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基于TaqMan探针的Real-timePCR定量检测空肠弯曲杆菌 被引量:16
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作者 阳成波 蒋原 +1 位作者 黄克和 祝长青 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期183-187,共5页
空肠弯曲杆菌 (Campylobacterjejuni ,C .jijuni)被认为是人类主要食源性病原菌之一。由于空肠弯曲杆菌特殊的生长条件和容易进入不可培养但存活的状态 (Viablebutnonculturable ,VNC) ,所以传统的生化鉴定结果并不一定可靠 ,并且是一... 空肠弯曲杆菌 (Campylobacterjejuni ,C .jijuni)被认为是人类主要食源性病原菌之一。由于空肠弯曲杆菌特殊的生长条件和容易进入不可培养但存活的状态 (Viablebutnonculturable ,VNC) ,所以传统的生化鉴定结果并不一定可靠 ,并且是一项费时而繁琐的工作。核酸检测方法的出现为空肠弯曲杆菌的检测带来了方便。在本文基于LightCycler为平台 ,建立一种基于TaqMan探针的Real_timePCR方法来定量检测空肠弯曲杆菌。用该方法检测时 ,发现所有空肠弯曲杆菌 (11株 )都呈阳性 ,所有其它弯曲菌 (3株 )和其它菌株 (5株 )都是阴性。整个检测过程 6 0min内可以完成 ,检测限度为5CFU ,标准曲线的相关系数为 0 .988。结果表明荧光定量PCR方法既为空肠弯曲杆菌提供了一种特异、敏感、快速和简洁的定量检测方法 ,又为研究空肠弯曲杆菌致病机理提供了一种重要方法。 展开更多
关键词 REAL-TIMEPCR lightcycler TAQMAN探针 定量检测 空肠弯曲杆菌
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Transforming growth factor-β1 gene polymorphisms are associated with progression of liver fibrosis in Caucasians with chronic hepatitis C infection 被引量:14
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作者 HaoWang SenaitMengsteab +5 位作者 CarmenG.Tag Chun-FangGao ClausHellerbrand FrankLammert AxelM.Gressner RalfWeiskirchen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第13期1929-1936,共8页
AIM: Considerable attention is focused on polymorphisms in the gene encoding transforming growth factor-pi (TGF-β1), a multifunctional cytokine that is in turn a potent growth inhibitor involved in wound healing and ... AIM: Considerable attention is focused on polymorphisms in the gene encoding transforming growth factor-pi (TGF-β1), a multifunctional cytokine that is in turn a potent growth inhibitor involved in wound healing and differentiation. In humans, it promotes the pathogenesis of organ fibrosis, atherosclerosis, cancer, autoimmune and inflammatory diseases, keloid disease, and hypertrophic scarring. For this reason, much emphasis has been placed on studies elucidating the impact of TGF-β1 and its gene variations for the susceptibility and pathogenesis of these diseases. Unfortunately, some studies have serious limitations. METHODS: We have recently described a high-throughput method for investigation the Arg25Pro polymorphism of human TGF-β1 gene and showed that the frequency of the Pro25 allele is significantly associated