏感试验,PCR检测耐药基因,多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳进行分子分型。结果9家医院共筛选到CRKP 48株(6.2%),PCR结果显示有39株携带碳青霉烯类耐药基因,其中37株携带blaKPC-2基因(77.1 %),2株携带blaIMP-4基因。多位点序列分型结果显示ST11为主要ST型(30株,62.5 %),脉冲场凝胶电泳显示48株肺炎克雷伯菌可分为15个克隆型。除温州、嘉兴和绍兴的临床菌株中未分离到碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌之外,其余6家医院均有此类耐药菌分布。 结论2011年CRKP在浙江省内大部分地区均有分布,产KPC-2型碳青霉烯酶是肺炎克雷伯菌最主要的碳青霉烯类耐药机制,ST11为最流行的ST型。 展开更多
关键词 克雷伯菌 肺炎 流行病学 分子 抗药性 碳青霉烯酶 地区分布
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荧光PCR探针熔解曲线法与微孔板法检测MTB耐药性的临床应用比较 被引量:13
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作者 王佩 赵国连 +3 位作者 雷倩 郑丹 崔晓利 周俊 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第2期132-138,共7页
目的分析荧光PCR探针熔解曲线法与微孔板法药物敏感性试验(简称"药敏试验")检测结核分枝杆菌(MTB)对抗结核药品耐药性结果的一致性及MTB基因突变与耐药的相关性,为临床诊疗优化提供参考。方法搜集2019年1-12月分离自西安市胸... 目的分析荧光PCR探针熔解曲线法与微孔板法药物敏感性试验(简称"药敏试验")检测结核分枝杆菌(MTB)对抗结核药品耐药性结果的一致性及MTB基因突变与耐药的相关性,为临床诊疗优化提供参考。方法搜集2019年1-12月分离自西安市胸科医院就诊患者并经鉴定确认的343株MTB临床分离株,菌株均进行了微孔板法药敏试验和荧光PCR探针熔解曲线法检测。以微孔板法药敏试验结果为参照,评价荧光PCR探针熔解曲线法检测MTB对异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、莫西沙星和左氧氟沙星耐药性的检测效能,并分析荧光PCR探针熔解曲线法检测的MTB基因突变与微孔板法药敏试验最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)的相关性。结果以微孔板法药敏试验结果为参照,荧光PCR探针熔解曲线法检测MTB对异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、莫西沙星和左氧氟沙星耐药性的敏感度、特异度、Kappa值分别为:96.20%(76/79)、95.28%(242/254)、0.88;93.62%(44/47)、94.58%(279/295)、0.79;96.88%(62/64)、94.96%(264/278)、0.86;93.33%(14/15)、95.37%(309/324)、0.61;92.31%(24/26)、97.16%(308/317)、0.80;91.18%(31/34)、99.35%(307/309)、0.92。荧光PCR探针熔解曲线法检测结果与微孔板法表型药敏试验检测结果不一致的菌株中,发生异烟肼AhpC启动子区(-44~-30及-15~3位点),利福平rpoB基因507~512位点,链霉素rrs基因905~908位点多位点突变和乙胺丁醇embB基因406位点突变的菌株,表型药敏试验耐药率较低,分别为1/5、1/5、1/10和1/5;而发生异烟肼KatG基因315位点、利福平rpoB基因529~533位点、链霉素rpsL基因43位点突变的菌株,表型药敏试验耐药率较高,分别为92.42%(61/66)、92.31%(36/39)和95.74%(45/47)。结论荧光PCR探针熔解曲线法与微孔板法药敏试验检测MTB对抗结核药品耐药性结果具有较好的一致性;MTB对异烟肼、利福平、链霉素的耐药与其部分基因突变具有一� 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 聚合酶链反应 分子探针技术 抗药性 细菌 对比研究
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内蒙古部分地区致奶牛乳房炎链球菌的流行病学及生物学特性分析 被引量:12
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作者 刘琪 王秋东 +5 位作者 崔彪 兰儒冰 宋丽华 张万江 刘思国 韩吉雨 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期875-879,共5页
