期刊文献+
共找到38篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
基于整合药理学平台探究三棱抗血栓形成及抗血小板聚集的分子机制 被引量:22
1
作者 徐男 王亮 +3 位作者 孙蓉 黄欣 张成博 时海燕 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期192-200,共9页
目的:探讨三棱抗血小板聚集及抗血栓形成的分子机制。方法:利用中药整合药理学平台(TCM-IP)的中药材数据库、中药成分数据库和疾病靶标数据库的数据信息和分析功能,检索三棱所含的化学成分信息,构建三棱作用的潜在靶标和疾病靶标之间的... 目的:探讨三棱抗血小板聚集及抗血栓形成的分子机制。方法:利用中药整合药理学平台(TCM-IP)的中药材数据库、中药成分数据库和疾病靶标数据库的数据信息和分析功能,检索三棱所含的化学成分信息,构建三棱作用的潜在靶标和疾病靶标之间的相互作用网络,然后富集计算核心靶标,进行基因功能分析和通路分析,再进一步构建"中药材-化学成分-核心靶标-关键通路"多维关系网络。结果:对三棱预测活性成分主要包括黄酮、酚酸等成分,如山柰酚、三棱酸等;抗血栓形成涉及202个核心靶标,包括蛋白激酶Cδ(PRKCD),葡萄糖激酶(GCK),腺嘌呤核糖核苷酸活化蛋白激酶α-2催化亚基等;涉及内分泌系统、循环系统、神经退行性疾病等相关生物过程和信号通路。抗血小板聚集涉及136个核心靶标,包括PRKCD,细胞色素C氧化酶蛋白7C(COX7C),GCK等;涉及帕金森病、循环系统、神经退行性疾病等相关生物过程和信号通路。结论:三棱主要通过调控中枢神经系统的神经递质活性达到调节血管内皮细胞黏附分子表达以及血小板线粒体功能介导血小板的凋亡,从而发挥抗血栓形成及抗血小板聚集的药效作用。 展开更多
关键词 三棱 血栓形成 血小板聚集 整合药理学 作用机制 关键通路 核心靶标
原文传递
当归-川芎药对治疗脑梗死的“调控网络”和机制 被引量:22
2
作者 杨正飞 杨小燕 +4 位作者 陈叶飞 吴旦斌 郭茂娟 徐彦龙 姜希娟 《中医学报》 CAS 2020年第1期149-154,共6页
目的:本研究借助网络药理学的方法预测当归-川芎药对治疗脑梗死的潜在靶点,探讨其调控网络及作用机制。方法:首先,本研究运用在线中医药生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选当归-川芎作用的共同靶点;其次,通过OMIM数据库、GAD数据库、TT... 目的:本研究借助网络药理学的方法预测当归-川芎药对治疗脑梗死的潜在靶点,探讨其调控网络及作用机制。方法:首先,本研究运用在线中医药生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选当归-川芎作用的共同靶点;其次,通过OMIM数据库、GAD数据库、TTD数据库以及PharmGKB数据库筛选与脑梗死相关的靶点,并通过Cytoscape3.6.1软件筛选"药物-靶点-疾病"网络中的关键靶点;最后,利用DAVID 6.8在线分析工具对得到的关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集,并运用Omicshare在线分析工具对通路富集结果进行可视化。结果:通过筛选得到当归-川芎药对的共同靶点229个,脑梗死相关的作用靶点102个,通过网络合并和拓扑最终得到当归-川芎药对治疗脑梗死的关键靶点493个,其中涉及154个生物过程,65种细胞组成,51种分子功能及20条具有显著意义的通路(P<0.01,FDR<0.05)。结论:当归-川芎药对可能通过Thyroid hormone信号通路、Neurotrophin信号通路、MAPK信号通路及PI3K信号通路发挥治疗脑梗死的功效。其中,Thyroid hormone信号通路可能是治疗脑梗死的新方向。 展开更多
关键词 当归-川芎药对 脑梗死 “调控网络” 网络药理学 富集分析 关键靶点 作用机制
下载PDF
基于系统药理模式挖掘中药寒热药性的关键靶标和疾病网络 被引量:15
3
作者 戴逸飞 霍海如 +2 位作者 王朋倩 张淼 隋峰 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期521-526,共6页
