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土壤微生物多样性研究方法 被引量：118
1
作者 钟文辉 蔡祖聪 《应用生态学报》 CAS CSCD 2004年第5期899-904,共6页
概述了研究土壤微生物多样性的主要方法 .传统上 ,土壤微生物群落的分析依赖于培养技术 ,使用各种培养基最大限度地培养各种微生物群体 ,但仍只能培养和分离出一小部分土壤微生物群落 .使用Biolog分析、磷脂脂肪酸分析和核酸分析等方法 ... 概述了研究土壤微生物多样性的主要方法 .传统上 ,土壤微生物群落的分析依赖于培养技术 ,使用各种培养基最大限度地培养各种微生物群体 ,但仍只能培养和分离出一小部分土壤微生物群落 .使用Biolog分析、磷脂脂肪酸分析和核酸分析等方法 ,可研究和表征那些现在还不能够被培养的土壤微生物 ,从而获取关于土壤微生物群落多样性的更多和更完整的信息 . 展开更多
关键词 土壤 微生物多样性 BIOLOG 磷脂脂肪酸 核酸分析
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土壤管理措施及环境因素对土壤微生物多样性影响研究进展 被引量：120
2
作者 钟文辉 蔡祖聪 《生物多样性》 CAS CSCD 2004年第4期456-465,共10页
本文综述了土壤管理措施及环境因素对土壤微生物多样性影响的研究进展 ,并介绍了土壤微生物多样性的研究方法。土壤微生物多样性包括微生物物种多样性、遗传多样性和生态多样性。传统上 ,土壤微生物群落的分析依赖于培养技术 ,但使用该... 本文综述了土壤管理措施及环境因素对土壤微生物多样性影响的研究进展 ,并介绍了土壤微生物多样性的研究方法。土壤微生物多样性包括微生物物种多样性、遗传多样性和生态多样性。传统上 ,土壤微生物群落的分析依赖于培养技术 ,但使用该技术只能培养和分离出一小部分土壤微生物群落。现在国际上普遍使用Biolog分析、磷脂脂肪酸 (PLFA)分析和核酸分析等多种现代技术研究和表征土壤微生物多样性。土壤微生物多样性受土壤管理措施和多种环境因素的影响。农药可能使土壤微生物多样性减少或改变其结构和功能 ;施有机肥有利于维持土壤微生物的多样性及活性 ;但在施用无机肥的影响上目前的报道有矛盾之处。农业土壤减少耕作可能增加微生物多样性和生物量 ;轮作可能比单一栽培耕作更有利于维持土壤微生物的多样性及活性。土壤微生物多样性也受土壤有机质、植被、季节变化等因素的影响 ,且通常遭受干旱、过度放牧、营养缺乏等的胁迫作用。 展开更多
关键词 土壤 微生物多样性 化肥 农药 耕作 轮作
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DGGE/TGGE技术及其在微生物分子生态学中的应用 被引量：92
3
作者 宫曼丽 任南琪 邢德峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期845-848,共4页
变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和温度梯度凝胶电泳 (TGGE)是近些年微生物分子生态学研究中的热点技术之一。由于DGGE TGGE技术具有可靠性强、重现性高、方便快捷等优点 ,被广泛地应用于微生物群落多样性和动态性分析。文章对DGGE TGGE技术原... 变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和温度梯度凝胶电泳 (TGGE)是近些年微生物分子生态学研究中的热点技术之一。由于DGGE TGGE技术具有可靠性强、重现性高、方便快捷等优点 ,被广泛地应用于微生物群落多样性和动态性分析。文章对DGGE TGGE技术原理与关键环节。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 温度梯度凝胶电泳 微生物多样性 微生物分子生态学
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PCR-DGGE技术在农田土壤微生物多样性研究中的应用 被引量：84
4
