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紫苏油脂合成相关基因家族鉴定及表达分析
被引量：
3
1
作者
郝月茹
周雅莉
+4 位作者
王志龙
薛应红
邢志
李润植
王计平
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1663-1671,共9页
该研究从转录组数据库中筛选鉴定紫苏溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAT)家族基因,采用生物信息学方法分析了该家族基因的序列特征及蛋白结构,利用qRT-PCR技术对该基因时空表达特性进行了研究,为进一步了解紫苏油脂合成机制提供理论依据。结果...
该研究从转录组数据库中筛选鉴定紫苏溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAT)家族基因,采用生物信息学方法分析了该家族基因的序列特征及蛋白结构,利用qRT-PCR技术对该基因时空表达特性进行了研究,为进一步了解紫苏油脂合成机制提供理论依据。结果表明:(1)从紫苏转录组数据库中共检测出11个LPAT家族基因,分别命名为PfLPAT1、PfLPAT2-1、PfLPAT2-2、PfLPAT2-3、PfLPAT2-4、PfLPAT4-1、PfLPAT4-2、PfLPAT5-1、PfLPAT5-2、PfLPAT5-3和PfLPAT5-4;PfLPATs编码氨基酸长度介于250~384 aa之间,理论等电点在7.6~9.6之间。(2)基因序列比对结果表明,11个PfLPATs蛋白分别属于3个亚类,其中1型LPAT包含1个基因,2/3型LPAT包含4个,4/5型LPAT包含6个。(3)实时荧光定量PCR结果显示,11个LPAT家族基因在‘晋紫苏1号’不同组织中均有表达,其中LPAT2-1、LPAT2-2和LPAT2-3在种子中表达量较高,推测其在紫苏种子油脂合成代谢过程中发挥重要作用。该结果为后续紫苏LPAT家族基因的功能研究提供了重要的基因信息。
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关键词
紫苏
lpat
家族
基因
油脂代谢
基因
序列特征
表达特性
下载PDF
职称材料
续随子溶血磷脂酸酰基转移酶基因家族的鉴定与表达分析
2
作者
盛晓倩
葛丽萍
+2 位作者
牛听风
王壮琳
李润植
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期220-228,共9页
该研究利用组学方法从续随子(Euphorbia lathyris)基因组数据库中鉴定出续随子溶血磷脂酸酰基转移酶(lysophosphatidic acid acyltransferase, LPAT)家族基因,并对其基因结构、蛋白理化性质、进化关系进行生物信息学分析,利用qRT-PCR等...
该研究利用组学方法从续随子(Euphorbia lathyris)基因组数据库中鉴定出续随子溶血磷脂酸酰基转移酶(lysophosphatidic acid acyltransferase, LPAT)家族基因,并对其基因结构、蛋白理化性质、进化关系进行生物信息学分析,利用qRT-PCR等技术对该基因家族的时空表达特性进行分析,以探讨ElLPAT家族基因在调控种子脂肪酸生物合成中的作用。结果表明:(1)从续随子基因组共检测出5个LPAT家族基因,分别命名为ElLPAT1~5;ElLPAT1~5基因编码氨基酸长度介于237~388 aa之间,理论等电点在6.23~9.56之间。(2)系统进化分析显示,5个ElLPATs蛋白分别属于3个亚类,其中ElLPAT1属于1型LPAT,ElLPAT2和ElLPAT3属于2/3型LPAT,ElLPAT4和ElLPAT5属于4/5型LPAT。(3)实时荧光定量qRT-PCR结果显示,5个ElLPATs基因在续随子不同组织中均有表达,ElLPAT1和ElLPAT4在各组织中表达量较低;ElLPAT2在各组织中表达量较高,且在种子中表达量最高。研究推测,ElLPAT2在续随子种子油脂合成代谢过程中可能发挥重要作用。
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关键词
续随子
lpat
家族
基因
表达分析
油脂合成
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职称材料
题名
紫苏油脂合成相关基因家族鉴定及表达分析
被引量：
3
1
作者
郝月茹
周雅莉
王志龙
薛应红
邢志
李润植
王计平
机构
山西农业大学分子农业与生物能源研究所
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1663-1671,共9页
基金
