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12 085例无创产前基因检测在胎儿染色体异常筛查中的临床应用 被引量:22
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作者 王路明 周赤燕 +2 位作者 胡月 金玉霞 刘晓丹 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第10期1069-1073,共5页
目的探讨无创产前基因检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)在胎儿染色体异常筛查中的临床应用价值。方法选择2017年11月1日至2019年5月31日于嘉兴市妇幼保健院产前诊断中心行NIPT的12085名孕妇的检测结果与介入性产前诊断确诊结... 目的探讨无创产前基因检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)在胎儿染色体异常筛查中的临床应用价值。方法选择2017年11月1日至2019年5月31日于嘉兴市妇幼保健院产前诊断中心行NIPT的12085名孕妇的检测结果与介入性产前诊断确诊结果进行比较分析。结果12085例样本中,检测成功12067例,共检出染色体异常179例,筛查阳性率1.48%,灵敏度98.39%,特异度99.02%。检测失败的18例中有3例行产前诊断,核型分析未见异常;分娩结果除1例双胎剖宫产一正常女性胎儿及一未知性别死胎外,其余新生儿均无异常。各检测指征中,超声提示异常组NIPT筛查阳性率高于其他组,差异有统计学意义(P<0.01)。NIPT筛查阳性结果中122例行介入性产前诊断,确诊21三体25例、18三体7例、13三体3例、其他常染色体非整倍体异常4例、性染色体非整倍体异常13例、微缺失/微重复9例,阳性预测值分别为86.21%、50.00%、23.08%、21.05%、46.43%、47.36%。结论NIPT具有较高的灵敏度、特异度和阳性预测值,是一种高效的筛查手段。除对21、18、13号染色体外,NIPT对其他常染色体非整倍体异常、性染色体非整倍体异常、微缺失/微重复的提示结果具有一定参考价值,能够为后续的核型分析和基因芯片验证提供参考依据。 展开更多
关键词 无创产前基因检测 产前诊断 染色体非整倍体 微缺失/微重复
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基因组拷贝数变异测序用于高危妊娠胎儿产前诊断的临床价值评估 被引量:11
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作者 程龙凤 袁静 +6 位作者 魏兆莲 李琴 周培 张小鹏 陈薇 方慧琴 吴仁花 《生殖医学杂志》 CAS 2020年第4期495-501,共7页
目的应用基因组拷贝数变异测序技术对高危妊娠胎儿进行遗传学检测,分析其在产前诊断中的临床价值。方法对于2018年1月至12月就诊于安徽医科大学第一附属医院妇产科有产前诊断指征的孕妇,根据其不同孕周行羊膜腔穿刺或脐血管穿刺术,样本... 目的应用基因组拷贝数变异测序技术对高危妊娠胎儿进行遗传学检测,分析其在产前诊断中的临床价值。方法对于2018年1月至12月就诊于安徽医科大学第一附属医院妇产科有产前诊断指征的孕妇,根据其不同孕周行羊膜腔穿刺或脐血管穿刺术,样本送检染色体核型分析,同时行低深度全基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)检测染色体数目和拷贝数。结果在455例羊水和脐血标本核型分析中共检出染色体非整倍体17例(3.7%)、微重复2例(0.4%)、微缺失2例(0.4%)、嵌合体1例(0.2%)。CNV-seq共检测出17例非整倍体(3.7%),致病性异常的微重复4例(0.9%)、可能致病性异常的微重复4例(0.9%)、致病性异常的微缺失5例(1.1%)、可能致病性异常的微缺失6例(1.3%)、致病性异常的微重复合并缺失3例(0.7%)。嵌合体共3例(0.7%)。结论 CNV-seq无法直接辨别染色体易位、倒位;对于标准型非整倍体异常,染色体核型分析和CNV-seq均可检测出,CNV-seq耗时更短;CNV-seq可分析出低比例嵌合体,检出率优于染色体核型分析;CNV-seq在检测染色体微缺失/重复方面较核型分析有独特的价值,能提高染色体异常的检出率,对产前咨询起重要作用;CNV-seq分析结果的不确定性也增加了临床遗传咨询的难度,需结合多种产前诊断方法综合评估。 展开更多
关键词 高危妊娠 产前诊断 染色体核型分析 拷贝数变异测序 染色体微缺失/微重复
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新生突变的16p11.2微缺失综合征(附1例报告及文献复习) 被引量:6
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作者 蒋萍 张桐 +4 位作者 汤继宏 黄静 张兵兵 肖潇 师晓燕 《中国临床神经科学》 2021年第3期303-309,共7页