with hepatic fibrogenesis. In this report, we describe two novel LightCyder (LC) techniques that facilitate the examination of the two other known alterations in the coding region of TGF-β1. We investigated whether these polymorphisms contribute to hepatitis-induced progression of fibrogenesis in Chinese and Caucasians. RESULTS: In the Chinese ancestry, the gene polymorphisms at codons 25 and 263 were not found and the genetic variant at codon 10 is unlikely to confer susceptibility to hepatic fibrosis. Contrarily, in Caucasians TGF-β1 allelic variations are more frequent and the presence of prolines either in codon 25 or 10 is associated with the interindividual variability in developing more severe fibrosis during chronic hepatitis C infection. CONCLUSION: In summary, these results confirm the hypothesis that TGF-β1 polymorphisms are associated with fibrosis progression in Caucasians chronically infected with hepatitis C. 展开更多
关键词 TGF-β1 Gene polymorphism lightcycler Viral hepatitis Fibrosis
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荧光定量PCR快速检测炭疽芽孢杆菌的实验研究 被引量:13
3
作者 张玲 翟俊辉 +3 位作者 周冬生 郭兆彪 王津 杨瑞馥 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第11期976-980,共5页
目的利用LightCycler建立一种简便、特异的实时荧光定量PCR检测方法,用于炭疽芽孢杆菌的快速检测。方法采用SYBR GreenⅠ随机掺入法,利用本实验室建立的实时荧光定量PCR反应体系,根据炭疽芽孢杆菌荚膜和水肿因子设计引物,同时检测两个... 目的利用LightCycler建立一种简便、特异的实时荧光定量PCR检测方法,用于炭疽芽孢杆菌的快速检测。方法采用SYBR GreenⅠ随机掺入法,利用本实验室建立的实时荧光定量PCR反应体系,根据炭疽芽孢杆菌荚膜和水肿因子设计引物,同时检测两个毒力相关质粒的存在,检测其灵敏度和特异性,并以盲测试验进行验证;在此基础上鉴定14株炭疽芽孢杆菌,并测试该法检测土壤模拟污染标本的灵敏度,实验中设置内对照以排除假阴性结果的存在。结果炭疽杆菌基因组DNA的检测灵敏度可达每反应体系0.53pg,两个克隆株提取质粒的检测限分别为每反应体系12拷贝、140拷贝;检测14株炭疽芽孢杆菌及29株非炭疽芽孢杆菌的PCR扩增结果表明,炭疽芽孢菌DNA均出现特异的扩增结果,29株对照菌的DNA均为阴性;土壤模拟污染标本检测灵敏度可达每反应体系36个芽孢;20次重复实验结果表明其平均值与标准差为14.602±0.640。结论该方法检测炭疽芽孢杆菌具有简便、快捷、灵敏度高和特异性好的特点,为临床诊断、环境监测、卫生防疫等方面,快速检出炭疽芽孢杆菌提供了有利的手段。 展开更多
关键词 炭疽芽孢杆菌 荧光定量PCR 荚膜因子 水肿因子 lightcycler
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荧光定量PCR快速检测鼠疫耶尔森氏菌的实验研究 被引量:13
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作者 张玲 翟俊辉 +4 位作者 周冬生 郭兆彪 毕玉晶 王津 杨瑞馥 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第3期206-209,共4页
