用mtDNA序列鉴定一头小布氏鲸标本 被引量：19

1

作者 杨光 刘海 +1 位作者 周开亚 季国庆 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期35-38,共4页

测定了采自浙江省瑞安市的一头须鲸类标本的线粒体DNA(mitochondrialDNA ,mtDNA)细胞色素b(cytochromeb,cytb)基因 36 9bp和控制区 (controlregion) 933bp的序列 ,通过与已发表的须鲸类同源序列比对 ,发现与西太平洋和日本水域的布氏鲸... 测定了采自浙江省瑞安市的一头须鲸类标本的线粒体DNA(mitochondrialDNA ,mtDNA)细胞色素b(cytochromeb,cytb)基因 36 9bp和控制区 (controlregion) 933bp的序列 ,通过与已发表的须鲸类同源序列比对 ,发现与西太平洋和日本水域的布氏鲸的cytb基因和控制区分别有 6 78%～ 7 0 5 %和 1 3 30 %～ 1 4 4 0 %的序列差异 ,而与来自所罗门群岛的的布氏鲸之间cytb基因的序列完全相同 ,控制区的序列也仅相差一个碱基 ( 0 2 8% )。提示与邻近的西太平洋和日本海的普通布氏鲸在遗传上有显著区别 ,而可能与所罗门群岛的布氏鲸为同一种 ,即小布氏鲸 (Balaenopteraedeni)。同时表明 ,应用分子生物学手段来进行鲸肉及其制品的种类鉴定是可行和有效的。 展开更多

关键词 mtdna序列 鉴定 小布氏鲸 标本

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用mtDNA序列探讨羚牛亚种分类(偶蹄目:牛科) 被引量：10

2

作者 李明 魏辅文 +1 位作者 冯祚建 蒙世杰 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2002年第4期865-870,共6页

羚牛 4个亚种在我国均有分布 ,且四川亚种和秦岭亚种是我国的特产动物 ,但对于分布于甘肃南部羚牛种群的亚种归属则有着不同的观点。本文就羚牛 3个亚种的分类地位从线粒体DNA细胞色素b和D Loop序列水平上进行探讨 ,分析结果基本支持形... 羚牛 4个亚种在我国均有分布 ,且四川亚种和秦岭亚种是我国的特产动物 ,但对于分布于甘肃南部羚牛种群的亚种归属则有着不同的观点。本文就羚牛 3个亚种的分类地位从线粒体DNA细胞色素b和D Loop序列水平上进行探讨 ,分析结果基本支持形态学上的亚种划分 ,但甘肃南部羚牛种群在两个DNA片段上均与羚牛四川亚种存在着一定的差异 ,而与秦岭亚种则完全一致。结合羚牛地理分布特点 。 展开更多

关键词 mtdna序列 羚牛 亚种 分类 偶蹄目 牛科

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基于部分线粒体DNA序列的疣螈属亚属(有尾目,蝾螈科,疣螈属)系统发育关系 被引量：6

3

作者 谷晓明 陈蓉蓉 +3 位作者 王会 田应洲 陈光照 田东 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期20-28,共9页

对疣螈属Yaotriton亚属5个已知物种23个个体的mtDNA序列数据(ND2、tRNATrp、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys和tRNA Tyr,1421bp),使用贝叶斯(BI)和最大似然(M P)方法重建了疣螈属Yaotriton的系统发育关系。结果表明:1)Yaotriton亚属的所有物... 对疣螈属Yaotriton亚属5个已知物种23个个体的mtDNA序列数据(ND2、tRNATrp、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys和tRNA Tyr,1421bp),使用贝叶斯(BI)和最大似然(M P)方法重建了疣螈属Yaotriton的系统发育关系。结果表明:1)Yaotriton亚属的所有物种形成1个单元群;2)海南疣螈T.hainanensis是Yaotriton亚属的1有效物种,不是细痣疣螈T.asperrimus的同物异名;3)文县疣螈T.wenxianensis雷山种群应是细痣疣螈的地理种群,细痣疣螈绥阳种群应是文县疣螈的地理种群;4)6个文县疣螈地理种群和3个细痣疣螈地理种群分别形成单系群,文县疣螈是Yaotriton亚属的1有效物种。 展开更多

