长链非编码RNA KCNMB2-AS1在胃癌中的表达及机制研究 被引量：6

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作者 唐银炳 陆佳伟 +6 位作者 谢黎 张伟亚 邹晨 祁卫东 马圭 张文波 蒋鹏程 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第13期1759-1764,共6页

目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)KCNMB2-AS1在胃癌(gastric cancer,GC)组织和血浆中的表达水平、临床意义及其对胃癌细胞生物学功能的影响和可能机制。方法实时荧光定量PCR(QRT-PCR)检测82例配对胃癌及癌旁对照组织... 目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)KCNMB2-AS1在胃癌(gastric cancer,GC)组织和血浆中的表达水平、临床意义及其对胃癌细胞生物学功能的影响和可能机制。方法实时荧光定量PCR(QRT-PCR)检测82例配对胃癌及癌旁对照组织、31例患者和31例健康体检者血浆KCNMB2-AS1的表达;分析KCNMB2-AS1表达量与临床病理特征的相关性。通过细胞计数、克隆形成、Transwell实验及流式细胞术观察敲减KCNMB2-AS1后胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的变化。QRT-PCR检测敲减KCNMB2-AS1对肿瘤相关基因表达水平的影响。结果 KCNMB2-AS1在胃癌组织和血浆中显著高表达,其表达水平与肿瘤大小、淋巴结转移、TNM分期及预后密切相关。血浆KCNMB2-AS1表达水平诊断胃癌的ROC曲线下面积为0.865。敲减KCNMB2-AS1抑制胃癌细胞增殖、迁移和侵袭并诱导其凋亡,间质标志N-cadherin、Fibronectin 1和转录因子Twist1、Slug、ZEB1表达下调。结论 KCNMB2-AS1在胃癌组织及血浆中均高表达,其高表达与疾病进展及不良预后相关。血浆KCNMB2-AS1表达水平对诊断胃癌具有一定价值。敲减KCNMB2-AS1抑制胃癌细胞增殖、迁移和侵袭,诱导胃癌细胞凋亡并抑制EMT过程。 展开更多

关键词 胃癌 长链非编码rna KCNMB2⁃AS1 上皮间质转化

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lncRNA NEAT1在鼻咽癌中的表达情况及其对鼻咽癌放疗敏感性的影响

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作者 莫柒艳 黄欢 +6 位作者 张维明 韦志松 石丹丽 韩露 农思凯 韩宇源 林国享 《广西医学》 CAS 2024年第8期1217-1225,共9页

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)核旁斑富集转录本1(NEAT1)在鼻咽癌中的表达情况及其对鼻咽癌放疗敏感性的影响。方法(1)使用UALCAN数据库分析NEAT1在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况及其与患者临床分期、预后的关系。(2)利用实时荧光定量... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)核旁斑富集转录本1(NEAT1)在鼻咽癌中的表达情况及其对鼻咽癌放疗敏感性的影响。方法(1)使用UALCAN数据库分析NEAT1在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况及其与患者临床分期、预后的关系。(2)利用实时荧光定量PCR检测鼻咽癌组织及正常鼻咽黏膜上皮、人永生化鼻咽上皮细胞NP-69及多株鼻咽癌细胞(CNE-1、CNE-2、CNE-2R、C666-1、C666-1R)中NEAT1的表达情况。(3)使用RNA干扰技术构建NEAT1沉默的CNE-2R细胞[NEAT1-短发夹RNA(shRNA)组],并设立对照组(未转染的CNE-2R细胞)、NEAT1-NC组(转染对照序列的CNE-2R细胞)。给予不同放射剂量X线照射后,检测3组CNE-2R细胞的存活率、凋亡率、克隆形成率及放射生物学参数。结果(1)NEAT1在头颈部鳞状细胞癌组织中呈高表达,且表达水平随着头颈部鳞状细胞癌分期的增加呈升高趋势(P<0.05),但不同NEAT1表达水平患者的总生存率差异无统计学意义(P>0.05)。(2)相较于正常鼻咽黏膜上皮组织,鼻咽癌组织中NEAT1表达上调(P<0.05)。相较于NP-69细胞,NEAT1在鼻咽癌细胞中的表达上调(P<0.05),其中CNE-2R细胞中的表达量最高(P<0.05);放射抗拒性细胞CNE-2R、C666-1R中NEAT1的表达量分别高于放疗敏感性细胞CNE-2、C666-1(P<0.05)。(3)在接受不同剂量X射线照射后,与对照组及NEAT1-NC组比较,NEAT1-shRNA组CNE-2R细胞存活率、克隆形成率及放射生物学参数降低,凋亡率升高(P<0.05),但对照组与NEAT1-NC组上述指标差异无统计学意义(P>0.05)。结论lncRNA NEAT1在鼻咽癌组织和细胞中呈高表达,与肿瘤分期密切相关,沉默NEAT1的表达可增加鼻咽癌的放疗敏感性。 展开更多

关键词 鼻咽癌 放疗敏感性 长链非编码rna 核旁斑富集转录本1 rna干扰技术

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广州管圆线虫感染大鼠脑组织转录组分析

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作者 程东慧 蒋天哥 +5 位作者 景一丹 杨丽敏 郭云海 方圆 李中秋 张仪 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CSCD 北大核心 2024年第2期217-224,233,共9页