目的 利用LightCycler建立一种简便、特异的荧光定量PCR检测方法 ,用于鼠疫耶尔森氏菌的快速检测。 方法 采用SYBRGreenI随机掺入法 ,以Roche试剂盒为标准 ,比较两公司的DNA聚合酶 ,用鼠疫菌 310 0 4建立荧光PCR反应体系 ;针对鼠疫耶... 目的 利用LightCycler建立一种简便、特异的荧光定量PCR检测方法 ,用于鼠疫耶尔森氏菌的快速检测。 方法 采用SYBRGreenI随机掺入法 ,以Roche试剂盒为标准 ,比较两公司的DNA聚合酶 ,用鼠疫菌 310 0 4建立荧光PCR反应体系 ;针对鼠疫耶尔森氏菌特异的染色体标识序列和质粒上F1抗原基因设计引物 ,检测其灵敏度和特异性 ,以盲测试验进行验证 ;在此基础上鉴定 2 75株鼠疫耶尔森氏菌 ,并测试该法检测脏器污染模拟标本的灵敏度。结果 建立以一个公司试剂为主较低成本的PCR反应体系 ;EV76的检测灵敏度可达每反应体系 1.6个菌 ;检测我国 18个生态型共计 2 75株鼠疫耶尔森氏菌及 2 8株非鼠疫菌株的PCR扩增结果表明 ,鼠疫菌株均出现特异的扩增结果 ,2 8株对照菌株均为阴性 ;肝、脾、肺模拟标本检测灵敏度可达每反应体系 4 0 0 0个菌。结论 该方法对于检测鼠疫耶尔森氏菌具有简便、快捷、高敏感性和特异性的特点 。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森氏菌 荧光定量PCR 标识序列 lightcycler
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Survivin isoforms and clinicopathological characteristics in colorectal adenocarcinomas using real-time qPCR 被引量:9
5
作者 Anastasia Pavlidou Maria Dalamaga +4 位作者 Christos Kroupis George Konstantoudakis Maria Belimezi George Athanasas Kleanthi Dimas 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2011年第12期1614-1621,共8页
AIM:To investigate three isoforms of survivin in colorectal adenocarcinomas.METHODS:We used the LightCycler Technology(Roche),along with a common forward primer and reverse primers specific for the splice variants and... AIM:To investigate three isoforms of survivin in colorectal adenocarcinomas.METHODS:We used the LightCycler Technology(Roche),along with a common forward primer and reverse primers specific for the splice variants and two common hybridization probes labeled with fluorescein and LightCycler-Red fluorophore(LC-Red 640).Real time quantitative polymerase chain reaction(PCR) was performed on cDNAs from 52 tumor specimens from colorectal cancer patients and 10 unrelated normal colorectal tissues.In the patients group,carcinoembryonic antigen(CEA) and CA19-9 tumor markers were also measured immunochemically.RESULTS:Wild type survivin mRNA isoform was expressed in 48%of the 52 tumor samples,survivin-2b in 38%and survivin-ΔΕx3 in 29%,while no expression was found in normal tissues.The mRNA expression of wild type survivin presented a significant correlation with the expression of the ratio of survivin-2b,survivin-ΔΕx3,survivin-2b/wild type survivin and survivin-ΔΕx3/wild type survivin(P<0.001).The mRNA expression of wildsurvivin and survivin-ΔΕx3 was related with tumor size and invasion(P=0.006 and P<0.005,respectively).A significant difference was found between survivin-2b and morphologic cancer type.Also,the ratio of survivin-ΔEx3/ wild-survivin was significantly associated with prognosis.No association was observed between the three isoforms and grade,metastasis,Dukes stage and gender.The three isoforms were not correlated with CEA and CA19-9.CONCLUSION:Survivin isoforms may play a role in cell apoptosis and their quantification could provide information about clinical management of patients suffering from colorectal cancer. 展开更多
