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Snail基因甲基化与TGFβ1诱导前列腺癌细胞发生EMT的相关性研究 被引量:7
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作者 杜彦丹 牛艺卿 +8 位作者 郑海军 王晓艳 姜玉海 陈海秋 李寅雁 孙刚 李春雨 陆德生 孙辉 《分子诊断与治疗杂志》 2019年第6期451-456,共6页
目的探讨Snail基因甲基化与转化生长因子β1(TGFβ1)诱导前列腺癌细胞上皮间质转化(EMT)过程的相关性。方法TGFβ1诱导前列腺癌PC3、DU145细胞,通过细胞形态、划痕及侵袭实验筛选EMT明显的细胞系;利用Westernblot、RT PCR技术检测该细胞... 目的探讨Snail基因甲基化与转化生长因子β1(TGFβ1)诱导前列腺癌细胞上皮间质转化(EMT)过程的相关性。方法TGFβ1诱导前列腺癌PC3、DU145细胞,通过细胞形态、划痕及侵袭实验筛选EMT明显的细胞系;利用Westernblot、RT PCR技术检测该细胞系EMT时相关Marker表达的变化,确定EMT过程中的决定性转录因子;沉默组蛋白去甲基化酶KDM4A的表达,观察前列腺癌细胞形态学及转录因子Snail表达的变化;收集前列腺良性增生组织(对照组)及Gleason分级四级以上的前列腺癌组织(实验组)各60例,检测Snail、E cadherin和Vimentin的表达。结果细胞形态学变化、划痕及侵袭实验证明TGFβ1诱导后前列腺癌细胞PC3具有明显的迁移及侵袭能力;Westernblot、RT PCR实验表明PC3细胞EMT时E cadherin表达下调,Snail1和Vimentin表达上调,其中Snail1变化最为明显。免疫组化结果显示对照组E cadherin细胞膜表达强阳性,Vimentin、Snail细胞质表达弱阳性;实验组E cadherin细胞膜表达弱阳性,Vimentin、Snail细胞质表达强阳性。沉默KDM4A表达,PC3细胞由间质转变为上皮形态,Snail1表达上调。结论Snail1甲基化富集程度改变与TGFβ1诱导前列腺癌细胞上皮间质转化相关。 展开更多
关键词 前列腺癌 TGFΒ1 上皮间质转化 SNAIL1 kdm4A
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牦牛KDM4A基因克隆、组织表达谱及其在卵母细胞和颗粒细胞中的表达 被引量:6
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作者 韩杰 熊显荣 +4 位作者 蔡雯祎 杨显英 阿果约达 张燕红 李键 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期291-299,共9页
本研究旨在阐明牦牛KDM4A基因的表达特性及其在牦牛卵母细胞和颗粒细胞中的作用。采集牦牛心、肝、脾、卵巢、肺、肾、睾丸、小肠、子宫、胃、大脑组织,以GenBank上已发布的黄牛KDM4A基因序列设计引物,利用RT-PCR方法扩增克隆牦牛KDM4A... 本研究旨在阐明牦牛KDM4A基因的表达特性及其在牦牛卵母细胞和颗粒细胞中的作用。采集牦牛心、肝、脾、卵巢、肺、肾、睾丸、小肠、子宫、胃、大脑组织,以GenBank上已发布的黄牛KDM4A基因序列设计引物,利用RT-PCR方法扩增克隆牦牛KDM4A基因及检测其在牦牛各组织中的表达谱,并使用在线软件ExPASY分析KDM4A基因的结构和功能。采用实时荧光定量PCR法检测牦牛不同时期卵母细胞和颗粒细胞中KDM4A基因的表达水平。结果表明,本研究克隆得到牦牛KDM4A基因3 289bp的cDNA序列。牦牛KDM4A核苷酸序列与其它哺乳动物的遗传距离较近,表明KDM4A基因在进化中较为保守。牦牛KDM4A基因CDs区为3 201bp,编码1 066个氨基酸残基,相对分子质量122.48ku。KDM4A蛋白为亲水不稳定的酸性蛋白,无跨膜区和信号肽,二级结构主要包含α-螺旋和无规卷曲,与三级结构分析结果一致。KDM4A基因在所选牦牛组织样本中均有表达,其中在卵巢、脾和睾丸中表达量最高。牦牛KDM4A mRNA在MII期颗粒细胞中表达量显著高于在MI期和GV期颗粒细胞中的表达量(P<0.05),GV期卵母细胞中,KDM4A mRNA的表达水平显著高于在MI期和MII期卵母细胞中的表达量(P<0.05)。综上表明,本研究成功克隆了KDM4A基因及其在牦牛卵母细胞和颗粒细胞成熟过程中mRNA表达水平的差异,表明KDM4A基因在卵母细胞及颗粒细胞成熟过程中发挥一定作用。 展开更多
关键词 牦牛 kdm4A 生物信息学 卵母细胞 颗粒细胞
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过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响
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作者 李亚楠 张贤君 +5 位作者 张宁 梁雅琳 张宇星 招华兴 李紫聪 黄思秀 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期67-77,共11页
组蛋白异常修饰是克隆胚胎发育的重要制约因素,组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4家族的过表达可以有效提高克隆胚胎的发育效率。为探究过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响,本研究在猪克隆胚胎1-细胞期和2-细胞期分别注射KDM4A m... 组蛋白异常修饰是克隆胚胎发育的重要制约因素,组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4家族的过表达可以有效提高克隆胚胎的发育效率。为探究过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响,本研究在猪克隆胚胎1-细胞期和2-细胞期分别注射KDM4A mRNA和KDM4D mRNA检测胚胎的囊胚率;收集1-细胞期注射KDM4A mRNA和胚胎注射水(对照组)的2-细胞期克隆胚胎检测H3K9me3表达水平;此外,收集1-细胞期注射KDM4A mRNA和胚胎注射水的4-细胞期克隆胚胎进行单细胞转录组测序,并对测序数据进行GO与KEGG富集分析。