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猪MYL1和MYL2基因的mRNA在不同组织中的表达分析 被引量：6
1
作者 杨沛方 陈伟 +4 位作者 覃海 周萍 秦媛 许厚强 陈祥 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期2989-2994,共6页
为研究MYL1、MYL2基因在猪的不同组织中的mRNA的表达水平。本试验以大白猪为实验动物,首先,提取其心脏、肝脏、背最长肌、脂肪等组织的总RNA;其次,扩增MYL1、MYL2基因的cDNA序列;最后,以GAPDH基因作为内参,应用实时荧光定量PCR技术检测M... 为研究MYL1、MYL2基因在猪的不同组织中的mRNA的表达水平。本试验以大白猪为实验动物,首先,提取其心脏、肝脏、背最长肌、脂肪等组织的总RNA;其次,扩增MYL1、MYL2基因的cDNA序列;最后,以GAPDH基因作为内参,应用实时荧光定量PCR技术检测MYL1、MYL2基因在不同组织中mRNA的表达水平。结果表明:MYL1基因在背最长肌中表达量最高,MYL2基因在心肌和背最长肌表达量最高,在其它器官表达量很少甚至几乎不表达,说明MYL2基因可能对骨骼肌生长和发育起调节作用。本研究表明MYL1和MYL2基因的mRNA在同一猪种不同组织器官间表达量呈现显著性差异,可能与不同组织器官的功能相适应,可为进一步研究猪的肌肉生长发育机理提供理论基础。 展开更多
关键词 大白猪 myl1基因 myl2基因 实时荧光定量PCR
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藏猪MYL1基因的克隆及生物信息学分析
2
作者 巩兴龙 罗布白珍 +5 位作者 韦明邦 肖青青 徐士军 叶幼荣 张健 商鹏 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第2期122-127,132,140-142,共10页
为了克隆藏猪肌球蛋白轻链1 (myosin light chain 1, MYL1)基因编码区序列,并对其进行生物信息学分析,试验根据NCBI网站GenBank中公布的野猪MYL1基因mRNA序列(登录号为NM;14374.2)设计特异性引物,以提取的藏猪背最长肌组织总RNA反转录... 为了克隆藏猪肌球蛋白轻链1 (myosin light chain 1, MYL1)基因编码区序列,并对其进行生物信息学分析,试验根据NCBI网站GenBank中公布的野猪MYL1基因mRNA序列(登录号为NM;14374.2)设计特异性引物,以提取的藏猪背最长肌组织总RNA反转录得到的cDNA为模板,对藏猪MYL1基因编码区序列进行PCR扩增,将目的基因进行测序,应用生物信息学分析软件对藏猪MYL1基因编码区序列的同源性、蛋白质的结构和功能(氨基酸组成、一般理化性质、疏水性、二级结构及三级结构、磷酸化位点、跨膜螺旋结构和信号肽亚细胞定位及蛋白网络互作)进行分析。结果表明:藏猪MYL1基因编码区序列全长为453 bp;藏猪与野猪的亲缘关系最近,与斑马鱼的亲缘关系最远;藏猪MYL1基因编码区序列与野猪、牛、智人、马、绵羊、犬、穴兔、家鼠、鸡和斑马鱼的核苷酸序列相似性分别为100%、92.1%、91.4%、91.2%、91.2%、90.5%、90.3%、89.2%、80.6%和68.2%;藏猪MYL1蛋白存在19种氨基酸,由150个氨基酸组成;藏猪MYL1蛋白分子质量为16 657.86 u,分子式为C;H;N;O;S;,脂肪系数为79.33,理论等电点pI为4.63,不稳定系数为37.81,负电荷氨基酸残基(Asp+Glu)总数为26个,正电荷氨基酸残基(Arg+Lys)总数为15个,理论半衰期为30 h,为亲水蛋白;二级结构中α螺旋占比最大(58.67%),其次为无规则卷曲(24.67%),β转角(8.67%)和延伸链(8.00%)占比较小;三级结构与二级结构预测结果相符合;氨基酸序列中共有16个磷酸化位点,其中有8个丝氨酸磷酸化位点,6个苏氨酸磷酸化位点,2个酪氨酸磷酸化位点;无跨膜螺旋结构,为非跨膜蛋白;无信号肽,为非分泌蛋白;主要定位于细胞质(47.8%)中,在细胞核约占26.1%,在细胞骨架约占8.3%,在内质网、高尔基体、分泌系统的囊泡、液泡中均约占4.3%;与TNNC2蛋白及MYH1、MYH3、MYH7等蛋白之间存在互作网络关系,与TNNC2蛋白相关系数高达0.999,与肌球蛋白� 展开更多
关键词 藏猪 myl1基因 克隆 肌肉 生长发育 生物信息学
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黄腐酸对小尾寒羊生长及肌球蛋白轻链1基因表达的影响 被引量：5
3
作者 张春兰 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第21期70-72,共3页
为了探究黄腐酸(FA)在绵羊上的应用效果,试验以育肥期小尾寒羊为试验动物,在基础日粮中添加不同比例的FA,测定了小尾寒羊的平均日增重、免疫功能指标、血常规指标,并对肌球蛋白轻链1基因(Myl1)的差异表达进行了分析,探究了FA在绵羊日粮... 为了探究黄腐酸(FA)在绵羊上的应用效果,试验以育肥期小尾寒羊为试验动物,在基础日粮中添加不同比例的FA,测定了小尾寒羊的平均日增重、免疫功能指标、血常规指标,并对肌球蛋白轻链1基因(Myl1)的差异表达进行了分析,探究了FA在绵羊日粮中的最适添加量。结果表明:随着FA添加量的增加,小尾寒羊的平均日增重、血清中免疫球蛋白M(IgM)的含量、肌肉中Myl1基因的表达量均逐渐上升,并在添加量为8 g/kg时达到最高,添加FA后血液常规指标无明显变化。说明小尾寒羊基础日粮中FA的最佳添加量为8 g/kg。 展开更多
关键词 黄腐酸 小尾寒羊 生长性能 免疫功能 血清生化指标 myl1基因表达
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