目的了解广州管圆线虫感染后大鼠脑组织转录组的表达水平。方法将32只SD大鼠随机分为对照组(12只)和感染组(20只),感染组每只大鼠经灌胃感染40条广州管圆线虫Ⅲ期幼虫,对照组灌胃等体积生理盐水。感染后1、7、14、21 d,对照组、感染组... 目的了解广州管圆线虫感染后大鼠脑组织转录组的表达水平。方法将32只SD大鼠随机分为对照组(12只)和感染组(20只),感染组每只大鼠经灌胃感染40条广州管圆线虫Ⅲ期幼虫,对照组灌胃等体积生理盐水。感染后1、7、14、21 d,对照组、感染组分别随机解剖3、5只,取脑组织制备石蜡切片,苏木精-伊红(HE)染色后观察脑组织病理变化。TRIzol法提取感染后14 d大鼠脑组织RNA,逆转录为cDNA后测序。选取差异表达mRNA进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,采用STRING数据库预测差异表达mRNA靶蛋白之间的蛋白质互作(PPI)关系。利用生物信息学方法构建差异表达基因的竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络。采用qPCR验证表达差异的lncRNA。结果HE染色结果显示,感染广州管圆线虫后14 d,感染组大鼠脑组织出现病理变化,脑海马区神经元胞浆固缩;感染后21 d,脑膜处可见寄生虫样组织。RNA测序结果显示,感染广州管圆线虫后14 d,大鼠脑组织中差异表达mRNA的数量为955个(890个上调、65个下调);差异表达lncRNA的数量为193个(122个上调、71个下调)。GO富集分析结果显示,差异表达mRNA主要富集在炎症反应、免疫应答等生物过程,细胞成分主要为质膜外侧的胞外空间、细胞表面等,分子功能主要为趋化因子活性、趋化因子受体结合等;KEGG代谢通路分析结果显示,差异表达mRNA主要参与细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子等信号通路。PPI分析结果显示,差异表达基因主要的靶点为趋化因子配体11、RT1-Da、丝氨酸家族E成员1等,均与免疫应答相关。ceRNA结果显示,显著富集的miRNA如mir-466b-3p、mir-1956、mir-207和mir-328a-5p等与免疫应答、细胞凋亡、血管生成等过程有关。qPCR结果显示,感染广州管圆线虫后,感染组大鼠H19的相对转录水平逐渐升高,在感染后21 d达到峰值,为15.07 展开更多

关键词 广州管圆线虫 长链非编码rna 转录组学 竞争性内源rna

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原代人脐静脉内皮细胞的分离及沉默长链非编码RNA效率验证

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作者 樊宗成 马康源 +6 位作者 程小兵 陈鑫 林云钗 王来成 虞坚建 张顺鹏 彭峰 《热带医学杂志》 CAS 2024年第8期1067-1072,1083,F0002,共8页

目的旨在优化分离原代人脐静脉内皮细胞(pHUVECs)技术,探索建立简便、高效和经济的沉默长链非编码RNA(lncRNA)的pHUVECs模型方法。方法实验所用脐带来自福建医科大学附属第一医院健康产妇剖宫产的新生儿脐带。使用胶原酶消化法分离pHUVE... 目的旨在优化分离原代人脐静脉内皮细胞(pHUVECs)技术,探索建立简便、高效和经济的沉默长链非编码RNA(lncRNA)的pHUVECs模型方法。方法实验所用脐带来自福建医科大学附属第一医院健康产妇剖宫产的新生儿脐带。使用胶原酶消化法分离pHUVECs,5%胎牛血清培养液[内皮细胞培养基(ECM)∶M199=1∶4]培养细胞。显微镜观察形态学及免疫荧光法检测pHUVECs特异性Ⅷ因子和CD31的表达。使用脂质体将不同浓度小干扰RNA(siRNA)-Fam转染pHUVECs,并设置CTL组、1 nmol/L siRNA-Fam组、10 nmol/L siRNA-Fam组、20 nmol/L siRNA-Fam组、50 nmol/L siRNA-Fam组、100 nmol/L siRNA-Fam组,倒置荧光显微镜观察各组荧光强度,筛选最佳siRNA转染浓度。设置CTL组、1μL RNAFIT组、3μL RNAFIT组、5μL RNAFIT组、10μL RNAFIT组,转染siRNA-SNHG8后,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测SNHG8表达,筛选最佳RNAFIT转染浓度。设置CTL组、阴性对照组、si-SNHG81#组、si-SNHG82#组、si-SNHG83#组、si-SNHG81+2+3#组。脂质体转染法将siRNA导入pHUVECs,分别培养24、48和72 h。RT-qPCR检测lncRNA SNHG8的表达。结果pHUVECs在培养48 h后呈典型的鹅卵石样排列。免疫荧光结果显示,Ⅷ因子和CD31呈阳性。与CTL组比较,50 nmol/L siRNA-Fam组荧光强度最高,差异有统计学意义(t=32.020,P<0.0001),5和10μL RNAFIT组SNHG8表达均较低,差异均有统计学意义(t=36.030、19.890,P均<0.0001)。50nmol/L siRNA和5μL RNAFIT转染pHUVECs 24h后,RT-qPCR结果显示,与CTL组比较,si-SNHG83#组及si-SNHG81+2+3#组沉默SNHG8的效率最高,差异均有统计学意义(t=13.950、4.606,P均<0.05);转染48及72 h后,与CTL组比较,si-SNHG81+2+3#组沉默SNHG8的效率较高,差异均有统计学意义(t=48.620、24.160,P均<0.0001)。转染48及72 h后,与si-SNHG83#组比较,si-SNHG81+2+3#组沉默SNHG8的效率较高,差异均有统计学意义(t=9.316、4.055,P均<0.05)。同时si-SNHG81+2+3#组转染后呈时间依赖性抑制SNHG 展开更多

关键词 原代人脐静脉内皮细胞 长链非编码rna 脂质体转染 沉默效率

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lncRNA在ALI/ARDS中潜在治疗靶点及调控机制的研究进展

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作者 庄义鸣 张红 《国际麻醉学与复苏杂志》 CAS 2024年第1期92-96,共5页