结果显示:在1-细胞期注射KDM4A mRNA的猪克隆胚胎囊胚率显著高于对照组(25.32±0.74%vs 14.78±0.87%),注射KDM4D mRNA对猪克隆胚胎囊胚率无明显作用(16.27±0.77%vs 14.78±0.87%);在2-细胞期注射KDM4A mRNA和KDM4D mRNA的克隆胚胎囊胚率与对照组相比均无显著差异(32.18±1.67%、30.04±0.91%vs 31.22±1.40%)。在1-细胞期注射KDM4A mRNA的克隆胚胎组蛋白H3K9me3表达水平低于对照组。通过测序,筛选出133个差异表达基因,其中上调基因52个、下调基因81个,GO分析主要富集到与蛋白质定位相关的通路,KEGG分析富集到细胞衰老和急性髓细胞白血病等相关通路。本研究结果表明,过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4A可以显著提高猪克隆胚胎的发育效率。 展开更多
关键词 克隆胚胎 H3K9me3 kdm4A kdm4D
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The emerging roles of lysine-specific demethylase 4A in cancer:Implications in tumorigenesis and therapeutic opportunities 被引量:1
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作者 Guanjun Yang Changyun Li +6 位作者 Fan Tao Yanjun Liu Minghui Zhu Yu Du Chenjie Fei Qiusheng She Jiong Chen 《Genes & Diseases》 SCIE CSCD 2024年第2期645-663,共19页
Lysine-specific demethylase 4 A(KDM4A,also named JMJD2A,KIA0677,or JHDM3A)is a demethylase that can remove methyl groups from histones H3K9me2/3,H3K36me2/3,and H1.4K26me2/me3.Accumulating evidence suggests that KDM4A ... Lysine-specific demethylase 4 A(KDM4A,also named JMJD2A,KIA0677,or JHDM3A)is a demethylase that can remove methyl groups from histones H3K9me2/3,H3K36me2/3,and H1.4K26me2/me3.Accumulating evidence suggests that KDM4A is not only involved in body homeostasis(such as cell proliferation,migration and differentiation,and tissue development)but also associated with multiple human diseases,especially cancers.Recently,an increasing number of studies have shown that pharmacological inhibition of KDM4A significantly attenuates tumor progression in vitro and in vivo in a range of solid tumors and acute myeloid leukemia.Although there are several reviews on the roles of the KDM4 subfamily in cancer development and therapy,all of them only briefly introduce the roles of KDM4A in cancer without systematically summarizing the specific mechanisms of KDM4A in various physiological and pathological processes,especially in tumorigenesis,which greatly limits advances in the understanding of the roles of KDM4A in a variety of cancers,discovering targeted selective KDM4A inhibitors,and exploring the adaptive profiles of KDM4A antagonists.Herein,we present the structure and functions of KDM4A,simply outline the functions of KDM4A in homeostasis and non-cancer diseases,summarize the role of KDM4A and its distinct target genes in the development of a variety of cancers,systematically classify KDM4A inhibitors,summarize the difficulties encountered in the research of KDM4A and the discovery of related drugs,and provide the corresponding solutions,which would contribute to understanding the recent research trends on KDM4A and advancing the progression of KDM4A as a drug target in cancer therapy. 展开更多
关键词 Cancer therapy Drug resistance Histone demethylation JmjC domain kdm4A