关键词 SURVIVIN mRNA isoforms Apoptosis gene Colorectal adenocarcinomas Real time quantitative polymerase chain reaction lightcycler
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罗氏LightCycler Nano荧光定量PCR仪性能评价 被引量:2
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作者 张宇 李冬 +2 位作者 戴燕 郑为超 万海英 《检验医学与临床》 CAS 2015年第2期145-146,共2页
目的对美国罗氏公司LightCycler Nano 32孔荧光定量聚合酶链反应(PCR)仪的主要性能指标进行评价。方法按照美国临床实验室标准化协会(CLSI)制定的评价标准,评价仪器精密度、准确度、灵敏度、可报告范围、仪器间比对等指标。结果LightCyc... 目的对美国罗氏公司LightCycler Nano 32孔荧光定量聚合酶链反应(PCR)仪的主要性能指标进行评价。方法按照美国临床实验室标准化协会(CLSI)制定的评价标准,评价仪器精密度、准确度、灵敏度、可报告范围、仪器间比对等指标。结果LightCycler Nano精密度批内变异系数(CV)为2.63%、1.51%,批间CV为6.2%、4.15%;准确度与室间质控物比较,5个标本均在靶值区间内;灵敏度检测CV≤10%;可报告范围为最大稀释比例1∶100;与比对仪器的比对结果偏差结果均小于15%。结论罗氏LightCycler Nano荧光定量PCR仪5项性能经验证后与厂家提供的性能参数相符,可以用于临床检测。 展开更多
关键词 lightcycler NANO PCR 性能评价 精密度
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罗氏Lightcycler PCR仪离心式控温系统原理及常见故障维修 被引量:2
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作者 王海清 王一 石伍华 《医疗卫生装备》 CAS 2014年第8期153-153,155,共2页
0引言荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是在常规PCR的基础上加入荧光标记探针,把核酸扩增、杂交及光谱技术结合在一起,实现对目的基因的准确定量检测[1]。我院的罗氏Lightcycler荧光定量PCR仪体积小、实验... 0引言荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是在常规PCR的基础上加入荧光标记探针,把核酸扩增、杂交及光谱技术结合在一起,实现对目的基因的准确定量检测[1]。我院的罗氏Lightcycler荧光定量PCR仪体积小、实验成本低,检测通道为3通道,可装32位孔数的20μL的玻璃毛细管,主要用于病毒的测定及疾病诊断等工作。 展开更多
关键词 lightcycler 荧光定量PCR仪 故障维修 控温系统 荧光定量聚合酶链式反应 离心式 荧光标记探针 定量检测
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一种国产乙型肝炎病毒核酸定量检测试剂不同检测平台上的验证情况分析 被引量:7
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作者 李云霞 邬兰 邱樊 《标记免疫分析与临床》 CAS 2017年第3期341-344,360,共5页
目的将圣湘公司乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)在不同荧光定量PCR系统进行性能验证,以给出该试剂盒在不同检测平台上的性能评价。方法依据美国临床和实验室标准化协会(CLSI)颁布的EP系列文件和《医学实验室质量... 目的将圣湘公司乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)在不同荧光定量PCR系统进行性能验证,以给出该试剂盒在不同检测平台上的性能评价。方法依据美国临床和实验室标准化协会(CLSI)颁布的EP系列文件和《医学实验室质量和能力认可准则》相关文件,应用Roche LightCycler~480 II实时荧光定量PCR系统及美国ABI 7500型实时荧光定量PCR系统对圣湘公司乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)进行临床样本精密度、正确度、可报告范围和检测下限的性能验证实验。