作者 罗海峰 齐鸿雁 +1 位作者 薛凯 张洪勋 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第8期1570-1575,共6页
变性梯度凝胶电泳技术 ( DGGE)在微生物生态学领域有着广泛的应用。研究采用化学裂解法直接提取出不同农田土壤微生物基因组 DNA,并以此基因组 DNA为模板 ,选择特异性引物 F357GC和 R518对 1 6Sr RNA基因的 V3区进行扩增 ,长约 2 30 bp... 变性梯度凝胶电泳技术 ( DGGE)在微生物生态学领域有着广泛的应用。研究采用化学裂解法直接提取出不同农田土壤微生物基因组 DNA,并以此基因组 DNA为模板 ,选择特异性引物 F357GC和 R518对 1 6Sr RNA基因的 V3区进行扩增 ,长约 2 30 bp的 PCR产物经变性梯度凝胶电泳 ( DGGE)进行分离后 ,得到不同数目且分离效果较好的电泳条带。结果说明 ,DGGE能够对土壤样品中的不同微生物的 1 6Sr RNA基因的 V3区的 DNA扩增片断进行分离 ,为这些 DNA片断的定性和鉴定提供了条件。与传统的平板培养方法相比 ,变性梯度凝胶电泳 ( DGGE)技术能够更精确的反映出土壤微生物多样性 ,它是一种有效的微生物多样性研究技术。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 DGGE 基因组DNA 16S RRNA 微生物多样性 农田土壤
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16S rRNA基因在微生物生态学中的应用 被引量：108
5
作者 刘驰 李家宝 +2 位作者 芮俊鹏 安家兴 李香真 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期2769-2788,共20页
16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中。近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,大量基于16S rRNA基因的研究... 16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中。近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,大量基于16S rRNA基因的研究使得微生物生态学得到了快速发展,然而使用16S rRNA基因作为分子标志物时也存在诸多问题,比如水平基因转移、多拷贝的异质性、基因扩增效率的差异、数据分析方法的选择等,这些问题影响了微生物群落组成和多样性分析时的准确性。对当前使用16S rRNA基因分析微生物群落组成和多样性的进展情况做一总结,重点讨论当前存在的主要问题以及各种分析方法的发展,尤其是与高通量测序技术有关的实验和数据处理问题。 展开更多
关键词 16S RRNA基因 微生物群落 多样性 高通量测序 生物信息数据处理
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高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的研究进展 被引量：104
6
作者 楼骏 柳勇 李延 《中国农学通报》 CSCD 2014年第15期256-260,共5页
为了阐明高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用前景,归纳介绍了Solexa、454和Ion Torrent等常用高通量测序技术的原理和优点,综述了近年高通量测序技术在土壤微生物物种多样性、结构多样性、功能多样性和遗传多样性四个方面应... 为了阐明高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用前景,归纳介绍了Solexa、454和Ion Torrent等常用高通量测序技术的原理和优点,综述了近年高通量测序技术在土壤微生物物种多样性、结构多样性、功能多样性和遗传多样性四个方面应用的研究进展,总结了高通量测序技术应用中存在的问题,并分析展望了其在土壤微生物多样性研究中的发展趋势。 展开更多
关键词 高通量测序 土壤微生物 微生物多样性 应用.