目的:通过系统药理学的方法挖掘影响中药寒热药性的关键靶标,为进一步研究寒热药性的实质提供新的思路。方法:构建寒热中药成分数据库;通过活性成分筛选及网络打靶构建有效成分-靶点网络;通过网络分析筛选出关键靶点,并以此构建靶点-疾... 目的:通过系统药理学的方法挖掘影响中药寒热药性的关键靶标,为进一步研究寒热药性的实质提供新的思路。方法:构建寒热中药成分数据库;通过活性成分筛选及网络打靶构建有效成分-靶点网络;通过网络分析筛选出关键靶点,并以此构建靶点-疾病网络。结果:通过网络分析得到寒性中药网络中有PTGS2、PTGS1和SCN5A关键靶点,热性中药网络中有GABRA1、PTGS2和PTGS1关键靶点;寒性中药对于前列腺癌、乳腺癌等癌症及心血管疾病具有潜在的治疗作用,而热性中药在阿兹海默症、疼痛、认知障碍、焦虑症、帕金森症等精神类疾病方面显示出一定的应用价值。结论:基于系统药理学的研究方法有助于寻找寒热药性的关键靶点和疾病网络,为深入诠释寒热药性的生物学本质提供有益的信息和数据支撑。 展开更多
关键词 中药 寒热药性 系统药理学 关键靶点 疾病网络 拓扑分析
原文传递
基于中药整合药理学平台探究开心散治疗AD的物质基础与作用机制 被引量:12
4
作者 毕婷婷 战丽彬 张栎婧 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第16期135-141,共7页
目的:探究开心散治疗阿尔茨海默病的"成分-靶点-疾病"相互关系。方法:利用中药整合药理学平台V1.0收集开心散所含4味中药的相关活性成分及潜在靶点,并搜索阿尔茨海默病疾病靶标,对其节点(hubs)进行基因本体数据库和京都基因... 目的:探究开心散治疗阿尔茨海默病的"成分-靶点-疾病"相互关系。方法:利用中药整合药理学平台V1.0收集开心散所含4味中药的相关活性成分及潜在靶点,并搜索阿尔茨海默病疾病靶标,对其节点(hubs)进行基因本体数据库和京都基因与基因组百科全书数据库富集分析。结果:开心散的250个化合物中有2 877个靶点与阿尔茨海默病相互关联。其中线粒体三功能酶α亚基(HADHA),羟基酰基辅酶A脱氢酶(HADH),甾醇-4-α-羧酸盐3-脱氢酶(NSDHL)等关键靶标主要通过调控嘌呤代谢、核苷酸代谢、亨廷顿氏病、阿尔茨海默病、神经退行性疾病,氧化磷酸化以及内分泌与代谢性疾病等生物过程,在细胞质、线粒体、三磷酸腺苷结合、线粒体基质等分子反应中发挥其药理作用。结论:通过该平台能够预测出开心散治疗阿尔茨海默病的关键靶标及其参与的相关通路,可为深入揭示该复方的物质基础和作用机制提供参考,同时为深入挖掘和开发经典名方开心散提供依据。 展开更多
关键词 中药整合药理学平台 开心散 阿尔茨海默病 关键靶标 嘌呤代谢 细胞质 经典名方
原文传递
网络化作战体系中的关键目标选择研究 被引量:12
5
作者 杨国利 邹瑞涛 +1 位作者 任步春 张博 《指挥与控制学报》 2018年第4期312-318,共7页
网络化作战体系是联合作战中各种武器、装备、设施、力量的有机组织形式.研究结合目标节点特性和网络结构特征,围绕作战打击链路,在多层异构网络中分析有效作战能力的形成机理.基于复杂网络级联失效理论,模拟计算单个目标或目标组合失... 网络化作战体系是联合作战中各种武器、装备、设施、力量的有机组织形式.研究结合目标节点特性和网络结构特征,围绕作战打击链路,在多层异构网络中分析有效作战能力的形成机理.基于复杂网络级联失效理论,模拟计算单个目标或目标组合失效后对体系作战能力的影响,并以体系能力的最大化下降为目标函数,以打击目标代价为约束条件,运用多目标优化方法求解作战体系关键节点,为联合作战目标分析选择提供理论指导和计算支撑. 展开更多
关键词 网络化作战体系 多层异构网络 关键目标 多目标优化
下载PDF
旋覆花治疗胃食管反流病作用机制的网络药理学研究 被引量:10
6
作者 张渊 喻斌 《河南中医》 2021年第5期773-779,共7页
目的:运用网络药理学的方法分析旋覆花治疗胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)的有效活性成分、关键靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台和疾病数据库搜索整理旋覆花的活性成分、作用靶点与GERD... 目的:运用网络药理学的方法分析旋覆花治疗胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)的有效活性成分、关键靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台和疾病数据库搜索整理旋覆花的活性成分、作用靶点与GERD的作用靶点,并取交集在STRING数据库对交集靶点进行拓扑结构扩展,分别构建互作网络图,采用Cytoscape3.7.0软件对网络图取交集,获得"旋覆花治疗GERD靶点PPI网络图"并获取关键靶点(Hub基因),构建"旋覆花活性成分-关键靶点-通路"网络图,在DAVID数据库对Hub基因进行GO功能及KEGG通路富集分析。结果:旋覆花的有效活性成分共19种,靶点393个,治疗GERD的作用靶点共352个,通过PPI网络属性筛选出旋覆花治疗GERD可能作用靶点共138个,并得出旋覆花治疗GERD可能通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、毛地黄黄酮等活性成分作用于JUN、STAT3、TP53、TNF、IL6、CXCL8、EGFR和EGF等关键靶点以及调节HIF-1信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路及与癌症相关等信号通路发挥直接或间接的治疗作用。结论:本研究初步分析了旋覆花抗GERD的作用机制,为其在临床的应用提供了理论基础。 展开更多