长链非编码RNA(lncRNA)通过调节炎症反应、氧化应激和免疫应答等途径参与急性肺损伤(ALI)/急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的发展。通过研究lncRNA在ALI/ARDS的表达变化以及其作用机制,能更好地理解疾病的发生和发展过程。文章收集近三年为主... 长链非编码RNA(lncRNA)通过调节炎症反应、氧化应激和免疫应答等途径参与急性肺损伤(ALI)/急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的发展。通过研究lncRNA在ALI/ARDS的表达变化以及其作用机制,能更好地理解疾病的发生和发展过程。文章收集近三年为主的研究报道,对lncRNA在ALI/ARDS中调控基因表达的作用机制、分子调控机制进行综述。概括了lncRNA在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因表达,参与介导细胞凋亡、细胞焦亡、细胞自噬、核因子⁃κB(NF⁃κB)信号通路激活和巨噬细胞激活等,旨在对lncRNA在ALI/ARDS发生、发展中的作用机制进行综述和展望,探索lncRNA的治疗潜力,为临床应用提供更多潜在的治疗靶点。 展开更多

关键词 长链非编码rna 急性肺损伤 急性呼吸窘迫综合征

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特应性皮炎患者血清ApoA1、ApoB、ApoE、IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平及临床意义

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作者 李洁 李作森 《中国烧伤创疡杂志》 2023年第3期244-247,共4页

目的探讨特应性皮炎患者血清载脂蛋白(Apo)A1、ApoB、ApoE、白细胞介素(IL)⁃4、IL⁃10、长链非编码RNA00324(Linc00324)的表达水平及其临床意义。方法选取2018年8月至2021年1月鹿邑真源医院收治的180例特应性皮炎患者(设为特应性皮炎组)... 目的探讨特应性皮炎患者血清载脂蛋白(Apo)A1、ApoB、ApoE、白细胞介素(IL)⁃4、IL⁃10、长链非编码RNA00324(Linc00324)的表达水平及其临床意义。方法选取2018年8月至2021年1月鹿邑真源医院收治的180例特应性皮炎患者(设为特应性皮炎组),以及同期于鹿邑真源医院接受健康体检的100名健康体检者(设为对照组)作为研究对象,对比两组研究对象血清ApoA1、ApoB、ApoE、IL⁃4、IL⁃10及Linc00324水平,分析血清ApoA1、ApoB、IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平与特应性皮炎的相关性以及ApoA1、ApoB水平与IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平的相关性。结果特应性皮炎组患者血清ApoA1、IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平均明显高于对照组(t=2.574、15.077、18.257、89.225,P=0.011、P<0.001、P<0.001、P<0.001),ApoB水平明显低于对照组(t=9.013,P<0.001),ApoE水平与对照组无明显差异(t=0.079,P=0.937)。Spearman相关系数分析结果显示,血清ApoA1、IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平与特应性皮炎呈显著正相关性(r=0.417、0.359、0.403、0.552,P均<0.001),ApoB水平与特应性皮炎呈显著负相关性(r=-0.362,P<0.001)。Pearson相关系数分析结果显示,血清ApoA1水平与IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平呈显著正相关性(r=0.511、0.523、0.623,P均<0.001),ApoB水平与IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平呈显著负相关性(r=-0.535、-0.412、-0.549,P均<0.001)。结论血清ApoA1、ApoB、IL⁃4、IL⁃10、Linc00324水平均与特应性皮炎的发生发展密切相关,可作为特应性皮炎早期诊断与病情评估的生物学指标以及病情防控靶点。 展开更多

关键词 特应性皮炎 载脂蛋白A1 载脂蛋白B 载脂蛋白E 白细胞介素⁃4 白细胞介素⁃10 长链非编码rna

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基于全转录组技术研究慢性应激抑郁模型中微小RNA、长链非编码RNA及环状RNA的表达谱及调控网络

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作者 孟盼 张熙 +7 位作者 杨蕙 刘检 方锐 王枭冶 葛金文 刘彤彤 赵洪庆 王宇红 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期405-413,共9页

目的 筛选慢性应激抑郁模型大鼠海马组织中微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)的表达谱及其竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,探讨抑郁症潜在的病理生理机制。方法 12只SD大鼠分为空白组和模型组,采用慢性温和不可... 目的 筛选慢性应激抑郁模型大鼠海马组织中微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)的表达谱及其竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,探讨抑郁症潜在的病理生理机制。方法 12只SD大鼠分为空白组和模型组,采用慢性温和不可预测性应激(CUMS)构建抑郁症大鼠模型,取大鼠海马组织进行全转录组分析,并用生物信息学方法找出可能存在的lncRNA-miRNA-mRNA、circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果 根据|差异倍数(fold change)|≥1.5和P≤0.05共鉴定出29个差异miRNAs(上调21个,下调8个),686个差异lncRNAs(上调163个,下调523个),8个差异circRNAs(上调3个,下调5个)。基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析显示,miRNAs的靶基因主要富集于细胞膜内的高尔基体和钙离子结合过程;LncRNAs靶基因的功能涉及核酸结合的调节、细胞因子和蛋白质泛素化等;CircRNAs的宿主基因主要集中在细胞刺激反应、代谢进程、催化活性等过程中。LncRNAs和circRNAs相互竞争的ceRNA网络显示,非编码RNA(ncRNA)与突触可塑性相关的mRNA之间存在复杂相互作用,如与轴突导向相关的Wnt-ta蛋白(WNT5a)和Ⅷ型胶原α1(COL8α1),以及神经发育相关的层黏连蛋白A2(LAMA2)。结论 LncRNA和circRNA的ceRNA网络显示,ncRNA和mRNA之间的复杂相互作用与抑郁症的神经可塑性受损有关。 展开更多

关键词 微小rna 长链非编码rna 环状rna 抑郁症 神经可塑性 全转录组技术 大鼠

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长链非编码RNA MALAT1对人肺成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的影响

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作者 常清 陈飞 +2 位作者 张铁栓 乔华 万军营 《循证医学》 2023年第2期103-108,共6页

