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环介导等温扩增核酸技术及其应用 被引量:45
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作者 匡燕云 李思光 罗玉萍 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期557-560,共4页
环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,简称LAMP)是利用4个特殊设计的引物和具有链置换活性的DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA的新技术。该技术在1h内能扩增出109靶序列拷贝,扩增产物是一系列反向... 环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,简称LAMP)是利用4个特殊设计的引物和具有链置换活性的DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA的新技术。该技术在1h内能扩增出109靶序列拷贝,扩增产物是一系列反向重复的靶序列构成的茎环结构和多环花椰菜样结构的DNA片段的混合物,电泳后在凝胶上显现出由不同大小的区带组成的阶梯式图谱。LAMP技术以其特异性强、灵敏度高、快速、准确和操作简便等优点在核酸的科学研究、疾病的诊断和转基因食品检测等领域得到了日益广泛的应用。 展开更多
关键词 等温扩增 核酸 链置换反应 内引物 外引物
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桶装水中铜绿假单胞菌检测方法的比较 被引量:40
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作者 张淑红 吴清平 +3 位作者 徐晓可 张菊梅 潘宝怡 彭飞艇 《现代食品科技》 EI CAS 2011年第11期1403-1405,1335,共4页
分别采用传统国标GB/T 8538-2008方法、基于OprL基因的PCR方法和环介导等温扩增(LAMP)方法检测桶装水中的铜绿假单胞菌,比较三种方法的检测效果。结果显示,采集的46份市场水样中,用传统GB8538-2008方法检出了3份阳性样品,检出率为6.5%,... 分别采用传统国标GB/T 8538-2008方法、基于OprL基因的PCR方法和环介导等温扩增(LAMP)方法检测桶装水中的铜绿假单胞菌,比较三种方法的检测效果。结果显示,采集的46份市场水样中,用传统GB8538-2008方法检出了3份阳性样品,检出率为6.5%,检测时间至少2天;而PCR和LAMP方法都检出4份阳性样品,检出率为8.7%,并且可在24 h内报告结果。PCR和LAMP方法与传统方法相比具有快速灵敏等优点,可用于大批量水样的快速检测和结果初筛。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 传统方法 PCR lamp
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环介导等温扩增技术快速检测沙门菌 被引量:34
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作者 朱胜梅 吴佳佳 +3 位作者 徐驰 屈炯 成炜 陈福生 《现代食品科技》 EI CAS 2008年第7期725-730,共6页
环介导等温扩增(1oop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种在等温条件下高特异、高效、快速地扩增靶序列的DNA扩增新技术。以沙门菌(Salmonellaspp.)为研究对象,根据其特异性的invA基因,设计了一套特异性引物对该基因进行了L... 环介导等温扩增(1oop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种在等温条件下高特异、高效、快速地扩增靶序列的DNA扩增新技术。以沙门菌(Salmonellaspp.)为研究对象,根据其特异性的invA基因,设计了一套特异性引物对该基因进行了LAMP,同时优化了其反应条件,建立了沙门菌的LAMP快速检测技术。结果表明,LAMP的最佳反应条件为外引物浓度5pmol/L、内引物浓度40pmol/L,Mg2+浓度6mmol/L,dNTP浓度0.8mmol/L,甜菜碱浓度0.8mmol/L,BstDNA聚合酶8U,反应温度63℃,反应时间1h。在此条件下,LAMP检测沙门菌DNA的敏感度达10fg/反应,且与其他常见的细菌无交叉反应。其对牛奶样品的检出量为102cfu/mL,适合于食品中污染沙门菌的快速检测。 展开更多
关键词 环介导等温DNA扩增 lamp 沙门菌 快速检测
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三重LAMP法检测食品中沙门氏菌、单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌 被引量:35