目的探讨16p11.2微缺失综合征患儿的临床表型和基因特征。方法回顾分析1例以癫发作起病的16p11.2微缺失综合征患儿的临床和辅助检查资料,并结合相关文献复习进行讨论。结果患儿,女性,8月龄,因"半天内抽搐2次"入院。入院后查体... 目的探讨16p11.2微缺失综合征患儿的临床表型和基因特征。方法回顾分析1例以癫发作起病的16p11.2微缺失综合征患儿的临床和辅助检查资料,并结合相关文献复习进行讨论。结果患儿,女性,8月龄,因"半天内抽搐2次"入院。入院后查体:患儿头围偏大、发育落后,有癫发作等情况。完善相关检查:胸部X线片提示脊柱侧弯。脑电图示右颞起源后泛化全导的异常放电,予抗癫药治疗后未再出现抽搐发作。家系全外显子基因检测提示:患儿16p11.2区域存在大片段缺失[hg19,(chr16:29802034-30200397)],缺失区域大于390 kb,该区域涉及CORO1A、PRRT2、ALDOA、KIF22、TBX6、FAM57B、KCTD13、SEZL6L2等27个基因,确诊为16p11.2微缺失综合征。患儿父母基因检测结果均未发现异常,提示患儿为新生突变。结论患儿早期出现癫发作,合并发育落后、多发骨骼畸形(头围偏大、脊柱侧弯,等),需警惕16p11.2微缺失综合征,完善基因检测有助于早期识别该病并早期干预,也有助于预后判断。 展开更多
关键词 16p11.2 16号染色体 微缺失/微重复 发育落后
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16p11.2微缺失/微重复胎儿的产前诊断和遗传学分析 被引量:5
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作者 傅婉玉 王俊育 +2 位作者 王元白 江矞颖 李燕青 《生殖医学杂志》 CAS 2022年第8期1099-1104,共6页
目的 分析16p11.2微缺失/微重复胎儿的产前指征及预后情况。方法 回顾性分析2017年1月1日至2021年8月31日在我院产前诊断中心行羊水染色体核型及单核苷酸多态性微阵列芯片(SNP-array)检测的2 942例孕妇的临床资料,共检出涉及16p11.2区... 目的 分析16p11.2微缺失/微重复胎儿的产前指征及预后情况。方法 回顾性分析2017年1月1日至2021年8月31日在我院产前诊断中心行羊水染色体核型及单核苷酸多态性微阵列芯片(SNP-array)检测的2 942例孕妇的临床资料,共检出涉及16p11.2区域拷贝数变异(CNVs)的胎儿9例,分析此9例胎儿的产前指征、家系验证情况及预后随访情况。结果 本研究共检出来自8个家系的9例16p11.2区域CNVs胎儿,检出率为0.31%,其中,微缺失发生率0.14%(4/2 942),微重复发生率0.17%(5/2 942)。家系6孕妇两次妊娠均检出胎儿存在相同片段16p11.2微重复,经验证遗传自表型正常的母亲。9例胎儿产前超声检查提示2例胸椎异常、1例心内膜垫缺损及1例腹腔多房囊性包块;4例胎儿存在母亲血清学筛查异常。结论 16p11.2微缺失/微重复胎儿表型存在高度异质性,当超声检查提示胎儿椎体异常或心脏畸形时应考虑CNVs可能,建议行SNP-array检测协助排查遗传学病因,以期为产前遗传咨询提供一定参考。 展开更多
关键词 16p11.2 微缺失/微重复 单核苷酸多态性微阵列 临床表型
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染色体微阵列分析技术在股骨长度偏短胎儿遗传学诊断中的应用
5
作者 刘磊 王优 +3 位作者 黄锐斌 张丽娜 宋一丹 雷婷缨 《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》 CAS 2023年第4期437-445,共9页
目的:探讨染色体微阵列分析(CMA)技术在全基因组水平探讨股骨长度(FL)偏短胎儿的遗传学病因。方法:选取2019年1月至2020年12月于广州市妇女儿童医疗中心经产前胎儿超声检查提示胎儿FL偏短,并接受侵入性产前诊断的73例孕妇及其胎儿为研... 目的:探讨染色体微阵列分析(CMA)技术在全基因组水平探讨股骨长度(FL)偏短胎儿的遗传学病因。方法:选取2019年1月至2020年12月于广州市妇女儿童医疗中心经产前胎儿超声检查提示胎儿FL偏短,并接受侵入性产前诊断的73例孕妇及其胎儿为研究对象。根据是否合并其他明显结构异常,将其分为孤立组(n=56,单纯FL或四肢长骨短于同胎龄儿,较正常值<-2 s,伴或不伴超声软指标阳性者)和复杂组[n=17,合并骨骼系统其他畸形和(或)其他系统结构畸形者]。对这73例胎儿进行染色体核型分析和CMA检测,并应用染色体分析套件(ChAS)及相关的生物信息学方法对结果进行分析。本研究遵循的程序符合广州市妇女儿童医疗中心人体试验委员会所制定的伦理学标准,得到该伦理委员会批准(审批文号:穗妇儿科伦通字〔2019〕第11600号)。所有孕妇在接受侵入性产前诊断前及接受遗传咨询时,均签署知情同意书,并告知产前诊断风险、检测优势及局限性。结果:①孤立组56例胎儿中,6例合并超声软指标异常;复杂组17例胎儿中,6例合并神经系统畸形,6例合并心血管畸形,6例合并其他骨骼系统畸形。②这73例胎儿CMA检测结果中,10例含有致病性/可能致病性染色体拷贝数变异(CNV),总致病性检出率为13.7%(10/73),临床意义不明变体(VUS)CNV检出率为2.7%(2/73),其中非致病CNV检出率为83.6%(61/73)。③44例同时接受染色体核型分析和CMA检测的FL偏短胎儿中,孤立组为34例,复杂组为10例。复杂组中,染色体核型异常率(10.0%)和CMA技术检出异常率(30.0%)比较,差异无统计学意义(χ^(2)=2.08,P=0.149),④这73例胎儿均未检出含有已知FGFR3基因的致病性位点突变。其中63例CMA技术检出结果呈阴性胎儿中,7例因产前超声检测高度怀疑为长骨发育不良(四肢长骨较同胎龄儿正常值<-3 s),进一步进行全外显子组测序(WES)检测结果显示,1例胎儿检 展开更多