关键词 旋覆花 胃食管反流病 网络药理学 活性成分 关键靶点
下载PDF
基于系统药理方法挖掘六君子汤的关键靶点与治疗疾病 被引量:9
7
作者 孙亮 戴逸飞 +1 位作者 陆雪秋 张明明 《环球中医药》 CAS 2018年第2期216-222,共7页
目的通过系统药理学的方法挖掘六君子汤的关键靶标,为进一步研究六君子汤的作用机制提供新的方向。方法基于数据库及文献构建了六君子汤的成分组合库;通过口服生物利用度、药物相似度及半衰期三个参数对化学成分进行活性筛选,在此基础上... 目的通过系统药理学的方法挖掘六君子汤的关键靶标,为进一步研究六君子汤的作用机制提供新的方向。方法基于数据库及文献构建了六君子汤的成分组合库;通过口服生物利用度、药物相似度及半衰期三个参数对化学成分进行活性筛选,在此基础上,通过Sys DT靶点预测模型进行活性成分的靶点预测,然后通过Cytoscape软件构建活性成分-预测靶点网络;最后通过网络分析筛选出关键靶点,结合Uniprot数据库的靶点的疾病信息来构建靶点-疾病网络,并通过统计分析得出六君子汤的主治疾病。结果通过中心性算法进行计算分析得到六君子汤中最重要的四个靶点分别是环氧酶-2(PTGS2)、环氧酶-1(PTGS1)、γ-氨基丁酸受体α-1亚型(GARBRA1)、PKA催化剂C-α亚型的mRNA(PRKACA);结合Uniprot数据库获得与六君子汤的关键靶点相对应的疾病信息,统计发现该方对于溃疡性结肠炎和众多炎症可能具有治疗效果,同时对于前列腺癌、乳腺癌、实体瘤等癌症,以及心血管疾病、血栓症和阿兹海默症也显示出潜在的治疗作用,与部分已发表论文相互印证,其治疗癌症与阿兹海默症的效果还有待进一步研究。结论基于系统药理学的研究方法有助于寻找六君子汤的关键靶点和疾病网络,为深入研究六君子汤的作用机制提供新的研究方向和思路。 展开更多
关键词 六君子汤 系统药理学 关键靶点 疾病网络 拓扑分析
下载PDF
抛物方程方法的亚网格模型及其应用研究 被引量:8
8
作者 张青洪 廖成 +2 位作者 盛楠 赵朋程 周海京 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2014年第8期2005-2009,共5页
该文在抛物方程非均匀网格技术的基础上,提出了抛物方程方法的亚网格模型,并给出了该亚网格模型的具体构建方法,以快速准确地求解大尺度复杂电磁环境中存在关键目标的电波传播问题。通过对存在强散射体的复杂电磁环境中电磁波的分布特... 该文在抛物方程非均匀网格技术的基础上,提出了抛物方程方法的亚网格模型,并给出了该亚网格模型的具体构建方法,以快速准确地求解大尺度复杂电磁环境中存在关键目标的电波传播问题。通过对存在强散射体的复杂电磁环境中电磁波的分布特性进行模拟,探讨了抛物方程亚网格技术的高效性。结果表明:与细网格相比,亚网格技术使得抛物方程的计算速度提升了4.57倍,网格空间数下降了86.64%,且较非均匀网格具有更高的计算精度。可见,抛物方程的亚网格模型能够极大地提升抛物方程的仿真效率。 展开更多
关键词 电波传播 抛物方程 亚网格技术 关键目标
下载PDF
基于网络药理学与分子对接技术探究逍遥丸治疗乳腺增生的作用机制 被引量:7
9
作者 管庆霞 杨芳芳 +5 位作者 杨志平 聂泽卉 周小影 林泽榆 陈忠新 邹淑君 《粮油食品科技》 2022年第1期134-149,共16页
用网络药理学方法进行逍遥丸治疗乳腺增生过程的机制研究。通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)进行逍遥丸活性成分的搜集和筛选,将纳入的化合物成分通过TCMSP数据库进行成分的靶点预测;在GeneCards数据库,NCBI基因数据库以及OMI... 用网络药理学方法进行逍遥丸治疗乳腺增生过程的机制研究。通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)进行逍遥丸活性成分的搜集和筛选,将纳入的化合物成分通过TCMSP数据库进行成分的靶点预测;在GeneCards数据库,NCBI基因数据库以及OMIM数据库进行乳腺增生疾病靶点筛选;取药物靶点和疾病靶点作韦恩图,并利用共有靶点在String数据库中作PPI网络图,利用拓扑分析和MCODE聚类分析筛选核心靶点和核心基因;在cytoscape 3.8.0软件中进行关键活性成分的筛选;关键靶点使用String数据库进行GO分析和KEGG分析,将相关结果导入Cytoscape3.8.0绘制成分—疾病—通路—靶点网络图。