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作者 姜侃 吕沁风 +3 位作者 汪新 夏琳 张峥 陈小珍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第24期182-187,共6页
为能一步快速检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌3种食源性致病菌,建立了三重环介导等温扩增(LAMP)检测方法。针对沙门氏菌的侵袭蛋白(invA)基因、金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶(nuc)基因、单增李斯特菌(hly)基因3个高度保守的基... 为能一步快速检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌3种食源性致病菌,建立了三重环介导等温扩增(LAMP)检测方法。针对沙门氏菌的侵袭蛋白(invA)基因、金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶(nuc)基因、单增李斯特菌(hly)基因3个高度保守的基因,设计出3套LAMP引物。以8株代表目标菌株,三重LAMP反应体系中Mg2+浓度4.6mmol/L、扩增温度61℃。通过电泳检测、离心观察沉淀和荧光检测证明该方法能够在90min内一次性检出以上3种致病菌。3种菌的检测灵敏度均约为10fg/μL,是PCR检测灵敏度(10pg/μL)的1000倍。以无害李斯特菌等常见的20株非目标菌株为对照,证明了此方法的特异性。LAMP产物DNA测序结果与预期一致,证明了该方法的正确性。该三重LAMP检测方法具有快速、特异、灵敏度高的优点,适用于食品中沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌的快速检测。 展开更多
关键词 lamp 沙门氏菌 金黄色葡萄球菌 单增李斯特菌 快速检测
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非洲猪瘟病毒环介导等温扩增快速检测方法的建立 被引量:34
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作者 江彦增 朱鸿飞 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第2期72-74,共3页
本试验利用环介导等温扩增技术(LAMP)建立了一种快速高效检测非洲猪瘟病毒的方法。整个反应在水浴锅中恒温进行,不需要其他昂贵仪器,30 min即可得到阳性结果,灵敏度是OIE标准PCR方法的100倍,并且与其他常见猪DNA病毒无交叉反应。该方法... 本试验利用环介导等温扩增技术(LAMP)建立了一种快速高效检测非洲猪瘟病毒的方法。整个反应在水浴锅中恒温进行,不需要其他昂贵仪器,30 min即可得到阳性结果,灵敏度是OIE标准PCR方法的100倍,并且与其他常见猪DNA病毒无交叉反应。该方法非常适合在野外现场或缺乏试验条件的边远地区检测非洲猪瘟病毒。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 环介导等温扩增
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一种新的高效快速核酸恒温扩增方法——LAMP法 被引量:26
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作者 吴阳升 罗淑萍 《生物技术》 CAS CSCD 2004年第4期76-78,共3页
介绍一种新式恒温核酸扩增方法LAMP(Loop -MediatedIsothermalAmplification)法 ,其原理是采用四条特异引物及一种具有链置换活性的DNA聚合酶 ,在 6 5℃左右对核酸进行扩增。短时间扩增效率可达到 10 9- 10 1 0 个拷贝。LAMP法具有高特... 介绍一种新式恒温核酸扩增方法LAMP(Loop -MediatedIsothermalAmplification)法 ,其原理是采用四条特异引物及一种具有链置换活性的DNA聚合酶 ,在 6 5℃左右对核酸进行扩增。短时间扩增效率可达到 10 9- 10 1 0 个拷贝。LAMP法具有高特异性、高效性、快速、廉价、易检测等特点。预计在临床诊断。 展开更多
关键词 lamp 恒温扩增 DNA聚合酶
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改良环介导等温扩增技术快速检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌 被引量:29
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作者 胡连霞 张伟 +5 位作者 张先舟 袁耀武 张蕴哲 张会彦 马晓燕 苏旭东 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期378-382,共5页
