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蛋鸡INHBA的克隆分析及其对卵泡发育调控的研究
被引量:
6
1
作者
孙君卫
马向飞
+3 位作者
朱帅鹏
田亚东
康相涛
孙桂荣
《中国家禽》
北大核心
2019年第22期9-15,共7页
试验旨在探讨INHBA(Inhibin subunit beta A)基因在鸡卵泡发育过程中的作用,为提高蛋鸡产蛋性能提供理论依据。首先从海兰褐蛋鸡各级卵泡组织中提取总RNA,经反转录后对INHBA CDS编码区进行克隆且进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量...
试验旨在探讨INHBA(Inhibin subunit beta A)基因在鸡卵泡发育过程中的作用,为提高蛋鸡产蛋性能提供理论依据。首先从海兰褐蛋鸡各级卵泡组织中提取总RNA,经反转录后对INHBA CDS编码区进行克隆且进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR法检测鸡INHBA在不同卵泡以及卵泡膜细胞和颗粒细胞中的表达规律。结果表明:扩增片段为1547 bp,包含1275 bp的编码区,编码424个氨基酸;海兰褐蛋鸡与日本鹌鹑、黄牛、绵羊、兔、猪、人、小鼠和非洲爪蛙的INHBA同源性分别为97.7%、78.2%、78.0%、77.4%、77.0%、72.8%、79.8%和72.8%,进化分析表明海兰褐蛋鸡的INHBA在进化过程中保守性较高,与日本鹌鹑关系最近,与哺乳动物相差也不远,与非洲爪蛙等两栖类动物相差最远。INHBA蛋白质理化性质分析表明,其属于弱酸性蛋白,不稳定,流动性较好。蛋白结构分析显示,其无跨膜域,N端有信号肽,无规则卷曲为整体的主要结构。不同卵泡INHBA表达显示,INHBA随着卵泡的发育表达量逐渐升高,并且在等级卵泡颗粒细胞中表达量最高,在等级卵泡颗粒细胞中添加低浓度促卵泡素(Follicle-stimulating hormone,FSH)处理后,INHBA表达显著升高,表明其在卵泡发育过程中可能受FSH的调控。研究结果可为后期INHBA功能以及其对鸡卵泡发育调控机制的研究提供一定的参考依据。
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关键词
海兰褐蛋鸡
inhba
基因
克隆分析
卵泡发育
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职称材料
徐淮山羊PRLR和INHBA基因的多态性及其与产羔数的关联分析
被引量:
5
2
作者
张玉龙
孙伟
+7 位作者
苏锐
陈禄
张向楠
倪蓉
花为华
周洪
陈家振
储明星
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2014年第9期14-18,共5页
本实验以徐淮山羊产羔性状作为研究对象,以波尔山羊作为参照群体,采用PCR-SSCP方法分析PRLR基因和INHBA基因在2个群体中的单核苷酸多态性(SNP),并分析其与徐淮山羊群体产羔数性状的关联性。结果表明:所设计的5对引物在波尔山羊群体中的...
本实验以徐淮山羊产羔性状作为研究对象,以波尔山羊作为参照群体,采用PCR-SSCP方法分析PRLR基因和INHBA基因在2个群体中的单核苷酸多态性(SNP),并分析其与徐淮山羊群体产羔数性状的关联性。结果表明:所设计的5对引物在波尔山羊群体中的扩增片段都没有多态性,在徐淮山羊种中,引物2和引物5的扩增片段有多态性、引物2有AA和AB 2种基因型,引物5有CC和CD 2种基因型。经测序得知,AB型与AA型相比,PRLR基因外显子10在第307 bp处发生A→G的突变,CD型与CC型相比较,INHBA基因在1042 bp处发生T→A的突变。PRLR基因的AA和BB基因型的产羔羊数性状的最小二乘均值以及INHBA基因的CC和DD基因型的产羔羊数性状的最小二乘均值差异均不显著(P>0.05)。研究结果初步表明,检测的PRLR基因位点及其INHBA基因位点对徐淮山羊高繁殖力没有显著影响。
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关键词
PRLR基因
inhba
基因
多态性
产羔数
徐淮山羊
原文传递
藏猪和大约克猪INHBA基因多态性及差异表达分析
3
作者
孙雪倩
段梦琪
+2 位作者
周林聪
商鹏
张健
《高原农业》
2024年第2期163-170,共8页
为探究INHBA基因在藏猪与大约克猪中的多态性与表达差异。在DNA水平上对藏猪、大约克猪INHBA基因5'侧翼区和CDS区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选,同时在mRNA水平上用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检...
