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广东地区口面裂患者IRF6基因编码区序列特点分析 被引量:5
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作者 邬文莉 华亮 +1 位作者 王洪涛 黎凡 《中国优生与遗传杂志》 2011年第8期12-14,共3页
目的探讨广东地区口面裂患者干扰素调节因子6(Interferon regulatory factor 6,IRF6)基因编码区序列的特点。方法收集广东籍口面裂患者及部分双亲血样共47例,包括1个Van der Woude综合征(van der Woude syndrome,VWS)患者核心家庭,NSCL/... 目的探讨广东地区口面裂患者干扰素调节因子6(Interferon regulatory factor 6,IRF6)基因编码区序列的特点。方法收集广东籍口面裂患者及部分双亲血样共47例,包括1个Van der Woude综合征(van der Woude syndrome,VWS)患者核心家庭,NSCL/P患者40例,面横裂3例,正中裂3例;同时采取13例正常人血液样本做为对照,所有样本提取DNA后扩增IRF6基因的编码区,并进行序列测定和分析。结果共检测到3个突变位点。其中459G>T和820G>A两种突变在正常对照及未患病双亲中均被检出,NSCL/P组与正常对照组之间无差异(P>0.05)。1234C>T仅在VWS综合征患者中检出,与国际已报道的致病性突变一致。结论广东地区口面裂患者IRF6基因编码区存在三个突变,其中IRF6基因外显子9的1234C>T突变可能是广东地区VWS患者的一个致病因素。 展开更多
关键词 唇腭裂 面裂 干扰素调节因子6(IRF6)基因 编码区 基因突变
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IRF6基因rs2235371位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的相关性研究 被引量:5
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作者 李梦洁 朱文丽 +3 位作者 汪云 郭晋臻 李书琴 李勇 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期149-154,共6页
目的探讨干扰素调节因子6(interferonregulatoryfactor6,IRF6)基因rs2235371位点820G〉A单核苷酸多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(nonsyndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate,NSCL±P)的相关性。方法收集106例患者及... 目的探讨干扰素调节因子6(interferonregulatoryfactor6,IRF6)基因rs2235371位点820G〉A单核苷酸多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(nonsyndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate,NSCL±P)的相关性。方法收集106例患者及其父母以及129名对照及其父母的核心家庭标本,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性的方法进行IRF6基因rs2235371位点单核苷酸多态性检测;用人群关联研究、传递不平衡检验(transmissiondisequilibriumtest,TDT)、单倍型相对风险率(haplotype—basedhaplotyperelativerisk,HHRR)、家系为基础的关联检验(family—basedassociationtests,FBAT)等方法进行统计分析。结果病例组与对照组相比,子代的基因型分布差异无统计学意义(P〉0.05),而等位基因频率比较差异有统计学意义(P〈0.05);母亲组基因型分布差异有统计学意义(P〈0.05);按唇腭裂类型分类后,单纯唇裂组子代基因型分布和等位基因的频率与对照组相比差异均有统计学意义(P〈0.05);而唇腭裂组基因型分布和等位基因频率差异均无统计学意义(P〉0.05)。传递不平衡检验提示,rs2235371位点的G等位基因在NSCL±P核心家庭中存在传递不平衡(χ^2=5.56,P=0.024)。HHRR检验χ^2=5.115,P=0.024,OR=1.674,95%CI:1.069~2.621;FBAT检验Z=2.218,P=0.027。结论在中国北方人群中IRF6基因rs2235371位点突变与非综合征性唇腭裂存在关联。 展开更多
关键词 非综合征性唇裂伴或不伴腭裂 干扰素调节因子6基因 单核苷酸多态性 关联分析
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中国人群非综合征性唇腭裂患者IRF6基因突变检测 被引量:3
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作者 陈嘉珮 牛振民 +3 位作者 乌丹旦 杨育生 黄薇 陈振琦 《中国口腔颌面外科杂志》 CAS 2014年第4期333-336,共4页
目的:探讨干扰素调节因子6(interferon regulatory factor 6,IRF6)在非综合征性唇腭裂(non-sydromic cleft lip and/or cleft palate,NSCL/P)患者中的突变情况。方法:收集119例NSCL/P患者及288名健康人对照样本的外周血血样并提取DNA。... 目的:探讨干扰素调节因子6(interferon regulatory factor 6,IRF6)在非综合征性唇腭裂(non-sydromic cleft lip and/or cleft palate,NSCL/P)患者中的突变情况。方法:收集119例NSCL/P患者及288名健康人对照样本的外周血血样并提取DNA。在IRF6基因的全部外显子分别设计引物,PCR扩增其序列,通过测序找出IRF6基因突变,并将这些突变在对照样本中进行验证。结果:共发现5种在正常人中没有的突变,其中4种是新发现的突变。结论:IRF6基因突变在中国人群中参与了非综合征唇腭裂疾病的发生。 展开更多
关键词 非综合征性唇腭裂 干扰素调节因子6基因 基因突变
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干扰素调节因子-6基因与非综合征性唇腭裂的关系 被引量:2