结果表明,筛选得到逍遥丸各药活性成分及靶点,其中与乳腺增生相关的有169个靶点。STAT3、AKT1、MAPK1、JUN、MAPK3等20个靶点为该药治疗乳腺增生的关键靶点,HTR2A、IL2、TOP2A、PCNA、MMP1为该药治疗乳腺增生的核心基因。槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、叶黄素(luteolin)、柚皮素(naringenin)、甘草酮a(licochalcone a)、7-甲氧基-2-甲基异黄酮(7-Methoxy-2-methylisoflavone)、芒柄花素(formononetin)、醋栗素(acacetin)等可能是逍遥丸治疗乳腺增生发挥作用的主要活性成分。GO富集分析总共富集到2 328条生物过程,160项分子功能相关,47项细胞组成相关。通路富集分析显示与166条通路相关,涉及AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、TH17细胞分化、流体剪切应力与动脉粥样硬化等信号通路。分子对接验证结果说明关键活性成分与核心靶点均对接良好。 展开更多
关键词 网络药理学 逍遥丸 乳腺增生 关键靶点 分子对接
下载PDF
基于网络药理学探寻淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制 被引量:7
10
作者 王瀚 马紫童 +3 位作者 唐秀凤 高莹莹 杨丽平 刘仁慧 《世界中医药》 CAS 2021年第5期742-750,共9页
目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制。方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶... 目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制。方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶标互作网络筛选关键靶标;利用数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析;构建生物网络并进行拓扑分析。结果:通过筛选得到白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等10个关键靶标,富集的通路有IL-17信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible Factor,HIF)-1信号通路等66条,功能信息共得到446条,包括参与炎症反应、调控细胞增殖与细胞凋亡等。结论:淫羊藿中的活性成分靶标及作用通路在对抗炎症反应、逆转气道重塑方面均表现出显著富集,与治疗哮喘的作用机制相符合,在哮喘防治方面具有广阔的发展前景。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 淫羊藿 哮喘 关键靶标 信号通路 炎症反应 气道重塑
下载PDF
心房颤动患者经皮冠状动脉介入后的抗血栓潜在生物标志物和治疗靶点的综合分析
11
作者 李景瑞 吴晓杰 +2 位作者 信鸿巍 张百会 丁园园 《智慧健康》 2024年第13期48-50,共3页
目的探究治疗靶点对于房颤患者经皮冠状动脉介入术(PCI)后血栓形成的预测效能。方法选择某医院2022年7月—2023年7月收治的120例进行PCI术治疗的房颤患者为研究对象,根据术后14d内是否出现血栓将其分为血栓组(44例)和无血栓组(76例)。... 目的探究治疗靶点对于房颤患者经皮冠状动脉介入术(PCI)后血栓形成的预测效能。方法选择某医院2022年7月—2023年7月收治的120例进行PCI术治疗的房颤患者为研究对象,根据术后14d内是否出现血栓将其分为血栓组(44例)和无血栓组(76例)。收集对比两组的一般临床资料,分析影响房颤患者PCI术后血栓形成的危险因素,探究关键性靶点的临床预测效能。结果与无血栓组相比,血栓组原发性高血压患者占比、vWT和D-D水平更高,差异有统计学意义(P<0.05),两组其余资料比较,差异无统计学意义(P>0.05);原发性高血压、vWF和D-D水平是房颤患者PCI术后出现血栓的独立危险因素,差异有统计学意义(P<0.05)。结论临床对存在原发性高血压病史的患者及其vWT和D-D水平进行密切监测,可有效预测房颤患者PCI术后发生血栓的可能性,改善患者预后。 展开更多
关键词 心房颤动 经皮冠状动脉介入 抗血栓 关键性靶点
下载PDF
复杂交通环境下基于关键目标的视觉SLAM 被引量:2