为探究INHBA基因在藏猪与大约克猪中的多态性与表达差异。在DNA水平上对藏猪、大约克猪INHBA基因5'侧翼区和CDS区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选,同时在mRNA水平上用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测INHBA基因在卵巢组织中的相对表达量。结果发现:INHBA基因在5'侧翼区存在一个突变位点A-1589T,并在藏猪与大约克猪2个品种间存在极显著差异(P<0.01);经转录因子预测,发现该突变位点与繁殖性能相关,并推测消失的转录因子结合位点可能是导致藏猪繁殖力低的主要原因之一。INHBA基因在卵巢中,藏猪表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),推测INHBA基因可能与猪繁殖性能有关,并对提高猪的繁殖性能起到积极作用。本研究结果为进一步探究INHBA基因在猪繁殖性能的作用机制提供理论支撑。
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关键词
藏猪
inhba
基因
繁殖性能
基因表达
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职称材料
CRISPR/Cas9系统介导大鼠Inhba基因的编辑
被引量:
2
4
作者
赵为民
涂枫
+4 位作者
王泽平
程金花
付言峰
李碧侠
任守文
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期700-704,共5页
利用chopchop网站对大鼠Inhba基因的第二外显子设计sgRNA位点,通过合成sgRNA寡核苷酸、酶切连接构建到px330载体,再转染px330-Inhba-sgRNA载体到大鼠L6细胞,通过T7E1酶切、T载体克隆测序来验证sgRNA编辑Inhba基因的效率。结果表明:转染p...
利用chopchop网站对大鼠Inhba基因的第二外显子设计sgRNA位点,通过合成sgRNA寡核苷酸、酶切连接构建到px330载体,再转染px330-Inhba-sgRNA载体到大鼠L6细胞,通过T7E1酶切、T载体克隆测序来验证sgRNA编辑Inhba基因的效率。结果表明:转染pX330-Inbha-sgRNA载体后,Inhba基因的编辑区域的PCR产物能被T7E1酶切割预期条带;T载体克隆测序显示,随机选取的20个单克隆中有5个克隆在预期切割位点附近出现不同长度的碱基缺失,估测编辑效率为25%。可见,本研究设计的sgRNA能够有效利用CRISPR/Cas9系统对Inhba基因进行编辑。
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关键词
大鼠
inhba
基因
CRISPR/Cas9
外显子
sgRNA
基因编辑
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职称材料
INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态和临床病理特征的关系
5
作者
马炀斐
谭琦
+4 位作者
李琪
王亚帝
谷泽慧
李伦
陈素贤
《肿瘤研究与临床》
CAS
2023年第10期733-738,共6页
目的探讨INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态、临床病理特征之间的关系。方法基于基因表达综合(GEO)数据库及基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库进行生物信息学分析,选定结直肠癌差异表达预后相关目标基因。收集2016年1月至2022年6...