【目的】采用改良环介导等温扩增(LAMP)技术,快速检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌。【方法】以阪崎肠杆菌(ATCC29544)的16S-23SrRNA间区序列作为靶序列,设计内、外引物和环引物,通过肉眼观察白色沉淀,判断检测结果。【结果】LAMP检测阪... 【目的】采用改良环介导等温扩增(LAMP)技术,快速检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌。【方法】以阪崎肠杆菌(ATCC29544)的16S-23SrRNA间区序列作为靶序列,设计内、外引物和环引物,通过肉眼观察白色沉淀,判断检测结果。【结果】LAMP检测阪崎肠杆菌的灵敏度为0.101CFU/mL,人工污染阪崎肠杆菌的婴儿配方奶粉的检出限为1.1CFU/g。采用试剂盒提取DNA,从样品处理到报告结果,耗时1h。而对照,PCR检测阪崎肠杆菌的灵敏度为101CFU/mL,人工污染阪崎肠杆菌的婴儿配方奶粉的检出限为1100CFU/g。采用同样方法提取DNA,从样品处理到报告结果,耗时3h。【结论】因此,LAMP检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌灵敏度高,耗时短,方法简便。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 lamp 检测 阪崎肠杆菌 婴儿配方奶粉
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柑橘黄龙病LAMP快速检测方法的建立及应用 被引量:31
8
作者 黄丽 苏华楠 +3 位作者 唐科志 黄爱军 周常勇 李中安 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1121-1126,I0003,共7页
【目的】为了建立柑橘黄龙病菌亚洲种LAMP快速检测方法。【方法】根据黄龙病菌亚洲种外膜蛋白基因,在种属特异保守区域的6个位点设计2对特异性引物,对反应条件和体系进行优化,并通过产物沉淀观察和SYBRGreen I荧光染料显色的方法来快速... 【目的】为了建立柑橘黄龙病菌亚洲种LAMP快速检测方法。【方法】根据黄龙病菌亚洲种外膜蛋白基因,在种属特异保守区域的6个位点设计2对特异性引物,对反应条件和体系进行优化,并通过产物沉淀观察和SYBRGreen I荧光染料显色的方法来快速判读检测结果。同时对田间样品进行了特异性和灵敏度分析试验。【结果】该方法仅需63℃反应70 min即可得到结果,特异性强,灵敏度高。对柑橘常见病害样品进行LAMP扩增,仅HLB阳性样品扩增产物电泳呈特征性梯状条带。检测灵敏度比常规PCR高100倍,与实时定量PCR相当。在对105份黄龙病田间疑似样品检测中,LAMP阳性检出率为52.4%,常规PCR为37.1%,2种检测方法符合率为84.7%。【结论】建立的黄龙病菌亚洲种LAMP检测方法,快速简便、特异性强、灵敏度高,为快速检测柑橘黄龙病提供了新方法和新思路。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病菌亚洲种 外膜蛋白基因 环介导等温扩增技术
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猪细小病毒LAMP检测方法的建立 被引量:27
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作者 刘业兵 张磊 +2 位作者 宁宜宝 王琴 范学政 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第14期3012-3018,共7页
【目的】建立一种快速、敏感、特异的检测猪细小病毒(PPV)环介导等温扩增(LAMP)方法,为诊断猪细小病毒提供准确可靠工具。【方法】根据GenBank公布的PPV序列,在其保守序列区域设计了多套LAMP引物,利用LAMP Real Time Turbidimeter LA-32... 【目的】建立一种快速、敏感、特异的检测猪细小病毒(PPV)环介导等温扩增(LAMP)方法,为诊断猪细小病毒提供准确可靠工具。【方法】根据GenBank公布的PPV序列,在其保守序列区域设计了多套LAMP引物,利用LAMP Real Time Turbidimeter LA-320仪监测反应进程并筛选最佳引物、反应条件,建立了对PPV病毒DNA进行特异扩增的LAMP检测方法,并可通过加入SYBR Green I肉眼判断结果。【结果】该方法在63℃恒温下作用45min,PPV病毒DNA获得了高效率的特异性扩增;其检出限量为0.23TCID50,敏感性高;在反应结束后加入SYBR Green I肉眼判断结果,与Real Time Turbidimeter LA-320仪监测结果一致。通过对20份临床样品的LAMP检测与免疫荧光鉴定、PCR方法比对,符合率均为20/20。【结论】本研究建立的PPV LAMP检测方法具有快速、特异、灵敏,操作简单、设备要求低的特点,适合用于临床PPV快速检测。 展开更多
关键词 猪细小病毒 lamp 检测方法
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动物布鲁氏菌病快速诊断方法研究进展 被引量:24
