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题名芒属植物叶绿体InDel标记的开发与应用
被引量：2
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作者
薛宏
易自力
肖亮
丁力
彭思佳
蒋建雄
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机构
湖南农业大学生物科学技术学院
湖南省蚕桑科学研究所
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出处
《现代农业科技》
2015年第7期153-155,159,共4页
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基金
863计划(2012AA10180104)
国家支撑计划(2013BAD22B01)
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文摘
研究利用芒属植物(芒02381和荻04005)叶绿体全基因组测序的结果,开发12对InDel标记。采用正交设计法优化cpInDelPCR体系,得到模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶5个关键因素在体系中的最佳组合。12对InDel标记对43份芒属和2份甘蔗材料进行扩增,共扩增出538条条带,其中3对引物扩增出13条多态性条带,占总数的2.4%。将所有位点读带转化为数值矩阵并用UPGMA法聚类,在遗传相似系数1.4的水平上,和南荻聚为一类,而芒和与五节芒、双药芒、红山茅、尼泊尔芒、甘蔗聚为一类,4个具有杂交种特征的材料单独聚为一类。试验开发的芒属植物cpInDel标记可用于芒与荻的区分,指导芒属植物的杂交育种。
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关键词
芒属植物
叶绿体
INDEL标记
育种
应用
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Keywords
miscanthus A nderss
chloroplast
InDel marker
breeding
application
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
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