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2017—2018年广州市H3N2流感病毒流行及血凝素基因分子特征分析 被引量:11
1
作者 曹蓝 鲁恩洁 +4 位作者 陈艺韵 马钰 李魁彪 陆剑云 狄飚 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期899-904,921,共7页
目的对广州市H3N2流感病毒进行基因变异和进化分析,为H3N2流感科学防控提供科学依据。方法对广州市2017年1月-2018年9月流感监测标本进行H3N2病毒检测和分离,并对HA基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒变异和进化特点。结果所监测... 目的对广州市H3N2流感病毒进行基因变异和进化分析,为H3N2流感科学防控提供科学依据。方法对广州市2017年1月-2018年9月流感监测标本进行H3N2病毒检测和分离,并对HA基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒变异和进化特点。结果所监测的8 535份标本中,检出H3N2流感阳性标本386份,阳性率为4.52%。对其中16株分离株HA基因测序结果显示,与同年度疫苗推荐株A/Hong Kong/4801/2014相比,2017年广州H3N2病毒A 区抗原位点变异频率较高,多发生于140位、144位和150位,其中有7株病毒发生新抗原漂移,变异毒株占比43.75%。受体结合位点变异主要发生在前壁,位于T131K位和T135K(N)位。糖基化位点变异同样多发生于A区抗原位点和受体结合位点前壁。2017年广州H3N2流感病毒均位于3C.2a分支,但分支内又进一步进化形成3个不同的小流行分支,包括3C.2a1分支,以及与2016年北京、2017年美国分离株亲缘相近的另外两个小分支。结论 2017年广州H3N2流感病毒HA蛋白重要氨基酸位点的变异表现遗传多态性,特别是在抗原性上可能发生了较大变异。在基因进化上表现为多样性和复杂性,呈现多分支进化特点。因此有必要密切监测流行毒株的进化趋势,以期及时对疫苗株的匹配性进行有效评估。 展开更多
关键词 h3n2流感病毒 血凝素 基因变异 基因进化
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济宁市2017-2020年流感流行季甲型H3N2流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因特征 被引量:9
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作者 韩淑琪 王胜男 +2 位作者 王玉宁 江亚娟 焦伯延 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2022年第3期303-308,共6页
目的了解济宁市甲型H3N2流感病毒流行株血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因特征。方法于2017-2020年流感流行季在济宁市2家流感监测哨点医院和流感聚集疫情中选取流感样疾病(ILI)病例咽拭子标本中分离获得的19株甲型H3N2流感病毒,分析HA和N... 目的了解济宁市甲型H3N2流感病毒流行株血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因特征。方法于2017-2020年流感流行季在济宁市2家流感监测哨点医院和流感聚集疫情中选取流感样疾病(ILI)病例咽拭子标本中分离获得的19株甲型H3N2流感病毒,分析HA和NA基因序列同源性、HA基因进化特征、HA和NA基因位点的氨基酸差异。结果济宁市2017-2020年流感流行季ILI病例中甲型H3N2流感病毒检测阳性率为4.77%(218/4575),检测阳性数占流感病毒检测总阳性数的25.89%(218/842)。19株甲型H3N2流感病毒之间HA和NA氨基酸同源性分别为97.7%-100%和98.6%-99.5%,平均遗传距离分别为0.009和0.008。HA基因进化树显示,19株分离株均属3C.2a1b分支,与疫苗代表株A/Kansas/14/2017的亲缘性较远。与该疫苗代表株相比,分离株HA的33个位点存在氨基酸差异,包括10个抗原表位位点、4个受体结合位点、3个糖基化位点、1个潜在类泛素蛋白修饰分子化修饰位点和1个潜在泛素化修饰位点;NA的27个位点存在氨基酸差异,但NA的酶活性催化位点、耐药位点和糖基化位点均无氨基酸差异。结论济宁市2017-2020年流感流行季甲型H3N2流感病毒可能发生了抗原漂移;需加强甲型H3N2流感监测,为疫苗株筛选提供依据。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 抗原漂移 基因特征
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2007—2017年中国甲型H3N2流感病毒HA基因特征分析 被引量:8
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作者 徐姿 柯美霞 +1 位作者 崔大伟 王胜军 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第12期937-941,共5页
