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基于网络药理学和分子对接探讨解毒通利方治疗肝纤维化的作用机制
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作者 陈宇彬 林洁 +3 位作者 蔡媛媛 程亚伟 李冠慧 蔡敏 《海南医学》 CAS 2023年第15期2221-2229,共9页
目的采用网络药理学和分子对接的方法探讨解毒通利方治疗肝纤维化(HF)的可能作用机制。方法借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)获得解毒通利方所有有效活性成分,通过TCMSP数据库将这些有效活性成分进行成分靶... 目的采用网络药理学和分子对接的方法探讨解毒通利方治疗肝纤维化(HF)的可能作用机制。方法借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)获得解毒通利方所有有效活性成分,通过TCMSP数据库将这些有效活性成分进行成分靶点预测,并与GeneCards数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、OMIM数据库和DrugBank数据库中HF疾病基因相关靶点使用R语言软件取交集,从而获得解毒通利方治疗HF的靶点;通过STRING绘制交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白;利用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药—关键化合物—核心靶点”网络;运用R语言软件进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测核心靶点的作用机制。最后,应用分子对接技术,将关键有效活性成分和PPI中核心蛋白进行分子对接。结果共筛选解毒通利方药物活性化合物172种,作用靶点4068个,构建PPI网络,运用“CytoNCA”插件筛选出IL6、AKT1、STAT1、RELA、MYC、FOS、STAT3、MAPK1、CCND1等19个核心蛋白。GO功能富集分析结果包括2612个生物过程,234种分子功能以及89种细胞组分,涉及氧化应激、化学应激、氧水平感知等过程。KEGG通路富集以病毒感染、炎症反应、细胞凋亡、脂质代谢、肿瘤等相关的信号通路为主。分子对接结果显示,关键靶点AKT1、STAT3和关键活性成分和柚皮素、甘草查尔酮结合能为负值,显示较好的结合能力。结论本研究揭示了解毒通利方中的化学成分与关键靶蛋白的结合通过调节多种生物学过程及信号通路治疗HF。 展开更多
关键词 解毒通利方 肝纤维化 网络药理学 分子对接 作用机制
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