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题名贵州黑山羊LYRM1基因生物信息学及组织表达分析
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作者
杨洋
陈浩林
徐敏
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机构
贵州省农业科学院畜牧兽医研究所
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
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出处
《畜牧与兽医》
北大核心
2020年第9期1-6,共6页
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基金
贵州省科技厅科技支撑计划(黔科合NY[2015]3010-2)
贵州省农业科学院院专项项目(黔农科院院专项[2015]23号)。
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文摘
采用RT-PCR的方法对贵州黑山羊LYRM1基因进行了克隆,并对该基因的编码区序列进行生物信息学分析,利用qRT-PCR的方法检测LYRM1基因在贵州黑山羊不同组织中mRNA的相对表达量以及在不同月龄的时序表达。结果:黑山羊LYRM1基因的编码区全长369 bp,编码122个氨基酸,编码蛋白分子质量为14.4 kDa,理论等电点为9.73,不稳定系数为49.48,为不稳定蛋白;与GenBank数据库中提供的山羊LYRM1基因的编码区序列匹配度为99%,存在2个碱基的突变,分别为第177位和242位;通过LYRM1基因系统进化树得知,黑山羊与牛的进化距离较近,与斑马鱼进化距离较远。qRT-PCR结果显示LYRM1基因在贵州黑山羊7个组织中均有表达,在脂肪组织的表达量最高,背最长肌中的表达量最低;时序表达结果表明,LYRM1基因在黑山羊脂肪组织的整体表达趋势为先增加再减少,6月龄的表达量最高,7日龄最低。本试验成功克隆了黑山羊LYRM1基因编码区并进行了生物信息学分析,且检测了其在黑山羊不同组织中的表达以及在脂肪组织中的时序表达,为深入研究LYRM1基因功能奠定基础。
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关键词
黑山羊
lyrm1基因
克隆
QRT-PCR
组织表达
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Keywords
black goat
lyrm1 genes
cloning
qRT-PCR
expression in tissue
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分类号
S827
[农业科学—畜牧学]
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