目的回顾性分析2007—2017年我国人感染季节性甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)的分子特征,为我国甲型H3N2流感病毒的防控和疫苗的研发提供科学依据。方法从全球共享禽流感数据库(the global initiative on sharing a-vian inf... 目的回顾性分析2007—2017年我国人感染季节性甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)的分子特征,为我国甲型H3N2流感病毒的防控和疫苗的研发提供科学依据。方法从全球共享禽流感数据库(the global initiative on sharing a-vian influenza data,GISAID)中下载中国2007—2017年人感染季节性甲型流感病毒H3N2亚型毒株HA基因序列,利用MEGA7.0生物学信息软件分析其HA的分子特征。结果 2007—2017年,中国甲型流感病毒H3N2亚型共1 991例,总体上病毒株数呈逐渐递增趋势。HA序列分析表明,甲型H3N2流感病毒的亚型存在多样性且多种亚型共存,3C.2a.1系的病毒株自2010年起逐年增多,2016年起成为最主要的流行优势株。1系、2系、3A系、3B系、3C.1系、3C.2系、3C.2a系、3C.2a.1系、3C.3系、3C.3a系和3C.3b系的同源性分别为94.0%~100.0%、96.7%~100.0%、94.3%~100.0%、94.9%~100.0%、94.6%~100.0%、95.4%~100.0%、95.1%~100.0%、93.3%~100.0%、97.5%~100.0%、95.3%~100.0%和94.6%~100.0%。HA蛋白关键位点N121K、G/R142K出现变异,268株发生N121K突变且主要来源于2017年的毒株,358株发生G/R142K突变且主要来源于2016年和2017年的毒株。结论甲型H3N2流感病毒的亚型存在多样性,多种亚型共存且不同年份间的优势流行株存在差异,这些将有助于疫苗的研发和疾病的防控。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 血凝素 分子特征
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2022—2023年新疆甲型H3N2流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因特征分析
4
作者 陈媛 张璇 +3 位作者 李泉希 尼格德力·阿力腾赛尔 米日扎提·努尔买买提 马鑫 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2024年第4期334-339,共6页
目的分析新疆2022—2023年甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征,为流感防控提供科学依据。方法从新疆15家国家级流感监测网络实验室分离上送的甲型H3N2流感毒株中随机选取15株,用二代... 目的分析新疆2022—2023年甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征,为流感防控提供科学依据。方法从新疆15家国家级流感监测网络实验室分离上送的甲型H3N2流感毒株中随机选取15株,用二代测序技术进行HA和NA基因组序列测定,用Mega X和BioEdit软件进行基因序列特征及同源性分析。结果15株甲型H3N2流感病毒HA和NA基因序列与世界卫生组织推荐疫苗株A/Darwin/9/2021相比,核苷酸同源性为98.2%~98.4%、99.3%~99.4%,氨基酸同源性为97.8%~98.0%、99.3%~99.5%;系统进化树分析表明,甲型H3N2流感毒株与疫苗株有较高的亲缘关系,共同归属于3C.2al分支。所有分离株HA基因共涉及8个氨基酸突变位点,仅I156K(15/15)涉及HA蛋白的B区,N138D(12/15)发生在受体结合位点130环,其余6个均为非关键位点的改变;NA基因共发生3个氨基酸位点突变,但均不属于已报道的与耐药相关的关键性突变位点。结论2022—2023年新疆甲型H3N2流感病毒株的HA和NA基因与世界卫生组织当年推荐的疫苗株亲缘关系较近,未出现抗原漂移和耐药毒株。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因
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2022年河南省安阳市甲型H3N2流感病毒基因特征
5
作者 王伟伟 张相萍 +5 位作者 侯自员 李文杰 李战朋 张一纯 晁雪宁 包小兵 《现代疾病预防控制》 2024年第9期698-704,共7页
目的分析河南省安阳市2022年甲型H3N2流感病毒基因特征,为科学防控流感提供依据。方法利用测序技术对2022年安阳市17株甲型H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,运用生物信息学软件对甲型H3N2流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序... 目的分析河南省安阳市2022年甲型H3N2流感病毒基因特征,为科学防控流感提供依据。方法利用测序技术对2022年安阳市17株甲型H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,运用生物信息学软件对甲型H3N2流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序列进行比对,构建分子进化树,分析基因特征。结果安阳市17株甲型H3N2流感病毒分离株间核苷酸序列的同源性为98.7%~100.0%,氨基酸序列的同源性为98.1%~100.0%;与疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020(H3N2)比较,核苷酸序列的同源性为95.7%~99.4%,氨基酸序列的同源性为96.9%~98.6%。17株甲型H3N2流感病毒分离株均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020(H3N2)相比,HA基因共发生16处氨基酸位点变异,但变异位点均没有在HA抗原决定簇和RBS的位置;NA基因共发生13处氨基酸位点变异,与目前已知报道的耐药相关的变异位点不同,HA和NA潜在N-糖基化位点在数量和位置上均发生变化。结论2022年安阳市甲型H3N2流感病毒在流行过程中未发生明显变异;但HA和NA多个氨基酸位点的变异提示仍需加强对甲型H3N2流感病毒分子水平的动态监测。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 hA基因 nA基因 进化分析