目的探索长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)肺腺癌转移相关转录本1(metastasisassociated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)对人肺成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的影响。方法培养人肺成纤维细胞(human fetal lung fib... 目的探索长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)肺腺癌转移相关转录本1(metastasisassociated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)对人肺成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的影响。方法培养人肺成纤维细胞(human fetal lung fibroblast 1,HFL-1),按照有无转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)作用分为观察组和对照组,检测两组细胞中lncRNA MALAT1表达水平。在此基础上设置四个组别:空白组、TGF-β1组、转染对照组和siMALAT1组。空白组细胞不接受任何处理;TGF-β1组采用5 ug/L的TGF-β1处理;转染对照组在TGF-β1组的基础上应用siMALAT1阴性对照(negative control,NC)处理;siMALAT1组在TGF-β1组的基础上应用siMALAT1。比较其lncRNA MALAT1、Ⅰ型胶原(collagen 1,COL1)和α-平滑肌肌动蛋白(α-smooth muscle activation protein,α-SMA)的mRNA表达水平,COL1和α-SMA的蛋白表达水平和细胞增殖情况。结果观察组lncRNA MALAT1相对表达量较对照组高(P<0.05)。四组细胞lncRNA MALAT1、α-SMA和COL1的mRNA及蛋白相对表达量有统计学差异(P<0.05);其中,转染对照组和TGF-β1组以上RNA和蛋白相对表达量均高于siMALAT1组和空白组(P<0.05),而TGF-β1组与转染对照组之间上述RNA和蛋白相对表达量则无差异(P>0.05)。四组细胞增殖活力的差异具有统计学意义(P<0.05);转染对照组和TGF-β1组细胞增殖活力较siMALAT1组和空白组高(P<0.05),而TGF-β1组与转染对照组之间则无差异(P>0.05)。结论lncRNA MALAT1可以促进人肺成纤维细胞向肌成纤维细胞的转化,影响肺纤维化进程中COL1、α-SMA在肺组织中的沉积,靶向lncRNA MALAT1将有助于对肺纤维化过程的深入研究。 展开更多

关键词 长链非编码rna 肺腺癌转移相关转录本1 特发性肺纤维化

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生存相关DLEU1与HPV感染阳性宫颈癌关系研究

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作者 苗霞 董爱萍 郭文斐 《潍坊医学院学报》 2023年第2期81-86,共6页

目的 探讨淋巴细胞白血病中lncRNA缺失型1(DLEU1)是否与人乳头瘤病毒(HPV)感染相关以及DLEU1在HPV阳性(HPV+)宫颈癌(CC)患者中的临床价值。方法 选择2016年1月~2017年12月接受治疗的CC患者128例作为宫颈癌组,同期行子宫切除术的子宫肌... 目的 探讨淋巴细胞白血病中lncRNA缺失型1(DLEU1)是否与人乳头瘤病毒(HPV)感染相关以及DLEU1在HPV阳性(HPV+)宫颈癌(CC)患者中的临床价值。方法 选择2016年1月~2017年12月接受治疗的CC患者128例作为宫颈癌组,同期行子宫切除术的子宫肌瘤患者99例作为对照组,通过受试者工作特征分析评估DLEU1从对照中筛选CC患者的能力以及区分不同HPV感染状态个体的能力,利用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析评估DLEU1与CC患者生存预后的关系。结果 DLEU1表达在CC组织和细胞系中显著上调,特别是在HPV+的组织和细胞系中。DLEU1在区分CC患者以及区分HPV+和HPV阴性(HPV-)CC患者方面具有较高的诊断价值,并对HPV+对照具有一定的筛选能力。结论 DLEU1与CC患者HPV感染相关,与总CC患者和HPV+CC患者的生存预后相关,并可独立预测CC患者的预后,DLEU1可作为HPV+CC患者的诊断和预后生物标志物。 展开更多

关键词 宫颈肿瘤 人乳头瘤病毒 长链非编码rna 淋巴细胞白血病缺失基因1

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长链非编码RNA TSI抑制TGF⁃β1介导的乳腺癌细胞MCF⁃7和BT474转移 被引量：3

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作者 谭梓聪 张洋璠 +2 位作者 黄晓燕 杨浩杰 曹铭辉 《岭南现代临床外科》 2021年第2期171-176,共6页

目的研究长链非编码RNA TSI(Lnc-TSI)在TGF-β1促进乳腺癌细胞MCF-7和BT474转移中的作用。方法TGF-β1处理乳腺癌细胞MCF-7和BT474后,观察细胞形态变化,western blot实验检测上皮-间充质转化相关蛋白的变化,transwell实验检测细胞侵袭... 目的研究长链非编码RNA TSI(Lnc-TSI)在TGF-β1促进乳腺癌细胞MCF-7和BT474转移中的作用。方法TGF-β1处理乳腺癌细胞MCF-7和BT474后,观察细胞形态变化,western blot实验检测上皮-间充质转化相关蛋白的变化,transwell实验检测细胞侵袭能力。qRT-PCR分别检测MCF-10A和TGF-β1处理前后MCF-7、BT474细胞的Lnc-TSI变化。在MCF-7和BT474细胞中分别敲除和过表达Lnc-TSI,transwell实验检测细胞在TGF-β1处理后侵袭迁移能力的变化。结果TGF-β1引起乳腺癌细胞MCF-7和BT474发生上皮-间充质转化,细胞形态呈梭形改变,上皮-间充质转化相关蛋白E-cadherin下调,N-cadherin和Vimentin上调,细胞侵袭数目增加。与正常乳腺上皮细胞MCF-10A细胞相比,MCF-7和BT474细胞中的Lnc-TSI表达更高。TGF-β1处理能显著上调MCF-7和BT474细胞中的Lnc-TSI水平。Transwell实验显示敲除和过表达Lnc-TSI能分别增强和抑制MCF-7和BT474细胞的侵袭和迁移,在TGF-β1处理下这种现象更为明显。结论在TGF-β1促进的乳腺癌细胞MCF-7和BT474的转移进程中Lnc-TSI表达上调,Lnc-TSI能抑制乳腺癌细胞MCF-7和BT474的转移。 展开更多

关键词 长链非编码rna TGF⁃β1 乳腺癌 转移

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长链非编码RNA DUXAP9促进头颈鳞癌细胞增殖和转移 被引量：1

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作者 周文凯 王佳璇 +6 位作者 王媛凤 陈萌 陶星如 刘喆麒 张煦 季彤 曹巍 《口腔疾病防治》 2022年第6期381-389,共9页