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作者 吴彤 王慧煜 +3 位作者 吴绍亮 崔金磊 杨晓野 吴绍强 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期746-750,759,共6页
布鲁氏菌病是一种流行范围广、危害严重的人畜共患传染病。近年来,布鲁氏菌病的人畜疫情在国内外均出现回升势头,严重影响了流行地区的养殖产业发展,并引发严重的公共卫生问题。因此,该病的快速准确检测能为预防、治疗提供早期、有效的... 布鲁氏菌病是一种流行范围广、危害严重的人畜共患传染病。近年来,布鲁氏菌病的人畜疫情在国内外均出现回升势头,严重影响了流行地区的养殖产业发展,并引发严重的公共卫生问题。因此,该病的快速准确检测能为预防、治疗提供早期、有效的疫病信息。鉴于布鲁氏菌病危害的严重性,建立快速有效的检测方法是十分必要的,是布鲁氏菌病早期诊断和疾病控制的关键。本文将对多重PCR、实时定量荧光PCR、LAMP等分子生物学检测方法以及ELISA、胶体金试纸条等免疫学检测方法两个方面对布鲁氏菌病快速检测方法的研究进展进行综述。其中LAMP方法和胶体金免疫层析法对布病的检测更加适合在基层的推广和使用,并且免疫层析技术正朝着定量、高灵敏度、多标记检测等方向发展。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 多重PCR 荧光PCR 环介导等温扩增反应 酶联免疫吸附试验 胶体金试纸条 诊断
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利用环介导等温扩增技术对沙门氏菌进行检测 被引量:22
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作者 张宏伟 叶露萌 +4 位作者 彭杨思 赵玉龙 赵良娟 郑文杰 刘寅 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2009年第5期115-118,共4页
提出食品中沙门菌的环介导等温扩增技术(LAMP)检测方法。针对沙门菌特异性基因invA,设计了4条沙门菌LAMP检测特异性引物,建立食品中沙门菌LAMP检测方法。用16个血清型45株沙门菌,58株近源菌验证试验表明,所建立的LAMP方法准确且灵敏度... 提出食品中沙门菌的环介导等温扩增技术(LAMP)检测方法。针对沙门菌特异性基因invA,设计了4条沙门菌LAMP检测特异性引物,建立食品中沙门菌LAMP检测方法。用16个血清型45株沙门菌,58株近源菌验证试验表明,所建立的LAMP方法准确且灵敏度高。加菌试验表明,食品样品中沙门菌检测低限为1.5CFU/100g;新建的LAMP方法与FDABAM方法比较试验表明,二种方法的检测结果完全符合。本方法特异性好、灵敏度高、与传统方法相比可节省大量时间且对实验仪器和操作人员的要求低,非常适于在实际工作推广。 展开更多
关键词 沙门菌 lamp invA
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鹅星状病毒LAMP快速检测方法的建立与应用 被引量:21
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作者 张玉霞 杨金兴 +3 位作者 孟凯 蔡李萌 袁小远 王友令 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1137-1140,共4页
鹅星状病毒是一种新发的可导致雏鹅以痛风为主要特征的传染性病原。为建立鹅星状病毒(AstV)的快速检测方法,本研究根据鹅Ast V ORF1b基因的保守序列设计了一组特异性的LAMP引物,建立鹅AstV的LAMP快速检测方法,并检测其特异性和灵敏度。... 鹅星状病毒是一种新发的可导致雏鹅以痛风为主要特征的传染性病原。为建立鹅星状病毒(AstV)的快速检测方法,本研究根据鹅Ast V ORF1b基因的保守序列设计了一组特异性的LAMP引物,建立鹅AstV的LAMP快速检测方法,并检测其特异性和灵敏度。结果显示:建立的LAMP方法的最佳反应温度为64℃;仅能扩增鹅Ast V,而对鹅细小病毒、鹅副黏病毒、鸭坦布苏病毒及鹅源H9N2亚型禽流感病毒均不能扩增;能够检测到的最低模板(cDNA)浓度为1 ng/μL,因此该方法具有较好的特异性和敏感性。临床样品检测结果显示:建立的LAMP方法与RT-PCR方法阳性符合率为95.65%。综上,本研究建立的LAMP方法能够特异、快速地检测新发鹅Ast V,为养殖基地、科研和检验检疫部门提供了一种快速检测该病原的技术手段。 展开更多
关键词 鹅星状病毒 lamp 快速检测 RT-PCR
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植物青枯菌LAMP检测方法的建立 被引量:22
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作者 黄雯 徐进 +3 位作者 张昊 许景升 丁伟 冯洁 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2093-2102,共10页