结果 LightCycler~480 II实时荧光定量PCR系统:2×10~6IU/mL浓度水平批内精密度为1.38%,批间精密度为0.25%;2×10~4IU/mL浓度水平批内精密度为0.35%,批间精密度为0.79%。正确度验证可溯源标准品,偏倚均小于7.5%,符合厂家说明及文件要求。HBV DNA定量结果在2.1×10~2IU/mL至2.1×10~7IU/mL浓度水平范围内线性关系良好(R^2=0.9994),临床可报告范围为2.1×10~2IU/mL^2.1×10~8IU/mL。该系统检测下限为148 IU/mL。ABI 7500型实时荧光定量PCR系统:2×10~6IU/mL浓度水平批内精密度为0.70%,批间精密度为1.34%。2.5×10~4IU/mL浓度水平批内精密度为1.18%,批间精密度为3.01%。正确度验证可溯源标准品,偏倚均小于7.5%,符合厂家说明及文件要求。HBV DNA定量结果在2×10~2IU/mL至2×10~8IU/mL浓度水平范围内线性关系良好(R^2=0.9991),临床可报告范围为2×10~2IU/mL^2×10~9IU/mL。该系统检测下限为203 IU/mL。结论圣湘公司乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)在Roche LightCycler~480 II实时荧光定量PCR系统及美国ABI 7500型实时荧光定量PCR系统上的性能验证结果均符合试剂说明书性能范围,检测结果无明显差异,均可准确快捷的对HBV DNA定量检测,为后续超敏定量工作奠定基础。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒定量检测 实时荧光定量聚合酶链反应 ROCHE lightcycler^(R)480 Ⅱ实时荧光定量PCR仪 ABI 7500型实时荧光定量PCR仪 性能验证
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Light Cycler实时监测PCR定量分析血清HBV DNA 被引量:5
9
作者 杨洁 关宇 +3 位作者 王燕军 杨守昌 侯金林 骆抗先 《热带医学杂志》 CAS 2002年第2期118-120,共3页
目的 检验LightCycler实时监测PCR(real timedetectionPCR ,RTD PCR)对血清中HBVDNA定量检测的灵敏性和可重复性 ,探讨HBV血清标志物与HBVDNA定量的关系。方法 HBV定量按深圳匹基公司乙肝PCR荧光检测试剂盒使用说明 ,对乙肝标志物已... 目的 检验LightCycler实时监测PCR(real timedetectionPCR ,RTD PCR)对血清中HBVDNA定量检测的灵敏性和可重复性 ,探讨HBV血清标志物与HBVDNA定量的关系。方法 HBV定量按深圳匹基公司乙肝PCR荧光检测试剂盒使用说明 ,对乙肝标志物已明确的 773例血清中HBVDNA定量结果进行统计分析。结果 实时监测PCR对血清中HBVDNA定量检测的灵敏性高 ,可检测低至 1 0 0 0拷贝 /ml血清 ;可重复性好 ,批间误差 <2 0 % ;各种标志物类型的血清HBVDNA含量分布情况表明 ,HBV血清标志物中HBeAg与HBVDNA含量有明显的关系 ,一般HBeAg阳性血清HBVDNA含量较高 ,但也有相当一部分例外。结论 LightCycler实时监测PCR对血清中HBVDNA定量检测灵敏性高可重复性好 ;仅根据HBV血清标志物往往不能确定乙肝患者HBVDNA复制水平的高低 ,HBVDNA定量检测具有十分重要的临床意义。 展开更多
关键词 lightcycler实时监测PCR 乙型肝炎病毒 聚合酶链反应 荧光定量 血清标志物 乙型肝炎
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实时定量检测乙肝患者HBV DNA及其与抗原抗体模式的关系 被引量:3
10
作者 夏伟 傅雷 +1 位作者 王书奎 王自正 《中国实验诊断学》 2004年第1期58-60,共3页
目的 探讨乙肝患者血清HBVDNA定量检测的临床意义及与乙肝抗原抗体模式的关系。方法 用Light CyclerTM对 315例乙肝初诊患者进行HBVDNA定量检测 ,同时定量测定乙肝表面抗原、表面抗体 ,e抗原、e抗体和核心抗体等指标 ,观察患者血清中... 目的 探讨乙肝患者血清HBVDNA定量检测的临床意义及与乙肝抗原抗体模式的关系。方法 用Light CyclerTM对 315例乙肝初诊患者进行HBVDNA定量检测 ,同时定量测定乙肝表面抗原、表面抗体 ,e抗原、e抗体和核心抗体等指标 ,观察患者血清中乙肝病毒基因组含量与抗原抗体表型组合的关系。结果 在 16 9例患者血清中检测出HBVDNA ,病毒基因组拷贝值范围为 3 77× 10 2 ~ 3 12× 10 8copies ml,平均拷贝值为 3 6 7× 10 6 copies ml,阳性检出率为 5 3 6 % ;在大多数e抗原阳性的患者血清中均能检测到较高拷贝水平的病毒基因组含量 ;而在e抗原阴性患者中仍有 35 4 %可检测出HBVDNA。结论 LightCyclerTM是测定乙肝病人血清中HBVDNA含量较精确的方法之一 ,能够正确反映乙肝病毒的复制水平和活跃程度 ;乙肝特异性血清学检测结合HBVDNA定量检测分别从蛋白水平和DNA水平反映患者体内病毒的存在状态及机体的反应性 ,对临床诊断、估计病情及用药方案的选择有重要的指导意义。 展开更多
