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乙型脑炎病毒TaqMan PCR检测方法的建立及初步应用
被引量:
22
1
作者
刘卫滨
付士红
+6 位作者
宋宏
王环宇
曹玉玺
何英
王俊文
王力华
梁国栋
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第8期656-662,共7页
目的利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,初步应用于蚊虫媒介的JEV监测。方法根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其NS5基因区段设计JEV特异的引物与探针;优化Mg2...
目的利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,初步应用于蚊虫媒介的JEV监测。方法根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其NS5基因区段设计JEV特异的引物与探针;优化Mg2+浓度和引物浓度比例,并利用11株JEV和7株相关病毒株考核检测体系的保守性、特异性、灵敏性和稳定性;利用体外转录的病毒RNA和定量的病毒样品,建立相应的定量分析模型;初步应用于蚊虫媒介的监测与检测分析。结果Mg2+优化浓度为5mmolL,上下游引物浓度比例为4∶1,引物探针具有良好的保守性和特异性,灵敏度为10PFUml,稳定性分析表明,同一样品Ct值的重复检测5次,变异系数均小于5%;绘制两种标准曲线,构建了JEV基因拷贝数、病毒滴度为分析指标的定量分析模型,检测蚊虫标本结果显示,TaqMan PCR方法较病毒分离法敏感、快捷、简便。结论本研究建立了一种灵敏、特异、简便易行的JEVTaqMan PCR检测方法,为蚊虫媒介检测奠定了基础,为乙型脑炎的预防控制和脑炎相关疾病的诊断与鉴别诊断提供了一种技术手段。
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关键词
乙型脑炎病毒
TAQMAN
PCR
定量
PCR检测方法
初步应用
encephalitis
MG^2+
稳定性分析
定量分析
原文传递
乙型脑炎病毒E蛋白Ⅰ、Ⅱ结构域抗原表位鉴定
被引量:
4
2
作者
闫丽萍
华荣虹
+6 位作者
亓文宝
周艳君
李国新
于海
姜一峰
田志军
童光志
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期56-60,共5页
为鉴定乙型脑炎病毒(JEV)E蛋白I,II结构域抗原表位,本研究设计了一系列针对E蛋白的I、II结构域(1aa~296aa)部分重叠短肽,分别进行GST融合表达,用JEV阳性血清进行western blot和ELISA反应性筛选,获得了5个线性抗原表位分别为:E1(1FNCLGM...
为鉴定乙型脑炎病毒(JEV)E蛋白I,II结构域抗原表位,本研究设计了一系列针对E蛋白的I、II结构域(1aa~296aa)部分重叠短肽,分别进行GST融合表达,用JEV阳性血清进行western blot和ELISA反应性筛选,获得了5个线性抗原表位分别为:E1(1FNCLGMGNRDFIEGAS16)、E10-4(77TGEAHNEK84)、E11-2(83EKRADSS YVCKQ94)、E19(145GTTTSENHGNYSAQVG160)和E33(257SQEGGLHHALAGAIVV272)。除E10和E19外,其它表位均为第一次通过实验方法确定的。将这5个融合蛋白对小鼠进行免疫,获得了高滴度的针对5个融合短肽的抗血清,研究证明了这些表位具有良好的免疫原性。本研究为乙型脑炎特异性诊断试剂及表位疫苗的开发奠定了基础。
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关键词
乙型脑炎病毒
E蛋白
抗原表位
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职称材料
长距离RT-PCR非特异性扩增的鉴定与排除
被引量:
2
3
作者
唐青海
乔宪凤
+5 位作者
何维明
郑新民
华文君
刘西梅
陈果亮
马秋明
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007年第15期4448-4450,共3页
根据已经测定的乙脑病毒WHe株全基因组序列(GenBank EF107527),设计1对引物扩增基因组全长cDNA和2对特异性的鉴定引物。经RT-PCR技术扩增后,得到约9 kb的产物,经过反复实验,鉴定为外源性污染核酸扩增产物,并加以有效的排除,初步的研究...