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微生物群落结构和多样性解析技术研究进展 被引量：72
7
作者 车玉伶 王慧 +2 位作者 胡洪营 梁威 郭玉凤 《生态环境》 CSCD 北大核心 2005年第1期127-133,共7页
微生物群落结构和多样性是微生物生态学和环境科学研究的热点内容,对于开发微生物资源,阐明微生物群落与其生境的关系,揭示群落结构与功能的联系,从而指导微生物群落功能的定向调控具有重要意义。基本按照年代顺序概述了常用的微生物群... 微生物群落结构和多样性是微生物生态学和环境科学研究的热点内容,对于开发微生物资源,阐明微生物群落与其生境的关系,揭示群落结构与功能的联系,从而指导微生物群落功能的定向调控具有重要意义。基本按照年代顺序概述了常用的微生物群落结构及多样性解析技术,同时也体现了解析技术由片面向全面、由低分辨水平向高分辨水平的发展过程。20 世纪 70 年代以前,对环境微生物群落结构及多样性的认识依赖传统的培养分离方法,方法的分辨水平低,认识是不全面的和有选择性的;20 世纪 70 年代和 80 年代,在微生物化学成分分析的基础上建立了生物标记物方法(醌指纹法、磷脂脂肪酸法等),对微生物群落结构和多样性的认识进入到较客观的层次上;在 80 和 90 年代,以 DNA 为目标物的现代分子生物学技术(rRNA基因测序技术、基因指纹图谱等)比较精确地揭示了微生物种类和遗传的多样性,并给出了关于群落结构的直观信息。指出了每种解析技术的功能特点和局限性,并展望了解析技术的发展趋势是原位、快速、灵敏、高通量和准确定量。 展开更多
关键词 微生物群落结构 微生物多样性 解析技术 研究进展
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陆地生态系统混合凋落物分解研究进展 被引量：91
8
作者 李宜浓 周晓梅 +1 位作者 张乃莉 马克平 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第16期4977-4987,共11页
凋落物分解在陆地生态系统养分循环与能量流动中具有重要作用,是碳、氮及其他重要矿质养分在生态系统生命组分间循环与平衡的核心生态过程。自然生态系统中,植物群落大多具有较高的物种丰富度和多样性,其混合凋落物在分解过程中也更有... 凋落物分解在陆地生态系统养分循环与能量流动中具有重要作用,是碳、氮及其他重要矿质养分在生态系统生命组分间循环与平衡的核心生态过程。自然生态系统中,植物群落大多具有较高的物种丰富度和多样性,其混合凋落物在分解过程中也更有可能发生养分传递、化学抑制等种间互作,形成多样化的分解生境,多样性较高的分解者类群以及复杂的级联效应分解,这些因素和过程均对研究混合凋落物分解过程、揭示其内在机制形成了极大的挑战。从构成混合凋落物物种丰富度和多样性对分解生境、分解者多样性及其营养级联效应的影响等方面,综合阐述混合凋落物对陆地生态系统凋落物分解的影响,探讨生物多样性在凋落物分解中的作用。通过综述近些年的研究发现,有超过60%的混合凋落物对其分解速率的影响存在正向或负向的效应。养分含量有差异的凋落物混合分解过程中,分解者优先利用高质量凋落物,使低质量的凋落物反而具有了较高的养分有效性,引起低质量凋落物分解加快并最终使混合凋落物整体分解速率加快;而凋落物物种丰富度对土壤动物群落总多度有轻微的影响或几乎没有影响,但是对线虫和大型土壤动物的群落组成和多样性有显著影响,并随着分解阶段呈现一定动态变化;混合凋落物改变土壤微生物生存的理化环境,为微生物提供更多丰富的分解底物和养分,优化微生物种群数量和群落结构及其分泌酶的活性,并进一步促进了混合凋落物的分解。这些基于植物-土壤-分解者系统的动态分解过程的研究,表明混合凋落物分解作用不只是经由凋落物自身质量的改变,更会通过逐级影响分解者多样性水平而进一步改变分解速率和养分释放动态,说明生物多样性确实在一定程度上调控凋落物分解及其养分释放过程。 展开更多
关键词 生物多样性 凋落物分解 微生物多样性 土壤动物 非加和效应
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不同土地利用方式对红壤微生物多样性的影响 被引量：70
9
作者 姚槐应 何振立 黄昌勇 《水土保持学报》 CSCD 北大核心 2003年第2期51-54,共4页
试验采用碳素利用(BIOLOG)及磷酸酯脂肪酸(PLFA)法,研究了8种供试红壤微生物群落的功能多样性和结构多样性。两种方法均表明土地利用方式能显著影响微生物的多样性。采用磷酸酯脂肪酸法无需培养就能鉴别土壤微生物的组成结构,试验表明总... 试验采用碳素利用(BIOLOG)及磷酸酯脂肪酸(PLFA)法,研究了8种供试红壤微生物群落的功能多样性和结构多样性。两种方法均表明土地利用方式能显著影响微生物的多样性。采用磷酸酯脂肪酸法无需培养就能鉴别土壤微生物的组成结构,试验表明总PLFA含量与微生物生物量呈显著相关。碳素利用法的研究结果显示,茶叶园土中微生物对各类碳源的利用能力均很低,呈现出非常独特的微生物功能多样性。 展开更多