关键词 Yaotriton亚属 系统发育关系 mtdna序列 有争议种的分类地位

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4个线粒体基因在鲤所属国家种质鉴定中的应用及效果评价 被引量：3

4

作者 苏胜彦 董在杰 朱文彬 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS 北大核心 2017年第1期45-51,共7页

近年来,mtDNA条形码技术已广泛应用于鱼类种质鉴定研究。为探讨该技术在鲤种质鉴定方面应用的可行性及如何有效应用于地域种群等鉴定分析,从NCBI网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)搜集鲤COⅠ、COⅡ、Cytb和D-loop4个mtDNA序列,并尝试... 近年来,mtDNA条形码技术已广泛应用于鱼类种质鉴定研究。为探讨该技术在鲤种质鉴定方面应用的可行性及如何有效应用于地域种群等鉴定分析,从NCBI网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)搜集鲤COⅠ、COⅡ、Cytb和D-loop4个mtDNA序列,并尝试基于DNA条形码技术来进行鲤所属国家的鉴定分析。结果表明:Cytb相对其他3个线粒体序列存在较大的DNA条形码间隙,COⅡ基因最佳匹配的准确率最高(准确率82.97%),基于4个mtDNA序列的聚类分析表明鲤所属国家按照临近区域聚类。综合条形码间隙及假阳性率和假阴性率的评价,研究认为,相比其他3个mtDNA序列,Cytb基因用于鉴定鲤所属国家更具优势,但其鉴定效率仍不理想。综上所述,mtDNA序列用于鉴定鲤不同地域的技术依然需要改进,以降低这一技术的假阳性率和假阴性率。 展开更多

关键词 鲤亚种 mtdna序列 鲤所属国家 DNA条形码间隙

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金线巴鱼属两亚种mtDNA的序列变异(英文) 被引量：1

5

作者 肖春杰 李梅章 +1 位作者 李维贤 昝瑞光 《云南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1998年第3期218-220,共3页

对抚仙金线巴鱼和滇池金线巴鱼的线粒体细胞色素ｂ基因的部分序列进行了测定及分析。发现①两亚种间共有３８个变异位点，占总位点的１０．９％；②转换明显多于颠换，且第三位置上的同义突变最为常见；③两亚种间的遗传距离为０．１１... 对抚仙金线巴鱼和滇池金线巴鱼的线粒体细胞色素ｂ基因的部分序列进行了测定及分析。发现①两亚种间共有３８个变异位点，占总位点的１０．９％；②转换明显多于颠换，且第三位置上的同义突变最为常见；③两亚种间的遗传距离为０．１１４，高于已研究过的淡水鱼类种内遗传距离的最大值，接近种间的较高值，是否仍然把它们视为同种的两个亚种看来值得进一步研究。 展开更多

关键词 金线Ba属 mtdna序列 变异

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金线属两个同域穴居物种的mtDNA序列变异 被引量：2

6

作者 李维贤 李梅章 昝瑞光 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2004年第3期311-313,共3页

对洞穴鱼种犀角金线(Sinocyclocheilusrhinocerous)及与之同域的软鳍金线(S.malacopterus)的线粒体细胞色素b基因的部分序列进行了测定和分析。发现两种之间有45个变异位点,占测序总位点的12 89%.其中在密码子第3位置上的变异有33个... 对洞穴鱼种犀角金线(Sinocyclocheilusrhinocerous)及与之同域的软鳍金线(S.malacopterus)的线粒体细胞色素b基因的部分序列进行了测定和分析。发现两种之间有45个变异位点,占测序总位点的12 89%.其中在密码子第3位置上的变异有33个,占全部变异点的73 33%.转换与颠换比值为6 5∶1.种间遗传距离为12 9%,表明这两个同域种间的血缘关系可能较远。 展开更多