12
作者 连静 皮家豪 李琳辉 《重庆理工大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2023年第1期19-25,共7页
为解决当前视觉SLAM(simultaneous localization and mapping,同时定位及地图构建)算法在近处纹理稀缺、动态物体遮挡等复杂交通环境下出现的定位失效的问题,提出一种基于关键目标的视觉SLAM算法。首先,以典型交通场景环境感知算法所检... 为解决当前视觉SLAM(simultaneous localization and mapping,同时定位及地图构建)算法在近处纹理稀缺、动态物体遮挡等复杂交通环境下出现的定位失效的问题,提出一种基于关键目标的视觉SLAM算法。首先,以典型交通场景环境感知算法所检测的交通信号、标志等静止目标为基础,在静止目标中进行特征提取并筛选关键目标。其次,通过关键目标的类别和几何参数完成相连帧之间关键目标的匹配。然后,基于关键目标进行SLAM系统的初始化和跟踪,并通过最小化重投影误差求解当前相机位姿。最后,在局部建图线程中对相机位姿和关键目标三维坐标联合优化,并在局部地图中更新。经实验验证,所提算法能有效解决近处纹理缺失环境下的定位失效问题,保持了较高的定位精度,具有良好的环境适应性。 展开更多
关键词 视觉SLAM 近处纹理稀缺 定位失效 关键目标
下载PDF
基于网络药理学和分子对接技术探讨泽漆汤治疗非小细胞肺癌的作用机制 被引量:2
13
作者 窦丹旎 钱韦丹 《中国医药科学》 2023年第11期47-50,共4页
目的采用网络药理学和分子对接技术,探讨泽漆汤治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法通过TCMSP、GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、PharmGKD以及String数据库获得泽漆汤活性成分、作用靶点以及NSCLC相关疾病靶点,采用Cytoscape 3.8.... 目的采用网络药理学和分子对接技术,探讨泽漆汤治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法通过TCMSP、GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、PharmGKD以及String数据库获得泽漆汤活性成分、作用靶点以及NSCLC相关疾病靶点,采用Cytoscape 3.8.0软件绘制“活性成分-靶点-疾病”网络图,采用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析并绘制网络图,使用DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用AutoDock软件对关键活性成分和核心靶点进行分子对接。结果共筛选出178个泽漆汤活性成分和189个药物-疾病共有靶点,GO功能和KEGG通路富集分析显示泽漆汤可能通过RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、细胞因子介导的信号通路、DNA模板转录的正调控、基因表达的正向调控、凋亡过程的负调控等生物学过程,调控肿瘤蛋白P53、AP-1转录因子、AKT/蛋白激酶B信号等关键靶点的表达,进一步调控癌症通路、脂质与动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路、乙型肝炎、前列腺癌等信号通路,从而治疗NSCLC。分子对接结果显示,泽漆汤中活性成分与核心靶点间存在分子结合位点。结论泽漆汤能通过多成分、多靶点、多通路、多机制治疗NSCLC。 展开更多
关键词 泽漆汤 非小细胞肺癌 网络药理学 活性成分 核心靶点 分子对接
下载PDF
生物信息学分析桑白皮汤治疗慢性阻塞性肺病急性加重的关键靶点和潜在机制 被引量:2
14
作者 王坤 朱慧志 +4 位作者 杨磊 徐晴雯 任冯春 刘向国 万磊 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期130-137,共8页