目的探讨长链非编码RNA双同源盒假基因9(double homeoboxApseudogene 9,DUXAP9)在头颈鳞癌中的作用,研究DUXAP9在头颈鳞癌细胞中的表达水平、分子功能和机制。方法lnc RNA芯片筛选头颈鳞癌组织与癌旁组织差异表达的lncRNA,TCGA数据库中... 目的探讨长链非编码RNA双同源盒假基因9(double homeoboxApseudogene 9,DUXAP9)在头颈鳞癌中的作用,研究DUXAP9在头颈鳞癌细胞中的表达水平、分子功能和机制。方法lnc RNA芯片筛选头颈鳞癌组织与癌旁组织差异表达的lncRNA,TCGA数据库中分析DUXAP9在头颈鳞癌组织中的表达水平及其与患者预后的关系;qRT⁃PCR检测DUXAP9在头颈鳞癌组织样本和细胞系中的表达水平。沉默DUXAP9后,CCK⁃8实验、细胞划痕实验、Transwell迁移实验和裸鼠皮下成瘤实验评估其在头颈鳞癌细胞中的功能。qRT⁃PCR和Western blot检测沉默DUXAP9后,头颈鳞癌细胞中上皮⁃间充质转化(epithelial⁃mesenchymaltransition,EMT)相关蛋白转录及翻译水平的变化。结果lncRNA芯片结果显示,与癌旁组织相比,DUXAP9在头颈鳞癌中异常高表达。TCGA数据库分析表明,与DUXAP9低表达患者相比,DUXAP9高表达的患者生存率差;qRT⁃PCR实验表明DUXAP9在头颈鳞癌组织标本和细胞系中异常高表达。沉默DUXAP9可以显著抑制头颈鳞癌细胞的增殖能力、迁移能力和EMT相关基因的表达水平。沉默DUXAP9能显著抑制头颈鳞癌细胞系CAL27的裸鼠皮下成瘤能力。结论DUXAP9促进头颈鳞癌细胞的增殖、迁移和裸鼠皮下成瘤能力。DUXAP9可能通过调控EMT介导头颈鳞癌细胞的迁移能力。 展开更多

关键词 长链非编码rna DUXAP9 基因沉默 头颈鳞癌 上皮间质转化 E⁃钙黏附蛋白 N⁃钙黏附蛋白 波形蛋白 细胞增殖 细胞迁移 裸鼠皮下成瘤

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非小细胞肺癌患者血浆LncRNA UCA1与吉西他滨耐药相关性研究 被引量：2

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作者 韦瑞富 《分子诊断与治疗杂志》 2021年第7期1047-1050,1054,共5页

目的研究非小细胞肺癌患者血浆长链非编码RNA(LncRNA)上皮癌胚抗原1(UCA1)表达水平与吉西他滨耐药的相关性。方法选取2017年4月至2020年10月本院收治的非小细胞肺癌患者84例,随机分为吉西他滨组(n=43,予以吉西他滨/顺铂治疗)、紫杉醇组(... 目的研究非小细胞肺癌患者血浆长链非编码RNA(LncRNA)上皮癌胚抗原1(UCA1)表达水平与吉西他滨耐药的相关性。方法选取2017年4月至2020年10月本院收治的非小细胞肺癌患者84例,随机分为吉西他滨组(n=43,予以吉西他滨/顺铂治疗)、紫杉醇组(n=41,予以紫杉醇/顺铂治疗),治疗结束评估疗效,并分为敏感亚组、中介亚组、耐药亚组,采用实时荧光定量PCR法测定所有患者化疗前、化疗1个周期、化疗2个周期时血浆LncRNA UCA1表达水平。结果吉西他滨组中化疗敏感19例,中介8例,耐药16例,耐药亚组化疗后LncRNA UCA1表达水平高于敏感亚组、中介亚组,差异有统计学意义(P<0.05)。化疗后吉西他滨组疾病进展(PD)患者LncRNA UCA1表达水平高于完全缓解(CR)患者、部分缓解(PR)患者、疾病稳定(SD)患者,差异有统计学意义(P<0.05)。紫杉醇组不同化疗效果患者的LncRNA UCA1表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。化疗1个周期、2个周期,吉西他滨耐药亚组的LncRNA UCA1表达水平增加,敏感亚组的LncRNA UCA1表达水平下降(P<0.05),而中介亚组的LncRNA UCA1表达水平无明显变化(P>0.05)。结论非小细胞肺癌患者血浆LncRNA UCA1表达水平与吉西他滨耐药有相关性,LncRNA UCA1可作为预测吉西他滨耐药的标志物。 展开更多

关键词 非小细胞肺癌 长链非编码rna UCA1 吉西他滨 耐药

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长链非编码RNA KCNQ1重叠转录物1在肝细胞癌迁移及增殖和侵袭中的作用与机制研究 被引量：2

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作者 梅洪亮 黄致远 +4 位作者 胡逸林 江艳 陈敏 卢绮萍 刘志苏 《中华消化外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1083-1090,共8页