关键词 土地利用方式 红壤 土壤微生物多样性 碳素利用 磷酸酯脂肪酸
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PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究 被引量：78
10
作者 赵兴青 杨柳燕 +6 位作者 陈灿 肖琳 蒋丽娟 马喆 朱昊巍 于振洋 尹大强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期3610-3616,共7页
采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构，研究结果表明，三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp，为16S rDNA V3～V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中... 采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构，研究结果表明，三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp，为16S rDNA V3～V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20种优势菌群，且同一湖泊不同采样点DGGE图谱的差异性不大，细菌群落结构具有较高的相似性，而太湖样品DGGE条带的数目和位置表现出明显差异，且不同采样点图谱的差异性较大。三湖泊除具有特征性的微生物种属外，还分布约5个相同的细菌种群，可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关。对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序，结果显示其优势菌群具有不同的序列组成，其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99％，2个序列的同源性为96％和93％，其中2个相似的细菌类群目前尚未获得纯培养。 展开更多
关键词 沉积物 微生物多样性 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 16S RDNA 序列测定
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不同有机无机复混肥对水稻产量和氮素利用率的影响 被引量：84
11
作者 张小莉 孟琳 +5 位作者 王秋君 罗佳 黄启为 徐阳春 杨兴明 沈其荣 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期624-630,共7页
通过田间试验,研究了菜粕堆肥、猪粪堆肥和中药渣堆肥有机无机复混肥与化肥对常优1号水稻产量、氮素利用效率、土壤供氮特征以及土壤微生物多样性的影响.结果表明:各施氮肥处理的稻谷产量(7918.8～9449.2kg·hm-2)均显著高于对照(69... 通过田间试验,研究了菜粕堆肥、猪粪堆肥和中药渣堆肥有机无机复混肥与化肥对常优1号水稻产量、氮素利用效率、土壤供氮特征以及土壤微生物多样性的影响.结果表明:各施氮肥处理的稻谷产量(7918.8～9449.2kg·hm-2)均显著高于对照(6947.9kg·hm-2),其中有机无机复混肥处理的稻谷产量(8532.0～9449.2kg·hm-2)显著高于化肥处理(7918.8kg·hm-2),比化肥处理增产7.7%～19.3%;菜粕堆肥、猪粪堆肥、中药渣堆肥有机无机复混肥处理的氮素积累量、氮素转运率、氮素回收率和氮肥农学利用效率及生理利用效率均显著高于化肥处理;有机无机复混肥处理明显提高了土壤矿质氮含量,改善了土壤供氮特性,提高了氮利用率;对各处理土壤DNA条带采用邻接法分析显示:5个处理土壤样品可分为三大族群,化肥与对照处理为第一族群,猪粪堆肥、中药渣堆肥处理为第二族群,菜粕堆肥处理属第三族群.表明施入外源有机物质(菜粕、猪粪与中药渣)可能会改变土壤的细菌群落结构,而施入化肥对土壤的细菌群落结构影响较小. 展开更多
关键词 水稻 有机无机复混肥 产量 氮素利用效率 矿质态氮 微生物多样性