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基于KDM4D受体研究隔药饼灸抑制结肠炎相关性结肠癌肿瘤生长的作用机制
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作者 徐宏潇 王逸然 +11 位作者 徐静 黄艳 乔宇 李斐斐 李国娜 赵继梦 李峰 陈子怡 李昆珊 顾沐恩 吴焕淦 杨燕萍 《Journal of Acupuncture and Tuina Science》 CAS CSCD 2024年第1期1-11,共11页
目的:从组蛋白赖氨酸去甲基化酶4D(KDM4D)的角度探究隔药饼灸抑制结肠炎相关性结肠癌(CAC)肿瘤生长的效应机制。方法:将近交系雄性Sprague-Dawley大鼠随机分为正常组、CAC组、隔药饼灸组和抑制剂组。除正常组外,其余3组大鼠采用偶氮甲烷... 目的:从组蛋白赖氨酸去甲基化酶4D(KDM4D)的角度探究隔药饼灸抑制结肠炎相关性结肠癌(CAC)肿瘤生长的效应机制。方法:将近交系雄性Sprague-Dawley大鼠随机分为正常组、CAC组、隔药饼灸组和抑制剂组。除正常组外,其余3组大鼠采用偶氮甲烷(AOM)联合葡聚糖硫酸钠(DSS)制备CAC大鼠模型。正常组和CAC组不干预;隔药饼灸组大鼠取气海和双侧天枢,每次每穴灸2壮,每日1次,每周休息1 d,共30 d;抑制剂组予以KDM4D抑制剂5-氯-8-羟基喹啉(5-c-8HQ)腹腔注射,每日1次,共30 d。干预后观察各组大鼠的一般情况、结肠长度、瘤体数量和体积及结肠组织病理学变化。采用实时荧光定量聚合酶链反应法检测腺瘤样息肉病基因(APC)、体轴抑制因子(Axin)、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、基质金属蛋白酶(MMP)-7及MMP-9 mRNA的表达。免疫组化法检测结肠组织增殖细胞核抗原(PCNA)、cleaved caspase3、KDM4D、APC及Axin蛋白的表达。结果:与正常组相比,CAC组大鼠一般情况较差,结肠长度显著缩短(P<0.01),结肠组织瘤体数目增多、体积增大(P<0.01),可见腺管结构明显紊乱,出现“背靠背”及共壁现象,高级别腺癌形成;CAC组结肠组织PCNA及KDM4D蛋白表达水平显著升高(P<0.01),cleaved caspase3、APC及Axin蛋白表达水平显著降低(P<0.01),cyclin D1、MMP-7及MMP-9 mRNA表达水平显著升高(P<0.01),APC及Axin mRNA表达水平显著降低(P<0.01)。与CAC组相比,隔药饼灸组与抑制剂组大鼠的一般情况改善,结肠长度显著增加(P<0.01),结肠瘤体数目减少、体积缩小(P<0.05),大鼠的结肠组织可见结肠上皮细胞增生,核增大且深染,异型增生,炎性细胞浸润。隔药饼灸组与抑制剂组大鼠结肠组织PCNA及KDM4D蛋白表达水平显著降低(P<0.01),cleaved caspase3、APC及Axin蛋白表达水平显著升高(P<0.01),cyclin D1、MMP-7及MMP-9 mRNA表达降低(P<0.05),APC及Axin mRNA表达升高(P<0.05)。结论:隔药饼灸能调控C 展开更多
关键词 气海 天枢 药饼灸疗法 结肠炎相关性肿瘤 结直肠肿瘤 组蛋白赖氨酸去甲基化酶4D Wnt/β-catenin信号通路 大鼠
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KDM4A的结构、功能及其在肿瘤中作用的研究进展 被引量:2
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作者 季涛 燕晓霞 +1 位作者 韩兵社 张俊芳 《生命科学》 CSCD 北大核心 2021年第6期742-751,共10页
组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传修饰,而赖氨酸特异性去甲基化酶4A(KDM4A,也称JMJD2A)能特异性催化组蛋白赖氨酸残基的去甲基化过程,从而调节染色质的结构和基因转录。近年来研究发现,KDM4A参与调控了细胞增殖、分化、发育、代谢等多... 组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传修饰,而赖氨酸特异性去甲基化酶4A(KDM4A,也称JMJD2A)能特异性催化组蛋白赖氨酸残基的去甲基化过程,从而调节染色质的结构和基因转录。近年来研究发现,KDM4A参与调控了细胞增殖、分化、发育、代谢等多种重要的生物学进程,其功能异常也和肿瘤等疾病的发生发展密切相关,成为未来肿瘤治疗的重要靶点。KDM4A在肿瘤中的作用是目前的研究热点,该文就KDM4A的结构、作用机制、生物学功能、在肿瘤中作用及抑制剂开发的最新研究进展作一综述。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化 kdm4A 发育 肿瘤
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PHF20相互作用蛋白质组学分析及其在肿瘤中的作用研究 被引量:1
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作者 孙干成 侯永强 +1 位作者 高杰 邱熔芳 《天津医科大学学报》 2019年第6期563-566,共4页
目的:探究PHF20相互作用蛋白,初步揭示PHF20促进肿瘤发生发展的分子机制。方法:通过免疫亲和纯化联合银染质谱的方法检测PHF20的相互作用蛋白。免疫共沉淀方法对质谱的结果进行验证。在干扰PHF20及对照乳腺癌细胞系中,用EdU和转移小室... 目的:探究PHF20相互作用蛋白,初步揭示PHF20促进肿瘤发生发展的分子机制。方法:通过免疫亲和纯化联合银染质谱的方法检测PHF20的相互作用蛋白。免疫共沉淀方法对质谱的结果进行验证。在干扰PHF20及对照乳腺癌细胞系中,用EdU和转移小室的实验检测PHF20在乳腺癌发生发展中的作用。结果:质谱结果显示,PHF20可以结合KDM4A和PRC2等复合物,免疫共沉淀验证了PHF20与各个复合物之间相互作用的可信性。EdU和转移小室实验表明,干扰PHF20后与对照细胞相比,其增殖和侵袭能力显著降低。结论:PHF20在体内与多种表观遗传调控相关的复合物相互作用,并促进肿瘤细胞增殖和侵袭的能力。 展开更多