为了解内蒙古部分地区规模化奶牛场奶牛乳房炎临床分布情况及病原菌的生物学特性,本研究从内蒙古部分地区规模化奶牛场采集330份患有奶牛乳房炎的奶样,进行链球菌的分离、鉴定。结果共分离到24株链球菌,分离率为7.27%。利用脉冲场凝胶... 为了解内蒙古部分地区规模化奶牛场奶牛乳房炎临床分布情况及病原菌的生物学特性,本研究从内蒙古部分地区规模化奶牛场采集330份患有奶牛乳房炎的奶样,进行链球菌的分离、鉴定。结果共分离到24株链球菌,分离率为7.27%。利用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)分析24株链球菌的亲缘关系,共得到16株不同谱型的链球菌。采用微量肉汤稀释法测定16株链球菌对临床上常用的12种抗生素的耐药谱,采用PCR方法分别进行耐药基因、血清型分型基因、表面蛋白基因及毒力基因的检测。结果显示,16株链球菌对林可霉素、红霉素及四环素耐药率均超过50%,其中对林可霉素的耐药率达到68.75%(11/16);耐药基因erm(B)和tet(M)的检出率分别为31.25%(5/16)和50%(8/16);其中10株不同谱型的无乳链球菌血清型均属于荚膜多糖Ⅱ型,表面蛋白均属于未定型且所携带的毒力基因相同。本研究为治疗临床中由链球菌感染所引起的奶牛乳房炎提供了实验依据。 展开更多
关键词 链球菌 流行病学 生物学特性 耐药
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FOX家族介导的上皮间质转化在肿瘤转移中的研究进展 被引量:12
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作者 蒋宗胜 阮君山 王少明 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1053-1058,共6页
在肿瘤的侵袭转移进程中,上皮间质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)是其中一个重要的生物学过程。但由于EMT复杂的信号通路和未尽阐明的分子机制,治疗EMT仍然是世界性的难题。但多种研究也证实了EMT并非是不可逆转的过程。... 在肿瘤的侵袭转移进程中,上皮间质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)是其中一个重要的生物学过程。但由于EMT复杂的信号通路和未尽阐明的分子机制,治疗EMT仍然是世界性的难题。但多种研究也证实了EMT并非是不可逆转的过程。近年来对叉头框转录因子(FOX)基因家族在EMT中的研究,显示了其在肿瘤转移中具有重要的调控作用。该文综述了FOX基因家族介导的EMT过程在肿瘤多种生物学过程的研究,以期对EMT的信号网络有更好的了解,并为有效干预EMT提供新的依据。 展开更多
关键词 EMT FOX 转录 分子靶标 肿瘤干细胞 耐药性
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2018年至2019年浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型感染者的分子传播网络特征分析 被引量:12
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作者 曹栋卿 陈金堃 +3 位作者 汤佳良 何婷婷 卢巧玲 杨作凯 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2021年第3期157-162,共6页
目的分析浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者传播关系的分子网络特征,为疫情流行趋势和防治提供依据。方法纳入2018年8月至2019年12月绍兴市新确证未经抗病毒治疗的423份HIV-1感... 目的分析浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者传播关系的分子网络特征,为疫情流行趋势和防治提供依据。方法纳入2018年8月至2019年12月绍兴市新确证未经抗病毒治疗的423份HIV-1感染/艾滋病病例血液样本,获得375份样本序列,采用反转录聚合酶链反应和巢式聚合酶链反应扩增HIV-1的pol基因,采用MEGA 6.0软件构建系统进化树分析亚型,并采用HyPhy软件和Cytoscape 3.7.2。生成不同基因距离的分子网络,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点。结果375份样本序列中发现8种亚型,优势亚型为流行重组型(circulating recombinant form,CRF)07BC 215份(57.33%),CRF01AE 103份(27.47%),其他包括CRF08BC、CRF85BC、CRF5501B、B、C和CRF01AE/B亚型。在基因距离为1.50%时,共形成24个分子簇,194条序列入网,入网率为51.73%。在分子簇最多的0.75%基因距离时,共形成30个分子簇,129条序列入网,入网率为34.40%,35例以老年人为主的病例聚集成CL1簇。42份样本存在监测性耐药突变(surveillance drug resistance mutation,SDRM),耐药传播率为11.20%(42/375),其中非核苷类反转录酶抑制剂耐药突变38例,分别为K103N(32/375,8.53%)、K103S(4/375,1.07%)、Y188L(1/375,0.27%)和G190A(1/375,0.27%),蛋白酶抑制剂耐药突变4例,分别为M46I(3/375,0.80%)和V82A(1/375,0.27%)。分子簇C2序列携带高比例耐药突变(94.29%,33/35)。结论绍兴市HIV-1亚型丰富多样,CRF07BC亚型传播迅速;在0.75%基因距离仍聚集的CL1簇老年病例亟待干预,防止该耐药毒株的进一步快速传播。 展开更多
关键词 HIV 亚型 分子传播网络 分子簇 耐药 耐药突变
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福建省鼠伤寒沙门菌PFGE分子分型和耐药的关联性研究 被引量:12
