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题名凌云牛心李DNA条形码基因筛选及其亲缘关系分析
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作者
滕峥
杨翠凤
侯宪斌
刘正鲁
冯邦朝
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机构
百色学院农业与食品工程学院
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出处
《中国南方果树》
北大核心
2024年第3期200-205,共6页
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基金
广西重点研发计划项目(桂科AB22080058)
百色市科技支撑计划项目(百科20211804)资助。
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文摘
ITS、mat K及rbc L是植物常用DNA条形码基因(序列)。为筛选适合凌云牛心李的DNA条形码基因,对9份凌云牛心李种质进行ITS、mat K及rbc L序列PCR扩增和序列比对分析。通过序列比对分析,9份凌云牛心李种质ITS序列长度在713~717 bp之间,G+C含量59.33%~60.95%之间,存在27个变异位点;mat K序列长度为935~937 bp之间,G+C含量33.33%~33.55%之间,存在5个变异位点;rbc L序列长度为743 bp,G+C含量在42.20%~43.07%之间,存在3个变异位点。相对于mat K及rbc L序列,ITS序列进化速率较快,存在更为丰富的遗传变异位点,更适宜用来开展凌云牛心李分子鉴定及亲缘关系分析。基于ITS序列构建了9份凌云牛心李、22份其他地区李种质、5份杏种质和5份梅种质的NJ系统进化树,凌云牛心李与其他李种质亲缘关系较近,其中4份凌云牛心李种质与中国宁波的茄皮李及日本的大石早生李聚为一个类群,另5份凌云牛心李种质与中国嘉兴的槜李、中国山东的玉皇李、中国贵州的九阡李聚为一个分支。凌云牛心李作为地方优质李品种,在长期种植过程中产生了较丰富的遗传变异。
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关键词
凌云牛心李
DNA条形码
亲缘关系
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Keywords
lingyun niuxin plum
DNA barcoding
genetic relationship
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分类号
TP3
[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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