关键词 产前超声 胎儿股骨短 结构畸形 染色体异常 微缺失/微重复
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无创产前筛查扩展性检测临床研究进展
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作者 徐玉婵(综述) 严提珍(审校) 《现代医药卫生》 2023年第2期295-299,共5页
随着高通量测序技术的发展,获取孕妇外周血胎儿游离DNA进行胎儿染色体非整倍体评估的无创产前筛查(NIPT)技术已在国内外广泛应用。21、18、13-三体综合征是目前NIPT的主要检测目标,但已有许多学者提出了将NIPT技术用于性染色体、双胎妊... 随着高通量测序技术的发展,获取孕妇外周血胎儿游离DNA进行胎儿染色体非整倍体评估的无创产前筛查(NIPT)技术已在国内外广泛应用。21、18、13-三体综合征是目前NIPT的主要检测目标,但已有许多学者提出了将NIPT技术用于性染色体、双胎妊娠,以及对染色体微缺失、微复制,单基因遗传病等其他范围扩展检测的可能性。 展开更多
关键词 无创产前筛查 扩展性检测 双胎妊娠 微缺失微重复 单基因遗传病 综述
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孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查结果的回顾性分析
7
作者 魏友华 王蕊 +3 位作者 奚美霞 魏莉 朱文娟 刘彦 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2023年第8期933-938,共6页
目的分析孕妇外周血胎儿游离DNA(cfDNA)无创产前筛查(NIPT)对于21三体综合征、18三体综合征、13三体综合征、性染色体异常及染色体微缺失/微重复的筛查价值。方法选择2015年2月至2021年12月在枣庄市妇幼保健院进行NIPT检测的共计15237... 目的分析孕妇外周血胎儿游离DNA(cfDNA)无创产前筛查(NIPT)对于21三体综合征、18三体综合征、13三体综合征、性染色体异常及染色体微缺失/微重复的筛查价值。方法选择2015年2月至2021年12月在枣庄市妇幼保健院进行NIPT检测的共计15237例孕妇作为研究对象。对NIPT筛查高风险孕妇抽取羊水细胞进行G显带染色体核型分析和染色体微阵列检测,明确胎儿NIPT结果与介入性产前诊断的结果一致性。最后,电话随访胎儿妊娠结局,收集胎儿信息。结果15237例孕妇中累计检出染色体异常266例,染色体异常的检出率为1.75%(266/15237)。266例中筛查出21三体高风险79例(29.7%),18三体高风险26例(9.77%),13三体高风险9例(3.38%),性染色体非整倍体高风险74例(27.82%),其他常染色体非整倍体高风险12例(4.51%),染色体微缺失/微重复高风险66例(24.81%)。266例中217例NIPT阳性孕妇同意接受后续介入性产前诊断,确诊21三体50例、18三体13例、13三体1例、性染色体异常25例、其他常染色体非整倍体1例、微缺失/微重复18例,阳性预测值分别为75.76%、68.42%、11.11%、40.32%、10%和35.29%。15237例孕妇成功随访胎儿妊娠结局13042例,胎儿妊娠结局随访成功率为85.59%(13042/15237)。随访发现21三体假阴性1例,未发现13三体和18三体假阴性。结论孕妇cfDNA产前筛查除对13三体、18三体和21三体具备良好的筛查性能外,对其他常染色体非整倍体异常、性染色体非整倍体异常以及微缺失/微重复也具有重要的临床应用价值。 展开更多
关键词 无创产前基因检测 胎儿游离DNA 染色体非整倍体 微缺失/微重复
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染色体微阵列分析在婴幼儿先天性心脏病中的应用 被引量:4
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作者 陈晨 邓琼 +4 位作者 张雯雯 符芳 李茹 崔彦芹 邓力 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2020年第20期1577-1582,共6页