目的探讨长链非编码RNA KCNQ1重叠转录物1(LncRNA KCNQ1OT1)在肝细胞癌迁移、增殖和侵袭中的作用及机制。方法采用实验研究方法。收集StarBase数据库中LncRNA KCNQ1OT1在肝细胞癌组织和正常肝脏组织中的表达数据,通过实验方法(实时荧光... 目的探讨长链非编码RNA KCNQ1重叠转录物1(LncRNA KCNQ1OT1)在肝细胞癌迁移、增殖和侵袭中的作用及机制。方法采用实验研究方法。收集StarBase数据库中LncRNA KCNQ1OT1在肝细胞癌组织和正常肝脏组织中的表达数据,通过实验方法(实时荧光定量PCR、细胞转染、划痕实验、CCCK8实验、Transwell实验、Western blot法)检测肝癌细胞中LncRNA KCNQ1OT1表达、迁移、增殖、侵袭及其与磷脂酰肌醇3⁃激酶(PI3K)、p⁃AKT信号通路的关系。观察指标:(1)肝细胞癌组织与正常肝脏组织中LncRNA KCNQ1OT1表达情况。(2)敲低LncRNA KCNQ1OT1基因,HepG2、SMCC⁃7721和MHCC⁃97H细胞迁移情况。(3)敲低LncRNA KCNQ1OT1基因,HepG2、SMCC⁃7721和MHCC⁃97H细胞增殖、侵袭情况。(4)敲低LncRNA KCNQ1OT1基因对PI3K、p⁃AKT信号通路影响情况。正态分布的计量资料以x􀭰±s表示,组间比较采用t检验。采用Kaplan⁃Meier法计算生存率并绘制生存曲线。结果(1)肝细胞癌组织与正常肝脏组织中LncRNA KCNQ1OT1表达情况:收集StarBase数据库374例肝细胞癌组织和50例正常肝脏组织中LncRNA KCNQ1OT1的相对表达量分别为3.320±0.017和1.470±0.025,两者比较,差异有统计意义(t=5.24,P<0.05)。分析基因表达谱交互分析数据库结果显示:肝细胞癌组织LncRNA KCNQ1OT1高表达与低表达患者30个月无病生存率为41%和55%,两者比较,差异有统计学意义(χ2=6.209,P<0.05)。实验研究结果显示:LncRNA KCNQ1OT1在HepG2、SMCC⁃7721、MHCC⁃97H细胞中的相对表达量分别为1.470±0.042、3.300±0.032、4.040±0.031,在LO2细胞中的相对表达量为1.000±0.022,HepG2、SMCC⁃7721、MHCC⁃97H细胞与LO2细胞比较,差异均有统计学意义(t=17.66,95.40,114.20,P<0.05)。(2)敲低LncRNA KCNQ1OT1基因HepG2、SMCC⁃7721、MHCC⁃97H细胞迁移情况。①转染实验结果显示:敲低LncRNA KCNQ1OT1基因的HepG2、SMCC⁃7721、MHCC⁃97H细胞和其相应阴性对照细胞LncRNA KCNQ1OT1相对表达� 展开更多

关键词 癌 肝细胞 长链非编码rna KCNQ1OT1基因 基因敲除 PI3K/AKT信号通路

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恶性肿瘤中小核仁RNA宿主基因3的表达及作用研究 被引量：2

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作者 关沧海 赵俞乔(综述) +1 位作者 史文广 姜兴明(审校) 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2020年第6期638-643,共6页

越来越多的研究显示长链非编码RNA(lncRNA)在诸多肿瘤的发生发展过程中发挥重要作用。小核仁RNA宿主基因3(SNHG3)是近年新发现的一种lncRNA,其异常高表达与肿瘤患者的整体生存情况及预后密切相关。SNHG3可以通过内源竞争性吸附miRNA、... 越来越多的研究显示长链非编码RNA(lncRNA)在诸多肿瘤的发生发展过程中发挥重要作用。小核仁RNA宿主基因3(SNHG3)是近年新发现的一种lncRNA,其异常高表达与肿瘤患者的整体生存情况及预后密切相关。SNHG3可以通过内源竞争性吸附miRNA、调节细胞周期、介导上皮间质转化以及激活多种信号通路来调控肿瘤的发生发展。因此,对SNHG3促癌机制的深入研究有助于相关肿瘤的早期诊断、靶向治疗和预后评估。文章就SNHG3在乳腺癌、卵巢癌、肾癌、肝癌、胃癌、结肠癌、骨肉瘤以及头颈肿瘤中的表达情况和相关作用机制等最新研究进展进行综述,以其为后续的研究提供参考。 展开更多

关键词 长链非编码rna 小核仁rna宿主基因3 表达 调控作用

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LINC01515通过调控Ki67/p21蛋白的表达影响非小细胞肺癌细胞增殖与凋亡 被引量：2

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作者 黄仲 郑耀宗 +4 位作者 林燕明 李姝君 周金钊 杨志雄 李晓玲 《循证医学》 2020年第5期294-299,共6页

目的研究长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA)LINC01515对非小细胞肺腺癌细胞增殖、凋亡的影响。方法采用qRT⁃PCR法检测4株非小细胞肺腺癌细胞和1株正常支气管上皮细胞LINC01515的表达水平,选择LINC01515表达水平最高的H1975和H... 目的研究长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA)LINC01515对非小细胞肺腺癌细胞增殖、凋亡的影响。方法采用qRT⁃PCR法检测4株非小细胞肺腺癌细胞和1株正常支气管上皮细胞LINC01515的表达水平,选择LINC01515表达水平最高的H1975和H838两株细胞进行后续实验。将siLINC01515转染细胞后,qRT⁃PCR检测转染效率,并用WST法检测各细胞增殖活力,流式细胞术检测细胞凋亡,蛋白质免疫印迹(western blot,WB)法检测细胞中Ki67、p21表达水平。结果在H1975、PC⁃9、H838、H1650和HBE五种细胞系中,H1975和H838细胞LINC01515表达水平最高。与对照组比较,siLINC01515组细胞增殖活力显著降低(P<0.01)、凋亡期细胞比例显著升高(P<0.01),Ki67表达水平显著降低,p21表达水平显著升高(均P<0.01)。结论敲低LINC01515通过抑制细胞增殖相关蛋白及促进凋亡相关蛋白的表达,进而影响非小细胞肺腺癌细胞的增殖和凋亡。 展开更多

关键词 长链非编码rna LINC01515 非小细胞肺癌 细胞增殖 细胞凋亡

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长链非编码RNA对动脉粥样硬化炎性反应的研究进展 被引量：2

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作者 郭宁 秦合伟 《分子诊断与治疗杂志》 2021年第8期1372-1376,共5页