关键词 PHF20 kdm4A PRC2 恶性肿瘤
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KDM4A在儿童和成人甲状腺乳头状癌中的表达及诊断价值 被引量:1
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作者 金雅琼 冯林 +11 位作者 初平 张杰 邰隽 韩阳 王生才 耿江桥 洪恩宇 韩书婧 于永波 鲁洁 倪鑫 郭永丽 《肿瘤学杂志》 CAS 2016年第10期838-843,共6页
[目的]探讨KDM4A在儿童和成人甲状腺乳头状癌中的表达及诊断价值。[方法]采用实时荧光定量PCR的方法进行组织KDM4A表达检测,其中甲状腺乳头状癌组织样本22例,癌旁组织样本13例(配对样本共13对)。其中,儿童甲状腺乳头状癌样本10例,癌旁组... [目的]探讨KDM4A在儿童和成人甲状腺乳头状癌中的表达及诊断价值。[方法]采用实时荧光定量PCR的方法进行组织KDM4A表达检测,其中甲状腺乳头状癌组织样本22例,癌旁组织样本13例(配对样本共13对)。其中,儿童甲状腺乳头状癌样本10例,癌旁组织3例(配对样本3对);成人甲状腺乳头状癌标本12例,癌旁组织10例(配对样本10对)。并采用受试者工作特征(ROC)曲线对其诊断价值进行评估。[结果]甲状腺乳头状癌组织较配对癌旁组织中KDM4A表达显著增高(P=0.011),非配对比较甲状腺乳头状癌组织较癌旁组织中KDM4A表达显著增高(P=0.027);KDM4A诊断PTC的ROC曲线下面积指数为0.794(P=0.004)(Youden指数0.538);儿童甲状腺乳头状癌中KDM4A表达略高于成人(P>0.05),且儿童甲状腺乳头状癌标本中KDM4A的ROC曲线下面积指数为0.831(P=0.007)(Youden指数0.615),高于成人标本的0.763,P=0.026(Youden指数0.538)。[结论 ]KDM4A表达在甲状腺乳头状癌中显著高于癌旁组织,并明确了KDM4A具有诊断价值。此外,本研究还明确了KDM4A作为分子标志物在儿童甲状腺乳头状癌中的诊断价值高于成人。 展开更多
关键词 kdm4A 甲状腺肿瘤 受试者工作特征曲线
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口腔鳞癌组织中KDM4A表达与患者临床病理参数和预后的关系 被引量:2
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作者 何海蕾 严俊峰 +1 位作者 王羽 刘建伟 《山东医药》 CAS 2018年第29期8-11,共4页
目的探讨口腔鳞癌组织中组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A(KDM4A)的表达变化及其与患者临床病理参数和预后的关系。方法选取110例口腔鳞癌患者的癌组织,并取其中21例患者的癌旁正常口腔黏膜组织(距离癌组织>5 cm)作为对照,免疫组化法检测样... 目的探讨口腔鳞癌组织中组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A(KDM4A)的表达变化及其与患者临床病理参数和预后的关系。方法选取110例口腔鳞癌患者的癌组织,并取其中21例患者的癌旁正常口腔黏膜组织(距离癌组织>5 cm)作为对照,免疫组化法检测样本组织中KDM4A蛋白表达。采用Kaplan-Meier生存曲线进行预后评估。分析口腔鳞癌组织中KDM4A表达与患者临床病理参数、预后的关系。结果口腔鳞癌组织中KDM4A表达水平较癌旁正常口腔黏膜组织升高(P<0.05)。口腔鳞癌组织中KDM4A表达与患者的性别、年龄、吸烟史、饮酒史和肿瘤组织分化程度均无关(P均>0.05),与TNM分期和是否发生淋巴结转移密切相关(P均<0.05)。与KDM4A表达阳性组比较,KDM4A表达阴性组患者生存率高、生存时间长(P均<0.05)。结论 KDM4A在口腔鳞癌组织中异常高表达,其与患者的TNM分期、淋巴结转移及预后有关。 展开更多
关键词 口腔鳞癌 组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A 临床病理参数 预后
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沼泽型水牛KDM4A(JMJD2A)基因克隆分析与表达模式
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作者 许洁 赵鑫 +7 位作者 俸云 史鹏飞 邓凯 沈朋雷 文冬梅 王露露 石德顺 陆凤花 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2386-2391,共6页
旨在克隆并分析水牛赖氨酸特异性去甲基化酶4A(lysine-specific demethylase 4A,KDM4A)基因,并检测其在水牛不同组织中的表达情况,探讨KDM4A在水牛胚胎发育过程中的功能。提取卵巢组织的RNA,获得水牛KDM4A基因CDS区的全长序列。结果显示... 旨在克隆并分析水牛赖氨酸特异性去甲基化酶4A(lysine-specific demethylase 4A,KDM4A)基因,并检测其在水牛不同组织中的表达情况,探讨KDM4A在水牛胚胎发育过程中的功能。提取卵巢组织的RNA,获得水牛KDM4A基因CDS区的全长序列。结果显示,水牛KDM4A基因编码区全长3151bp,编码1067个氨基酸。水牛KDM4A基因与黄牛、绵羊、骆驼和家犬的同源性分别为99%,97%,92%,91%;且在不同物种间高度保守,符合生物的进化规律。KDM4A蛋白包含369个α-螺旋,85个β-转角,409个无规卷曲和204个延伸链,为亲水不稳定的酸性蛋白。qRT-PCR结果显示,KDM4A在水牛肌肉、肺脏、卵巢、大脑、皮肤、心脏、脾脏、肾脏和肝脏组织中均有表达,其中肌肉、肺脏、卵巢中表达量较高,肝脏和肾脏中表达量较低。本研究克隆得到了沼泽型水牛KDM4A基因,并对不同组织内KDM4A进行了基础的生物信息学分析,为阐明KDM4A在水牛胚胎发育过程中的功能,提高水牛胚胎发育水平提供理论基础。 展开更多
关键词 水牛 kdm4A 组蛋白修饰 克隆分析 胚胎发育
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过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期Xist表达的影响