关键词 犀角金线鲃 软鳍金线鲃 同域穴居种 mtdna序列变异

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金线鲃属两个同域种的mtDNA序列变异

7

作者 李维贤 李梅章 昝瑞光 《湛江海洋大学学报》 2004年第6期68-70,共3页

关键词 同域种 大头金线鲃 尖头金线 mtdna序列变异

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胃粘膜细胞核内线粒体DNA整体与幽门螺杆菌感染有关

8

作者 凌贤龙 房殿春 等 《胃肠病学》 2001年第C00期36-37,共2页

关键词 胃癌 胃粘膜 细胞核内线粒体 mtdna序列整合 幽门螺杆菌感染

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基因变异让狗“变脸”

9

《生物学通报》 2006年第8期6-6,共1页

现存的狗大约有400多个品种，它们在外型上与野生的犬科动物有着天壤之别。一个瑞典的研究小组认为他们已经找到了其中的原因。据美国《科学》杂志在线报道，研究人员将14条狗、6条狼和3条北美山狗的线粒体DNA（mtDNA）序列进行了对比... 现存的狗大约有400多个品种，它们在外型上与野生的犬科动物有着天壤之别。一个瑞典的研究小组认为他们已经找到了其中的原因。据美国《科学》杂志在线报道，研究人员将14条狗、6条狼和3条北美山狗的线粒体DNA（mtDNA）序列进行了对比，发现与2个表亲相比，狗的mtDNA序列产生了很多的遗传变异。这是由于与野生的犬科动物相比，一旦经过人类的驯化，狗所面临的自然选择压力将大大减少，从而允许产生更多的mtDNA差异。研究人员推测，这种多样性为饲养狗的人提供了最初的“原料” 展开更多

关键词 养狗 基因变异 mtdna序列 《科学》杂志 犬科动物 研究人员 遗传变异 选择压力 种多样性 线粒体

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新疆野猪mtDNA控制区序列遗传多样性分析 被引量：4

10

作者 韩春梅 高庆华 +2 位作者 赵书红 龚慧婷 赵余 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第8期3142-3143,3245,共3页

[目的]为研究猪种起源和遗传分化提供依据。[方法]从6个新疆野猪样本中提取基因组DNA,克隆线粒体DNA控制区序列并进行测序。在测定新疆野猪与其他20个国内外猪种间的遗传距离的基础上,对其进行聚类分析。[结果]通过PCR扩增克隆到大小为1... [目的]为研究猪种起源和遗传分化提供依据。[方法]从6个新疆野猪样本中提取基因组DNA,克隆线粒体DNA控制区序列并进行测序。在测定新疆野猪与其他20个国内外猪种间的遗传距离的基础上,对其进行聚类分析。[结果]通过PCR扩增克隆到大小为1398bp的DNA片段,其A+T含量为59.87%,有明显的碱基偏向性。控制区内存在大量的ACACGTGCGT串联重复序列。在6个新疆野猪样本中检测到3个单倍型。群体平均单倍型多样度(H)为0.600,核苷酸多样度(π)为0.00086。聚类分析结果表明新疆野猪与滇南小耳猪、泰国野猪和藏猪具有较近的遗传关系。[结论]新疆野猪与亚洲野猪和中国地方猪种有较近的遗传关系。 展开更多

关键词 新疆野猪 mtdna控制区序列 遗传多样性

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基于线粒体DNA控制区序列的6个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖群体的遗传多样性分析 被引量：3

11

作者 刘红 张海强 +1 位作者 蔡生力 戴习林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第1期63-73,共11页