【目的】由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum,简称青枯菌)引起的青枯病(bacterial wilt of plants)是世界范围内危害最为严重的土传细菌病害之一,严重制约了多种经济作物的生产。建立高效、精准的早期诊断技术,是实现青枯病有效防... 【目的】由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum,简称青枯菌)引起的青枯病(bacterial wilt of plants)是世界范围内危害最为严重的土传细菌病害之一,严重制约了多种经济作物的生产。建立高效、精准的早期诊断技术,是实现青枯病有效防控的基础。论文旨在建立一种能够特异检测青枯菌的环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),实现青枯菌的田间快速检测。【方法】通过比对分析青枯菌的lpx C基因序列,并利用在线引物设计软件Primer Explorer Version 4.0得到4条LAMP特异性引物,F3(5′-CCTGTACGTGGTCGGCTAT-3′)、B3(5′-ACCGCAACACGGGATCA-3′)、FIP(5′-TACGCCGTTTCATCGGCCAGGTACACGGCGCACAAGT-3′)、BIP(5′-ATCGTCACGTTCGACAAGGTGGAATGCCGGCTGCAACTG-3′)。通过单因素变化试验对LAMP反应体系中的各参数进行优化,设置反应温度为60、61、62、63、64、65℃,设置镁离子浓度为2、4、6、8、10、12 mmol·L-1,设置内外引物浓度比为2﹕1、4﹕1、6﹕1、8﹕1、10﹕1、12﹕1,确定最优反应体系。以分离自不同寄主的24个青枯菌株为参试对象,5个非青枯菌株(Ralstonia mannitolilytica、Ralstonia pickettii、Enterobacter sp.、Acidovorax citrulli、Burkhoderia cepacia)为对照,验证LAMP检测方法的特异性。将青枯菌GMI1000菌株的基因组DNA进行10倍梯度系列稀释,以原液和10~1、10~2、10~3、10~4、10~5、10~6、10~7倍的稀释液为模板同步进行LAMP和普通PCR检测,比较两者的检测灵敏度。将马铃薯青枯病菌株Po41、姜青枯病菌株Z-Aq-1分别与马铃薯块茎和生姜根茎组织悬浮液混合,以LAMP检测方法对混合物进行检测,并以同样方法对表现典型萎蔫症状的人工接种番茄植株和健康植株以及田间马铃薯罹病块茎样品进行检测。反应结果直接通过观察产生的白色焦磷酸镁沉淀情况进行判定,或通过加入1μL SYBR GreenⅠ荧光染料进行观察,阳性样品为绿色,阴性样品为橙色。� 展开更多
关键词 青枯菌 检测 环介导等温扩增
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亚洲Ⅰ型口蹄疫病毒环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立 被引量:18
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作者 吴绍强 孙晓智 +4 位作者 林祥梅 刘建 韩雪清 贾广乐 梅琳 《检验检疫科学》 2008年第1期9-12,共4页
以灭活的亚洲Ⅰ型口蹄疫细胞培养病毒为材料,通过在病毒基因组的3D区域设计3对引物,建立口蹄疫病毒的RT-LAMP检测方法,对反应体系中的MgSO4、Betaine、Bst DNA PoLymerase、dNTP、ThermoScriptTM Rnase H-Reverse Transcriptase、3对引... 以灭活的亚洲Ⅰ型口蹄疫细胞培养病毒为材料,通过在病毒基因组的3D区域设计3对引物,建立口蹄疫病毒的RT-LAMP检测方法,对反应体系中的MgSO4、Betaine、Bst DNA PoLymerase、dNTP、ThermoScriptTM Rnase H-Reverse Transcriptase、3对引物等成分以及反应条件(反应温度)分别进行优化,并进行敏感性和特异性确定。建立了亚洲Ⅰ型口蹄疫病毒的RT-LAMP检测方法,可以采用琼脂糖凝胶电泳、颜色变化、生成的沉淀等现象或者直接采用荧光PCR仪判定反应结果,为口蹄疫的现场快速检测提供了一种更加简便快速的方法,可以满足现场检疫的需要。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 环介导等温扩增反应 lamp 检测
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快速检测日本血吸虫感染性钉螺LAMP试剂盒的建立及应用 被引量:19
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作者 余传信 殷旭仁 +5 位作者 王玠 宋丽君 钱春艳 吴锋 何伟 张伟 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2011年第2期121-124,共4页
