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薰衣草DXS基因家族的全基因组鉴定和表达分析
被引量:
1
1
作者
克拉热木·克里木江
陈永坤
+2 位作者
李翠翠
贺启琛
陈凌娜
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期919-926,共8页
脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类生物合成甲基苏糖醇磷酸(methylerythritol phosphate,MEP)途径的第一个关键酶,在薰衣草(Lavandula angustifolia)萜类物质的生物合成中起重要作用...
脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类生物合成甲基苏糖醇磷酸(methylerythritol phosphate,MEP)途径的第一个关键酶,在薰衣草(Lavandula angustifolia)萜类物质的生物合成中起重要作用。本研究中,通过薰衣草全基因组序列分析发现了DXS家族(命名为LaDXS)的22个成员,处于4个进化分支中。多数LaDXS是以α-螺旋和无规则卷曲为主的稳定性蛋白,其氨基酸数量在143~848,分子量为15.6~91.4 kDa,没有明显的信号肽和跨膜结构域,其中72%的成员定位于叶绿体。基因表达分析结果显示LaDXS在薰衣草不同组织中具有差异表达,La23G00913和La07G01277在除花瓣以外的各组织中的表达量显著;La11G00786、La17G01254和La22G01334在花蕾及花萼中的表达量最高,这可能与薰衣草精油中萜类合成密切相关。启动子分析结果显示它们受光强度、茉莉酸甲酯以及脱落酸等多种因素调节。RT-qPCR分析确认La11G00786、La02G02002、La03G00622和La23G00913在花蕾中的表达显著被光诱导。本研究结果为进一步研究LaDXS家族基因在薰衣草萜类物质合成中的作用奠定基础。
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关键词
薰衣草
ladxs
基因
家族
萜类生物合成
表达分析
光诱导
原文传递
题名
薰衣草DXS基因家族的全基因组鉴定和表达分析
被引量:
1
1
作者
克拉热木·克里木江
陈永坤
李翠翠
贺启琛
陈凌娜
机构
新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期919-926,共8页
基金
2020年新疆维吾尔自治区“天池百人计划”(新人社函[2021]254号)
新疆师范大学博士科研启动基金(XJNUBS2109)共同资助。
文摘
脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类生物合成甲基苏糖醇磷酸(methylerythritol phosphate,MEP)途径的第一个关键酶,在薰衣草(Lavandula angustifolia)萜类物质的生物合成中起重要作用。本研究中,通过薰衣草全基因组序列分析发现了DXS家族(命名为LaDXS)的22个成员,处于4个进化分支中。多数LaDXS是以α-螺旋和无规则卷曲为主的稳定性蛋白,其氨基酸数量在143~848,分子量为15.6~91.4 kDa,没有明显的信号肽和跨膜结构域,其中72%的成员定位于叶绿体。基因表达分析结果显示LaDXS在薰衣草不同组织中具有差异表达,La23G00913和La07G01277在除花瓣以外的各组织中的表达量显著;La11G00786、La17G01254和La22G01334在花蕾及花萼中的表达量最高,这可能与薰衣草精油中萜类合成密切相关。启动子分析结果显示它们受光强度、茉莉酸甲酯以及脱落酸等多种因素调节。RT-qPCR分析确认La11G00786、La02G02002、La03G00622和La23G00913在花蕾中的表达显著被光诱导。本研究结果为进一步研究LaDXS家族基因在薰衣草萜类物质合成中的作用奠定基础。
关键词
薰衣草
ladxs
基因
家族
萜类生物合成
表达分析
光诱导
Keywords
Lavandula angustifolia
ladxs
gene family
Terpenoids biosynthesis
Expression analysis
Light induction
分类号
Q943 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
薰衣草DXS基因家族的全基因组鉴定和表达分析
克拉热木·克里木江
陈永坤
李翠翠
贺启琛
陈凌娜
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
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