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2022-2024年盐城市甲型H3N2流感病毒HA1和NA基因分子特征
6
作者 李春香 孙雄英 +6 位作者 杨敏 沈鹏 袁嘉婧 张敏 陈晨 李长城 陈国清 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2024年第4期446-453,共8页
目的研究2022-2024年盐城市分离的甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)分子进化特征。方法收集盐城市2022年4月至2024年3月间的流感哨点监测医院以及各县市区流感暴发点采集的流感样病例标本,Rt-q... 目的研究2022-2024年盐城市分离的甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)分子进化特征。方法收集盐城市2022年4月至2024年3月间的流感哨点监测医院以及各县市区流感暴发点采集的流感样病例标本,Rt-qPCR进行核酸检测,阳性样本进行病毒分离。分离的甲型H3N2毒株,采用一步RT-PCR方法扩增HA1和NA基因并测序,采用相关生物信息学软件分析基因核苷酸、氨基酸位点变异及进化特征。结果2022年4月至2024年3月间共采集5020份样本,流感病毒核酸阳性检出率为18.59%(933/5020)。2022年4月至2024年3月两个监测季冬春季流感峰明显,其中,仅2022年4月-2023年3月监测季夏季流感峰明显,甲型H3N2亚型流感病毒是两个监测季的优势流行株。遗传进化树显示:2022-2024年盐城市32株甲型H3N2毒株HA1和NA基因在各分支的聚类关系基本一致,2023-2024年24株分离株的HA1基因和NA基因与2022-2024年北半球疫苗株A/Darwin/9/2021(H3N2)聚类位于3C.2a1b.2a.2a.3a.1进化谱系;2022年8株分离株与2021-2022年北半球疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020(H3N2)聚类位于3C.2a1b.2a.1a进化谱系。6株分离株(A/JSTH/11735/2023、A/JSTH/11788/2023、A/JSTH/11974/2023、A/JSYD/353/2023、A/JSYD/354/2023、A/JSTH/138/2023)均发生F79L、N122D、P239S、K276E氨基酸位点的变异,既存在于散发株又存在于暴发株。盐城市甲型H3N2毒株HA1基因编码区抗原表位、受体结合位点、糖基化位点发生了一定程度变异,基因层面上分析,2023-2024年24株分离株与2022-2024年北半球疫苗株A/Darwin/9/2021免疫原性匹配性较好,2022年8株分离株与2021-2022年北半球疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020免疫原性匹配性较好。盐城市分离株未发生NA蛋白酶活性位点以及耐药位点的变化。结论2022-2024年盐城市流行的甲型H3N2毒株HA1和NA基因正逐渐发生抗原性漂移,增加推荐疫苗株的不匹配度,造成流感的暴发流行。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 RT-PCR hA1基因 nA基因 序列分析
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2015-2017年盐城市甲型H3N2流感病毒HA1、NA基因分子特征 被引量:6
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作者 陈国清 李春香 +4 位作者 邵荣标 王瑶 李峰 徐士林 李长城 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期902-907,共6页
目的从分子流行病学角度对盐城市2015-2017年流行的甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的分子特征进行研究。方法收集盐城市2015-2017年流感监测哨点医院以及流感爆发点采集的3 891例流感样... 目的从分子流行病学角度对盐城市2015-2017年流行的甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的分子特征进行研究。方法收集盐城市2015-2017年流感监测哨点医院以及流感爆发点采集的3 891例流感样病例标本进行核酸检测和病毒分离,从中筛选出20株经血凝抑制试验(hemagglutination inhibition,HI)验证为甲型H3N2亚型的毒株,采用反转录聚合酶链式反应方法扩增其HA1和NA基因并进行测序。结果 2015-2017年流行的20株甲型H3N2毒株HA1和NA基因各自分支的聚类关系基本一致。盐城市A/Jiangsu-YC/1474/2015、A/Jiangsu-YC/1725/2015两株分离株与疫苗株A/Switzerland/9715293/2013和A/Hongkong/4801/2014的进化距离较近,而其余18株分离株与国内部分省市相近年份毒株亲缘关系相近,并与疫苗株A/Switzerland/9715293/2013和A/Hongkong/4801/2014进化距离较远。该20株毒株HA1基因编码区抗原表位、受体结合位点和糖基化位点均发生了一定程度变异。从基因变异角度进行分析,疫苗株A/Switzerland/9715293/2013对盐城地区流感流行的保护效果要弱于疫苗株A/Hongkong/4801/2014。结论 2015-2017年盐城市流行的甲型H3N2毒株HA1和NA基因已逐渐发生变异,可能导致流感病毒发生实质性的抗原性漂移,降低与流感疫苗株的匹配度,减弱流感疫苗的保护作用。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感 hA基因 nA基因 序列分析