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在PCR-DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应 被引量：42
12
作者 罗海峰 齐鸿雁 +3 位作者 薛凯 王晓谊 王川 张洪勋 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第10期2170-2175,共6页
应用普通细胞裂解法提取 3株实验菌株 (Escherichia coli DH5α,Staphylococcus aureus SA- 1和 A-grobacterium tumerfaciens 1 31 2 9)的基因组 DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取 7种不同土壤样品中的微生物的基因组 DNA... 应用普通细胞裂解法提取 3株实验菌株 (Escherichia coli DH5α,Staphylococcus aureus SA- 1和 A-grobacterium tumerfaciens 1 31 2 9)的基因组 DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取 7种不同土壤样品中的微生物的基因组 DNA,两组不同结构的引物 F3 57GC,R51 8(在正向引物的 5′端有 GC发卡结构 )和 F3 57,R51 8,分别对实验菌株和土壤样品中微生物的 1 6Sr RNA基因 V3区进行扩增 ,均得到了目的片段。比较了不同引物扩增的 1 6S r DNA片段在 DGGE中的不同电泳行为 ,结果表明 ,含 GC发卡结构的PCR扩增产物在 DGGE中能够得到很好的分离 ,而无 GC发卡结构的 PCR产物则不能在 DGGE中获得满意分离。引入 GC发卡结构 。 展开更多
关键词 PCR—DGGE 微生物多样性 GC发卡结构
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有机农业施肥方式对土壤微生物活性的影响研究 被引量：69
13
作者 李东坡 武志杰 陈利军 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 2005年第2期99-101,共3页
综述了国内外有机农业施肥方式对培肥土壤及土壤主要微生物活性的影响,有机农业施肥方式显著增加土壤微生物数量,调控微生物种群结构,提高土壤有益微生物种群数量,土壤微生物量C、N含量倍数增加。阐明施用有机肥料对维持土壤微生物多样... 综述了国内外有机农业施肥方式对培肥土壤及土壤主要微生物活性的影响,有机农业施肥方式显著增加土壤微生物数量,调控微生物种群结构,提高土壤有益微生物种群数量,土壤微生物量C、N含量倍数增加。阐明施用有机肥料对维持土壤微生物多样性与生态稳定性的必要性。 展开更多
关键词 施肥方式 土壤微生物活性 有机农业 施用 土壤微生物数量 培肥土壤 土壤微生物多样性 增加 国内外 展望
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环境微生物群落分析的T-RFLP技术及其优化措施 被引量：67
14
作者 余素林 吴晓磊 钱易 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期861-868,共8页
末端限制性酶切片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism, T-RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及... 末端限制性酶切片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism, T-RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及互联网海量数据共享等优势,自1997年最先被报道以来得到了广泛的应用,成为环境微生物群落分析的最强有力的工具之一.本文详细介绍了T-RFLP技术的原理,并从环境样品群落DNA的提取、引物设计和PCR扩增、限制性酶切、电泳分离检测和T-RFLP图谱解析等5个方面讨论了用该技术解析环境微生物群落的方法和技巧,简述了近8 a来国外T-RFLP技术在群落分析中的研究进展.类似于其他的分子微生物生态学技术, T-RFLP也有自身的缺陷,因此重点分析了该技术的局限性及相应的解决办法. 展开更多
关键词 微生物群落 末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP) 分子微生物生态学 生物多样性