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作者 杨劲松 陈建辉 +3 位作者 林杰 郑金凤 严延生 陈爱平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期10-13,共4页
目的分析福建省鼠伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型和耐药结果之间的关联性,探讨二者的内在联系。方法对福建省66株鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型和药敏试验,并对分子分型和药敏试验结果进行关联性分析。结果 66株鼠伤寒沙门... 目的分析福建省鼠伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型和耐药结果之间的关联性,探讨二者的内在联系。方法对福建省66株鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型和药敏试验,并对分子分型和药敏试验结果进行关联性分析。结果 66株鼠伤寒沙门菌分为32个PFGE型,P1、P8型为优势型别,其中40.9%(27/66)的菌株为P1型,10.6%(7/66)的菌株为P8型,51.52%(34/66)的试验菌株归于P1和P8型别;耐药结果经聚类分析,可将抗生素分为4类,其中头孢类和环丙沙星(氟喹诺酮类)是较高敏感药物,敏感率分别为94.42%(61/66)和62.12%(41/66);P1型在多重耐药严重的菌株中(>6耐)为优势型别,占该类菌株数的56.82%,以6耐为分界,P1型菌株在两组中的分布存在差异,具有统计学意义;P8型菌株在两组中的分布差异无统计学意义。结论 P1和P8型是福建省鼠伤寒沙门菌的PFGE分型的优势基因型,其中P1型与多重耐药严重的菌株(>6耐)间存在关联性;头孢类和环丙沙星(氟喹诺酮类)仍是当前治疗福建省严重耐药鼠伤寒菌的主要药物。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 脉冲场凝胶电泳 分子分型 耐药性 关联性
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姜黄素逆转非小细胞肺癌分子靶向药物耐药的研究进展 被引量:12
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作者 于梦迪 王明霞 王海东 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1633-1637,共5页
近年来,随着分子生物学的飞速发展,非小细胞肺癌(NSCLC)的分子靶向治疗成为研究的热点。靶向治疗相对于传统化疗具有很大优势,但是在进行靶向治疗过程中不可避免地遇到耐药问题。耐药问题成为了靶向药物对NSCLC患者治疗的重大障碍。姜... 近年来,随着分子生物学的飞速发展,非小细胞肺癌(NSCLC)的分子靶向治疗成为研究的热点。靶向治疗相对于传统化疗具有很大优势,但是在进行靶向治疗过程中不可避免地遇到耐药问题。耐药问题成为了靶向药物对NSCLC患者治疗的重大障碍。姜黄素是姜黄植物根茎提取物的主要活性成分,具有广泛的抗肿瘤等药理活性,一些研究已证实姜黄素能对许多肿瘤的耐药具有逆转作用。然而,姜黄素对靶向药物耐药的逆转作用的报道并不多。该文总结了国内外相关文献,对靶向药物的主要耐药机制和姜黄素对其耐药的相关作用研究进展进行综述。 展开更多
关键词 分子靶向药物 药物耐药 非小细胞肺癌 姜黄素 耐药机制 逆转耐药
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Xpert MTB/RIF Ultra快速诊断涂阴肺结核的临床价值 被引量:10
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作者 丁彩红 王余余 +3 位作者 王庆 高绪胜 解丹 熊瑜 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期761-767,共7页
目的评估超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测(XpertUltra)方案检测痰液及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在涂阴肺结核患者中早期、快速诊断的价值。方法选择2020年5月-2021年12月在山东省公共卫生临床中心就诊的痰涂片阴性疑似肺结核患... 目的评估超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测(XpertUltra)方案检测痰液及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在涂阴肺结核患者中早期、快速诊断的价值。方法选择2020年5月-2021年12月在山东省公共卫生临床中心就诊的痰涂片阴性疑似肺结核患者93例,其中临床诊断为涂阴肺结核57例,非肺结核36例。收集所有患者的痰液及BALF标本,分别采用Xpert Ultra、GeneXpert MTB/RIF(Xpert)、BACTEC MGIT 960培养(MGIT 960培养)进行检测。以临床诊断为参考标准,评价3种检测方案及相互联合检测痰液及BALF标本时诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度及符合率。