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作者 杨瑛楠 蔡玉 +4 位作者 刘孜斐 李东旭 万永杰 王锋 邓明田 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1227-1234,共8页
[目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过... [目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[结果]与对照组相比,组蛋白H3K9甲基化(H3K9me3)水平在2~8细胞期和囊胚期过表达Kdm4d的山羊孤雌胚胎中均显著降低,过表达Kdm4d山羊的4、8细胞期胚胎和囊胚的发育潜能无显著变化;Xist表达水平在过表达Kdm4d的山羊8细胞期孤雌胚胎中显著升高,但Xist启动子仍维持高甲基化,与对照组相比无显著变化。[结论]Kdm4d能有效移除孤雌胚胎中H3K9me3修饰,促进Xist表达,但不影响Xist启动子DNA甲基化水平和山羊孤雌胚胎发育潜能。本研究为深入理解Kdm4d调控山羊早期胚胎X染色体失活的机制奠定了基础。 展开更多
关键词 kdm4d XIST 孤雌胚胎 胚胎基因组激活 山羊
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MicroRNA-409-5p Inhibits GIST Tumorigenesis and Improves Imatinib Resistance by Targeting KDM4D Expression
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作者 Cheng QIU Yong-dong FENG Xi YANG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第5期935-946,共12页
Objective Gastrointestinal stromal tumors(GISTs)can rapidly proliferate through angiogenesis.Previous studies indicated the potential influence of microRNA on the progression of tumor immature angiogenesis.This study ... Objective Gastrointestinal stromal tumors(GISTs)can rapidly proliferate through angiogenesis.Previous studies indicated the potential influence of microRNA on the progression of tumor immature angiogenesis.This study aimed to explore the specific mechanism by which microRNA-409-5p(miR-409-5p)contributes to GIST.Methods To identify genes potentially involved in the development and progression of GIST,the differences of miR-409-5p between tumors and adjacent tissues were first analyzed.Following this analysis,target genes were predicted.To further investigate the function of miRNA in GIST cells,two GIST cell lines(GIST-T1 and GIST882)were transfected with lentiviruses that stably expressed miR-409-5p and scrambled miRNA(negative control).Later,the cells were subjected to Western blotting and ELSA to determine any differences in angiogenesis-related genes.Results In GISTs,there was a decrease in the expression levels of miR-409-5p compared to the adjacent tissues.It was observed that the upregulation of miR-409-5p in GIST cell lines effectively inhibited the proteins hypoxia-inducible transcription factor 1β(HIF1β)and vascular endothelial growth factor A(VEGF-A).Further investigations revealed that miR-409-5p acted as an inhibitor of angiogenesis by binding to the 3′-UTR of Lysine-specific demethylase 4D(KDM4D)mRNA.Moreover,the combination of miR-409-5p with imatinib enhanced its inhibitory effect on angiogenesis.Conclusion This study demonstrated that the miRNA-409-5p/KDM4D/HIF1β/VEGF-A signaling pathway could serve as a novel target for the development of therapeutic strategies for the treatment of imatinib-resistance in GIST patients. 展开更多