运用线粒体DNA(mt DNA)控制区部分基因序列测序技术对6个凡纳滨对虾养殖群体(S1、S2、G1、G2、K1和Sg)的遗传多样性和系统进化关系进行了分析。结果显示,在检测到的146个单倍型中,144个为单群体特有,其余两个为群体S1和S2共享。6个群体... 运用线粒体DNA(mt DNA)控制区部分基因序列测序技术对6个凡纳滨对虾养殖群体(S1、S2、G1、G2、K1和Sg)的遗传多样性和系统进化关系进行了分析。结果显示,在检测到的146个单倍型中,144个为单群体特有,其余两个为群体S1和S2共享。6个群体的单倍型多样性(Hd)为0.42–0.99,核苷酸多样性(π)为0.00–0.08,其中,单倍型多样性最高的是群体K1(Hd=0.99±0.01),核苷酸多样性最高的是群体S2(π=0.08±0.04)。综合考虑,遗传多样性最低的为群体S1(Hd=0.42±0.08,π=0.00),遗传多样性最高的是群体S2(Hd=0.88±0.02,π=0.08±0.04)。AMOVA分析结果显示,来自群体间的遗传差异(46.98%)略低于来自群体内的遗传差异(53.02%)。各群体间的遗传分化Fst值均为正值(0.173–0.974),表明6个群体间存在较大程度的遗传分化差异。基于遗传距离的构建的UPGMA系统进化树和基于单倍型结果构建的NJ聚类图显示,系统进化树主要分为两支:S1和S2群体聚在一起成为一支;G1和G2群体首先聚在一起,再与Sg群体聚在一起,随后与K1群体聚成另一支,6个群体单倍型的聚类关系与遗传距离的进化关系类似。进一步对群体内雌雄群体间遗传差异进行分析发现,同一群体的雌雄群体间遗传多样性水平相近,雌雄群体间基本出现轻微到明显的遗传分化;比较相同群体不同生长速率的个体的遗传参数发现,生长较快群体与生长较慢群体间可能出现一定程度的遗传分化差异;对同一公司不同时间购买的群体分析发现,购买间隔较长(7–9个月)的群体之间的遗传分化值可能会大于不同种虾公司间群体的遗传分化值。 展开更多

关键词 凡纳滨对虾 mtdna控制区序列 遗传多样性 遗传分化 雌雄群体差异 生长差异

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借助mtDNA控制区序列分析金鱼与不同地域鲫的亲缘关系 被引量：3

12

作者 朱雪莲 王志勇 韩志强 《大连水产学院学报》 CSCD 北大核心 2010年第2期153-157,共5页

用PCR法克隆测定了4个品种金鱼(草金、文种、龙种和蛋种)、6个不同水域鲫与银鲫的m tDNA控制区部分序列,并对之进行比较分析。结果表明:测得的金鱼与鲫的序列长度均为471 bp,银鲫为472bp;在所用样品中共检测到10种单倍型,金鱼4品种间序... 用PCR法克隆测定了4个品种金鱼(草金、文种、龙种和蛋种)、6个不同水域鲫与银鲫的m tDNA控制区部分序列,并对之进行比较分析。结果表明:测得的金鱼与鲫的序列长度均为471 bp,银鲫为472bp;在所用样品中共检测到10种单倍型,金鱼4品种间序列无差异,共享1种单倍型;11尾鲫(来自6个不同水域)呈现8种单倍型,4尾银鲫(来自2个不同水域)共享1种单倍型。聚类分析结果表明,金鱼隶属于鲫的一支,银鲫呈独立的另一支。对金鱼与不同地域鲫的遗传距离测定结果表明:金鱼与嘉兴南湖的鲫亲缘关系最近(遗传距离D=0.00426),其次为盐城射阳湖鲫(D=0.00534)、淮河鲫(D=0.00641)、鄱阳湖鲫(D=0.00749),再次为黄河下游鲫(D=0.01073),与闽江鲫亲缘关系较远(D=0.01291)。据此推测,金鱼起源于长江流域的鲫。 展开更多

关键词 金鱼 鲫 不同地域 mtdna控制区序列 亲缘关系

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