动脉粥样硬化是一种由多种危险因素引起、以高度特异性的细胞因子反应为特征的慢性炎症疾病,可引起心肌梗死、中风和外周动脉疾病等多种血管不良事件。炎性反应在动脉粥样硬化的各个阶段均有显著影响,其中内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细... 动脉粥样硬化是一种由多种危险因素引起、以高度特异性的细胞因子反应为特征的慢性炎症疾病,可引起心肌梗死、中风和外周动脉疾病等多种血管不良事件。炎性反应在动脉粥样硬化的各个阶段均有显著影响,其中内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞参与炎性反应的全过程。近年来,研究发现具有组织特异性的长链非编码RNA在动脉粥样硬化的发生发展中发挥着重要作用,并可参与动脉粥样硬化炎症微环境的调节,但对其具体作用机制仍处于初始阶段。笔者就近几年长链非编码RNA在动脉粥样硬化炎性反应中的作用作一综述,以期为动脉粥样硬化性疾病的防治提供新的干预靶点。 展开更多

关键词 长链非编码rna 动脉粥样硬化 炎症 细胞 微环境

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SMAD5⁃AS1干扰对人食管癌细胞株Eca109增殖的影响及机制 被引量：1

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作者 赵芳 伦淑敏 +2 位作者 高照伟 段丽娟 杨海军 《分子诊断与治疗杂志》 2022年第4期664-668,共5页

目的观察长链非编码核糖核酸(LncRNA)信号传导蛋白Sma和Mad相关蛋白同源物5(SMAD5)反义核糖核酸1(SMAD5⁃AS1)干扰对人食管癌细胞株Eca109增殖的影响,并初步探讨可能的机制。方法取人食管癌细胞株Eca109培养传代,分别转染SMAD5⁃AS1 siRN... 目的观察长链非编码核糖核酸(LncRNA)信号传导蛋白Sma和Mad相关蛋白同源物5(SMAD5)反义核糖核酸1(SMAD5⁃AS1)干扰对人食管癌细胞株Eca109增殖的影响,并初步探讨可能的机制。方法取人食管癌细胞株Eca109培养传代,分别转染SMAD5⁃AS1 siRNA沉默质粒、阴性对照质粒,并记为siRNA⁃1组、siRNA阴性对照组,另取未转染细胞记为对照组,每组设置3个复孔。实时逆转录聚合酶链反应(RT⁃qPCR)检测各组SMAD5⁃AS1、表观遗传诱导LncRNA⁃1(EPIC1)信使核糖核酸(mRNA)表达;细胞计数试剂⁃8(CCK⁃8)法检测各组细胞增殖活性;流式细胞仪检测各组细胞周期分布;RT⁃qPCR检测各组细胞细胞周期D1(cyclinD1)、促凋亡基因(Bad)、抗凋亡基因(Bcl⁃2)mRNA表达;蛋白质免疫印迹法(WB)检测各组细胞cyclinD1、Bad、Bcl⁃2蛋白表达。结果各组细胞SMAD5⁃AS1、EPIC1 mRNA表达水平比较:对照组>siRNA阴性对照组>siRNA⁃1组,差异有统计学意义(P<0.05);各组细胞增殖活性比较:siRNA⁃1组>siRNA阴性对照组>对照组,差异有统计学意义(P<0.05);与对照组和siRNA阴性对照组比较,siRNA⁃1组cyclinD1和Bcl⁃2 mRNA与蛋白表达均下降,差异有统计学意义(P<0.05),G1/S期细胞占比、BadmRNA及蛋白表达均升高,差异有统计学意义(P<0.05),上述指标siRNA阴性对照组和对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论SMAD5⁃AS1干扰可抑制人食管癌细胞株Eca109增殖,将其阻滞于G1/S期,推测与下调EPIC1、cyclinD1及Bcl⁃2表达,上调Bad表达有关。 展开更多

关键词 长链非编码核糖核酸 信号传导蛋白Sma和Mad相关蛋白同源物5反义核糖核酸1 食管癌 增殖

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长链非编码RNA ALMS1⁃IT1通过调控miRNA⁃889⁃3p、ATAD2表达对结直肠癌细胞增殖和迁移的影响

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作者 梅娟娟 曹国军 +3 位作者 贺红成 常剑 张彬 梅洋 《肿瘤研究与临床》 CAS 2021年第11期818-823,共6页

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)ALMS1⁃IT1在结直肠癌组织中的表达及对结直肠癌HT⁃29细胞体外增殖和迁移能力影响的分子机制。方法选取2018年7月至2020年11月湖北六七二中西医结合骨科医院行手术切除并经病理学检查确诊的40例结直肠癌患... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)ALMS1⁃IT1在结直肠癌组织中的表达及对结直肠癌HT⁃29细胞体外增殖和迁移能力影响的分子机制。方法选取2018年7月至2020年11月湖北六七二中西医结合骨科医院行手术切除并经病理学检查确诊的40例结直肠癌患者癌组织标本及癌旁组织(距肿瘤边缘>5 cm)标本。应用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT⁃PCR)检测ALMS1⁃IT1在结直肠癌组织及癌旁组织中的表达水平,以≥中位相对表达量者为ALMS1⁃IT1高表达,分析ALMS1⁃IT1表达与患者临床病理特征的关系。将空载慢病毒和载有ALMS1⁃IT1沉默序列的慢病毒分别感染HT⁃29细胞,分别为对照组和si⁃ALMS1⁃IT1组。采用qRT⁃PCR检测两组HT⁃29细胞中ALMS1⁃IT1表达情况。应用CCK⁃8法和Transwell实验分别检测两组HT⁃29细胞增殖能力和迁移能力。采用starBase v2.0在线数据库预测ALMS1⁃IT1相互作用的分子,采用qRT⁃PCR和蛋白质印迹法检测这些分子的表达情况。结果结直肠癌组织中ALMS1⁃IT1的相对表达量较癌旁组织增加(4.54±0.61比1.19±0.31;t=34.89,P<0.01)。40例患者癌组织中ALMS1⁃IT1中位相对表达量为2.93,ALMS1⁃IT1高表达率为50.0%(20/40)。TNM分期Ⅲ期患者癌组织ALMS1⁃IT1高表达率高于Ⅰ~Ⅱ期者,低分化者高表达率高于高、中分化者,淋巴结转移者高表达率高于无淋巴结转移者(均P<0.01)。si⁃ALMS1⁃IT1组HT⁃29细胞培养第2、3、4、5天的细胞增殖能力(吸光度值)均低于对照组(均P<0.05)。si⁃ALMS1⁃IT1组HT⁃29细胞24 h细胞迁移数较对照组少[(45±7)个比(112±18)个;t=3.45,P<0.05]。基于starBase v2.0在线数据库,预测到ALMS1⁃IT1的靶基因可能为miRNA⁃889⁃3p(miR⁃889⁃3p),miR⁃889⁃3p的靶基因可能为ATAD2。与对照组相比,si⁃ALMS1⁃IT1组HT⁃29细胞中miR⁃889⁃3p相对表达量升高(4.24±0.46比1.01±0.11;t=6.81,P<0.01)。与对照组相比,si⁃ALMS1⁃IT1组ATAD2 mRNA(P<0.01)和� 展开更多