关键词 microRNA-409-5p kdm4D gastrointestinal stromal tumor
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组蛋白去甲基化酶KDM4B促进根尖牙乳头干细胞中成骨和成牙本质分化 被引量:13
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作者 姚睿 范志朋 《北京口腔医学》 CAS 2013年第4期181-184,共4页
目的研究组蛋白去甲基化酶KDM4B对根尖牙乳头干细胞定向分化能力的影响。方法人重组骨形成蛋白4(BMP4)刺激根尖牙乳头干细胞后检测KDM4B的表达;利用慢病毒转染过表达或者基因敲除KDM4B进行获得性或丧失性功能研究。通过检测碱性磷酸酶(A... 目的研究组蛋白去甲基化酶KDM4B对根尖牙乳头干细胞定向分化能力的影响。方法人重组骨形成蛋白4(BMP4)刺激根尖牙乳头干细胞后检测KDM4B的表达;利用慢病毒转染过表达或者基因敲除KDM4B进行获得性或丧失性功能研究。通过检测碱性磷酸酶(ALP)活性、茜素红染色、钙离子定量分析研究根尖牙乳头干细胞体外成骨和成牙本质分化能力。结果 BMP4促进根尖牙乳头干细胞KDM4B的表达。基因敲除KDM4B抑制根尖牙乳头干细胞ALP活性及体外矿化能力、促进转录因子PPAR-gamma的表达。过表达KDM4B增强根尖牙乳头干细胞ALP活性和体外矿化能力。结论组蛋白去甲基化酶KDM4B具有促进根尖牙乳头干细胞成骨和成牙本质分化的潜能。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化酶 根尖牙乳头干细胞 成骨和成牙本质分化 kdm4B
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过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎体外发育效率的影响 被引量:4
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作者 吴霄 李果 +5 位作者 敖政 石俊松 蔡更元 刘德武 吴珍芳 李紫聪 《广东农业科学》 CAS 2017年第10期96-101,176,共7页
为了探索过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B/KDM4D对猪克隆胚胎体外发育效率的影响,研究构建了鼠源KDM4B/KDM4D表达载体,通过体外转录获得KDM4B/KDM4D mRNA并将其分别显微注射至猪克隆胚胎。结果显示两组注射的克隆胚胎的H3K9me3水平... 为了探索过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B/KDM4D对猪克隆胚胎体外发育效率的影响,研究构建了鼠源KDM4B/KDM4D表达载体,通过体外转录获得KDM4B/KDM4D mRNA并将其分别显微注射至猪克隆胚胎。结果显示两组注射的克隆胚胎的H3K9me3水平、卵裂率和囊胚率与对照克隆胚胎无显著差异,但两组注射的克隆胚胎的H3K9me3去甲基化酶表达水平显著高于无注射的对照克隆胚胎,且注射KDM4B mRNA的克隆胚胎的囊胚细胞数显著高于注射KDM4D mRNA的克隆胚胎及对照克隆胚胎,表明过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B可以显著提高猪克隆胚胎的体外发育效率。 展开更多
关键词 克隆胚胎 H3K9me3 kdm4B kdm4D
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山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析 被引量:2
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作者 李昆谕 刘玉芳 +4 位作者 陶林 江炎庭 欧阳依娜 储明星 洪琼花 《特产研究》 2023年第1期6-13,共8页
本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传... 本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性状表型(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学结果表明,EGR4 g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25 A位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM4C g.37764228T>A位点在济宁青山羊中为中度多态(0.25 A和g.37768026C>G位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM6A g.27177505C>A在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25 A、g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM4C g.37764228T>A、g.37767773T>A和g.37768026C>G在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM6A g.27102554T>A和g.27177505C>A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在云上黑山羊中EGR4 g.11029600T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM4C g.37764228T>A位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM6A g.27177505C>A位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型(P<0.05),g.27102554T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05)。综上所述,EGR4 g.11029600T>A、KDM4C g.37764228T>A和KDM6A g.27102554T>A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记;KDM4Cg.37764228T>A和KDM6Ag.27177505C>A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。 展开更多
