该研究通过网络药理学预测景芪愈溃胶囊治疗胃溃疡的活性成分及作用机制并采用动物实验进一步验证部分关键靶点及信号通路,探讨景芪愈溃胶囊对胃溃疡的治疗效果及机制。首先通过BATMAN-TCM(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular ...该研究通过网络药理学预测景芪愈溃胶囊治疗胃溃疡的活性成分及作用机制并采用动物实验进一步验证部分关键靶点及信号通路,探讨景芪愈溃胶囊对胃溃疡的治疗效果及机制。首先通过BATMAN-TCM(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine)、TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)下载得到景芪愈溃胶囊活性成分及作用靶点,通过GeneCards和OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)以“gastric ulcer”为关键词检索获取疾病靶点,将成分靶点和疾病靶点取交集,获得景芪愈溃胶囊治疗胃溃疡的潜在靶点。随后利用STRING在线数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建靶点的PPI(protein-protein interaction)网络图并分析,利用Matescape数据库进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路富集分析并利用Omicshare在线分析平台进行富集通路可视化处理。最后采用改良Okabe法构建胃溃疡大鼠模型,分别使用高、中、低剂量的景芪愈溃胶囊,安胃疡胶囊以及雷贝拉唑钠肠溶胶囊进行干预,肉眼观察溃疡情况,采用HE染色观察大鼠胃组织形态学变化,采用考马斯亮蓝法检测大鼠胃组织iNOS的含量,综合评价大鼠胃溃疡的溃疡愈合质量;采用RT-qPCR及Western blot检测大鼠胃组织中部分蛋白的基因及蛋白的表达水平,进一步验证部分关键靶点及信号通路。经数据库分析获得景芪愈溃胶囊活性成分206个,作用靶点535个,胃溃疡的作用靶点1 305个,药物和疾病交集靶点166个。PPI网络分析以及KEGG通路富集分析显示,多个关键靶蛋白IL6、TNF、MAPK1、MAPK3、MAPK14等,以及前20条关键信号通路中的NF-κB signaling pathway、IL-17 signaling pathway、leukocyte transendothelial migration与炎症关系密切;动物实验选取关键蛋白p38 MAPK以及经典的炎症信号通路NF-κB signaling pathway进行进一步动物实验验证,景芪愈溃展开更多
文摘该研究通过网络药理学预测景芪愈溃胶囊治疗胃溃疡的活性成分及作用机制并采用动物实验进一步验证部分关键靶点及信号通路,探讨景芪愈溃胶囊对胃溃疡的治疗效果及机制。首先通过BATMAN-TCM(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine)、TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)下载得到景芪愈溃胶囊活性成分及作用靶点,通过GeneCards和OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)以“gastric ulcer”为关键词检索获取疾病靶点,将成分靶点和疾病靶点取交集,获得景芪愈溃胶囊治疗胃溃疡的潜在靶点。随后利用STRING在线数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建靶点的PPI(protein-protein interaction)网络图并分析,利用Matescape数据库进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路富集分析并利用Omicshare在线分析平台进行富集通路可视化处理。最后采用改良Okabe法构建胃溃疡大鼠模型,分别使用高、中、低剂量的景芪愈溃胶囊,安胃疡胶囊以及雷贝拉唑钠肠溶胶囊进行干预,肉眼观察溃疡情况,采用HE染色观察大鼠胃组织形态学变化,采用考马斯亮蓝法检测大鼠胃组织iNOS的含量,综合评价大鼠胃溃疡的溃疡愈合质量;采用RT-qPCR及Western blot检测大鼠胃组织中部分蛋白的基因及蛋白的表达水平,进一步验证部分关键靶点及信号通路。经数据库分析获得景芪愈溃胶囊活性成分206个,作用靶点535个,胃溃疡的作用靶点1 305个,药物和疾病交集靶点166个。PPI网络分析以及KEGG通路富集分析显示,多个关键靶蛋白IL6、TNF、MAPK1、MAPK3、MAPK14等,以及前20条关键信号通路中的NF-κB signaling pathway、IL-17 signaling pathway、leukocyte transendothelial migration与炎症关系密切;动物实验选取关键蛋白p38 MAPK以及经典的炎症信号通路NF-κB signaling pathway进行进一步动物实验验证,景芪愈溃