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2012—2017年杭州地区甲型H3N2流感病毒HA和NA基因遗传进化分析 被引量:5
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作者 钱昕 于新芬 +4 位作者 李钧 寇宇 周银燕 文艳苹 王旭初 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期18-23,共6页
目的了解2012—2017年杭州地区甲型H3N2流感病毒的流行情况以及血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征。方法收集2012年1月至2017年12月间杭州地区流感样病例12185例,实时RT-PCR检测甲型H3N2流感病毒,同时选取部分甲型H3N2... 目的了解2012—2017年杭州地区甲型H3N2流感病毒的流行情况以及血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征。方法收集2012年1月至2017年12月间杭州地区流感样病例12185例,实时RT-PCR检测甲型H3N2流感病毒,同时选取部分甲型H3N2流感病毒阳性样本,用特异性引物扩增HA和NA基因,进行基因测序并分析其遗传进化特征。结果自2012年以来,杭州地区每年都有甲型H3N2流感病毒的流行。不同年龄段人群发病率存在统计学差异,趋势性卡方检验发现,随着年龄增长,发病率显著提高(Z=81.039,P<0.05)。2012年以来,杭州地区流行的甲型H3N2流感病毒主要属于3C.3a和3C.2a两个进化簇。HA和NA基因的序列一致性均为96.7%~100%,但在多个抗原位点发生了突变。结论甲型H3N2流感病毒在杭州地区流感流行中具有重要地位。2012—2017年,杭州地区甲型H3N2流感病毒抗原变异明显,但目前并未发现耐药株的出现和流行。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 遗传进化
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2013-2018年北京市怀柔区甲型H3N2流感病毒HA基因分子特征分析 被引量:5
9
作者 陈玲霞 孙卫明 +2 位作者 姬莉莉 喻金玉 毛玉梅 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第9期1067-1071,共5页
目的分析怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒血凝素(HA)基因的遗传变异特征。方法选取怀柔区2013年9月-2018年8月50株甲型H3N2流感病毒,进行HA基因扩增和测序,运用MEGA6.0软件分析HA的分子特征,并构建系统进化树。结果怀柔区2013-2018... 目的分析怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒血凝素(HA)基因的遗传变异特征。方法选取怀柔区2013年9月-2018年8月50株甲型H3N2流感病毒,进行HA基因扩增和测序,运用MEGA6.0软件分析HA的分子特征,并构建系统进化树。结果怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒优势流行株分别为3c.3系(2013年9月-2014年8月)、3c.3a系(2013年9月-2015年8月)和3c.2a系(2015年9月-2018年8月)。系统进化树分析显示,同一监测年度的流行株基本呈现集中分布,各监测年度流行株与当年推荐流感疫苗株距离均较远。分子特征显示HA蛋白5个抗原决定簇均发生变异,有29处氨基酸位点发生变异,变异频率逐年增加;受体结合位点发生N225D、T131K和T135K/N变异;糖基化位点自2015年9月-2018年8月变化增加,144NSS消失,部分流行株新增了142NSS、158NYT和135NSS。结论怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒HA基因不断发生突变,变异频率增加,可能出现了抗原漂移,与当年推荐疫苗株匹配程度降低,近期应加强对流感病毒分子变异的监测。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 血凝素 分子特征 进化分析
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2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒抗原漂移分析 被引量:4
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作者 方斌 余晓 +2 位作者 李翔 叶国军 刘琳琳 《疾病监测》 CAS 2017年第5期387-393,共7页