结果以临床诊断结果为参考标准,Xpert Ultra检测痰液标本对涂阴肺结核诊断的敏感度明显高于Xpert[56.14%(32/57)vs.36.84%(21/57),P=0.03]和MGIT960培养[56.14%(32/57)vs.33.33%(19/57),P=0.014];Xpert Ultra检测BALF标本对涂阴肺结核诊断的敏感度明显高于Xpert[75.44%(43/57)vs.56.14%(32/57),P=0.030]和MGIT960培养[75.44%(43/57)vs.38.60%(22/57),P<0.01]。3种检测方案及相互联合检测痰液标本诊断涂阴肺结核,受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)依次为:三者联合(0.807)>Xpert Ultra+Xpert(0.798)>Xpert Ultra+MGIT 960培养(0.789)>Xpert Ultra(0.781)>Xpert(0.684)>MGIT 960培养(0.667);检测BALF标本,AUC依次为:三者联合(0.895)=Xpert Ultra+Xpert(0.895)>XpertUltra+MGIT960培养(0.877)=XpertUltra(0.877)>Xpert(0.781)>MGIT960培养(0.693)。3种检测方案均未在入组患者中检测到利福平耐药。结论Xpert Ultra对早期、快速诊断涂阴肺结核具有较高的临床应用价值;其检测BALF的敏感度高于痰液标本,建议优先选择BALF标本。 展开更多
关键词 超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测 涂阴肺结核 分子诊断技术 耐药 早期诊断
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北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析 被引量:11
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作者 李东迅 舒高林 +1 位作者 王维钧 吴杨 《江苏预防医学》 CAS 2019年第3期246-248,共3页
目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,... 目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%~100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。 展开更多
关键词 腹泻 沙门菌 血清型 分子分型 脉冲场凝胶电泳 耐药性
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分子诊断技术在耐多药结核分枝杆菌检测中的应用进展 被引量:11
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作者 张太松 李明 《分子诊断与治疗杂志》 2009年第2期129-134,共6页
在过去的十年间,多种分子诊断方法应用于耐多药结核分枝杆菌的检测,包括微阵列法、直接测序法、电泳或者杂交的方法等。本文拟对这些方法的优缺点、检测靶标基因与传统检测方法之间的比较及未来临床应用前景作简要综述。
关键词 结核分枝杆菌 分子诊断 耐药
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住院患者分离纹带棒状杆菌耐药性及同源性分析 被引量:11
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作者 王俊瑞 杜小莉 +5 位作者 崔晶花 郭素芳 福泉 王艳艳 范文兵 韩艳秋 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第32期2501-2505,共5页
目的:对住院患者不同部位分离纹带棒状杆菌的分子流行病学特征及耐药性进行分析,为临床进一步认识纹带棒状杆菌临床意义提供新的实验数据和思路。方法收集内蒙古医科大学附属医院2013年11月至2014年3月间45例住院患者不同部位分离纹... 目的:对住院患者不同部位分离纹带棒状杆菌的分子流行病学特征及耐药性进行分析,为临床进一步认识纹带棒状杆菌临床意义提供新的实验数据和思路。方法收集内蒙古医科大学附属医院2013年11月至2014年3月间45例住院患者不同部位分离纹带棒状杆菌45株,采用微量肉汤稀释法进行体外药敏试验;采用盐水棉拭子法对纹带棒状杆菌阳性患者周边环境进行采样、分离纹带棒状杆菌,并对分离的纹带棒状杆菌进行体外药敏试验;进一步采用脉冲场凝胶电泳( PFGE)方法对45株纹带棒状杆菌进行分子分型。结果45株纹带棒状杆菌主要分离自神经外科病房(21株)、呼吸内科病房(8株)和重症监护病房(8株),其中39株分离自下呼吸道标本。2013年12月、2014年1月和2014年2月3个月内纹带棒状杆菌呈聚集分布。药敏试验结果显示,青霉素、红霉素、四环素、环丙沙星、克林霉素5种抗菌药物的最小抑菌浓度( MIC90)值≥64μg/ml;庆大霉素、万古霉素和利福平的MIC90值均为0.5μg/ml;仅1株分离株对除克林霉素之外的所有抗菌药物全部敏感。 PFGE分型结果显示,41株纹带棒状杆菌共分为7个不同基因型,其中以0002型和0006型为优势型,分别占63%(26/41)和22%(9/41)。同一病房同期住院患者分离株高度同源。环境采样结果显示,纹带棒状杆菌分离阳性率达40%(8/20)。结论住院患者分离纹带棒状杆菌呈多重耐药特征,不同患者分离株高度同源。特定病房如神经外科、重症监护病房、呼吸内科等科室应重新评估其临床分离意义及与临床治疗之间的相关性。 展开更多