目的:探讨全基因组、高分辨率染色体微阵列分析(CMA)技术在先天性心脏病(CHD)婴幼儿遗传病因学诊断中的应用价值。方法:回顾性分析2016年1月至2018年12月在广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心儿科住院并接受CMA检查的130例先天性... 目的:探讨全基因组、高分辨率染色体微阵列分析(CMA)技术在先天性心脏病(CHD)婴幼儿遗传病因学诊断中的应用价值。方法:回顾性分析2016年1月至2018年12月在广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心儿科住院并接受CMA检查的130例先天性心脏病婴幼儿的临床资料。患儿均按照美国Affymetrix公司CytoScan HD技术平台的标准操作流程行全基因组CMA检测,结果采用ChAS(chromosome ana-lysis suite染色体分析套件)软件及相关的生物信息学方法分析。根据CHD患儿是否合并心外异常分为孤立型CHD组和综合征型CHD组;根据CHD患儿解剖学特点对2组患儿CHD表型进行分类,分为简单型CHD组和复杂型CHD组。结果:在130例行CMA的CHD婴幼儿中,共在53例患儿中检出60个有临床意义的拷贝数变异(CNVs),总体检出率为40.8%(53/130例),其中32例(24.6%)患儿的致病性CNVs<107 bp。检出染色体微缺失/重复综合征29例(54.7%),其中最常见的为22q11.2微缺失综合征、Williams-Beuren综合征及Wolf-Hirschhorn综合征。孤立型CHD组致病性CNVs检出率为42.8%(30/70例),综合征型CHD组致病性CNVs检出率为38.3%(23/60例),差异无统计学意义(P=0.60)。简单型CHD致病性CNVs检出率为34.4%(20/58例),复杂型CHD致病性CNVs检出率为45.8%(33/72例),差异无统计学意义(P=0.19)。通过基因型与表型分析,发现SUZ12、DGCR6、YWHAE、CRKL、LZTR1、DLG1、ADAP2、TBX6基因是与CHD相关的候选致病基因。结论:CMA在婴幼儿CHD中具有重要的应用价值,推荐CMA作为CHD婴幼儿临床一线遗传学检测技术,无论哪种类型CHD均应接受CMA检测。 展开更多
关键词 先天性心脏病 拷贝数变异 染色体微阵列分析 微缺失/微重复 候选基因
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胎儿脐膨出孕期管理及娩出后转运1例并文献复习
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作者 胡凌云 卢彦平 +1 位作者 王旖 游艳琴 《中国医药》 2023年第4期596-598,共3页
脐膨出是一种发生在脐带根部、大小不定的中线腹壁缺损,表面是由羊膜、华通胶和腹膜组成的囊膜,囊内含有疝出的腹腔内容物,该出生缺陷是最常见的胎儿腹壁缺损,我国胎儿中发生率约为3.38/10000。含有肝脏组织的脐膨出,最早可在妊娠9~10... 脐膨出是一种发生在脐带根部、大小不定的中线腹壁缺损,表面是由羊膜、华通胶和腹膜组成的囊膜,囊内含有疝出的腹腔内容物,该出生缺陷是最常见的胎儿腹壁缺损,我国胎儿中发生率约为3.38/10000。含有肝脏组织的脐膨出,最早可在妊娠9~10周通过经阴道超声做出产前诊断。脐膨出与染色体非整倍体具有较高的相关性,除染色体层面异常外,根据文献报道,还与遗传综合征相关。本文介绍1例我们收治的胎儿脐膨出病例的孕期管理及分娩后转运情况,并进行了相关文献复习。 展开更多
关键词 脐膨出 染色体 微缺失微重复 产前咨询 产前诊断
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单核苷酸多态性微阵列芯片技术在生长迟缓患儿遗传学检查中的应用 被引量:3
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作者 罗仕玉 付春云 +10 位作者 张淑杰 王锦 范歆 罗静思 陈荣誉 胡旭昀 覃海松 李川 欧珊 李奇霏 陈少科 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期321-326,共6页
目的探讨单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array, SNP-array)在生长迟缓患儿遗传学检查中的应用价值。方法对181例生长迟缓的患儿,采用Illumina Human Cyto SNP-12微阵列芯片进行全基因组拷贝数变异(copy ... 目的探讨单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array, SNP-array)在生长迟缓患儿遗传学检查中的应用价值。方法对181例生长迟缓的患儿,采用Illumina Human Cyto SNP-12微阵列芯片进行全基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)检测,结合查询国际病理性CNVs数据库(ClinGen、ClinVar、DECIPHER、OMIM)、正常人基因组变异数据库(Database of Genomic Variants, DGV)以及PubMed文献数据库等对检出的CNVs的致病性进行分析。结果共检出47例变异阳性患儿,检出率约26%,其中包括已知的微缺失/重复综合征12例(占26%)、明确致病的CNVs(非综合征)10例(21%)、染色体数目异常3例(6%)、染色体非平衡易位3例(6%)、致病性嵌合4例(9%)、临床意义不明的CNVs15例(32%)。剔除染色体水平明显可见的数目与结构异常后,共检出15例小于5Mb的明确致病性CNVs,这是常规染色体核型分析所无法检出的。此外,还检出3例包含已知或预测为印迹基因的杂合性丢失(loss of heterozygosity,LOH)患儿以及2例亲本可能存在血缘关系的患儿。结论SNP-array技术具有分辨率高、准确性好等优点,是生长迟缓患儿遗传学诊断的有力工具。 展开更多