目的探讨INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态、临床病理特征之间的关系。方法基于基因表达综合(GEO)数据库及基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库进行生物信息学分析,选定结直肠癌差异表达预后相关目标基因。收集2016年1月至2022年6月于锦州医科大学附属第三医院行手术治疗的107例结直肠癌患者蜡块组织,制备组织芯片,采用免疫组织化学法检测结直肠癌组织中微卫星状态[错配修复(MMR)蛋白MLH1、MSH2、MSH6、PMS2均为阳性表达为错配修复完整(pMMR),代表微卫星低度不稳定或微卫星稳定;若其中任何一个指标为阴性,则判定为错配修复缺陷(dMMR),代表微卫星高度不稳定]和INHBA的表达情况。回顾性分析患者临床病理资料,分析INHBA与微卫星状态及临床病理特征之间的关系。结果从GEO数据库筛选出结直肠癌3个数据集:GSE110223(13个癌组织、13个癌旁组织)、GSE110224(17个癌组织、17个癌旁组织)、GSE113513(14个癌组织、14个癌旁组织),筛选出癌组织和癌旁组织间差异表达上调和下调的前50个基因,经韦恩图分析3个数据集的交集基因,筛选出上调基因12个,下调基因17个;根据GEPIA数据库,共有的上调和下调差异基因中AQP8、ZG16、INHBA基因与结直肠癌预后相关,INHBA在结直肠癌组织中表达水平较癌旁(距肿瘤边缘≥5 cm)组织高(P<0.05),选定INHBA基因进行分析。对收集的结直肠癌蜡块组织进行免疫组织化学检测显示,结直肠癌组织INHBA高表达患者比例高于癌旁组织INHBA高表达患者比例[85.05%(91/107)比67.29%(72/107),P<0.05]。癌组织INHBA高表达与病灶部位[右半结肠比左半结直肠:94.00%(47/50)比77.19%(44/57)]、肿瘤长径[>5 cm比≤5 cm:92.73%(51/55)比76.92%(40/52)]、浸润深度[T3~4期比T1~2期:96.43%(54/56)比72.55%(37/51)]、分化程度[低、中分化比高分化:91.04%(61/67)比75.00%(30/40)]、淋巴结转移[是比否:93.02%(40/43)比78.13%(50/64)
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关键词
结直肠肿瘤
微卫星不稳定性
inhba
基因
原文传递
题名
蛋鸡INHBA的克隆分析及其对卵泡发育调控的研究
被引量:
6
1
作者
孙君卫
马向飞
朱帅鹏
田亚东
康相涛
孙桂荣
机构
河南农业大学牧医工程学院
出处
《中国家禽》
北大核心
2019年第22期9-15,共7页
基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-40-K04)
国家自然科学基金(31872987)
文摘
试验旨在探讨INHBA(Inhibin subunit beta A)基因在鸡卵泡发育过程中的作用,为提高蛋鸡产蛋性能提供理论依据。首先从海兰褐蛋鸡各级卵泡组织中提取总RNA,经反转录后对INHBA CDS编码区进行克隆且进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR法检测鸡INHBA在不同卵泡以及卵泡膜细胞和颗粒细胞中的表达规律。结果表明:扩增片段为1547 bp,包含1275 bp的编码区,编码424个氨基酸;海兰褐蛋鸡与日本鹌鹑、黄牛、绵羊、兔、猪、人、小鼠和非洲爪蛙的INHBA同源性分别为97.7%、78.2%、78.0%、77.4%、77.0%、72.8%、79.8%和72.8%,进化分析表明海兰褐蛋鸡的INHBA在进化过程中保守性较高,与日本鹌鹑关系最近,与哺乳动物相差也不远,与非洲爪蛙等两栖类动物相差最远。INHBA蛋白质理化性质分析表明,其属于弱酸性蛋白,不稳定,流动性较好。蛋白结构分析显示,其无跨膜域,N端有信号肽,无规则卷曲为整体的主要结构。不同卵泡INHBA表达显示,INHBA随着卵泡的发育表达量逐渐升高,并且在等级卵泡颗粒细胞中表达量最高,在等级卵泡颗粒细胞中添加低浓度促卵泡素(Follicle-stimulating hormone,FSH)处理后,INHBA表达显著升高,表明其在卵泡发育过程中可能受FSH的调控。研究结果可为后期INHBA功能以及其对鸡卵泡发育调控机制的研究提供一定的参考依据。
关键词
海兰褐蛋鸡
inhba
基因
克隆分析
卵泡发育
Keywords
Hy-Line
Brown
layer
inhba
gene
cloning
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
徐淮山羊PRLR和INHBA基因的多态性及其与产羔数的关联分析
被引量:
5
2
作者
张玉龙
孙伟
苏锐
陈禄
张向楠
倪蓉
花为华
周洪
陈家振
储明星
机构
