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ABCC6基因变异所致婴儿泛发性动脉钙化1例患儿的遗传学分析
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作者 赵春娟 刘田田 +2 位作者 刘芳 崔丽茹 王军屏 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第6期734-740,共7页
目的:探讨1例罕见的ABCC6基因变异所致婴儿泛发性动脉钙化(GACI)患儿的临床表现与遗传学病因。方法:选取2022年8月26日就诊于首都医科大学附属北京儿童医院保定医院的1例44 d女性患儿作为研究对象。收集患儿的临床资料,通过核心家系全... 目的:探讨1例罕见的ABCC6基因变异所致婴儿泛发性动脉钙化(GACI)患儿的临床表现与遗传学病因。方法:选取2022年8月26日就诊于首都医科大学附属北京儿童医院保定医院的1例44 d女性患儿作为研究对象。收集患儿的临床资料,通过核心家系全外显子组测序(Trio-WES)、全基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)以及Minigene剪接实验对变异进行致病性分析。结果:患儿主要表现为发热、炎症指标高、抗感染治疗无效,超声显示全身大、中动脉广泛钙化、管壁增厚,考虑为GACI以及相关的动脉炎,经糖皮质激素、生物制剂治疗后发热缓解。Trio-WES发现患儿携带ABCC6基因复合杂合变异c.4404-1G>A与c.4041+5G>T,后者既往未见报道。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南,两个变异被分别判定为可能致病性(PVS1+PM2_Supporting)与临床意义不明(PM2_Supporting+PM3+PP3)。CNV-seq检测未见异常。Minigene剪接实验进一步验证两个变异均可影响剪接。结论:对于不明原因及常规治疗无效的发热,需要及时完善基因检测,避免GACI的漏诊。 展开更多
关键词 发热 泛发性动脉钙化 ABCC6基因变异 全外显子组测序 minigene剪接
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人SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A>G导致转录子剪接异常 被引量:2
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作者 陈君霖 李海清 +2 位作者 刘妍霖 李冰肖 张占会 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期369-375,共7页
目的:通过minigene剪接实验分析SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A> G是否导致转录子剪接异常,并确定其剪接方式,进而明确其在Citrin缺陷病的致病性.方法:构建携带突变的目的片段外显子捕获载体,转染293T细胞后逆转录PCR扩增转录产物,... 目的:通过minigene剪接实验分析SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A> G是否导致转录子剪接异常,并确定其剪接方式,进而明确其在Citrin缺陷病的致病性.方法:构建携带突变的目的片段外显子捕获载体,转染293T细胞后逆转录PCR扩增转录产物,测序并分析.结果:IVS6-11A> G突变导致SLC25A13基因内含子6的3'端10个碱基保留于转录子中,致蛋白翻译提前终止,Citrin蛋白功能丧失.结论:SLC25A13基因IVS6-11A> G突变为剪接突变,其剪接方式为可变3'剪接,该突变为Citrin缺陷病致病突变. 展开更多
关键词 SLC25A13基因 IVS6-11A>G minigene剪接 CITRIN缺陷病
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Comprehensive genetic diagnosis of patients with Duchenne/Becker muscular dystrophy(DMD/BMD) and pathogenicity analysis of splice site variants in the DMD gene 被引量:4
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作者 Yan-mei YANG Kai YAN +7 位作者 Bei LIU Min CHEN Li-ya WANG Ying-zhi HUANG Ye-qing QIAN Yi-xi SUN Hong-ge LI Min-yue DONG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2019年第9期753-771,共19页
Duchenne muscular dystrophy(DMD)and Becker muscular dystrophy(BMD)are caused by mutations in the DMD gene.The aim of this study is to identify pathogenic DMD variants in probands and reduce the risk of recurrence of t... Duchenne muscular dystrophy(DMD)and Becker muscular dystrophy(BMD)are caused by mutations in the DMD gene.The aim of this study is to identify pathogenic DMD variants in probands and reduce the risk of recurrence of the disease in affected families.Variations in 100 unrelated DMD/BMD patients were detected by multiplex ligation-dependent probe amplification(MLPA)and next-generation sequencing(NGS).Pathogenic variants in DMD were successfully identified in all cases,and 11 of them were novel.The most common mutations were intragenic deletions(69%),with two hotspots located in the 5'end(exons 2–19)and the central of the