关键词 生长迟缓 拷贝数变异 微缺失/重复 单核苷酸多态性微阵列芯片
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一例以精神发育迟滞为主要临床表现的XYY综合征患儿的遗传学分析 被引量:2
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作者 刘毅 董睿 +5 位作者 张开慧 王莹 张海燕 张艳卿 赵冬梅 盖中涛 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期686-689,共4页
目的对1例精神发育迟滞患儿及其父母进行遗传学分析,寻找其致病原因。方法对患儿及其父母进行常规染色体G显带核型和荧光原位杂交技术分析,再以染色体微阵列分析技术对该患儿进行检测,并以定量PCR对可疑突变进行检测验证。结果染色... 目的对1例精神发育迟滞患儿及其父母进行遗传学分析,寻找其致病原因。方法对患儿及其父母进行常规染色体G显带核型和荧光原位杂交技术分析,再以染色体微阵列分析技术对该患儿进行检测,并以定量PCR对可疑突变进行检测验证。结果染色体核型分析与荧光原位杂交结果确定患儿为47,XYY,未见其他染色体异常,其父母核型正常;染色体微阵列分析结果显示患儿X染色体单拷贝缺失,Y染色体探针覆盖区呈双拷贝重复,同时发现一可疑致病基因KYNU的片段缺失。结论当染色体畸变综合征表型异质性时,应进一步应用精度更高的染色体微阵列进行遗传学检查,以寻找其它可能并存的导致表型变异的染色体微缺失/微重复。 展开更多
关键词 染色体微阵列 XYY综合征 微缺失/微重复
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基因组光学图谱技术在16p11.2-p12.2微缺失诊断的应用 被引量:1
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作者 代鹏 朱朝锋 +1 位作者 赵干业 孔祥东 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第10期1167-1171,共5页
目的应用基因组光学图谱技术诊断染色体结构异常,为染色体结构异常导致的疾病提供可靠、实用的诊断方法。方法应用染色体核型分析技术、基因组光学图谱技术和拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)技术对1例患者染... 目的应用基因组光学图谱技术诊断染色体结构异常,为染色体结构异常导致的疾病提供可靠、实用的诊断方法。方法应用染色体核型分析技术、基因组光学图谱技术和拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)技术对1例患者染色体异常进行诊断与验证。结果患者核型分析结果为16号染色体可能为未知结构异常或16号染色体与其他染色体相互易位,基因组光学图谱技术和CNV-seq分别诊断和验证为染色体16p11.2-p12.2区杂合性缺失。结论基因组光学图谱技术可以作为染色体结构变异检测与诊断的新型技术。 展开更多
关键词 染色体结构异常 基因组光学图谱 微缺失/重复
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一例先天性唇腭裂胎儿的产前诊断 被引量:1
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作者 黄超 宋小艳 +6 位作者 张芹 刘敏娟 毛君 向菁菁 刘英华 李红 王挺 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第4期471-474,共4页
目的分析1例先天性唇腭裂胎儿的遗传学病因。方法应用染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA)检测胎儿及其家系成员染色体拷贝数变异(copy number variation,CNVs)。结果CMA检测显示胎儿为男性,其染色体Xp11.22区... 目的分析1例先天性唇腭裂胎儿的遗传学病因。方法应用染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA)检测胎儿及其家系成员染色体拷贝数变异(copy number variation,CNVs)。结果CMA检测显示胎儿为男性,其染色体Xp11.22区域存在228 kb的DNA片段缺失,染色体9p21.1区域存在721 kb的DNA片段重复,两个CNVs均遗传自亲代。其中染色体Xp11.22区域的CNV为可疑致病性CNV,致病基因为PHF8,9p21.1区域的CNV为良性CNV。结论染色体Xp11.22区域DNA片段缺失可能为胎儿唇腭裂的原因。 展开更多
