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蛋白质组研究中的多维液相色谱技术 被引量:6
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作者 王智聪 张庆合 +2 位作者 李彤 赵中一 张维冰 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期130-135,共6页
对近年来蛋白质组研究中的多维液相色谱技术进行了系统综述,详细介绍了在线及离线式阀切换接口的DALPC(direct analysis of large protein complexes)技术及整体式无接口的MudPIT(multidimensional protein identifica-tion technology... 对近年来蛋白质组研究中的多维液相色谱技术进行了系统综述,详细介绍了在线及离线式阀切换接口的DALPC(direct analysis of large protein complexes)技术及整体式无接口的MudPIT(multidimensional protein identifica-tion technology)系统,也系统阐述了其在蛋白质组研究中的应用。引用文献50篇。 展开更多
关键词 蛋白质组 多维液相色潜 DALPC mudpit
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用不同蛋白质分析方法鉴定玉米分泌蛋白组的比较研究 被引量:1
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作者 马玮 Frank Hochholdinger 李春俭 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2010年第10期2762-2766,共5页
玉米根系在生长过程中向根际分泌蛋白质类大分子物质。采用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳-质谱技术,一维液相色谱-质谱联用(LC/MS)和Shotgun三种不同鉴定方法对无菌条件收集的玉米根系分泌蛋白进行了分离、分析与鉴定,对3种鉴定方法在分泌蛋... 玉米根系在生长过程中向根际分泌蛋白质类大分子物质。采用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳-质谱技术,一维液相色谱-质谱联用(LC/MS)和Shotgun三种不同鉴定方法对无菌条件收集的玉米根系分泌蛋白进行了分离、分析与鉴定,对3种鉴定方法在分泌蛋白分析中的应用做了详细阐述和比较。结果表明,双向电泳通过银染可以看到200个蛋白质点,但由于蛋白量少,通过质谱无法对玉米根系分泌蛋白进行鉴定;用LC/MS鉴定得到了152个蛋白;用Shotgun技术鉴定得到了2 848个蛋白。LC/MS鉴定得到的蛋白全部出现在用Shotgun技术鉴定得到的2 848个蛋白中,后2种方法的结果可以互相验证。Shotgun技术具有更高的灵敏性,更适合对蛋白质浓度低、干扰物多的植物根分泌蛋白组进行鉴定,能够获得完整可靠的信息。 展开更多
关键词 玉米根系分泌物 分泌蛋白组 双向电泳 LC-MS SHOTGUN mudpit
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膜整合蛋白质的“鸟枪法”蛋白质组学分析策略
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作者 尹怡 李明 +1 位作者 吴玉章 李晋涛 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期141-144,共4页
疾病状态下生物膜表面蛋白质分子标记的表达量和修饰状态会发生改变。但由于其低丰度和不易溶解等特性,制约了膜蛋白质组学的研究,同时也制约了相关药物靶标的设计。近年来,为克服这些困难,学者们提出了"鸟枪法"的膜蛋白质组... 疾病状态下生物膜表面蛋白质分子标记的表达量和修饰状态会发生改变。但由于其低丰度和不易溶解等特性,制约了膜蛋白质组学的研究,同时也制约了相关药物靶标的设计。近年来,为克服这些困难,学者们提出了"鸟枪法"的膜蛋白质组学研究策略。基于此,本文论述了"鸟枪法"的蛋白质组学分析的基本过程及其后续的部分改进工作。随着新的策略不断被采用,更多膜蛋白质的拓扑学特征和功能的相关研究一定会走上新的台阶。 展开更多
关键词 mudpit 膜蛋白质纽学 膜整合蛋白质 “鸟枪法”
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多维蛋白鉴别技术分析天蓝色链霉菌膜内侧蛋白质组 被引量:1
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作者 石宣明 罗元明 +3 位作者 张贵锋 苏志国 黄玉碧 杨克迁 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期814-819,共6页
链霉菌是一类具有重要工业价值和复杂调控机制的微生物,天蓝色链霉菌是这个属的模式菌。已报道天蓝色链霉菌的蛋白组学的研究多采用二维聚丙烯酰胺凝胶电泳与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱相结合的方法,但由于膜蛋白疏水性较强,天... 链霉菌是一类具有重要工业价值和复杂调控机制的微生物,天蓝色链霉菌是这个属的模式菌。已报道天蓝色链霉菌的蛋白组学的研究多采用二维聚丙烯酰胺凝胶电泳与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱相结合的方法,但由于膜蛋白疏水性较强,天然丰度较低,此法得到的膜蛋白很少。用蛋白酶K保护高pH蛋白酶K法制备链霉菌膜内侧蛋白组样品,并用多维蛋白鉴别技术进行分析,得到154个可能的膜内侧蛋白(包括膜内在蛋白和膜外周蛋白),其中含跨膜区的膜内在蛋白44个,含3个以上跨膜区的膜内在蛋白有23个。此外,还鉴定了一批膜内侧蛋白的亲水性肽段及其在膜上的拓扑位置。该结果有助于对天蓝色链霉菌的膜蛋白进行拓扑学分类和功能研究。 展开更多
关键词 天蓝色链霉菌 多维蛋白鉴别技术 膜蛋白组 蛋白酶K 质谱 拓扑学
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模式植物蛋白质组研究进展 被引量:4
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作者 尹文兵 黄勤妮 印莉萍 《生物信息学》 2004年第2期47-50,共4页
蛋白质组学是后基因组时代研究的热点,而植物蛋白质组是此研究领域的一块奇葩。这主要归功于模式植物蛋白质组的成就。本文综述了模式植物拟南芥、大豆、水稻、大麦、小麦、玉米蛋白质组的研究进展,并简要介绍了本实验室的工作.最后展... 蛋白质组学是后基因组时代研究的热点,而植物蛋白质组是此研究领域的一块奇葩。这主要归功于模式植物蛋白质组的成就。本文综述了模式植物拟南芥、大豆、水稻、大麦、小麦、玉米蛋白质组的研究进展,并简要介绍了本实验室的工作.最后展望了植物蛋白质组学今后的发展前景。 展开更多
关键词 蛋白质组 基质辅助的激光解析/离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS) 同位素译码亲和标签(ICAT) 多维蛋白质鉴定技术(mudpit)
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