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不同施肥和耕作制度下土壤微生物多样性研究进展 被引量：78
15
作者 樊晓刚 金轲 +1 位作者 李兆君 荣向农 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期744-751,共8页
本文主要介绍了运用Biolog GN、磷脂脂肪酸(PLFA)、核酸分析法进行土壤微生物群落分析的优缺点,综述了施肥、耕作两种农业措施对土壤微生物多样性影响的研究进展。指出不同施肥处理对微生物影响效果不同,合理施用有机肥有利于维持土壤... 本文主要介绍了运用Biolog GN、磷脂脂肪酸(PLFA)、核酸分析法进行土壤微生物群落分析的优缺点,综述了施肥、耕作两种农业措施对土壤微生物多样性影响的研究进展。指出不同施肥处理对微生物影响效果不同,合理施用有机肥有利于维持土壤微生物的多样性及活性;由于受其他环境因素(如土壤类型、农作制度、残茬量等)的影响,不同耕作措施对土壤微生物多样性影响有差异,但是大多试验结果显示免耕、少耕能增加微生物多样性和生物量,保持系统的稳定性。文章还指出了目前研究中存在的问题,并对今后的研究方向做了展望。 展开更多
关键词 土壤 微生物多样性 施肥 耕作
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作物土传真菌病害发生的根际微生物机制研究进展 被引量：78
16
作者 杨珍 戴传超 +1 位作者 王兴祥 李孝刚 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期12-22,共11页
土传病害是制约我国农业生产可持续发展的重要瓶颈。根际是作物养分高效利用的窗口,是植物-土壤-微生物相互作用的关键微域,也是土传病害发生发展的主要场所。在宏基因组学快速发展的今天,了解根际微生物与土传病害互作关系,有利于从微... 土传病害是制约我国农业生产可持续发展的重要瓶颈。根际是作物养分高效利用的窗口,是植物-土壤-微生物相互作用的关键微域,也是土传病害发生发展的主要场所。在宏基因组学快速发展的今天,了解根际微生物与土传病害互作关系,有利于从微生物种群、功能代谢和抑病物质等研究找出防控土传病害的有效方法。本文综述了根际微生物与土传真菌病害的发生机制关系,探讨了土传病原真菌致害机理,并提出目前研究的不足和未来研究的重点。目前,我国农业生产中土传真菌病害发生严重,很多是由不同病原菌复合侵染的结果,其致害机理较为复杂。定向优化根际微生物群落结构提升植物根际微生态抗性,是防控土传病害途径之一,应加以重视。现有研究多偏向根际促生微生物,而忽视了根际有害细菌与病害发生和作物生长的关系。今后的研究应系统评估土传真菌病害的发生及危害程度、归类土传真菌病原菌类型、深入研究土传真菌病害发生的根际微生态机理以及研发土传真菌病害综合防控技术。 展开更多
关键词 土传真菌病害 根际微生物 微生物多样性 防控技术 作物抗性
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生草对果园土壤理化性状的影响研究进展 被引量：74
17
作者 曹铨 沈禹颖 +2 位作者 王自奎 张小明 杨轩 《草业学报》 CSCD 北大核心 2016年第8期180-188,共9页
果园生草栽培模式对土壤理化性状的影响是果园集约、高效、生态、可持续生产的重要基础。生草栽培可降低土壤容重4.7%-13.0%,提高水稳性土壤团聚体含量,进而改善土壤的导水性能和保水性能,也有助于拦截降雨,提高雨水的利用率;干旱少雨... 果园生草栽培模式对土壤理化性状的影响是果园集约、高效、生态、可持续生产的重要基础。生草栽培可降低土壤容重4.7%-13.0%,提高水稳性土壤团聚体含量,进而改善土壤的导水性能和保水性能,也有助于拦截降雨,提高雨水的利用率;干旱少雨的季节可能会出现牧草与果树争水的现象,需要通过选择适宜的草种及加强田间管理等措施来减小争水对果树造成的不利影响;生草有助于土壤有机碳的积累,连续生草6年可使土壤表层有机碳增加19.6%-27.8%,有机碳的累积量会随生草年限的增加而增加;生草覆盖可调节果园土壤温度,增加土壤微生物的多样性和酶活性;生草还可以促进土壤养分的有效性,同时豆科牧草也可通过固氮作用提高氮素利用效率,总体而言,果园多年种植牧草对土壤养分的积累具有正效应。本研究可为有关的研究工作和生草模式的进一步推广应用提供依据。 展开更多
关键词 生草模式 土壤水分 土壤养分 土壤有机碳 微生物多样性 土壤酶活性
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污染土壤微生物群落结构多样性及功能多样性测定方法 被引量：57
18
