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KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序及一个新等位基因的鉴定
被引量:
1
1
作者
孙革
王畅
+3 位作者
甄建新
张国彬
徐筠娉
邓志辉
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期694-697,共4页
目的建立K工R2DLI框架基因cDNA的分子克隆测序方法,并鉴定南方汉族人群一个新的KIR2DL1等位基因。方法对-K豫2DL1框架基因测序分型结果异常的外周血样,提取mRNA,反转录为cDNA,用1对KIR2DLl框架基因特异性PCR引物进行扩增,特异性扩...
目的建立K工R2DLI框架基因cDNA的分子克隆测序方法,并鉴定南方汉族人群一个新的KIR2DL1等位基因。方法对-K豫2DL1框架基因测序分型结果异常的外周血样,提取mRNA,反转录为cDNA,用1对KIR2DLl框架基因特异性PCR引物进行扩增,特异性扩增产物(1.2kb)经切胶回收纯化后,进行分子克隆和单倍型测序。结果KIR2DL1特异性PCR扩增产物,经分子克隆和单倍型测序,检出1个正常的K/R2DL1*00302等位基因和1个新变异的KIR2DL1等位基因。该新等位基因的序列与KIR2DL1*00302最相近,但存在编码区nt 188A〉G点突变、位于第4外显子的第42密码子由GAG变成GGG,导致第42位氨基酸残基发生GIu42Gly改变;其序列提交GenBank(序列号:KP025960)和IPD-KIR数据库(IWS40001982),已被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR2DL1*031。结论我们建立了KIR2DL1框架基因cDNA分子克隆测序方法,在等位基因水平的KIR研究中具有广泛的应用前景。
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关键词
kir
2
dl
1
框架
基因
测序分型
cDNA
分子克隆
单倍型测序
新等位
基因
原文传递
题名
KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序及一个新等位基因的鉴定
被引量:
1
1
作者
孙革
王畅
甄建新
张国彬
徐筠娉
邓志辉
机构
广东省深圳市血液中心免疫遗传研究室
大连医科大学检验医学院
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期694-697,共4页
基金
国家自然科学基金(81373158)
文摘
目的建立K工R2DLI框架基因cDNA的分子克隆测序方法,并鉴定南方汉族人群一个新的KIR2DL1等位基因。方法对-K豫2DL1框架基因测序分型结果异常的外周血样,提取mRNA,反转录为cDNA,用1对KIR2DLl框架基因特异性PCR引物进行扩增,特异性扩增产物(1.2kb)经切胶回收纯化后,进行分子克隆和单倍型测序。结果KIR2DL1特异性PCR扩增产物,经分子克隆和单倍型测序,检出1个正常的K/R2DL1*00302等位基因和1个新变异的KIR2DL1等位基因。该新等位基因的序列与KIR2DL1*00302最相近,但存在编码区nt 188A〉G点突变、位于第4外显子的第42密码子由GAG变成GGG,导致第42位氨基酸残基发生GIu42Gly改变;其序列提交GenBank(序列号:KP025960)和IPD-KIR数据库(IWS40001982),已被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR2DL1*031。结论我们建立了KIR2DL1框架基因cDNA分子克隆测序方法,在等位基因水平的KIR研究中具有广泛的应用前景。
关键词
kir
2
dl
1
框架
基因
测序分型
cDNA
分子克隆
单倍型测序
新等位
基因
Keywords
kir
2
dl
1 framework gene
Sequence-based typing
Complementary DNA
Cloning
Haplotype sequencing
Novel allele
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序及一个新等位基因的鉴定
孙革
王畅
甄建新
张国彬
徐筠娉
邓志辉
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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