关键词 唇腭裂 染色体微阵列分析 微缺失微重复 拷贝数变异 产前诊断
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基因芯片技术应用于颈项透明层增厚病例中的价值研究
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作者 丁小瑞 刘爱菊 +1 位作者 张玮 张俊绘 《中国医药导报》 CAS 2020年第36期114-118,共5页
目的探讨染色体微阵列分析(CMA)在胎儿颈项透明层(NT)增厚中的临床应用价值及拷贝数变异(CNVs)检出的差异性。方法回顾性分析2017年12月—2019年12月因超声提示“胎儿NT增厚”于内蒙古自治区妇幼保健院产前诊断中心行核型分析及CMA芯片... 目的探讨染色体微阵列分析(CMA)在胎儿颈项透明层(NT)增厚中的临床应用价值及拷贝数变异(CNVs)检出的差异性。方法回顾性分析2017年12月—2019年12月因超声提示“胎儿NT增厚”于内蒙古自治区妇幼保健院产前诊断中心行核型分析及CMA芯片检测185例单胎妊娠孕妇。结果CMA检测结果:共计185例NT增厚病例,染色体异常的59例,染色体异常的发生率为31.89%(59/185),微缺失/微重复即CNVs的检出,较染色体核型分析额外提高10.81%(20/185),致病性CNVs的检出率提高7.03%(13/185)。染色体核型分析结果:总计185例NT增厚病例,染色体核型异常的39例,染色体异常的发生率为21.08%(39/185);其中染色体结构异常的2例:1例46,XN,del(18)(P11)与CMA中的18p11.32p11.2缺失14.94 Mb,P为同一病例;1例:46,XN,t(15;17)(q15;q25)[4]/46,XN[122],CMA为46,XN。结论与核型分析技术比较,CMA技术的全基因组高分辨率优势得到体现,可将微缺失/微重复的检出率及致病性CNVs的检出率额外提高,由于CMA无法识别平衡重排(易位/倒位/插入),CMA技术暂不可以取代染色体核型分析技术进行诊断;CMA检出临床意义不明确(VOUS)的存在会给CMA的解释工作带来困难。 展开更多
关键词 染色体微阵列分析 颈项透明层增厚 产前诊断 微缺失/微重复
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单核苷酸多态微阵列技术在产前诊断中的应用
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作者 冯桐 李华锋 +1 位作者 朱金萍 王郡甫 《山东医学高等专科学校学报》 2019年第6期405-408,共4页
目的 探讨提高产前诊断准确率的方法。方法 选取508名孕妇,对其胎儿进行SNP检测和核型分析,比较两种方法检测结果的异同。结果 SNP阳性检出率为21.65%,高于染色体核型分析13.19%(χ^2=12.65,P <0.01)。染色体核型分析检出的2例47,XN,... 目的 探讨提高产前诊断准确率的方法。方法 选取508名孕妇,对其胎儿进行SNP检测和核型分析,比较两种方法检测结果的异同。结果 SNP阳性检出率为21.65%,高于染色体核型分析13.19%(χ^2=12.65,P <0.01)。染色体核型分析检出的2例47,XN,+mar,SNP可追溯微小额外标记染色体的来源和性质;染色体核型分析检出的5例平衡易位,SNP均未检出;在染色体核型分析正常的病例中,SNP检测出12例明确致病CNVs。结论 SNP染色体微阵列技术是一种有效的诊断亚微观的基因组不平衡的方法。 展开更多
关键词 单核苷酸多态微阵列 产前 染色体异常 微缺失/微重复
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染色体微阵列分析技术在489例生长发育迟缓/智力低下患儿中的应用 被引量:22
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作者 王荣跃 雷婷缨 +6 位作者 符芳 李茹 景象一 杨昕 潘敏 李东至 廖灿 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期528-533,共6页