作者 陈承利 廖敏 曾路生 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期3404-3412,共9页
土壤微生物在促进土壤质量和植物健康方面发挥着重要的作用,土壤微生物群落结构和组成的多样性及其变化在一定程度上反映了土壤质量。为了更好地了解土壤健康状况,非常有必要发展有效的方法来研究污染土壤微生物的多样性、分布以及行为... 土壤微生物在促进土壤质量和植物健康方面发挥着重要的作用,土壤微生物群落结构和组成的多样性及其变化在一定程度上反映了土壤质量。为了更好地了解土壤健康状况,非常有必要发展有效的方法来研究污染土壤微生物的多样性、分布以及行为等。回顾了近年来国内外污染土壤微生物群落结构多样性及功能多样性的测定方法,包括生物化学技术和分子生物学技术,现将它们的原理、优缺点、实用性及其发展动态作一阐述,同时指出结合这两种技术可为微生物群落分析提供一个更全面的、精确的方法。 展开更多
关键词 污染土壤 微生物多样性 分子生物学 BIOLOG PLFA PCR DNA
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分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用 被引量：41
19
作者 杨永华 姚健 《生物多样性》 CAS CSCD 2000年第3期337-342,共6页
微生物多样性是生物多样性的重要组成部分。由于微生物和大生物 (动、植物 )相比 ,存在着多种显著差异 ,因此其多样性研究、保护及利用也有所不同 ,尤其是研究方法亟待完善、提高。近年来 ,分子生物学方法广泛用于微生物多样性的研究并... 微生物多样性是生物多样性的重要组成部分。由于微生物和大生物 (动、植物 )相比 ,存在着多种显著差异 ,因此其多样性研究、保护及利用也有所不同 ,尤其是研究方法亟待完善、提高。近年来 ,分子生物学方法广泛用于微生物多样性的研究并取得了一系列研究成果。本文从四个方面加以介绍 :1)微生物总DNA制备及其遗传多样性检测方法 ;2 ) 16SrRNA基因序列研究 ;3)核酸杂交分析技术 ;4 )DNA动力学的研究。今后的发展趋势是加强这些方法间及其与传统方法的有机结合 ,并发展新的方法 ,促进微生物多样性研究的深入开展。 展开更多
关键词 微生物多样性 遗传多样性 核酸杂交 DNA动力学
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不同种植年限宁夏枸杞根际微生物多样性变化 被引量：64
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作者 纳小凡 郑国琦 +5 位作者 彭励 雷川怡 杨红艳 马玉 赵强 石硕矾 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期241-252,共12页
为了解长期人工种植枸杞根际土壤微生物的种群结构变化特征,利用Illumina Mi Seq测序平台分别对种植5 a、10 a和15 a宁夏枸杞根际土壤微生物基因组总DNA中16S和18S r DNA基因的部分区域进行测序,经UPARSE pipeline和RDP classifier软件... 为了解长期人工种植枸杞根际土壤微生物的种群结构变化特征,利用Illumina Mi Seq测序平台分别对种植5 a、10 a和15 a宁夏枸杞根际土壤微生物基因组总DNA中16S和18S r DNA基因的部分区域进行测序,经UPARSE pipeline和RDP classifier软件进行聚类分析和物种注释。结果表明,长期种植宁夏枸杞不会改变其根际土壤p H,但会导致根际土壤全磷、有效磷、全盐含量和电导率升高。测序结果表明,不同种植年限枸杞根际土壤细菌群落α多样性无显著变化,但真菌群落多样性在种植10 a枸杞中较种植5 a时显著降低(p<0.05),表明根际细菌群落多样性受种植年限影响较小。从门的分类水平看,酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、绿弯菌门、泉古菌门、蓝菌门、芽单胞菌门、变形菌门以及真菌子囊菌门、担子菌门、接合菌门的比例在不同种植年限的枸杞根际土壤中显著改变(p<0.05)。属水平的分析也表明,共有27个细菌属和16个真菌属的比例发生改变(p<0.05),这些结果表明枸杞根际土壤微生物群落组成受种植年限的影响更大。相关性分析结果表明,种植年限、土壤全磷及有效磷含量是影响枸杞根际微生物群落结构的主要因子。 展开更多
关键词 宁夏枸杞 微生物多样性 根际土壤
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