关键词 山羊 繁殖性状 SNPS EGR4 kdm4C kdm6A
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kdm4A在斑马鱼细胞低温胁迫过程中的作用 被引量:2
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作者 刘玮 罗军涛 +3 位作者 谢婷婷 燕晓霞 张俊芳 韩兵社 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期4467-4474,共8页
赖氨酸特异性去甲基化酶4A基因(lysine demethylase 4A,kdm4A)编码的蛋白具有去甲基化酶活性,并且在基因表达调控中起重要作用。该基因在斑马鱼中有两种类型kdm4aa和kdm4ab。本实验室前期对18℃低温胁迫下斑马鱼(Danio rerio)胚胎成纤... 赖氨酸特异性去甲基化酶4A基因(lysine demethylase 4A,kdm4A)编码的蛋白具有去甲基化酶活性,并且在基因表达调控中起重要作用。该基因在斑马鱼中有两种类型kdm4aa和kdm4ab。本实验室前期对18℃低温胁迫下斑马鱼(Danio rerio)胚胎成纤维样细胞(zebrafish embryos fibroblast like cell line,ZF4)的转录组数据分析发现kdm4aa表达量显著降低,但是该基因在鱼类低温胁迫下的作用仍不清楚。为了研究这两种基因在鱼类低温胁迫下的功能,本研究用EcoRⅠ和AgeⅠ酶切构建了pLKO.1-kdm4aa-shRNA、pLKO.1-kdm4ab-shRNA和pLKO.1-negative control(nc)三种重组质粒,并分别与慢病毒包装质粒pCMV-DR8.9.1、pCMV-VSVG共同转染至293T细胞中,经293T细胞包装的病毒,感染斑马鱼ZF4细胞,RT-qPCR检测表明ZF4细胞中kdm4aa和kdm4ab均成功被敲降。随后将细胞于28℃培养(Control)或经18℃低温处理1 d,使用台盼蓝染色法检测ZF4细胞存活率,并进一步检测了细胞内自噬相关基因beclin1和LC3的表达情况。结果显示:在18℃条件下,敲降kdm4aa的细胞与nc组细胞相比存活率显著上升(p<0.05),而敲降kdm4ab的细胞存活率与nc组相比无明显变化,证明敲降kdm4aa在低温胁迫下保护细胞。进一步的研究发现,敲降kdm4aa的细胞内自噬相关基因beclin1及LC3的表达量均显著上调,而敲降kdm4ab的细胞变化不显著,提示敲降kdm4aa在低温胁迫下对斑马鱼细胞的保护作用可能是通过上调自噬水平引起的。该研究为后期斑马鱼低温胁迫分子机制的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 kdm4aa kdm4ab 存活率 ZF4 细胞 低温胁迫 自噬
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组蛋白去甲基化酶家族中组蛋白去甲基化酶4作用机制及其应用的研究进展 被引量:6
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作者 叶覃 Andreana HOLOWATYJ +2 位作者 Roselyne M.LABBE 刘辉 ZengquanYANG 《转化医学杂志》 2014年第1期13-18,共6页
组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传性修饰方式,是一个可逆的动态调节过程。组蛋白去甲基化酶家族中组蛋白去甲基化酶4能催化去除组蛋白赖氨酸残基甲基标记,调节染色质的结构,参与精细调控基因转录,维持染色质的活性和非活性平衡。组蛋... 组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传性修饰方式,是一个可逆的动态调节过程。组蛋白去甲基化酶家族中组蛋白去甲基化酶4能催化去除组蛋白赖氨酸残基甲基标记,调节染色质的结构,参与精细调控基因转录,维持染色质的活性和非活性平衡。组蛋白去甲基化酶4异常可能导致细胞增殖、分化、个体发育、能量代谢及肿瘤发生发展等多种生物进程异常。研究显示组蛋白去甲基化酶4可作为新的药物靶标。本文就组蛋白去甲基化酶4家族的结构、作用机制、在疾病发生发展进程中的生物学功能及特异性抑制剂开发的最新研究进展作一综述。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化酶 组蛋白去甲基化酶4 肿瘤
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敲除kdm4ab对斑马鱼低温耐受能力的影响
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作者 张梦冉 罗军涛 +2 位作者 张瑶 韩兵社 张俊芳 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期67-73,共7页
为深入研究kdm4ab基因在鱼类低温胁迫下的作用,以斑马鱼(Danio rerio)为模式生物,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建kdm4ab^(-/-)斑马鱼品系。RT-qPCR结果显示,与WT斑马鱼相比,kdm4ab^(-/-)斑马鱼的kdm4ab mRNA表达量显著下调(P<0.000... 为深入研究kdm4ab基因在鱼类低温胁迫下的作用,以斑马鱼(Danio rerio)为模式生物,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建kdm4ab^(-/-)斑马鱼品系。RT-qPCR结果显示,与WT斑马鱼相比,kdm4ab^(-/-)斑马鱼的kdm4ab mRNA表达量显著下调(P<0.000 1),而kdm4c的mRNA表达量补偿性增加(P<0.05)。斑马鱼行为轨迹跟踪系统检测发现,18℃低温下kdm4ab^(-/-)斑马鱼幼鱼的最大加速度显著降低(P<0.05)。8℃低温下kdm4ab^(-/-)斑马鱼的半数致死时间(LT50)显著低于WT斑马鱼(P<0.000 1);低温处理后kdm4ab^(-/-)斑马鱼的γH2A.X表达量明显增加,ROS水平升高,即DNA损伤增强。研究表明,敲除kdm4ab基因降低了低温下斑马鱼的耐受能力及运动能力,这为鱼类的低温耐受机制研究提供新思路。 展开更多
