为研究贵妃鸡的遗传多样性,试验应用主要组织相容性复合体 B 区域（MHC-B）复合微卫星位点 LEI0258测定了贵妃鸡的等位基因信息,结合已发表的序列,进行等位基因与核苷酸多态性、单倍型中介网络图分析。40份样品中共检测到9个等位基因,...为研究贵妃鸡的遗传多样性,试验应用主要组织相容性复合体 B 区域（MHC-B）复合微卫星位点 LEI0258测定了贵妃鸡的等位基因信息,结合已发表的序列,进行等位基因与核苷酸多态性、单倍型中介网络图分析。40份样品中共检测到9个等位基因,长度为193-297 bp,其中5个为贵妃鸡特有。观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He ）和多态信息含量（P IC）分别为0.625、0.716和0.666。3个等位基因与6种已知 MHC 血清型相匹配。基于侧翼区变异信息的中介网络图将等位基因分为5个进化枝,贵妃鸡9个等位基因分布于 A 和 B 进化枝中,这2个进化枝同样存在于红原鸡中。研究结果表明贵妃鸡保持着中等偏上的遗传多样性水平,可能起源于红原鸡。展开更多
文摘本研究应用LEI0258微卫星标记来研究鸡主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)的遗传多态性,并对鸡群体的遗传结构进行挖掘。利用毛细管电泳技术原理,选用8个地理分布来源差异明显的群体(德化黑鸡、丝羽乌骨鸡、白来航鸡、重庆城口山地鸡、大宁河鸡、南川土鸡、增福土鸡和秀山土鸡)共计275只鸡进行分型,并使用STRUCTURE软件对8个鸡群体的群体遗传结构进行挖掘。结果显示,8个群体的期望杂合度(He)均大于观测杂合度(Ho),且多态信息含量(PIC)均在0.5以上,表现出高度的多态性,多数群体偏离哈代-温伯格(HWE)平衡且存在近交的风险;LEI0258位点上检测到67个等位基因,每个群体都有特异性等位基因,基因频率分布不均匀,家禽中MHC等位基因可能因家禽生产集约化而有所不同;从群体间差异(Fst)来看,8个群体的Fst分布在0.016 3(ZF vs NC)至0.237 0(WL vs XS)间,具有较大的遗传分歧;STRUCTURE分析发现不同重庆地方鸡群体有一些共同的遗传结构成分;相较于标准化生产品种,本地品种在MHC-B区域具有较高的遗传多样性,MHC基因的多态性在家禽中与多种传染病的抗性存在高度相关性,提示重庆本地鸡具有较强的抗病能力。本研究在探究出8个家鸡群体呈现出较高遗传多样性的同时,为地方品种的保护及家禽抗病育种提供参考。
文摘为研究贵妃鸡的遗传多样性,试验应用主要组织相容性复合体 B 区域（MHC-B）复合微卫星位点 LEI0258测定了贵妃鸡的等位基因信息,结合已发表的序列,进行等位基因与核苷酸多态性、单倍型中介网络图分析。40份样品中共检测到9个等位基因,长度为193-297 bp,其中5个为贵妃鸡特有。观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He ）和多态信息含量（P IC）分别为0.625、0.716和0.666。3个等位基因与6种已知 MHC 血清型相匹配。基于侧翼区变异信息的中介网络图将等位基因分为5个进化枝,贵妃鸡9个等位基因分布于 A 和 B 进化枝中,这2个进化枝同样存在于红原鸡中。研究结果表明贵妃鸡保持着中等偏上的遗传多样性水平,可能起源于红原鸡。