目的构建快速检测日本血吸虫感染性钉螺环介导同温DNA扩增(LAMP)试剂盒,用于血吸虫病流行区感染性钉螺调查。方法采用碱裂解法制备钉螺基因组DNA样品,以缩短检测过程中样品DNA制备时间;对LAMP试剂进行组合优化,采用染料显色方法判定LAM... 目的构建快速检测日本血吸虫感染性钉螺环介导同温DNA扩增(LAMP)试剂盒,用于血吸虫病流行区感染性钉螺调查。方法采用碱裂解法制备钉螺基因组DNA样品,以缩短检测过程中样品DNA制备时间;对LAMP试剂进行组合优化,采用染料显色方法判定LAMP结果,以减少LAMP检测的操作步骤,避免污染,减少假阳性结果产生;建立批量检测钉螺的LAMP方法,以适用于血吸虫病防治现场大规模钉螺筛查与有感染性钉螺地块的调查。将以上优化技术及试剂整合成快速检测日本血吸虫感染性钉螺LAMP试剂盒。结果制备的日本血吸虫感染性钉螺LAMP检测试剂盒可用于血吸虫流行区现场钉螺快速检测,检测时间可由原来的6h缩短为2h,方法的灵敏性与常规LAMP法相似。该试剂盒能检测出感染后1周钉螺,能对现场钉螺进行大批量检测。结论建立的LAMP试剂盒用于日本血吸虫感染性钉螺检测快速、特异、操作简便,适用于日本血吸虫病流行区感染性钉螺调查。 展开更多
关键词 血吸虫 日本 感染性钉螺 lamp 检测试剂盒
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植物罹病组织中象耳豆根结线虫的LAMP快速检测方法 被引量:20
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作者 何旭峰 彭焕 +3 位作者 丁中 贺文婷 黄文坤 彭德良 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期534-544,共11页
【目的】建立一种基于环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术,从植物罹病组织中直接检测象耳豆根结线虫(Meloidogyne enterolobii)的快速检测方法,为象耳豆根结线虫的监测和防治提供技术支持。【方法】根据... 【目的】建立一种基于环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术,从植物罹病组织中直接检测象耳豆根结线虫(Meloidogyne enterolobii)的快速检测方法,为象耳豆根结线虫的监测和防治提供技术支持。【方法】根据象耳豆根结线虫与其它根结线虫ITS序列差异设计LAMP特异性引物,通过对LAMP反应条件中的Mg2+、dNTPs、甜菜碱和反应时间进行优化,同时对检测体系的特异性和灵敏度进行验证,建立一种从罹病植物组织中检测象耳豆根结线虫的LAMP快速检测方法。【结果】象耳豆根结线虫LAMP检测体系优化结果表明在Mg2+的浓度为5.0 mmol·L-1、dNTPs的浓度为2.4 mmol·L-1、不添加甜菜碱、反应时间为45 min的条件下,扩增效率最优。本研究建立的LAMP检测方法能够从11个植物线虫种群中特异检测出象耳豆根结线虫,检测灵敏度为1/200000头线虫DNA,比普通PCR灵敏100倍,能够直接从植物根结中检测出象耳豆根结线虫,准确度为100%。【结论】本研究以rDNA-ITS序列为靶基因建立象耳豆根结线虫LAMP快速分子检测方法,具有特异性强、灵敏度高、简单、快速、经济等特征,能够从罹病植物组织中快速准确地检测出象耳豆根结线虫,具有极高的实践应用价值。 展开更多
关键词 象耳豆根结线虫 环介导恒温扩增 特异性 灵敏度 快速检测
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荧光定量PCR与LAMP检测IHHNV的特异性和灵敏性比较 被引量:18
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作者 赵哲 任春华 +3 位作者 江晓 张吕平 冯娟 胡超群 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期984-989,共6页
传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失。研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它... 传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失。研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它们的特异性和灵敏性进行了比较。结果显示,所建立的荧光定量PCR检测IHHNV的方法最低检测限度为6个DNA拷贝/反应,在待扩增DNA浓度为6.038×104-6.038×109cps/mL范围时,模板浓度与循环阈值Ct之间的相关性良好,决定系数r2为0.99521;对5份白斑综合症病毒基因组DNA和10份健康对虾基因组DNA样品进行荧光定量PCR检测,结果都为阴性;这说明荧光定量PCR检测IHHNV方法具有灵敏度高、特异性高和精确性高等优点。同样,所建立的LAMP检测IHHNV的方法在60min反应时间内也可检测到最低为6个拷贝的DNA模板,反应产物加入荧光染料SYBR Green I后反应液呈现明显的亮绿色,且特异的检测IHHNV DNA模板;这说明所建立的LAMP检测IHHNV的方法具有荧光定量PCR方法相当的灵敏度、特异性和精确性。考虑到LAMP检测方法操作更为简单、方便,而且不需要昂贵的仪器,LAMP检测IHHNV的方法更适合于对虾养殖现场检测的推广使用。 展开更多