扬州大学动物科学与技术学院
镇江市农科所
徐州市睢宁县林牧渔业局
江苏省丰县绿缘养羊专业合作社
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2014年第9期14-18,共5页
基金
现代肉羊产业技术体系建设(CARS-39)
科技部家养动物平台项目
+3 种基金
国家星火计划重点项目(2012GA690003)
江苏高校优势学科建设工程资助项目
江苏省农业科技支撑计划项目(BE2012331)
江苏省工程技术研究中心项目(BM2012308)
文摘
本实验以徐淮山羊产羔性状作为研究对象,以波尔山羊作为参照群体,采用PCR-SSCP方法分析PRLR基因和INHBA基因在2个群体中的单核苷酸多态性(SNP),并分析其与徐淮山羊群体产羔数性状的关联性。结果表明:所设计的5对引物在波尔山羊群体中的扩增片段都没有多态性,在徐淮山羊种中,引物2和引物5的扩增片段有多态性、引物2有AA和AB 2种基因型,引物5有CC和CD 2种基因型。经测序得知,AB型与AA型相比,PRLR基因外显子10在第307 bp处发生A→G的突变,CD型与CC型相比较,INHBA基因在1042 bp处发生T→A的突变。PRLR基因的AA和BB基因型的产羔羊数性状的最小二乘均值以及INHBA基因的CC和DD基因型的产羔羊数性状的最小二乘均值差异均不显著(P>0.05)。研究结果初步表明,检测的PRLR基因位点及其INHBA基因位点对徐淮山羊高繁殖力没有显著影响。
关键词
PRLR基因
inhba
基因
多态性
产羔数
徐淮山羊
Keywords
PRLR
gene
inhba
gene
polymorphism
prolificacy
Xuhuai
goat
分类号
S827.2 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
藏猪和大约克猪INHBA基因多态性及差异表达分析
3
作者
孙雪倩
段梦琪
周林聪
商鹏
张健
机构
西藏农牧学院动物科学学院
西藏自治区农业科技园区
江苏省南通市通州区金沙中学
出处
《高原农业》
2024年第2期163-170,共8页
基金
西藏自治区科技计划项目(XZ202202JD0002N)
西藏自治区重大科技专项项目(XZ202101ZD0005N)。
文摘
为探究INHBA基因在藏猪与大约克猪中的多态性与表达差异。在DNA水平上对藏猪、大约克猪INHBA基因5'侧翼区和CDS区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选,同时在mRNA水平上用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测INHBA基因在卵巢组织中的相对表达量。结果发现:INHBA基因在5'侧翼区存在一个突变位点A-1589T,并在藏猪与大约克猪2个品种间存在极显著差异(P<0.01);经转录因子预测,发现该突变位点与繁殖性能相关,并推测消失的转录因子结合位点可能是导致藏猪繁殖力低的主要原因之一。INHBA基因在卵巢中,藏猪表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),推测INHBA基因可能与猪繁殖性能有关,并对提高猪的繁殖性能起到积极作用。本研究结果为进一步探究INHBA基因在猪繁殖性能的作用机制提供理论支撑。
关键词
藏猪
inhba
基因
繁殖性能
基因表达
Keywords
Tibetan
pig
inhba
gene
reproductive
performance
gene
expression
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
CRISPR/Cas9系统介导大鼠Inhba基因的编辑
被引量:
2
4
作者
赵为民
涂枫
王泽平
程金花
付言峰
李碧侠
任守文
机构
江苏省农业科学院畜牧研究所
江苏省农业种质资源保护与利用平台
农业农村部种养结合重点实验室
江苏省农业科学院宿迁农科所
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期700-704,共5页
基金
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系
江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201733)。
文摘
利用chopchop网站对大鼠Inhba基因的第二外显子设计sgRNA位点,通过合成sgRNA寡核苷酸、酶切连接构建到px330载体,再转染px330-Inhba-sgRNA载体到大鼠L6细胞,通过T7E1酶切、T载体克隆测序来验证sgRNA编辑Inhba基因的效率。结果表明:转染pX330-Inbha-sgRNA载体后,Inhba基因的编辑区域的PCR产物能被T7E1酶切割预期条带;T载体克隆测序显示,随机选取的20个单克隆中有5个克隆在预期切割位点附近出现不同长度的碱基缺失,估测编辑效率为25%。可见,本研究设计的sgRNA能够有效利用CRISPR/Cas9系统对Inhba基因进行编辑。