目的应用染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)分析不明原因的生长发育迟缓(developmental delay,DD)/智力低下(intellectual disability,ID)患儿的遗传学病因。方法收集染色体核型结果正常的DD/ID伴或不... 目的应用染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)分析不明原因的生长发育迟缓(developmental delay,DD)/智力低下(intellectual disability,ID)患儿的遗传学病因。方法收集染色体核型结果正常的DD/ID伴或不伴其他异常的患儿489例。分为3组:单纯性DD/ID组(n=358),DD/ID合并癫痫组(n=49),DD/ID合并其他结构畸形组(n=82)。进一步行CMA检测,并通过配套的CHAS软件及相关的生物信息学分析检测结果。结果CMA在126例患儿中检测到致病性拷贝数变异片段(copynumber variants,CNVs),检出率为25.8%(126/489),其中单纯性DD/ID组、DD/ID合并癫痫组以及DD/ID合并其他结构畸形组的致病性CNVs检出率差异无统计学意义。在这些致病性CNVs中,79例(62.7%,79/126)为微缺失/微重复综合征,其中较常见者综合征76例,包括Angelman/Prader—Willi综合征、Williams—Beuren综合征、22q11.2微缺失/微重复综合征、Wolf-Hirschhorn综合征、16p11.2微缺失/微重复综合征、1p36微缺失综合征、17p11.2微缺失/微重复综合征、2q37单体综合征、Rubinstein-Taybi综合征;而罕见综合征3例,包括15q24微缺失综合征、Xq28微重复综合征以及眼脑肾综合征。47例(37.3%,47/126)为新发的致病性片段,片段大小在153kb到7.93Mb之间。其中,16p13.2区域的ABAT和PMM2基因,Xp11.23p11.22区域的FTSJ1基因,14q32.31q32.33区域的DYNC1H1基因以及18q12.3q21.1区域的SETBP1基因为DD/ID可疑致病性基因。结论CMA显著提高DD/ID患儿遗传学病因的检出率,检测出核型分析不能识别的微缺失/微重复综合征和拷贝数变异片段,为具有表型异质性的罕见综合征性DD/ID患者的遗传病学诊断提供了分子水平的检测手段。同时CMA还具有发现新的可疑致病性基因的能力。为疾病的诊断、咨询、治疗、预后 展开更多
关键词 生长发育迟缓 智力低下 染色体微阵列分析 拷贝数变异 微缺失/微重复综合征
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染色体微阵列芯片分析技术应用于产前诊断的关键问题探讨 被引量:16
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作者 安宇 吴柏林 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2014年第3期157-161,210,共6页
染色体微阵列芯片分析(CMA)包括比较基因组杂交微阵列(array CGH)和单核苷酸多态微阵列(SNP array),可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复,与传统染色体核型分析和荧光原位杂交(FISH)检测相比,具有高通量、高分辨率和... 染色体微阵列芯片分析(CMA)包括比较基因组杂交微阵列(array CGH)和单核苷酸多态微阵列(SNP array),可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复,与传统染色体核型分析和荧光原位杂交(FISH)检测相比,具有高通量、高分辨率和高自动化检测的优势,同时可以一次性同步检测许多与出生缺陷和先天性疾病相关的基因组异常,近年来已经开始应用于侵入性产前诊断。回顾近年来多个大样本和多中心的临床试验对CMA技术用于产前诊断的研究结果,借鉴美国妇产科医师协会(ACOG)和母婴医学协会(SMFM)发布的CMA在产前诊断应用中的建议,对CMA在应用过程中如何选择微阵列芯片类型、检测的适用对象和检测的时期、检测结果的解释以及相关的遗传咨询等关键问题进行了详细讨论,并指出CMA在产前诊断应用中面临的机遇和挑战,以及检测前和检测后遗传咨询在实际应用中的重要性和必要性。 展开更多
关键词 芯片分析技术 微阵列分析 生殖技术 辅助 基因组 杂交 遗传 产前诊断 微缺失微重复综合征
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无创产前检测胎儿染色体拷贝数变异的临床价值初探 被引量:16
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作者 黎冬梅 张红云 +6 位作者 唐新华 章锦曼 苏洁 李开元 夏勇梅 赵立见 朱宝生 《中国实用妇科与产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期554-559,共6页