目的运用网络药理学探究桑白皮汤治疗慢性阻塞性肺病急性加重期的关键靶点和分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索桑白皮汤的活性成分,预测其对应靶点;利用基因库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(... 目的运用网络药理学探究桑白皮汤治疗慢性阻塞性肺病急性加重期的关键靶点和分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索桑白皮汤的活性成分,预测其对应靶点;利用基因库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药品数据与综合药物靶点信息DrugBank数据库检索慢性阻塞性肺病急性加重疾病相关靶点,利用全球蛋白质资源(Uniprot)数据库将预测靶点和疾病靶点名称标准化后筛选出交集靶点,利用Cytoscape3.6.0绘制并分析中药-成分-靶点网络图。将共同靶点导入检索互作用基因/蛋白质的搜索工具(STRING)数据库获得蛋白质相互作用网络并利用Cytoscape3.6.0 CytoNCA插件筛选出核心靶点。将共同靶点导入富集分析库(Metascape)数据库进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并利用自动对接工具(Auto Dock Tools)软件进行分子对接。结果桑白皮汤有效活性成分126个,预测对应靶点1351个,疾病相关靶点2296个,主要活性成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、汉黄芩素、β谷甾醇,核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL-6)、肿瘤蛋白p53(TP53)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)、MAPK14。GO富集分析共获得2720条,KEGG富集分析获得信号通路334条,分子对接结果表明主要活性成分可以和核心靶点结合,结合构象稳定。结论桑白皮汤可能通过多种有效成分、多个作用靶点和信号通路发挥抗炎、抗氧化等生物作用,进而具有治疗慢性阻塞性肺病急性加重的作用。 展开更多
关键词 桑白皮汤 慢性阻塞性肺病急性加重 网络药理学 关键靶点 分子机制 分子对接
下载PDF
基于网络药理学与分子对接研究调中化湿汤治疗胃食管反流病的作用机制 被引量:2
15
作者 付文静 刘礼剑 +6 位作者 黎丽群 翁欣欣 钟焕英 王玉燕 刘芙蓉 黎秀娟 马超北 《中国医药》 2023年第2期270-274,共5页
目的通过网络药理学及分子对接的方法研究调中化湿汤治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制。方法从中药系统药理学数据库与分析平台数据库中筛选出调中化湿汤药物活性成分及对应的靶点蛋白。通过STRING数据库将靶点蛋白转换成基因。通过人... 目的通过网络药理学及分子对接的方法研究调中化湿汤治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制。方法从中药系统药理学数据库与分析平台数据库中筛选出调中化湿汤药物活性成分及对应的靶点蛋白。通过STRING数据库将靶点蛋白转换成基因。通过人类孟德尔遗传数据库、人类基因综合数据库、治疗目标数据库获取GERD相关基因,运用Cytoscape3.8.2和STRING软件构建“中药-化合物-靶点”网络与蛋白质-蛋白质相互作用网络图,并对重要的靶点基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获知其潜在的作用机制。最后通过PyMOLWin、AutoDockTools软件进行分子对接验证。结果经数据库检索获得调中化湿汤的196个有效成分、185个潜在靶点和1619个GERD靶点,将潜在靶点和GERD靶点进行映射,获得120个中药-疾病共同靶基因。通过GO功能分析结果得出1928个生物学过程、90个分子功能、50个细胞组分,KEGG通路分析发现167条信号通路,分子对接结果显示,信号传导与转录激活因子3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、MAPK1与对应化合物均有强烈的结合活性。结论调中化湿汤通过STAT3、MAPK3、MAPK1等关键靶点基因,通过调节炎症反应等生物过程达到治疗GERD的目的。 展开更多
关键词 调中化湿汤 胃食管反流病 网络药理学 活性成分 关键靶点
下载PDF
基于网络药理学和分子对接技术探究柯里拉京治疗卵巢癌的关键靶点及分子机制 被引量:2
16
作者 罗广文 黄丽丽 +3 位作者 黄燮 张豆豆 张照伟 程琴珍 《湖南中医杂志》 2023年第11期201-210,共10页