目的了解2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒流行特征、基因进化和抗原漂移情况。方法通过2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒核酸检测阳性率划分流行高峰,分析各流行高峰病毒的阳性数、分离数和进化簇分布,结合抗原决定簇氨基酸突变位... 目的了解2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒流行特征、基因进化和抗原漂移情况。方法通过2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒核酸检测阳性率划分流行高峰,分析各流行高峰病毒的阳性数、分离数和进化簇分布,结合抗原决定簇氨基酸突变位点和三维建模数据,分析3C.2a簇病毒抗原决定簇氨基酸突变位点变化情况。结果 2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒存在8个流行高峰,流行高峰会受到其他型别流感流行的影响,3C.2a簇病毒主要在第Ⅶ流行高峰后流行,与3C.3a簇病毒在HA蛋白3处抗原决定簇上存在7处不同氨基酸突变位点,3C.2a簇病毒159Y-160T位点和3C.3a簇病毒159S-160K位点在三维模拟结构图中差异明显。结论 2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒进化簇不断进化,加强对近期3C.2a簇病毒的进化学监测和抗原漂移分析,有助于提高湖北省流感病原学和流行病学监测水平和能力。 展开更多
关键词 h3n2亚型流感病毒 3C.2a簇病毒 流行特征 抗原漂移 进化
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甲型H3N2流感病毒基因特征全基因组测序分析 被引量:3
11
作者 曹蓝 李魁彪 +6 位作者 陈艺韵 吴迪 曾庆 夏丹 刘艳慧 狄飚 张周斌 《中国公共卫生》 CSCD 北大核心 2022年第3期302-308,共7页
目的通过对H3N2流感病毒进行全基因组序列基因特征分析,为H3N2流感的科学防控提供研究数据。方法选取2019年广东省广州市13株H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,通过生物信息学软件分析各基因特征。结果各基因核苷酸同源性最低为94%,最... 目的通过对H3N2流感病毒进行全基因组序列基因特征分析,为H3N2流感的科学防控提供研究数据。方法选取2019年广东省广州市13株H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,通过生物信息学软件分析各基因特征。结果各基因核苷酸同源性最低为94%,最高为100%,差异最大为NA基因(94%~100%),差异最小为PA基因(98.9%~100%)。各基因核苷酸位点变异率最高为NA基因(8.37%),最低为PA基因(2.14%),不同基因核苷酸变异率差异具有统计学意义(χ^(2)=123.503,P=0.000)。各基因均与疫苗株A/HONG KONG/2671/2019(H3N2)归属于同一进化分支,且来源于门诊监测毒株与暴发疫情毒株进化起源相同。根据流行时间的不同,HA、PB2、PB1、NP、M、NS基因可以继续划分为Group 1-3三个小分支,Group 1分支流行于2019年1-8月,Group 2分支流行于2019年11-12月,Group 3分支同时包含2019年1-8月和2019年11-12月流行期的毒株。结论2019年广州H3N2流感病毒与疫苗株位属于同一进化分支,不同来源毒株具有相同的进化起源。但全基因组在进化特点、同源性、分子变异率等方面存在基因多样性差异。 展开更多
关键词 h3n2流感 全基因组 基因进化 变异
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2012年宁波市甲3亚型流感流行特征与HA1基因特性的分析 被引量:4
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作者 焦素黎 胡逢蛟 +1 位作者 张姝 李永东 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第7期979-981,共3页
目的了解2012年宁波市甲3亚型流感病毒的流行特征及血凝素基因HA1区域的变异情况。方法全年度每周从流感监测哨点医院收集疑似病例标本进行病毒分离,获得的甲3亚型流感毒株进行血凝素基因HA1区nt序列测定并推导出其aa序列,然后进行基因... 目的了解2012年宁波市甲3亚型流感病毒的流行特征及血凝素基因HA1区域的变异情况。方法全年度每周从流感监测哨点医院收集疑似病例标本进行病毒分离,获得的甲3亚型流感毒株进行血凝素基因HA1区nt序列测定并推导出其aa序列,然后进行基因特性分析。结果系统进化分析显示2012年的甲3亚型流感病毒的分离株与近几年的代表株均不在同一进化分支上,aa比对结果显示2012年宁波市的流行株与2011年国内外的流行株在HA1区域有8个以上aa位点存在差异。与2012年-2013年疫苗株相比也存在5个aa位点的差异。结论 2012年宁波市流行的甲3亚型流感病毒在血凝素基因HA1区域发生了较为明显的改变,说明近几年宁波市流行的甲3亚型流感病毒变异较为频繁。 展开更多
关键词 3亚型流感病毒 序列分析 血凝素基因
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金翘片体内抗甲型H3N2流感病毒及禽流感病毒H9N2作用研究 被引量:2
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作者 张美义 何家靖 +7 位作者 杨子峰 杨兆丽 杨家庆 詹利之 曾庆慕 冯丽玲 李国桥 朱宇同 《广州中医药大学学报》 CAS 2019年第7期1064-1068,共5页