关键词 荧光定量PCR lamp IHHNV 特异性 灵敏度
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四种诱集源对棉铃虫成虫的诱杀效果及有效半径比较 被引量:14
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作者 魏国树 张青文 周明牂 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期157-162,共6页
研究了高压汞灯、双波灯、性诱剂和杨树枝把四种诱集源对棉铃虫(Helicoverpa armigera)的诱杀效果及有效半径。结果表明:四者均具有较明显的诱杀作用,其各自的诱杀效果有差异,并与棉铃虫种群数量有关,发生量大的世代或年份,效果较好,反... 研究了高压汞灯、双波灯、性诱剂和杨树枝把四种诱集源对棉铃虫(Helicoverpa armigera)的诱杀效果及有效半径。结果表明:四者均具有较明显的诱杀作用,其各自的诱杀效果有差异,并与棉铃虫种群数量有关,发生量大的世代或年份,效果较好,反之不明显或较差。综合比较各处理的诱蛾量、百株卵量、幼虫量及其活动态天敌量,发现其诱杀效果的优劣次序为高压汞灯、双波灯、性诱剂、杨树枝把;2种灯的有效诱杀半径约为80~160m,性诱剂约30m,杨树枝把约在10m内,该范围内高压汞灯、双波灯区内的百株卵量比对照分别降低31.7%~33.8%、40.1%~41.5%,性诱剂降低10.7%~21.5%,杨树枝把降低4.8%~14.6%。 展开更多
关键词 棉铃虫 灯光 性诱剂 杨树枝把 诱杀效果 诱杀半径
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环介导等温扩增(LAMP)技术检测沙门菌属方法的建立 被引量:18
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作者 欧新华 张如胜 +2 位作者 宋克云 苏良 魏泉德 《实用预防医学》 CAS 2008年第6期1945-1947,共3页
建立一种检测沙门菌属快速敏感的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。针对沙门菌属侵袭蛋白(invA)基因序列的六个区域设计四条LAMP引物,65℃保温约60min,完成对沙门菌属的扩增,扩增产物经电泳和酶... 建立一种检测沙门菌属快速敏感的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。针对沙门菌属侵袭蛋白(invA)基因序列的六个区域设计四条LAMP引物,65℃保温约60min,完成对沙门菌属的扩增,扩增产物经电泳和酶切鉴定。利用LAMP和普通PCR方法同时检测4株沙门菌和9株非沙门菌(对照组)来验证LAMP方法的特异性;将肠炎沙门菌菌液做一系列10倍稀释后用LAMP和PCR方法进行检测来比较两者敏感性。4株沙门菌扩增出LAMP特征性梯状条带,9株非沙门菌没有出现LAMP扩增,LAMP产物的特异性通过限制性内切酶得到了证实;LAMP检测沙门菌属的特异性与普通PCR相同,但其敏感性比普通PCR高10倍,LAMP检测沙门菌属的检测下限为10cfu/ml,PCR检测下限为100cfu/ml。LAMP检测速度相比PCR更快速,在60min内即可完成扩增反应。建立了一个快速、特异、敏感的沙门菌属LAMP检测方法。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 沙门菌属 侵袭蛋白
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高校大型仪器设备共享平台的设计与实现 被引量:19
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作者 马汉达 宋元书 丁勤林 《中国管理信息化》 2013年第9期99-101,共3页
本文分析高校大型仪器设备的使用现状和目前大型仪器设备共享平台的研究状况,提出通过信息化管理手段提高大型仪器设备利用率的方法。根据高校大型仪器设备共享平台的功能需求,讨论平台的数据库设计和功能设计,并使用LAMP技术开发了一... 本文分析高校大型仪器设备的使用现状和目前大型仪器设备共享平台的研究状况,提出通过信息化管理手段提高大型仪器设备利用率的方法。根据高校大型仪器设备共享平台的功能需求,讨论平台的数据库设计和功能设计,并使用LAMP技术开发了一个基于Web的大型仪器设备共享平台。 展开更多
关键词 大型仪器设备 共享平台 数据库设计 lamp
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