关键词 定量检测 乙肝 HBV DNA 抗原 抗体 血清 病毒感染
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LightCycler^(TM)全自动实时荧光定量PCR诊断系统原理分析 被引量:1
11
作者 刘刚 穆雪华 侯红卫 《医疗装备》 2008年第8期14-16,共3页
聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)技术自1989年应用于临床检验以来,以其快速、简便、灵敏等优点很快地成为临床实验诊断学的一个技术热点。2000年6月瑞士罗氏公司生产的LightCyclerTM全自动荧光定量PCR系统通过国家药品监... 聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)技术自1989年应用于临床检验以来,以其快速、简便、灵敏等优点很快地成为临床实验诊断学的一个技术热点。2000年6月瑞士罗氏公司生产的LightCyclerTM全自动荧光定量PCR系统通过国家药品监督管理局医疗器械产品准入审查,医疗器械注册证号:SDA(I)20000755。目前,已广泛用于涉及到核酸的科学研究以及临床疾病的诊断和治疗监测。 展开更多
关键词 PCR 实时荧光定量 原理
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LightCycler480实时荧光定量PCR仪在献血者血液筛查中的应用
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作者 孙秋影 卢长春 +1 位作者 魏强 庞淑芬 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期174-175,共2页
关键词 血液筛查 lightcycler480 实时荧光定量 核酸检测 核酸扩增 上海科华 窗口期 核酸提取 试剂盒 病毒检测
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LightCycler~ 480实时荧光定量PCR仪在献血者血液筛查中的应用
13
作者 孙秋影 卢长春 +1 位作者 魏强 庞淑芬 《哈尔滨医药》 2010年第1期44-44,共1页
关键词 荧光定量PCR仪 lightcycler 血液筛查 应用 献血者 输血相关传染病 输血安全性 直接检测
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EGFR基因突变与EGFR酪氨酸激酶抑制剂近期疗效的关系 被引量:4
14
作者 郭健 周彩存 +1 位作者 张颉 唐亮 《中国肺癌杂志》 CAS 2007年第6期504-507,共4页
背景与目的多项研究证实表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变与EGFR酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的疗效存在相关性。本研究应用荧光定量PCR技术检测晚期肺癌的EGFR基因突变,分析其与EGFR... 背景与目的多项研究证实表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变与EGFR酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的疗效存在相关性。本研究应用荧光定量PCR技术检测晚期肺癌的EGFR基因突变,分析其与EGFRTKI药物Gefitinib二线治疗晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的近期疗效之间的关系。方法从63例血浆和胸腔积液标本(其中血浆53例,胸腔积液10例)中提取游离DNA,应用荧光定量PCR技术进行EGFR18、19、21外显子基因的检测,并结合临床进行分析。结果在63例血浆和胸腔积液标本中检测到EGFR基因突变17例,突变率为27.0%。EGFR基因突变主要见于女性及非吸烟人群(P<0.05)。存在EGFR基因突变的患者Gefitinib二线治疗的疗效明显优于野生型患者(P<0.01)。结论晚期NSCLC患者的血浆、胸腔积液游离DNA中存在EGFR基因突变,这类突变可以通过荧光定量PCR技术检测出来。EGFR基因突变患者对Gefitinib的反应率明显高于野生型患者,检测胸腔积液和/或血浆EGFR基因突变有助于选择有效患者接受EGFRTKI治疗。 展开更多
关键词 肺肿瘤 血浆 胸腔积液 表皮生长因子受体 突变 荧光定量PCR
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《实时定量PCR方法与应用——遗传与肿瘤学卷》
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作者 Dietmaier.W. Wittwer,C., +1 位作者 Sivasubramanian,N. 丁华文 《国外医学情报》 2003年第6期48-48,共1页
关键词 实时定量聚合酶链反应 遗传 肿瘤 lightcycler系统
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