【目的】探讨金翘片体内抗甲型H3N2流感病毒及禽流感病毒H9N2的作用。【方法】分别以甲型H3N2流感病毒与禽流感病毒H9N2感染小鼠为模型,以小鼠肺指数及肺指数抑制率为评价指标,考察金翘片抗甲型H3N2流感病毒及抗禽流感病毒H9N2的作用,... 【目的】探讨金翘片体内抗甲型H3N2流感病毒及禽流感病毒H9N2的作用。【方法】分别以甲型H3N2流感病毒与禽流感病毒H9N2感染小鼠为模型,以小鼠肺指数及肺指数抑制率为评价指标,考察金翘片抗甲型H3N2流感病毒及抗禽流感病毒H9N2的作用,并观察金翘片的解热、镇痛、抗炎作用。【结果】金翘片具有明显的抑制甲型H3N2流感病毒致肺病变作用(P <0.05或P <0.01),抑制率随剂量增大而增大,呈量效关系;同时也对禽流感病毒H9N2感染鼠肺病变表现出明显的抑制作用(P<0.01)。并具有显著的解热、镇痛、抗炎作用。【结论】金翘片在体内具有显著的抗甲型H3N2流感病毒、抗禽流感病毒H9N2及解热、镇痛、抗炎作用。 展开更多
关键词 金翘片 甲型h3n2流感病毒 禽流感病毒h9n2 疾病模型 动物 小鼠 大鼠
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2013-2014年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒病原学特征分析 被引量:3
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作者 秦剑秋 王亮 +1 位作者 刘海燕 黄莉 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期560-565,共6页
目的分析南宁市2013-2014年A(H3N2)亚型流感病毒的病原学特征及流行趋势。方法通过RT-PCR扩增毒株A(H3N2)病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)并进行同源比对,采用Mega5.1(N-J法)构建系统进化树,统计氨基酸位点的差异,同源建模后分析蛋... 目的分析南宁市2013-2014年A(H3N2)亚型流感病毒的病原学特征及流行趋势。方法通过RT-PCR扩增毒株A(H3N2)病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)并进行同源比对,采用Mega5.1(N-J法)构建系统进化树,统计氨基酸位点的差异,同源建模后分析蛋白结构的变化。结果构建系统进化树,20株毒株HA基因与NA基因均分为4个类群,呈多侧支流行;部分毒株的HA蛋白A抗原决定簇144位点及B抗原决定簇156和158位点发生突变,二硫键和糖基化位点高度保守,未发生变化;NA蛋白抗原基本稳定,只有A/Nanning/43/2014(H3N2)毒株抗原决定簇312位点发生突变,二硫键、酶活性位点、糖基化位点及耐药性位点均未发生变化;HA和NA蛋白晶体结构分析显示氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲处。结论南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,在HA基因和NA基因进化树上疫苗株明显滞后于南宁市流行株,抗原决定簇位点出现氨基酸的替换,但关于疫苗的预防效果尚需进一步验证。 展开更多
关键词 A(h3n2)亚型流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 蛋白结构 同源建模
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2015-2017年浙江省衢州市H3N2亚型流感病毒血凝素基因分子进化特征分析 被引量:3
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作者 黄世腾 杨瑞军 +3 位作者 吕磊 陈旭富 叶承华 万圣 《疾病监测》 CAS 2018年第6期483-488,共6页
目的了解浙江省衢州市2015-2017年H3N2亚型流感病毒血凝素(HA)基因分子进化特征,为流感防控提供科学依据。方法选取衢州市2015-2017年分离到的H3N2亚型流感病毒18株,通过RT-PCR扩增病毒HA基因片段并测序,采用生物信息学软件分析其分子... 目的了解浙江省衢州市2015-2017年H3N2亚型流感病毒血凝素(HA)基因分子进化特征,为流感防控提供科学依据。方法选取衢州市2015-2017年分离到的H3N2亚型流感病毒18株,通过RT-PCR扩增病毒HA基因片段并测序,采用生物信息学软件分析其分子进化特征。结果 18株H3N2亚型流感病毒HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.36%~100.00%和96.76%~100.00%,与同年度疫苗株HA基因的核苷酸平均遗传距离分别为0.008 2、0.007 1和0.011 2,氨基酸平均遗传距离分别为0.009 2、0.003 1和0.010 0。分离株的HA基因分支从3C.3a转变为3C.2a支系,其HA氨基酸序列与同年度疫苗株比较,变异位点共涉及HA蛋白的5个抗原表位(A、B、C、D和E区),2个受体结合位点(T131K、T135N/K),6个潜在糖基化位点(122NES、126NWT、133NGT、135NSS、144NSS、158NYT)。结论 2015-2017年衢州市H3N2亚型流感病毒可能出现了抗原漂移,当前疫苗株A/Hong Kong/4801/2014的免疫效果需重新评估。 展开更多
关键词 h3n2亚型流感病毒 血凝素 序列分析 抗原漂移 分子特征
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2007-2009年广西壮族自治区甲3亚型流感病毒HA1基因变异的特征研究 被引量:3