关键词 结直肠肿瘤 长链非编码rna ALMS1⁃IT1 细胞增殖 细胞运动 ATAD2 mirna⁃889⁃3p

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长链非编码RNA的m^(6)A甲基化修饰在多种疾病中的调控作用

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作者 陈欣 刘佳 +1 位作者 秦文 金作林 《中华口腔医学研究杂志（电子版）》 CAS 2022年第1期1-6,共6页

随着高通量测序技术的发展,N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)修饰作为表观遗传学修饰中最具代表性的一种修饰方式,广泛存在于多种生物大分子上,并且充分参与调控各种生物进程。长链非编码RNA(lncRNA)作为生命进程的调控者,参与调节了多种生理... 随着高通量测序技术的发展,N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)修饰作为表观遗传学修饰中最具代表性的一种修饰方式,广泛存在于多种生物大分子上,并且充分参与调控各种生物进程。长链非编码RNA(lncRNA)作为生命进程的调控者,参与调节了多种生理过程及疾病的发展。近期发现,部分lncRNA上存在m^(6)A甲基化修饰,该修饰对lncRNA本身的结构和功能产生影响,从而对多种疾病产生不同的影响。本文就lncRNA的m^(6)A甲基化修饰在多种疾病中的调控作用进行文献回顾,展望lncRNA的m^(6)A修饰在口腔医学领域的应用和研究前景,以期对研究者们提供更好的研究思路。 展开更多

关键词 N^(6)-甲基腺嘌呤 rna甲基化修饰 长链非编码rna

原文传递

lncRNA BCYRN1在结外NK/T细胞淋巴瘤糖酵解激活中的作用及其机制研究

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作者 傅芮莹 刘辛迪 +2 位作者 梁远征 刘雪琳 王亮 《中国癌症防治杂志》 CAS 2022年第4期370-377,共8页

目的探讨长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA)BCYRN1在结外NK/T细胞淋巴瘤(extranodal NK/T⁃cell lymphoma,ENKTCL)糖酵解激活中的作用及其机制。方法收集2010—2021年于首都医科大学附属北京同仁医院诊治的236例ENKTCL患者信息... 目的探讨长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA)BCYRN1在结外NK/T细胞淋巴瘤(extranodal NK/T⁃cell lymphoma,ENKTCL)糖酵解激活中的作用及其机制。方法收集2010—2021年于首都医科大学附属北京同仁医院诊治的236例ENKTCL患者信息,分析空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)与无疾病进展生存(progression⁃free survival,PFS)的相关性;采用qRT⁃PCR检测32例初诊ENKTCL患者组织中的BCYRN1含量并分析其与PFS的相关性。利用质粒转染法构建过表达BCYRN1(OE⁃BCYRN1组)和干扰BCYRN1(shBCYRN1组)的ENKTCL SNK⁃6细胞株,采用Screen Quest^(TM)比色法检测葡萄糖摄取能力,用乳酸检测试剂盒检测乳酸的生成能力;采用qRT⁃PCR和Western blot法检测糖酵解关键分子PKM2、HIF⁃1α、SLC2A1、LDHA和PDK1的表达水平;分别添加蛋白合成抑制剂、溶酶体抑制剂或激活剂后观察BCYRN1对PKM2稳定性的影响。采用RNA pull⁃down和RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验判断BCYRN1与PKM2相互作用的模式。结果236例ENKTCL患者中,高血糖组(FBG>5.6 mmol/L)49例,正常血糖组(FBG≤5.6 mmol/L)187例,高血糖组5年PFS率低于低血糖组(32.1%vs 63.7%,P<0.001);BCYRN1高表达组3年PFS率低于低表达组(26.1%vs 82.5%,P=0.014)。干扰BCYRN1后,ENKTCL SNK⁃6细胞对葡萄糖的摄取量和乳酸生成水平均显著降低(均P<0.05);过表达BCYRN1后,糖酵解关键分子PKM2、HIF⁃1α、SLC2A1、LDHA和PDK1的表达量均显著升高(均P<0.05)。应用蛋白合成抑制剂(放线菌酮)分别处理SNK⁃6细胞3 h和6 h后,OE⁃BCYRN1组中PKM2的降解比例均显著低于OE⁃CTRL组(均P<0.05),而shBCYRN1组中PKM2的降解比例均显著高于shCTRL组(均P<0.05)。经溶酶体抑制剂(Leupeptin)处理后shBCYRN1+Leupeptin组的PKM2降解比例明显下降(P<0.01);经溶酶体激活剂(6⁃Aminonicotinamide,6⁃AN)处理后OE⁃BCYRN1+6⁃AN组的PKM2降解比例显著增加(P<0.001)。RNA pull⁃down和RIP实验显示BCYRN1基因可与PKM2蛋白发生直接相� 展开更多

关键词 结外NK/T⁃细胞淋巴瘤 糖酵解途径 长链非编码rna BCYRN1 PKM2

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