关键词 棒状杆菌属 分子分型 抗药性 微生物 交叉感染
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阪崎肠杆菌脉冲场凝胶电泳分型及耐药研究 被引量:11
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作者 许龙岩 袁慕云 +4 位作者 刘静宇 赵贵明 邹志飞 阳静 焦红 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第7期205-209,共5页
目的:研究北京、新疆、广东、辽宁等地和新西兰、美国、印度进口食品中分离的阪崎肠杆菌(ES)分子型别和耐药情况。方法:用限制性内切酶XbaⅠ酶切ES染色体DNA进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用BioNumerics软件对不同地区分离的ES进行比对... 目的:研究北京、新疆、广东、辽宁等地和新西兰、美国、印度进口食品中分离的阪崎肠杆菌(ES)分子型别和耐药情况。方法:用限制性内切酶XbaⅠ酶切ES染色体DNA进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用BioNumerics软件对不同地区分离的ES进行比对,分析菌株之间的相似度。用Vitek2进行药敏实验,分析ES耐药情况。结果:38株ES(其中ES12为标准菌株)分成37个PFGE型,相似度在25%~100%,未表现出优势带型和地区特异性,而部分食品被遗传紧密相关的ES克隆株污染。药敏实验结果显示37株ES共有9种耐药谱,部分菌株对呋喃类、头孢类、β-内酰胺类耐药。结论:建立的PFGE方法可应用于ES的分子分型和溯源。 展开更多
关键词 阪崎肠杆菌 脉冲场凝胶电泳 分子分型 食品 耐药
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质粒介导KPC-2型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌儿童分离株耐药基因研究 被引量:11
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作者 刘洋 李方去 +2 位作者 蒋伟燕 杨锦红 李向阳 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期861-865,共5页
目的研究碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌临床儿童分离株的耐药特点及分子流行病学特征。方法收集温州医学院附属第二医院2010年7月-2011年6月从儿童标本中分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌12株,所有菌株为非重复菌株,菌种鉴定采用全自动... 目的研究碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌临床儿童分离株的耐药特点及分子流行病学特征。方法收集温州医学院附属第二医院2010年7月-2011年6月从儿童标本中分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌12株,所有菌株为非重复菌株,菌种鉴定采用全自动微生物分析仪。改良的Hodge试验筛选产碳青霉烯酶阳性菌株,采用PCR法检测KPC、IMP、bla(s)、VIM、SPM和整合酶基因,测序确定基因型。对菌株进行质粒结合试验、质粒消除试验检测质粒的转移性。脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析耐药菌株的同源性。结果12株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌对庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星、环丙沙星、左氧氟沙星、复方磺胺甲嗯唑的敏感率分别为8.3%、41.7%、58.3%、8.3%、8.3%、33.3%;12株菌均携带有KPC-2基因,且同时携带有TEM-1和SHV型β-内酰胺酶基因,其中SHV-11-like和SHV·12-like各6株;11株携带CTX-M型基因,其中4株为CTX—M-14-like基因,6株CTX—M-15-like基因;2株携带有OXA-10型基因,1株携带有PER-1基因。未检出NDM-1、GIM、SPM、SIM、VIM型碳青霉烯酶基因。12株均为I类整合酶基因(intl)阳性。2株通过接合试验把质粒传递给受体菌EC600。所有接合子blaTEM-1基因阳性、超广谱B.内酰胺酶(ESBL)基因阳性及对亚胺培南、庆大霉素、阿米卡星、妥布霉素和头孢噻肟耐药,接合子ESBL基因型与供菌-致。2株菌经质粒消除后对亚胺培南的MIC值均有较大程度降低,消除后KPC-2基因扩增为阴性。12株KPC-2基因阳性菌株经PFGE分成5个基因型,主要为B型和C型。结论KPC-2型碳青霉烯酶基因已经在儿童肺炎克雷伯菌中播散,常伴随携带多种类型的ESBL基因和I类整合酶基因,部分耐药基因可通过质粒播散。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 分子流行病学 Β-内酰胺酶类 耐药性
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