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作者 康宁 谭毅 +3 位作者 闭福银 居昱 韦增良 潘浩 《疾病监测》 CAS 2011年第4期278-283,共6页
目的从HA1基因层面探讨2007-2009年广西壮族自治区(广西)甲3流感病毒的变异、进化发展规律,探寻与WHO疫苗推荐株以及上海市、北京市和浙江省等地当年流行株之间的差异。方法提取广西22株2007-2009年甲3流感毒株RNA,并测定其血凝素重链(H... 目的从HA1基因层面探讨2007-2009年广西壮族自治区(广西)甲3流感病毒的变异、进化发展规律,探寻与WHO疫苗推荐株以及上海市、北京市和浙江省等地当年流行株之间的差异。方法提取广西22株2007-2009年甲3流感毒株RNA,并测定其血凝素重链(HA1)区域的核苷酸序列,采用生物信息软件,分析与当年疫苗推荐株及上海、北京和浙江等地在HAI以及HAI抗原决定簇区域的差异,分析进化关系。结果 22株广西甲3流感病毒2007年与2008年比较接近,HA1区核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为99.39%和99.08%;而与2009年变异较大,同源性均值分别为99.04%和97.78%。而对比世界卫生组织(WHO)推荐的2008-2009年甲3流感疫苗株A/B risbane/10/2007,广西3年分离株HA1区氨基酸酸同源性均值分别为99.81%、99.25%和97.94%。2009年广西甲3流感病毒与当年疫苗株比较,HA1抗原决定簇发生了6个氨基酸的替换,且发生在A、D、E三区。各年度散发株和暴发株同源性较均在99.00%以上。2007年广西甲3毒株与上海及北京比,HA1区氨基酸同源性均值分别为99.83%和99.12%,2008年比较结果分别为98.93%和99.25%。基因进化树分析显示2009年分离株与2007年、2008年及当年疫苗株距离较远,单独分支。结论广西2007年与2008年甲3流感病毒HA1基因特性较为接近,2009年毒株发生了较大变异。广西与上海、浙江等地分离株更为接近,而与北京分离株差异较大。WHO推荐的当年疫苗株均滞后广西流行株。 展开更多
关键词 3亚型流感病毒 hA1基因 变异
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吉林省2018-2020年甲型H3N2亚型流感病毒耐药基因分析 被引量:2
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作者 李静 柳鸿敏 +2 位作者 侯程程 吴东林 杨显达 《分子诊断与治疗杂志》 2021年第1期8-11,共4页
目的掌握2018-2020年吉林省内H3N2亚型流感流行株对金刚烷胺类药物以及神经氨酸酶抑制剂类药物的耐药情况,为流感的临床治疗及预防控制提供参考依据。方法选取甲型H3N2亚型流感毒株34株,对M2和NA基因进行PCR扩增,测序后对耐药位点进行... 目的掌握2018-2020年吉林省内H3N2亚型流感流行株对金刚烷胺类药物以及神经氨酸酶抑制剂类药物的耐药情况,为流感的临床治疗及预防控制提供参考依据。方法选取甲型H3N2亚型流感毒株34株,对M2和NA基因进行PCR扩增,测序后对耐药位点进行分析。结果2018-2020年吉林省分离到流感毒株981株,其中甲型流感病毒毒株934株,乙型流感毒株47株。在分离到的甲型流感病毒毒株中,57.49%为H1N1pdm亚型毒株,39.61%为H3N2亚型毒株。对34株H3N2亚型流感病毒测序结果显示M2基因S31N耐药位点上发生了突变;在NA耐药相关基因位点E119V、Q136K、D151A、I222V、H274Y、R292K、N294S均未发生突变。结论吉林省2018-2020年以甲型流感流行为主。34株甲型H3N2亚型流感病毒均对金刚烷胺类药物耐药,但仍对神经氨酸酶抑制剂敏感。 展开更多
关键词 甲型h3n2亚型流感病毒 耐药基因分析 金刚烷胺类药物 神经氨酸酶抑制剂
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新一代全基因组测序揭示2014~2018年云南省临沧市H3N2亚型流感病毒的遗传突变机制 被引量:2
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作者 张汉菊 仇娜 +4 位作者 周晓荣 赵晓南 徐闻 伏晓庆 张美玲 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期840-854,共15页
季节性H3N2亚型流感病毒进化速率快,极易发生抗原漂移,引起区域流行且致死率较高。为阐明云南省临沧市2014~2018年H3N2亚型流感病毒的遗传突变机制,选取临沧市2014~2018年H3N2亚型流感病毒29株,通过全基因组核酸提取、扩增、文库构建以... 季节性H3N2亚型流感病毒进化速率快,极易发生抗原漂移,引起区域流行且致死率较高。为阐明云南省临沧市2014~2018年H3N2亚型流感病毒的遗传突变机制,选取临沧市2014~2018年H3N2亚型流感病毒29株,通过全基因组核酸提取、扩增、文库构建以及Illumina MiSeq测序获得基因组全序,并利用生物信息学软件比对基因组序列同源性、构建系统发育树以及解析氨基酸的变异规律。结果显示,29株H3N2亚型流感病毒的8个基因片段的基因进化树拓扑结构基本一致,17株毒株(2014年6株,2015年6株,2016年1株,2018年4株)隶属3C.3a进化支系,11株毒株(2015年1株,2016年1株,2017年7株,2018年2株)隶属3C.2a1进化分支,且这11株毒株出现3C.2a1进化支系特有的氨基酸突变(N121K、N171K、I406V和G484E),A/Yunnan-Linxiang/114/2018这一毒株在全基因组进化树上归属不同支系(例如:3C.3b、3C.2a、3C.2a1),提示临沧市2018年H3N2亚型流感病毒全基因组序列经历了快速进化。与相应年度疫苗株相比,所有毒株血凝素(Hemagglulinin,HA)蛋白重链HA1区抗原决定簇变异频率较高,T131K、T135K/N和A138S突变既位于抗原决定簇,又属HA蛋白受体结合位点(Receptor binding site,RBS),17株毒株HA1区潜在糖基化位点发生改变,且位于抗原决定簇上,15株毒株神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)蛋白潜在糖基化位点发生突变,其中7株糖基化位点的突变发生在NA抗原决定簇上,这都会导致病毒抗原性发生改变,形成抗原漂移。本研究剖析了2014~2018年云南省临沧市H3N2亚型流感病毒起源和扩散的遗传突变机制,为云南省临沧市流感的科学防控提供了理论依据。 展开更多
