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陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的结构特征和无序性分析 被引量：5
1
作者 王俊娟 阴祖军 +6 位作者 王德龙 王帅 王晓歌 樊伟丽 郭丽雪 陈超 叶武威 《中国棉花》 2017年第8期17-19,28,共4页
利用生物信息学对陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的氨基酸组成理化性质、保守结构域K片段以及无序性进行分析。结果表明,GhDHN1蛋白无明显跨膜结构,不是分泌蛋白,其2个序列相近的K片段均具有高度亲水性,属于部分无序性蛋白。推测GhDHN1的这些... 利用生物信息学对陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的氨基酸组成理化性质、保守结构域K片段以及无序性进行分析。结果表明,GhDHN1蛋白无明显跨膜结构,不是分泌蛋白,其2个序列相近的K片段均具有高度亲水性,属于部分无序性蛋白。推测GhDHN1的这些结构特性与其调控棉花响应低温胁迫有关。 展开更多
关键词 棉花 脱水素蛋白GhDHN1 结构特征 k片段 无序性
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核磁共振波谱对大米脱水素K片段在模拟膜中的结构研究 被引量：3
2
作者 薛蓉 吴亦洁 李晓晶 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期664-669,共6页
脱水素是一类植物抗逆相关蛋白,可帮助植物抵抗干旱、低温、盐碱等环境胁迫。富含赖氨酸的K片段是脱水素中的保守功能片段,在低温保护和膜保护功能中起至关重要的作用。目前,脱水素及K片段的作用机理仍不完全清楚。本研究采用圆二色谱(... 脱水素是一类植物抗逆相关蛋白,可帮助植物抵抗干旱、低温、盐碱等环境胁迫。富含赖氨酸的K片段是脱水素中的保守功能片段,在低温保护和膜保护功能中起至关重要的作用。目前,脱水素及K片段的作用机理仍不完全清楚。本研究采用圆二色谱(CD)和核磁共振波谱(NMR)方法及分子动力学模拟计算研究了具有抗菌活性的大米脱水素K片段在模拟膜中的三维结构及其与膜的结合方式。圆二色谱研究表明,水中呈现无规卷曲构象的K片段在模拟膜中会形成α-螺旋结构。核磁共振结构研究进一步证实了K片段在模拟膜中的空间结构,即中间部分形成了两亲性的α-螺旋结构,其中,疏水残基位于螺旋结构的一面,亲水残基位于螺旋结构的另一面。扩散排序(DOSY)核磁共振实验表明,K片段与膜在水溶液中形成了稳定的结合体;顺磁性探针检测表明,整个K片段插入膜中,其中疏水面朝向模拟膜的疏水核,其它部分朝向模拟膜亲水表层。本研究得到的K片段在模拟膜中的精细结构为理解环境胁迫下K片段及脱水素与膜的作用机理提供了重要信息。 展开更多
关键词 脱水素 核磁共振 三维结构 膜结合 分子动力学模拟 k片段
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浙江省散发猪链球菌病临床分离株存在89K候选致病岛 被引量：2
3
作者 朱水荣 王志刚 +6 位作者 陈恩富 杨婷婷 张政 徐宝祥 金大智 何剑琴 王复甦 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1110-1113,共4页
目的对浙江省临床分离猪链球菌血清2型（SS2）菌株进行89K候选致病岛检测。方法用多种特异性引物进行PCR扩增检测，同时对89K的3个扩增片段进行测序，并结合有关资料进行生物信息学和流行病学分析。结果8株SS2菌株，均检出89K（1＆2）、... 目的对浙江省临床分离猪链球菌血清2型（SS2）菌株进行89K候选致病岛检测。方法用多种特异性引物进行PCR扩增检测，同时对89K的3个扩增片段进行测序，并结合有关资料进行生物信息学和流行病学分析。结果8株SS2菌株，均检出89K（1＆2）、89K（3＆4）、89K（5＆6）候选致病岛特异片段和种特异性16S rDNA、cps2J、mrp毒力基因，和1998年江苏省暴发疫情的菌株结果一致。ZJ0501号SS2分离株89K候选致病岛的3个PCR扩增片段序列和1998年江苏省暴发疫情的菌株有99％以上的相似性，其中编码DNA重组蛋白的序列片段和病乳链球菌及无乳链球菌有较高的同源性。结论近年来在浙江省临床分离SS2菌株中，存在89K候选致病岛片段。 展开更多
关键词 猪链球菌血清2型 聚合酶链反应 89k片段
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