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作者 杨明 洪玉 谢金敏 《现代生物医学进展》 CAS 2013年第2期367-370,共4页
先天性唇腭裂常分为综合征性唇腭裂和非综合征性唇腭裂两大类,其中非综合征性唇腭裂(nonsyndromic cleft lip with orwithout cleft palate,NSCL/P)约占先天性唇腭裂的70%-80%。国内外学者在对NSCL/P相关基因进行研究后发现,干扰素调节... 先天性唇腭裂常分为综合征性唇腭裂和非综合征性唇腭裂两大类,其中非综合征性唇腭裂(nonsyndromic cleft lip with orwithout cleft palate,NSCL/P)约占先天性唇腭裂的70%-80%。国内外学者在对NSCL/P相关基因进行研究后发现,干扰素调节因子6(Interferon Regulatory Factor 6,IRF6)是迄今发现最有价值的并且与NSCL/P致病有相关性的热点基因之一,但是仍有部分学者通过实验研究后得出了相反的结论,故IRF6基因与NSCL/P之间的相关性说法不一,存在较大的争论,究竟前者是通过何种遗传方式作用于后者、仍然不十分清楚,且需要大样本的研究来证实。本文就IRF6基因与NSCL/P的关系做一综述,为研究两者的关系提供系统性参考。 展开更多
关键词 干扰素调节因子6 基因位点 非综合征性唇腭裂
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IRF6基因rs642961位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的相关性研究 被引量:2
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作者 田景丰 魏瑗 +3 位作者 王良 郭晋臻 周倩 朱文丽 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期543-548,共6页
目的探讨中国北方人群干扰素调节因子6(IRF6)基因rs642961位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(NSCL±P)的相关性。方法收集中国北方人群88个病例核心家庭和116个正常儿童作对照,用四引物扩增受阻突变体系聚合酶链反应(tetra-pr... 目的探讨中国北方人群干扰素调节因子6(IRF6)基因rs642961位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(NSCL±P)的相关性。方法收集中国北方人群88个病例核心家庭和116个正常儿童作对照,用四引物扩增受阻突变体系聚合酶链反应(tetra-primer ARMS-PCR)的方法,进行IRF6基因rs642961检测;用人群关联研究、传递不平衡检验(TDT)、单倍型相对风险率(HHRR)、家庭为基础的关联检验(family-based association test,FBAT)等进行统计分析。结果子代、父亲、母亲三个亚组人群的IRF6基因rs642961位点的基因型在NSCL±P组与对照组的分布差异具有统计学意义(P<0.05),OR值及其95%可信区间均不包含1,提示IRF6基因rs642961位点的变异能增加NSCL±P发病的危险。核心家庭资料TDT和HHRR的结果均显示有统计学差异(P<0.05),FBAT分析提示可能存在加性传递模式(P<0.05),进一步支持IRF6基因rs642961位点的突变和NSCL±P发生相关。结论在中国北方人群中,IRF6基因rs642961位点多态性与NSCL±P发病相关。 展开更多
关键词 非综合征性唇裂伴或不伴腭裂 单核苷酸多态性 干扰素调节因子6基因 rs642961位点 核心家系 关联分析
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干扰素调节因子-6基因多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究
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作者 黄永清 石冰 《国际口腔医学杂志》 CAS 2007年第2期119-121,共3页
20世纪80年代后期以来,学者们陆续报道了10~20个与非综合征型唇腭裂有关的易感基因和位点,其中干扰素调节因子-6(IRF-6)基因是迄今发现的最有价值的与非综合征型唇腭裂发病相关的基因之一。本文就IRF-6基因的结构和功能、IRF-6基因的... 20世纪80年代后期以来,学者们陆续报道了10~20个与非综合征型唇腭裂有关的易感基因和位点,其中干扰素调节因子-6(IRF-6)基因是迄今发现的最有价值的与非综合征型唇腭裂发病相关的基因之一。本文就IRF-6基因的结构和功能、IRF-6基因的多态性及其与非综合征型唇腭裂的相关性研究作一综述。 展开更多
关键词 干扰素调节因子-6 基因多态性 非综合征型唇腭裂
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范德伍德综合征家系基因型与表型的研究
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作者 陈丁莉 李守霞 +4 位作者 焦建军 郭丽丽 张小芳 孙彩霞 要跟东 《中国妇幼保健》 CAS 2015年第1期104-107,共4页
目的:探讨范德伍德综合征(VWS)家系的致病原因,从遗传学的角度阐明基因型与表型之间的关系。方法:选取2个VWS家系成员24例和正常人群200例。抽取所有研究对象外周血样本,并详细记录患者表型,采用Sanger测序法对2个VWS家系成员的干扰素... 目的:探讨范德伍德综合征(VWS)家系的致病原因,从遗传学的角度阐明基因型与表型之间的关系。方法:选取2个VWS家系成员24例和正常人群200例。抽取所有研究对象外周血样本,并详细记录患者表型,采用Sanger测序法对2个VWS家系成员的干扰素调节因子-6(IRF6)基因编码区的7个外显子进行测序。结果:2个家系中共有VWS患者6例,且均存在基因突变。家系1的3例患者均携带位于第9外显子的c.1234C>T(p.R412X)杂合突变;家系2的3例患者均携带位于第9外显子的c.1210G>A(p.E404K)杂合突变,未发现其他家系成员和正常人群携带IRF6基因突变。基因检测结果显示,突变与疾病共分离,c.1234C>T和c.1210G>A分别是这2个家系的致病突变。结论:突变c.1234C>T和c.1210G>A与疾病共分离是这2个家系的致病突变,中国的VWS存在遗传异质性和临床表型复杂性。 展开更多
关键词 干扰素调节因子-6 范德伍德综合征 基因测序 突变
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