目的:采用网络药理学和分子对接技术相结合的方法探究柯里拉京(Cor)治疗卵巢癌的关键作用靶点和分子机制。方法:利用PharmMapper、TargetNet及Swiss Target Prediction在线工具预测Cor的作用靶点,通过OMIM、TTD、CTD、DisGenet、PharmGK... 目的:采用网络药理学和分子对接技术相结合的方法探究柯里拉京(Cor)治疗卵巢癌的关键作用靶点和分子机制。方法:利用PharmMapper、TargetNet及Swiss Target Prediction在线工具预测Cor的作用靶点,通过OMIM、TTD、CTD、DisGenet、PharmGKB及MalaCards数据库获取卵巢癌相关的疾病靶点,并将药物靶点与疾病靶点取交集得到Cor治疗卵巢癌的预测靶点。借助STRING数据库、Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并采用CentiScape插件筛选出PPI网络中的核心靶点。运用GEPIA和Kaplan-Meier Plotter在线平台分别对这些核心靶点进行基因表达差异分析和生存分析,以明确Cor治疗卵巢癌的关键靶点。利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Autodock Vina软件进行正向分子对接,预测关键靶点和Cor之间的结合活性。结果:Cor治疗卵巢癌的预测作用靶点共24个,其中RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)是Cor治疗卵巢癌的关键靶点,主要涉及血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路及叉头样转录因子(FoxO)信号通路,可能通过调控细胞凋亡、细胞增殖、血管内皮细胞迁移等生物过程而发挥治疗卵巢癌的作用。分子对接结果显示,Cor与预测靶点之间具有较好的亲和力,表明通过网络药理学预测作用靶点的方法具有良好的可靠性。结论:Cor是通过多靶点、多通路的协同作用来干预多个生物过程,从而发挥其抗卵巢癌疗效,为进一步研究其治疗卵巢癌的分子机制提供了新的线索。 展开更多
关键词 卵巢癌 柯里拉京 关键靶点 网络药理学 分子机制
原文传递
基于网络药理学与分子对接技术探讨麻子仁丸治疗功能性便秘的作用机制 被引量:1
17
作者 张洋 陈萌 张虹玺 《西部中医药》 2023年第8期1-5,共5页
目的:通过网络药理学和分子对接方法探讨麻子仁丸治疗功能性便秘的作用机制。方法:在TCMSP数据库中检索麻子仁丸中各药物的主要活性成分及作用靶点,并应用UniProt数据库筛选功能性便秘的相关疾病靶点。应用Cytoscape 3.7.2软件构建有效... 目的:通过网络药理学和分子对接方法探讨麻子仁丸治疗功能性便秘的作用机制。方法:在TCMSP数据库中检索麻子仁丸中各药物的主要活性成分及作用靶点,并应用UniProt数据库筛选功能性便秘的相关疾病靶点。应用Cytoscape 3.7.2软件构建有效活性成分-靶点网络;用STRING数据库构建PPI网络,基于Bioconductor数据库利用R 3.6.3软件进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,并提取前20条结果生成可视化图形。结果:获取麻子仁丸的主要活性成分57个;作用靶点167个,功能性便秘相关基因4948个,交集基因135个。较重要的有效活性成分包括木犀草素、山柰酚、柚皮素等。构建可视化PPI网络图共得到135个节点、2033条边、平均度值30.1,获得AKT1、IL-6、MAPK3等30个核心靶点蛋白。GO富集分析获得条目154个,其中10个富集最多,KEGG通路富集分析获得175条信号传导通路,其中16条富集显著性较高。结论:麻子仁丸可能是通过AGE-RAGE、TNF、IL-17、PI3K-Akt等信号通路控制AKT1、IL-6、MAPK3等靶点治疗功能性便秘,木犀草素可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 功能性便秘 麻子仁丸 网络药理学 分子对接 有效成分 关键靶点 作用机制
下载PDF
痹祺胶囊对类风湿性关节炎关键靶点的调节作用 被引量:1
18
作者 韩彦琪 宋紫腾 +6 位作者 姚鹏飞 张祥麒 许浚 王磊 赵专友 张铁军 刘昌孝 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期7648-7661,共14页
目的采用G蛋白偶联受体及酶活检测实验方法,探究痹祺胶囊对类风湿性关节炎关键靶点的调节作用,明确其作用机制。方法选取与抑制滑膜炎症相关的靶点[环氧化酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2)、一氧化氮合酶(nitric oxide synthase,NOS)、核因... 目的采用G蛋白偶联受体及酶活检测实验方法,探究痹祺胶囊对类风湿性关节炎关键靶点的调节作用,明确其作用机制。