DMD gene(exons 45–55),while point mutations were observed in 22%patients.Further,c.1149+1G>A and c.1150?2A>G were confirmed by hybrid minigene splicing assay(HMSA).This two splice site mutations would lead to two aberrant DMD isoforms which give rise to severely truncated protein.Therefore,the clinical use of MLPA,NGS,and HMSA is an effective strategy to identify variants.Importantly,eight embryos were terminated pregnancies according to prenatal diagnosis and a healthy boy was successfully delivered by preimplantation genetic diagnosis(PGD).Early and accurate genetic diagnosis is essential for prenatal diagnosis/PGD to reduce the risk of recurrence of DMD in affected families. 展开更多
关键词 Dystrophin gene VARIATION Genetic diagnosis Splice site mutation Hybrid minigene splicing assay
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Leber先天性黑矇10型一家系CEP290基因变异及临床表型分析
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作者 张海涛 朱子芊 +4 位作者 但汉东 徐英英 郭含超 石路 毛良伟 《中华眼底病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期273-280,共8页
目的确定并观察1个汉族Leber先天性黑矇(LCA)家系的致病基因变异和临床表型。方法回顾性研究。2022年5月在河南省立眼科医院就诊的LCA10型一家系(1例患者和2名家系成员)纳入研究。详细询问患者病史、家族史并行眼底彩色照相、闪光视网... 目的确定并观察1个汉族Leber先天性黑矇(LCA)家系的致病基因变异和临床表型。方法回顾性研究。2022年5月在河南省立眼科医院就诊的LCA10型一家系(1例患者和2名家系成员)纳入研究。详细询问患者病史、家族史并行眼底彩色照相、闪光视网膜电图(F-ERG)检查。采集先证者及其父母的外周静脉血3 ml,提取全基因组DNA。全外显子组测序(WES)、线粒体环基因组(mtDNA)测序以获得致病基因及变异。通过生物信息学分析方法对所有变异位点进行注释,并参考美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)对所有变异位点进行致病等级评估。对候选位点进行Sanger验证,并对致病性证据不足的错义变异行Minigene体外功能验证。结果先证者,男,7个月。视物追随反应差,指压眼征、畏光、眼球震颤,黄斑中心凹周围区视网膜色素上皮部分脱失。2岁时,F-ERG检查发现,双眼a、b波振幅重度降低,峰时延长,甚至无波形。先证者父母临床表型未见明显异常。WES结果显示,先证者CEP290基因第40、2号外显子分别存在c.5515_5518del(p.Glu1839Lysfs*11)(V1)移码变异和c.74C>T(p.Ala25Val)(V2)错义变异。mtDNA测序结果为阴性。Sanger验证结果表明,先证者父亲、母亲分别携带杂合移码变异V1、新发错义变异V2,构成复合杂合变异。Minigene体外功能验证结果表明,V2变异使2号外显子产生一个新的剪接供体位点,从而导致2号外显子右侧缺失30个碱基对,蛋白质框内缺失10个氨基酸残基。ACMG评级分别为致病(V1)、可能致病变异(V2)。结论CEP290基因c.5515_5518del和新发变异c.74C>T构成复合杂合变异可能是本家系的致病原因,分别导致截短蛋白的产生和前体信使RNA的异常剪接。LCA具有发病年龄小、视功能严重损害和致病变异多样性等特点。 展开更多
关键词 Leber先天性黑矇10型 CEP290基因 全外显子组测序 minigene剪接验证
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应用Minigene剪接变异体分析技术诊断PMM2基因非经典剪接位点新变异的致病性
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作者 周琴 林伟霞 宋元宗 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS 北大核心 2024年第2期124-131,共8页
目的:研究Minigene剪接变异体分析技术在诊断磷酸甘露糖变位酶2(PMM2)相关先天性糖基化障碍(PMM2-CDG)中的价值,探讨磷酸甘露糖变位酶2(PMM2)基因剪接位点新变异对其转录产物的影响。方法:通过对1例PMM2-CDG患儿进行高通量测序查找可能... 目的:研究Minigene剪接变异体分析技术在诊断磷酸甘露糖变位酶2(PMM2)相关先天性糖基化障碍(PMM2-CDG)中的价值,探讨磷酸甘露糖变位酶2(PMM2)基因剪接位点新变异对其转录产物的影响。方法:通过对1例PMM2-CDG患儿进行高通量测序查找可能的遗传学病因,利用Minigene剪接变异体分析技术,研究PMM2基因新剪接位点变异的致病性。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南,判断新变异的致病性。结果:遗传学分析发现患儿系PMM2基因母源性c.691G>A(p.Val231Met)变异和父源性c.447+5G>A变异复合杂合子。Minigene剪接变异体分析发现:变异c.447+5G>A导致PMM2基因转录产物形成r.348_447del转录本,为致病性PMM2基因变异。患儿的临床特征为皮肤巩膜黄染,血清总胆红素、非结合胆红素和总胆汁酸明显升高,白蛋白明显降低,甲胎蛋白、铁蛋白和促甲状腺素等升高,对症支持治疗效果欠佳。结论:Minigene剪接变异体分析可为PMM2-CDG确诊和家系遗传咨询提供新的分子标记物,扩展了PMM2基因变异谱,为该病的临床诊治提供新的参考依据。 展开更多
关键词 磷酸甘露糖变位酶2(PMM2)基因 PMM2相关先天性糖基化障碍(PMM2-CDG) minigene剪接变异体分析
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