根据已经测定的乙脑病毒WHe株全基因组序列(GenBank EF107527),设计1对引物扩增基因组全长cDNA和2对特异性的鉴定引物。经RT-PCR技术扩增后,得到约9 kb的产物,经过反复实验,鉴定为外源性污染核酸扩增产物,并加以有效的排除,初步的研究表明该产物可能是由外源性污染核酸自身反向部分互补扩增所致。
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关键词
RT-PCR
乙脑病毒
非特异性扩增
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职称材料
题名
乙型脑炎病毒TaqMan PCR检测方法的建立及初步应用
被引量:
22
1
作者
刘卫滨
付士红
宋宏
王环宇
曹玉玺
何英
王俊文
王力华
梁国栋
机构
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第8期656-662,共7页
基金
国家高新技术研究发展计划(863)资助项目(2002AA215017)
文摘
目的利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,初步应用于蚊虫媒介的JEV监测。方法根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其NS5基因区段设计JEV特异的引物与探针;优化Mg2+浓度和引物浓度比例,并利用11株JEV和7株相关病毒株考核检测体系的保守性、特异性、灵敏性和稳定性;利用体外转录的病毒RNA和定量的病毒样品,建立相应的定量分析模型;初步应用于蚊虫媒介的监测与检测分析。结果Mg2+优化浓度为5mmolL,上下游引物浓度比例为4∶1,引物探针具有良好的保守性和特异性,灵敏度为10PFUml,稳定性分析表明,同一样品Ct值的重复检测5次,变异系数均小于5%;绘制两种标准曲线,构建了JEV基因拷贝数、病毒滴度为分析指标的定量分析模型,检测蚊虫标本结果显示,TaqMan PCR方法较病毒分离法敏感、快捷、简便。结论本研究建立了一种灵敏、特异、简便易行的JEVTaqMan PCR检测方法,为蚊虫媒介检测奠定了基础,为乙型脑炎的预防控制和脑炎相关疾病的诊断与鉴别诊断提供了一种技术手段。
关键词
乙型脑炎病毒
TAQMAN
PCR
定量
PCR检测方法
初步应用
encephalitis
MG^2+
稳定性分析
定量分析
Keywords
japanese encephalitis
vires
TaqMan
PCR
Quantification
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
乙型脑炎病毒E蛋白Ⅰ、Ⅱ结构域抗原表位鉴定
被引量:
4
2
作者
闫丽萍
华荣虹
亓文宝
周艳君
李国新
于海
姜一峰
田志军
童光志
机构
中国农业科学院上海兽医研究所
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/猪传染病研究室
华南农业大学兽医学院
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期56-60,共5页
基金
院所长基金(2006-A-02)
文摘
为鉴定乙型脑炎病毒(JEV)E蛋白I,II结构域抗原表位,本研究设计了一系列针对E蛋白的I、II结构域(1aa~296aa)部分重叠短肽,分别进行GST融合表达,用JEV阳性血清进行western blot和ELISA反应性筛选,获得了5个线性抗原表位分别为:E1(1FNCLGMGNRDFIEGAS16)、E10-4(77TGEAHNEK84)、E11-2(83EKRADSS YVCKQ94)、E19(145GTTTSENHGNYSAQVG160)和E33(257SQEGGLHHALAGAIVV272)。除E10和E19外,其它表位均为第一次通过实验方法确定的。将这5个融合蛋白对小鼠进行免疫,获得了高滴度的针对5个融合短肽的抗血清,研究证明了这些表位具有良好的免疫原性。本研究为乙型脑炎特异性诊断试剂及表位疫苗的开发奠定了基础。
关键词
乙型脑炎病毒
E蛋白
抗原表位
Keywords
japanese encephalitis
vires
envelope
protein
epitope
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
长距离RT-PCR非特异性扩增的鉴定与排除
被引量:
2
3
作者
唐青海
乔宪凤
何维明
郑新民
华文君
刘西梅
陈果亮
马秋明
机构
西北农林科技大学动物科技学院
湖北省畜牧兽医研究所
扬州大学兽医学院农业部畜禽传染病重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007年第15期4448-4450,共3页
基金
湖北省自然科学基金项目(2005ABA195)
文摘
根据已经测定的乙脑病毒WHe株全基因组序列(GenBank EF107527),设计1对引物扩增基因组全长cDNA和2对特异性的鉴定引物。经RT-PCR技术扩增后,得到约9 kb的产物,经过反复实验,鉴定为外源性污染核酸扩增产物,并加以有效的排除,初步的研究表明该产物可能是由外源性污染核酸自身反向部分互补扩增所致。
关键词
RT-PCR
乙脑病毒
非特异性扩增
Keywords
RT-PCR
japanese encephalitis
vires
Non-specific
amplification
分类号
Q819 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙型脑炎病毒TaqMan PCR检测方法的建立及初步应用
刘卫滨
付士红
宋宏
王环宇
曹玉玺
何英
王俊文
王力华
梁国栋
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005
22
原文传递
2
乙型脑炎病毒E蛋白Ⅰ、Ⅱ结构域抗原表位鉴定
闫丽萍
华荣虹
亓文宝
周艳君
李国新
于海
姜一峰
田志军
童光志
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
4
下载PDF
职称材料
3
长距离RT-PCR非特异性扩增的鉴定与排除
唐青海
乔宪凤
何维明
郑新民
华文君
刘西梅
陈果亮
马秋明
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007
2
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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