方法选取与抑制滑膜炎症相关的靶点[环氧化酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2)、一氧化氮合酶(nitric oxide synthase,NOS)、核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)、趋化因子受体4(C-C chemokine receptor type 4,CCR4)],与抑制血管翳生成相关的靶点[血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor 2,VEGFR2/KDR)],与抑制基质降解相关的受体[基质金属蛋白酶-3(matrix metalloproteinase-3,MMP-3)],以及与活血相关的靶点[凝血酶、磷酸二酯酶(cGMP-inhibited 3′,5′-cyclic phosphodiesterase,PDE3A)、肾上腺素受体α1(alpha-1A adrenergic receptor,ADRA1A)]为研究载体,通过胞内钙离子荧光和酶抑制剂检测技术评价痹祺胶囊中19个主要单体成分对受体的拮抗作用以及对酶的抑制活性。结果19个化合物中,士的宁、党参炔苷、茯苓酸、丹参素、丹参酮Ⅱ_(A)、丹酚酸B、迷迭香酸、人参皂苷Rb_(1)、阿魏酸、藁本内酯、牛膝皂苷D可显著抑制COX-2活性;马钱子碱、士的宁、党参炔苷、白术内酯Ⅲ、茯苓酸、丹参素、丹参酮Ⅱ_(A)、丹酚酸B、迷迭香酸、三七皂苷R_(1)、人参皂苷Rg_(1)、人参皂苷Rb_(1)、藁本内酯、蜕皮甾酮、甘草苷可显著抑制NOS活性;丹参素、迷迭香酸、丹酚酸B对NF-κB有较好拮抗作用;藁本内酯、牛膝皂苷Ⅳ、甘草次酸可拮抗CCR4;茯苓酸、牛膝皂苷Ⅳ、丹酚酸B、藁本内酯、甘草次酸能抑制VEGFR2/KDR;党参炔苷、丹参素、丹酚酸B、迷迭香酸、藁本内酯可抑制MMP-3活性;丹参素、丹参酮Ⅱ_(A)、阿魏酸可抑制凝血酶活性,迷迭香酸、丹酚酸B、藁本内酯、甘草苷可抑制PDE3A活性;马钱子碱、士的宁、藁本内酯、牛膝皂苷Ⅳ、甘草次酸可拮抗ADRA1A。结论痹祺胶囊可能通过干预COX-2、NOS、NF-κB、CCR4、VEGFR2/KDR、MMP-3� 展开更多
关键词 痹祺胶囊 类风湿性关节炎 关键靶点 作用机制 药效物质基础 马钱子碱 士的宁 甘草苷
原文传递
重点实验室建设浅谈 被引量:4
19
作者 刘惠文 《现代科学仪器》 2006年第1期131-133,共3页
提出了重点实验室的7个软硬件建设目标,给出了包括建立多模式实验室构想在内的3项实验室建设措施和笔者认为重要的8条建设内容。
关键词 重点实验室 建设目标 建设措施 建设内容
下载PDF
基于网络药理学探讨盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症的作用机制
20
作者 詹洁莹 李国全 +3 位作者 滕希峰 李芷瑶 张轶君 何琳 《生物化工》 CAS 2023年第5期13-18,共6页
目的:运用网络药理学研究盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症潜在的作用靶点和作用机制。方法:通过GeneCards数据库收集盐酸雷洛昔芬与绝经后骨质疏松症的靶点,共同靶点的交集通过Venny 2.1工具获得,采用STRING数据库构建共同靶点的PPI(P... 目的:运用网络药理学研究盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症潜在的作用靶点和作用机制。方法:通过GeneCards数据库收集盐酸雷洛昔芬与绝经后骨质疏松症的靶点,共同靶点的交集通过Venny 2.1工具获得,采用STRING数据库构建共同靶点的PPI(Protein-Protein Interation,PPI),使用可视化软件Cytoscape 3.9.1的McCreight算法(MCC)对PPI进行分析,筛选出排名前10的中枢基因(Hub genes),通过DAVID生物信息学资源数据库进行GO生物功能、KEGG通路富集分析。结果:筛选出药物与疾病有168个共同靶点;关键靶点涉及STAT3、SRC、MAPK1、ESR1、JUN、PIK3R1、FOS、SP1、MAPK14和MYC等。盐酸雷洛昔芬可能通过调节STAT3、SRC、MAPK1、ESR1和JUN等关键基因,内分泌抵抗通路、糖尿病并发症晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、与磷脂酰肌醇相关的PI3K-Akt信号通路等治疗绝经后骨质疏松症。结论:本文预测了盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症的作用靶点和信号通路,可为下一步实验研究和研究方向奠定基础。 展开更多
关键词 盐酸雷洛昔芬 绝经后骨质疏松症 网络药理学 关键靶点 信号通路
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部