关键词
大鼠
inhba
基因
CRISPR/Cas9
外显子
sgRNA
基因编辑
Keywords
rat
inhba
gene
CRISPR/Cas9
exon
sgRNA
gene
editing
分类号
S865.124.3 [农业科学—野生动物驯养]
Q78 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态和临床病理特征的关系
5
作者
马炀斐
谭琦
李琪
王亚帝
谷泽慧
李伦
陈素贤
机构
锦州医科大学附属第三医院病理科
锦州医科大学附属第三医院精准医学中心
出处
《肿瘤研究与临床》
CAS
2023年第10期733-738,共6页
文摘
目的探讨INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态、临床病理特征之间的关系。方法基于基因表达综合(GEO)数据库及基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库进行生物信息学分析,选定结直肠癌差异表达预后相关目标基因。收集2016年1月至2022年6月于锦州医科大学附属第三医院行手术治疗的107例结直肠癌患者蜡块组织,制备组织芯片,采用免疫组织化学法检测结直肠癌组织中微卫星状态[错配修复(MMR)蛋白MLH1、MSH2、MSH6、PMS2均为阳性表达为错配修复完整(pMMR),代表微卫星低度不稳定或微卫星稳定;若其中任何一个指标为阴性,则判定为错配修复缺陷(dMMR),代表微卫星高度不稳定]和INHBA的表达情况。回顾性分析患者临床病理资料,分析INHBA与微卫星状态及临床病理特征之间的关系。结果从GEO数据库筛选出结直肠癌3个数据集:GSE110223(13个癌组织、13个癌旁组织)、GSE110224(17个癌组织、17个癌旁组织)、GSE113513(14个癌组织、14个癌旁组织),筛选出癌组织和癌旁组织间差异表达上调和下调的前50个基因,经韦恩图分析3个数据集的交集基因,筛选出上调基因12个,下调基因17个;根据GEPIA数据库,共有的上调和下调差异基因中AQP8、ZG16、INHBA基因与结直肠癌预后相关,INHBA在结直肠癌组织中表达水平较癌旁(距肿瘤边缘≥5 cm)组织高(P<0.05),选定INHBA基因进行分析。对收集的结直肠癌蜡块组织进行免疫组织化学检测显示,结直肠癌组织INHBA高表达患者比例高于癌旁组织INHBA高表达患者比例[85.05%(91/107)比67.29%(72/107),P<0.05]。癌组织INHBA高表达与病灶部位[右半结肠比左半结直肠:94.00%(47/50)比77.19%(44/57)]、肿瘤长径[>5 cm比≤5 cm:92.73%(51/55)比76.92%(40/52)]、浸润深度[T3~4期比T1~2期:96.43%(54/56)比72.55%(37/51)]、分化程度[低、中分化比高分化:91.04%(61/67)比75.00%(30/40)]、淋巴结转移[是比否:93.02%(40/43)比78.13%(50/64)
关键词
结直肠肿瘤
微卫星不稳定性
inhba
基因
Keywords
Colorectal
neoplasms
Microsatellite
instability
inhba
gene
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋鸡INHBA的克隆分析及其对卵泡发育调控的研究
孙君卫
马向飞
朱帅鹏
田亚东
康相涛
孙桂荣
《中国家禽》
北大核心
2019
6
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职称材料
2
徐淮山羊PRLR和INHBA基因的多态性及其与产羔数的关联分析
张玉龙
孙伟
苏锐
陈禄
张向楠
倪蓉
花为华
周洪
陈家振
储明星
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2014
5
原文传递
3
藏猪和大约克猪INHBA基因多态性及差异表达分析
孙雪倩
段梦琪
周林聪
商鹏
张健
《高原农业》
2024
0
下载PDF
职称材料
4
CRISPR/Cas9系统介导大鼠Inhba基因的编辑
赵为民
涂枫
王泽平
程金花
付言峰
李碧侠
任守文
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
下载PDF
职称材料
5
INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态和临床病理特征的关系
马炀斐
谭琦
李琪
王亚帝
谷泽慧
李伦
陈素贤
《肿瘤研究与临床》
CAS
2023
0
原文传递
已选择
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