关键词 kdm4ab 斑马鱼 CRISPR/Cas9 低温
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MeRIP-qPCR技术检测RNA m^(6)A甲基化修饰对t(8;21)AML细胞中KDM4B基因表达的调控作用
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作者 李雨晴 邵杨柳 +2 位作者 李梦月 王莉莉 高晓宁 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期382-388,共7页
目的:通过MeRIP联合逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术,证明WTAP介导的RNA m^(6)A修饰对伴t(8;21)急性髓系白血病(AML)细胞中KDM4B基因的直接调控作用。方法:采用靶向WTAP或KDM4B基因的短发夹RNA(small hairpin RNA,shRNA)慢病毒载体沉默t... 目的:通过MeRIP联合逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术,证明WTAP介导的RNA m^(6)A修饰对伴t(8;21)急性髓系白血病(AML)细胞中KDM4B基因的直接调控作用。方法:采用靶向WTAP或KDM4B基因的短发夹RNA(small hairpin RNA,shRNA)慢病毒载体沉默t(8;21)AML细胞系Kasumi-1和SKNO-1中WTAP或KDM4B基因表达,以转染随机打乱序列(scramble)的shRNA的细胞为对照。用超纯RNA提取试剂盒(DNaseⅠ)提取细胞RNA,Magna MeRIP^(TM)m^(6)A Kit试剂盒富集甲基化修饰片段,并通过RT-qPCR检测m^(6)A甲基化修饰的RNA区域;采用蛋白免疫印迹实验(Western blot)和逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术检测细胞中WTAP、KDM4B蛋白和mRNA的表达水平。采用克隆形成实验检测细胞体外克隆形成能力。结果:沉默Kasumi-1细胞中WTAP的表达后,m^(6)A甲基化修饰在KDM4B mRNA 3’UTR的富集程度显著下降(P<0.01),沉默Kasumi-1和SKNO-1细胞中WTAP的表达可显著抑制KDM4B蛋白(P<0.001)和mRNA表达水平(Kasumi-1:P<0.001;SKNO-1:P<0.01)、细胞体外克隆形成能力下降(Kasumi-1:P<0.001;SKNO-1:P<0.01)。结论:t(8;21)AML细胞系中,WTAP通过调控KDM4B基因mRNA 3’UTR的m^(6)A修饰调控KDM4B的表达,沉默KDM4B表达可以抑制t(8;21)AML细胞增殖。 展开更多
关键词 MeRIP-qPCR 急性髓系白血病 t(8 21)染色体易位 kdm4B RNA m^(6)A甲基化修饰
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斑马鱼中kdm4aa基因对低温耐受能力的影响
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作者 张瑶 罗军涛 +3 位作者 张梦冉 韩丽洁 韩兵社 张俊芳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期91-99,共9页
为了研究赖氨酸特异性去甲基化酶4aa(lysine demethylase 4aa,kdm4aa)在斑马鱼(Danio rerio)低温耐受能力中的作用,本研究通过实时定量PCR检测kdm4aa^(-/-)斑马鱼中kdm4其他家族成员的表达水平和低温处理后野生型(wild type,WT)斑马鱼中... 为了研究赖氨酸特异性去甲基化酶4aa(lysine demethylase 4aa,kdm4aa)在斑马鱼(Danio rerio)低温耐受能力中的作用,本研究通过实时定量PCR检测kdm4aa^(-/-)斑马鱼中kdm4其他家族成员的表达水平和低温处理后野生型(wild type,WT)斑马鱼中kdm4aa基因的表达水平;通过斑马鱼行为轨迹跟踪系统检测低温下kdm4aa^(-/-)幼鱼的运动能力;采用逐级降温方法检测kdm4aa^(-/-)斑马鱼低温耐受能力;通过DCFH-DA荧光探针、ATP检测试剂盒、Western blot检测低温下kdm4aa^(-/-)斑马鱼中活性氧(reactive oxygen species,ROS)、腺苷三磷酸(adenosine triphosphate,ATP)、磷酸化组蛋白H2A.X(gamma histone H2A.X,γH2A.X)和微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3,LC3)水平。实时定量PCR结果显示,kdm4aa^(-/-)斑马鱼中kdm4ab、kdm4b基因的mRNA水平补偿性增加,kdm4c基因的mRNA水平与野生型斑马鱼的相比无显著性差异。斑马鱼行为轨迹跟踪系统检测发现,在18℃低温下,kdm4aa基因失活后斑马鱼幼鱼的移动距离显著增加。8℃低温下,野生型斑马鱼中kdm4aa基因的mRNA水平显著升高。与野生型斑马鱼相比,低温处理后kdm4aa^(-/-)斑马鱼的半数致死时间LT50显著降低(P<0.0001);ROS水平显著升高(P<0.0001);ATP含量显著降低(P<0.01);γH2A.X蛋白水平上升;LC3蛋白水平下降。结果表明:在低温环境下,kdm4aa^(-/-)斑马鱼的ROS积累导致ATP合成能力降低和DNA损伤增加,同时kdm4aa^(-/-)斑马鱼自噬能力降低,从而使斑马鱼的低温耐受能力降低。 展开更多
关键词 kdm4aa基因 斑马鱼 低温耐受 DNA损伤
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