目的探讨无创产前检测(NIPT)对筛查胎儿染色体拷贝数变异(CNVs)和微缺失/微重复综合征(MDs)的临床价值。方法收集2012年1月至2017年7月在云南省第一人民医院遗传诊断中心、产前诊断中心10 005例中孕期(15~20+6周)进行NIPT的孕妇资料,... 目的探讨无创产前检测(NIPT)对筛查胎儿染色体拷贝数变异(CNVs)和微缺失/微重复综合征(MDs)的临床价值。方法收集2012年1月至2017年7月在云南省第一人民医院遗传诊断中心、产前诊断中心10 005例中孕期(15~20+6周)进行NIPT的孕妇资料,对检测提示胎儿CNVs孕妇中选择介入性产前诊断者的羊水/脐血染色体G显带核型分析及高通量测序(NGS)基因组拷贝数分析,相关CNVs到相应数据库查找分析,分析NIPT所发现的CNVs与介入性产前诊断结果的一致性。结果中孕期进行NIPT的10 005例孕妇中提示胎儿CNVs 32例,筛查阳性率为0.32%(32/10 005)。知情同意接受介入性产前诊断25例,其中确诊胎儿CNVs14例,阳性预测值(PPV)为56%(14/25),包括微缺失9例、微重复5例,片段大小在587.75kb~36.05Mb之间。胎儿细胞DNA样本NGS检测到的片段大小和起止位置与NIPT筛查时所见CNVs基本吻合。在14例CNVs中确诊MDs 11例,临床意义不明CNVs 3例。对11例MDs胎儿的父母亲进行CNVs检测和外周血染色体核型分析,证实新发病CNVs 10例,其中父系染色体异常来源致病CNVs 2例;8例致病CNVs胎儿合并有染色体结构异常。经遗传咨询,这11例致病变异有10例夫妇知情选择终止妊娠;1例知情选择继续妊娠,分娩1例活产新生儿。结论 NIPT作为一种高精度筛查手段,能够筛查出部分有临床意义的胎儿CNVs,可望成为常规筛查手段,检测致病风险大的较大片段的染色体微缺失和微重复CNVs(≥5Mb);NIPT检测到胎儿CNVs高风险时需进行介入性产前诊断。 展开更多
关键词 无创产前检测 拷贝数变异 微缺失/微重复综合征 产前诊断
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无创产前检测筛查胎儿微缺失微重复综合征阳性病例的临床分析 被引量:11
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作者 胡芷洋 高雅 +3 位作者 郭辉 林琳华 任景慧 苏放明 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2016年第1期14-18,共5页
目的探索无创产前基因检测(NIPT)微缺失微重复综合征(MD)阳性病例的产前诊断以及咨询方法。方法对NIPT筛查MD阳性的病例进行产前超声检查、遗传咨询并进行有创性产前诊断,送检核型分析以及基因芯片(CMA)或者多重连接探针扩增技术... 目的探索无创产前基因检测(NIPT)微缺失微重复综合征(MD)阳性病例的产前诊断以及咨询方法。方法对NIPT筛查MD阳性的病例进行产前超声检查、遗传咨询并进行有创性产前诊断,送检核型分析以及基因芯片(CMA)或者多重连接探针扩增技术(MLPA)检查,验证NIPT的结果,同时抽取双亲血样进行核型分析以及MLPA。结果 2015年1-5月期间送检1191例NIPT检查,9例MD筛查阳性,其中3例MD筛查阳性病例完成验证检查。NIPT提示18q21.31-q23.23处23M缺失的一例病例,经验证为18q22.3-q23处8.6M的微缺失;另一例NIPT提示9p24.3-9p13.2处36M重复的病例,经验证除了该处有37M左右重复外,另外还有两处5M以下的MD。1例证实为假阳性,该假阳性病例母亲血测序发现有微重复。两名证实MD病例超声检查均发现异常,孕妇选择引产。假阳性病例继续妊娠。结论 NIPT可以筛查较大片段的缺失和重复,但对较小的缺失或重复检出能力欠佳,母体背景可以干扰结果。应建议筛查阳性的病例接受有创性产前诊断取样进行验证。 展开更多
关键词 无创产前检查 微缺失微重复综合征 产前诊断
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50例微缺失和微重复综合征患儿的临床表型及基因组拷贝数变异的分析 被引量:11
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作者 张丽娜 孟哲 +3 位作者 何展文 李栋方 罗向阳 梁立阳 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期840-845,共6页
目的了解微缺失和微重复综合征(MMSs)的基因型与临床表型的关系及致病性拷贝数变异(CNVs)的发生机制。方法收集2013年6月至2015年9月,应用染色体微阵列(CMA)诊断为MMSs的患儿50例,总结分析其临床表现和致病性CNVs的特点。结果 50例MMSs... 目的了解微缺失和微重复综合征(MMSs)的基因型与临床表型的关系及致病性拷贝数变异(CNVs)的发生机制。方法收集2013年6月至2015年9月,应用染色体微阵列(CMA)诊断为MMSs的患儿50例,总结分析其临床表现和致病性CNVs的特点。结果 50例MMSs患儿临床表现以精神发育迟滞(MR)、发育迟缓(DD)、矮小、特殊面容为主,且往往多系统的异常同时存在,共存在54处致病性CNVs,微缺失片段36个、微重复片段18个,片段大小介于28kb至48.5Mb,平均13.86Mb。致病性CNVs易发生在X染色体、15号染色体、1号染色体。结论 MMSs临床表现缺乏特异性,可以采取基因型优先的方法进行诊断。遗传方式、重组类型(缺失或者重复)、片段大小以及所包含的功能基因有利于新生突变CNVs的解读,少见发病机制的深入研究有望成为发现新的罕见MMSs的突破点。 展开更多
关键词 微缺失和微重复综合征 拷贝数变异 精神发育迟滞 发育迟缓 儿童
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