山西省重点研发计划(201803D221005-9)
国家青年科学基金(31201266)
山西省晋中市科技重点研发计划(Y172007-5)。
文摘
该研究从转录组数据库中筛选鉴定紫苏溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAT)家族基因,采用生物信息学方法分析了该家族基因的序列特征及蛋白结构,利用qRT-PCR技术对该基因时空表达特性进行了研究,为进一步了解紫苏油脂合成机制提供理论依据。结果表明:(1)从紫苏转录组数据库中共检测出11个LPAT家族基因,分别命名为PfLPAT1、PfLPAT2-1、PfLPAT2-2、PfLPAT2-3、PfLPAT2-4、PfLPAT4-1、PfLPAT4-2、PfLPAT5-1、PfLPAT5-2、PfLPAT5-3和PfLPAT5-4;PfLPATs编码氨基酸长度介于250~384 aa之间,理论等电点在7.6~9.6之间。(2)基因序列比对结果表明,11个PfLPATs蛋白分别属于3个亚类,其中1型LPAT包含1个基因,2/3型LPAT包含4个,4/5型LPAT包含6个。(3)实时荧光定量PCR结果显示,11个LPAT家族基因在‘晋紫苏1号’不同组织中均有表达,其中LPAT2-1、LPAT2-2和LPAT2-3在种子中表达量较高,推测其在紫苏种子油脂合成代谢过程中发挥重要作用。该结果为后续紫苏LPAT家族基因的功能研究提供了重要的基因信息。
关键词
紫苏
lpat
家族
基因
油脂代谢
基因
序列特征
表达特性
Keywords
Perilla frutescens
lpat
family genes
lipid metabolism
gene sequence characteristics
expression characteristics
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q789
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职称材料
题名
续随子溶血磷脂酸酰基转移酶基因家族的鉴定与表达分析
2
作者
盛晓倩
葛丽萍
牛听风
王壮琳
李润植
机构
山西农业大学林学院
山西农业大学分子农业与生物能源研究所
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期220-228,共9页
基金
山西省自然科学基金(201901D111223)
2022年度山西省研究生教育创新项目(2022Y325)。
文摘
该研究利用组学方法从续随子(Euphorbia lathyris)基因组数据库中鉴定出续随子溶血磷脂酸酰基转移酶(lysophosphatidic acid acyltransferase, LPAT)家族基因,并对其基因结构、蛋白理化性质、进化关系进行生物信息学分析,利用qRT-PCR等技术对该基因家族的时空表达特性进行分析,以探讨ElLPAT家族基因在调控种子脂肪酸生物合成中的作用。结果表明:(1)从续随子基因组共检测出5个LPAT家族基因,分别命名为ElLPAT1~5;ElLPAT1~5基因编码氨基酸长度介于237~388 aa之间,理论等电点在6.23~9.56之间。(2)系统进化分析显示,5个ElLPATs蛋白分别属于3个亚类,其中ElLPAT1属于1型LPAT,ElLPAT2和ElLPAT3属于2/3型LPAT,ElLPAT4和ElLPAT5属于4/5型LPAT。(3)实时荧光定量qRT-PCR结果显示,5个ElLPATs基因在续随子不同组织中均有表达,ElLPAT1和ElLPAT4在各组织中表达量较低;ElLPAT2在各组织中表达量较高,且在种子中表达量最高。研究推测,ElLPAT2在续随子种子油脂合成代谢过程中可能发挥重要作用。
关键词
续随子
lpat
家族
基因
表达分析
油脂合成
Keywords
Euphorbia lathyris
lpat
family genes
expression analysis
oil biosynthesis
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
Q786
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫苏油脂合成相关基因家族鉴定及表达分析
郝月茹
周雅莉
王志龙
薛应红
邢志
李润植
王计平
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
2
续随子溶血磷脂酸酰基转移酶基因家族的鉴定与表达分析
盛晓倩
葛丽萍
牛听风
王壮琳
李润植
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
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