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Lims E:一个新的LIM同源域基因的克隆和初步分析 被引量：1
1
作者 程立波 陈洁 +2 位作者 赵沐子 刘庆淮 李建民 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期550-554,共5页
目的:克隆与分析小鼠不同剪切的Lims基因。方法:应用巢式RT-PCR,以小鼠cDNA为模板,扩增Lims基因不同剪切子,构入PinPointTM Xa-1T质粒,测序鉴定。结果:测序表明克隆了新的Lims基因变异剪切体Lims E,该变异剪切体编码区为1164bp,编码387... 目的:克隆与分析小鼠不同剪切的Lims基因。方法:应用巢式RT-PCR,以小鼠cDNA为模板,扩增Lims基因不同剪切子,构入PinPointTM Xa-1T质粒,测序鉴定。结果:测序表明克隆了新的Lims基因变异剪切体Lims E,该变异剪切体编码区为1164bp,编码387个氨基酸。结论:比较基因组学分析显示,成功地克隆了一新的小鼠Lims基因剪切子Lims E,为进一步研究Lims基因在细胞发育中的功能打下了基础。 展开更多
关键词 lims基因 基因表达 基因剪切
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Lims A:一个新的LIM同源域基因的克隆和初步分析
2
作者 陈曦 赵沐子 +1 位作者 李建民 刘庆淮 《国际眼科杂志》 CAS 2009年第6期1036-1040,共5页
目的:克隆与分析大鼠不同剪切的Lims基因。方法:应用巢式RT-PCR,以SD大鼠cDNA为模板,扩增Lims基因不同剪切子,构入PinPointTMXa-1T质粒,测序鉴定。结果:测序表明克隆了新的Lims基因变异剪切体Lims A,该变异剪切体编码区为1014bp,编码33... 目的:克隆与分析大鼠不同剪切的Lims基因。方法:应用巢式RT-PCR,以SD大鼠cDNA为模板,扩增Lims基因不同剪切子,构入PinPointTMXa-1T质粒,测序鉴定。结果:测序表明克隆了新的Lims基因变异剪切体Lims A,该变异剪切体编码区为1014bp,编码338个氨基酸。结论:比较基因组学分析显示,成功地克隆了一新的大鼠Lims基因剪切子Lims A,为进一步探索Lims基因在增生性玻璃体视网膜病变中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 lims基因 基因表达 基因剪切 增生性玻璃体视网膜病变
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新的LIM同源基因Lims E的克隆和初步分析
3
作者 王云 赵沐子 +1 位作者 付鹤玲 李建民 《现代生物医学进展》 CAS 2009年第9期1620-1623,共4页
目的:克隆与分析大鼠不同剪切的Lims基因。方法:应用巢式RT-PCR,以大鼠cDNA为模板,扩增Lims基因不同剪切子,构入PinPointTM Xa-1T质粒,测序鉴定。结果:测序表明克隆了一种新的Lims基因变异剪切体Lims E,编码区为1164bp,编码387个氨基酸... 目的:克隆与分析大鼠不同剪切的Lims基因。方法:应用巢式RT-PCR,以大鼠cDNA为模板,扩增Lims基因不同剪切子,构入PinPointTM Xa-1T质粒,测序鉴定。结果:测序表明克隆了一种新的Lims基因变异剪切体Lims E,编码区为1164bp,编码387个氨基酸。结论:比较基因组学分析显示,成功地克隆了一个新的大鼠Lims基因剪切子Lims E,为进一步研究Lims基因在细胞发育中的功能打下了基础。 展开更多
关键词 lims基因 大鼠 基因变异剪切体
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芹菜AgLIMS基因的克隆和生物信息学分析及其表达特性 被引量：3
4
作者 贾丽丽 尹莲 +4 位作者 刘洁霞 王昊 沈迪 冯凯 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期23-31,共9页
以芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)和‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)为研究对象,分别克隆获得芹菜柠檬烯合酶基因,命名为AgLIMS,其开放阅读框长1800 bp,编码599个氨基酸。结果显示:2个芹菜品... 以芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)和‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)为研究对象,分别克隆获得芹菜柠檬烯合酶基因,命名为AgLIMS,其开放阅读框长1800 bp,编码599个氨基酸。结果显示:2个芹菜品种的AgLIMS基因核苷酸序列存在2个位点的差异,其编码的氨基酸序列也存在2个位点的差异;AgLIMS基因编码的氨基酸序列在第50至第586位存在植物萜类合酶(Terpene cyclase plant C1)保守区域,具有典型的类异戊二烯合成酶(Isoprenoid Biosyn C1)超家族结构域。2个芹菜品种的AgLIMS蛋白的理论相对分子质量分别为69120和69190,理论等电点均为pI 5.52。AgLIMS蛋白的氨基酸序列中,亲水性氨基酸比例高于疏水性氨基酸;其二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲构成,但α螺旋、延伸链和β转角的比例在2个芹菜品种间略有差异;其三级结构均含有1个β折叠,但α螺旋数量在2个芹菜品种间略有差异。AgLIMS基因与多种植物LIMS基因编码的氨基酸序列一致性为61.33%;在系统树上,2个芹菜品种与同科种类的进化关系较近,而与其他科木本种类的进化关系较远。qRT-PCR结果显示:AgLIMS基因在2个芹菜品种的叶片、叶柄和根中均能表达,其相对表达量在叶片中最高、在根中最低,且在不同组织间差异显著;该基因在‘六合黄心芹’不同组织中的相对表达量总体上显著高于‘津南实芹’。在高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(质量体积分数20%PEG6000)和高盐(0.2 mol·L^-1NaCl)条件下,2个芹菜品种AgLIMS基因的相对表达量呈现不同的变化趋势;总体上看,‘津南实芹’AgLIMS基因的相对表达量均不同程度升高,而品种‘六合黄心芹’AgLIMS基因的相对表达量则在高温和干旱条件下显著升高。综合分析结果表明:2个芹菜品种的AgLIMS基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列差异很小;AgLIMS蛋白为中性、亲水性蛋白,其进化具有 展开更多
关键词 芹菜 柠檬烯合酶基因(lims基因) 蛋白质理化特性 非生物胁迫 基因表达特性
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