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不同寡营养培养条件下南海水体细菌群落结构及其对碳源的利用特征
被引量:
9
1
作者
庄康
胡晓娟
+3 位作者
曹煜成
许云娜
张建设
文国樑
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期2697-2710,共14页
【背景】绝大多数海洋微生物不可培养,为挖掘海洋生态系统中可培养的微生物资源,研究者尝试寡营养培养等方法。【目的】比较不同寡营养培养条件下南海水体细菌数量、群落结构及其对碳源的利用特征差异。【方法】采用原2216E培养液(Y)、...
【背景】绝大多数海洋微生物不可培养,为挖掘海洋生态系统中可培养的微生物资源,研究者尝试寡营养培养等方法。【目的】比较不同寡营养培养条件下南海水体细菌数量、群落结构及其对碳源的利用特征差异。【方法】采用原2216E培养液(Y)、稀释10倍(Y-10)和稀释50倍(Y-50)的2216E培养液培养南海海水样品,用荧光定量PCR法和16S rRNA基因检测细菌数量和菌群结构;利用平板计数法计数异养细菌的数量,纯化鉴定可培养细菌;采用Biolog EcoPlateTM微板法分析不同培养基中细菌群落对碳源的利用特征。【结果】Y组细菌总数高于Y-10组和Y-50组,差异不显著(P>0.05),但异养细菌数量显著高于Y-10组和Y-50组(P<0.05)。16S rRNA基因测序结果表明,不同稀释倍数下的细菌群落结构差异明显,Y组检测出10门193属,优势类群为Proteobacteria(56.44%)和Bacteroides(37.27%);Y-10组检测出15门220属,优势类群为Proteobacteria(40.30%)、Bacteroides(36.91%)和Firmicutes(17.30%);Y-50组检测出14门226属,优势类群为Proteobacteria(45.19%)、Bacteroides(25.29%)、Planctomycetes(13.58%)和Firmicutes(11.21%)。通过平板培养,Y组和Y-10组均分离到6属14株优势菌,Y-50组分离到7属13株优势菌,其中,Bacillus为其共有的优势菌属,稀释10倍培养液筛得的Microbacterium(1株)、Vibro(1株)、Idiomarina(1株)、Halobacillus(1株)共4株优势菌和稀释50倍培养液筛得的Alcanivorax(1株)、Sulfitobacter(1株)、Alteromonas(1株)、Pseudomonas(1株)、Exiguobacterium(2株)、Vibro(3株)共9株优势菌不同于原培养液。通过寡营养培养,可培养细菌群落的代谢活性和McIntosh指数显著增加(P<0.05),其对聚合物、羧酸、氨基酸、糖类的利用率也显著提高(P<0.05)。【结论】通过寡营养培养能增加细菌群落的丰富度和多样性,提高可培养细菌的代谢活性和对碳源尤其是聚合物、羧酸、氨基酸和糖类的利用率,分离纯化可获得原培养基�
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关键词
寡营养培养
海洋微生物
细菌群落结构
细菌代谢功能
多样性指数
原文传递
题名
不同寡营养培养条件下南海水体细菌群落结构及其对碳源的利用特征
被引量:
9
1
作者
庄康
胡晓娟
曹煜成
许云娜
张建设
文国樑
机构
浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心
中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室广东省渔业生态环境重点实验室
中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期2697-2710,共14页
基金
农业农村部财政专项(NFZX2018)
国家重点研发计划(2019YFD0900402)
+3 种基金
中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2019TS06)
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-48)
广东省现代农业产业技术体系创新团队建设专项资金(2019KJ149)
广东省促进经济发展专项资金(粤农2019B12)。
文摘
【背景】绝大多数海洋微生物不可培养,为挖掘海洋生态系统中可培养的微生物资源,研究者尝试寡营养培养等方法。【目的】比较不同寡营养培养条件下南海水体细菌数量、群落结构及其对碳源的利用特征差异。【方法】采用原2216E培养液(Y)、稀释10倍(Y-10)和稀释50倍(Y-50)的2216E培养液培养南海海水样品,用荧光定量PCR法和16S rRNA基因检测细菌数量和菌群结构;利用平板计数法计数异养细菌的数量,纯化鉴定可培养细菌;采用Biolog EcoPlateTM微板法分析不同培养基中细菌群落对碳源的利用特征。【结果】Y组细菌总数高于Y-10组和Y-50组,差异不显著(P>0.05),但异养细菌数量显著高于Y-10组和Y-50组(P<0.05)。16S rRNA基因测序结果表明,不同稀释倍数下的细菌群落结构差异明显,Y组检测出10门193属,优势类群为Proteobacteria(56.44%)和Bacteroides(37.27%);Y-10组检测出15门220属,优势类群为Proteobacteria(40.30%)、Bacteroides(36.91%)和Firmicutes(17.30%);Y-50组检测出14门226属,优势类群为Proteobacteria(45.19%)、Bacteroides(25.29%)、Planctomycetes(13.58%)和Firmicutes(11.21%)。通过平板培养,Y组和Y-10组均分离到6属14株优势菌,Y-50组分离到7属13株优势菌,其中,Bacillus为其共有的优势菌属,稀释10倍培养液筛得的Microbacterium(1株)、Vibro(1株)、Idiomarina(1株)、Halobacillus(1株)共4株优势菌和稀释50倍培养液筛得的Alcanivorax(1株)、Sulfitobacter(1株)、Alteromonas(1株)、Pseudomonas(1株)、Exiguobacterium(2株)、Vibro(3株)共9株优势菌不同于原培养液。通过寡营养培养,可培养细菌群落的代谢活性和McIntosh指数显著增加(P<0.05),其对聚合物、羧酸、氨基酸、糖类的利用率也显著提高(P<0.05)。【结论】通过寡营养培养能增加细菌群落的丰富度和多样性,提高可培养细菌的代谢活性和对碳源尤其是聚合物、羧酸、氨基酸和糖类的利用率,分离纯化可获得原培养基�
关键词
寡营养培养
海洋微生物
细菌群落结构
细菌代谢功能
多样性指数
Keywords
low
-
nutrient
culture
Marine
microbes
Bacterial
community
structure
Bacterial
metabolic
function
Diversity
index
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同寡营养培养条件下南海水体细菌群落结构及其对碳源的利用特征
庄康
胡晓娟
曹煜成
许云娜
张建设
文国樑
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
9
原文传递
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