关键词 h3n2亚型流感病毒 进化树 氨基酸突变 抗原决定簇 糖基化位点
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2019年西安市甲型H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析 被引量:2
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作者 陈海龙 杨玉捷 +4 位作者 邓杨妮 黄银娟 韩月雯 薛泽润 吴瑞 《职业与健康》 CAS 2021年第5期607-610,共4页
目的了解西安市甲型流感病毒H3N2亚型血凝素基因特征及抗原变异情况。方法对2019年西安市分离到的流感毒株7株进行HA基因扩增及序列测定,同时获取WHO推荐的疫苗株HA基因序列,利用MEGA 6.0、BioEdit 7.2.5和NetNGlyc 1.0 Server在线分析... 目的了解西安市甲型流感病毒H3N2亚型血凝素基因特征及抗原变异情况。方法对2019年西安市分离到的流感毒株7株进行HA基因扩增及序列测定,同时获取WHO推荐的疫苗株HA基因序列,利用MEGA 6.0、BioEdit 7.2.5和NetNGlyc 1.0 Server在线分析软件对HA基因序列进行进化分析和抗原变异分析。结果 2019年3月西安市2株H3N2分离株的HA基因与2018—2019年疫苗株核苷酸序列同源性为98.7%~98.8%,与疫苗株相比共发生了13处氨基酸位点变异,其中位于E区的E78G变异发生在抗原决定簇,且未发生糖基化位点改变,10—11月5株H3N2分离株的HA基因与2019—2020年疫苗株核苷酸序列同源性为96.5%~96.8%,与疫苗株相比共发生了24个氨基酸位点变化,其中有6个发生在受体结合位点和抗原决定簇,分别为N137K、A144T、K160S、N187K、E78G、S153F,同时出现糖基化位点的增加或消失现象。结论 2019年上半年西安市H3N2流行株与WHO推荐2018—2019年疫苗株相比变异较少,下半年H3N2流行株与WHO推荐的2019—2020疫苗株匹配度程度降低,发生了抗原漂移现象,应加强流感病毒的分子变异监测。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 血凝素 基因特征
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2012-2015年上海地区成人甲型H3N2流感病毒抗原漂变分析 被引量:2
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作者 夏益兰 张万菊 +10 位作者 田棣 代发辉 宋志刚 冯净净 揭志军 杨天芸 郭雪君 俞慧菊 任涛 袁正宏 胡芸文 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2016年第2期133-137,共5页
目的 通过分析2012-2015上海地区成年人甲型H3N2流感病毒的分子流行病学及HA抗原漂变情况,从而了解甲型H3N2流感病毒分子流行及变异变迁规律.方法 采集2012-2015年间上海地区三家哨点医院流感样成人病例的呼吸道标本,收集临床资料.提取... 目的 通过分析2012-2015上海地区成年人甲型H3N2流感病毒的分子流行病学及HA抗原漂变情况,从而了解甲型H3N2流感病毒分子流行及变异变迁规律.方法 采集2012-2015年间上海地区三家哨点医院流感样成人病例的呼吸道标本,收集临床资料.提取标本核酸后用实时荧光PCR检测流感病毒,对甲型流感病毒阳性的标本进一步进行基因分型.对H3N2阳性标本扩增血凝素(HA)基因片段、测序和进行基因变异分析.结果 总共收集2 346例病例,甲型流感病毒核酸检测阳性病例331例,其中273例为H3 N2流感病毒阳性,58例为2009 pdmH1N1流感病毒阳性.2012年-2015年期间,上海地区H3N2流感病毒在每年的冬春季流行,但在2014年和2015年均呈现夏季流行高峰.对2012年-2015年间获得的上海地区180个H3N2流感病毒的HA基因全长序列进行系统进化树分析发现:2012-2015年间H3N2流感病毒总共引起了3个主要的流感流行峰,分别是2013年12月-2014年1月、2014年7-8月和2015年7-8月,且分别属于三个不同的基因簇:A/Finland/385/2013类似株,为group 3C.3b;A/Switzerland/9715293/2013类似株(SW13),为group 3C.3a和A/Hong Kong/5783/2014类似株(HK14),group 3C.2a分支.比较3个流行峰的甲型H3 N2流感病毒,发现血凝素蛋白氨基酸序列存在一定差异,主要分布于抗原表位和受体结合位点(RBS).结论 2012-2015年间,上海地区流行的H3N2流感病毒出现明显的2次抗原漂变,可能是导致上海地区近年来H3N2流感流行的原因. 展开更多
关键词 h3n2流感病毒 抗原漂变
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